NDUFAF3 - NDUFAF3

NDUFAF3
Identifikátory
AliasyNDUFAF3, 2P1, C3orf60, E3-3, NADH: faktor sestavy komplexu ubichinon oxidoreduktázy 3, MC1DN18
Externí IDOMIM: 612911 MGI: 1913956 HomoloGene: 32460 Genové karty: NDUFAF3
Umístění genu (člověk)
Chromozom 3 (lidský)
Chr.Chromozom 3 (lidský)[1]
Chromozom 3 (lidský)
Genomické umístění pro NDUFAF3
Genomické umístění pro NDUFAF3
Kapela3p21.31Start49,020,459 bp[1]
Konec49,023,495 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE C3orf60 209177 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

25915

66706

Ensembl

ENSG00000178057

ENSMUSG00000070283

UniProt

Q9BU61

Q9JKL4

RefSeq (mRNA)

NM_199417
NM_199069
NM_199070
NM_199073
NM_199074

NM_023247

RefSeq (protein)

NP_951032
NP_951033
NP_951047
NP_951056

NP_075736

Místo (UCSC)Chr 3: 49,02 - 49,02 MbChr 9: 108,57 - 108,57 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 alfa subkomplexní montážní faktor 3, také známý jako 2P1, E3-3nebo C3orf60, je protein že u lidí je kódován NDUFAF3 gen.[5][6][7] NDUFAF3 je mitochondriální montážní protein zapojený do sestavování NADH dehydrogenáza (ubichinon) také známý jako komplex I, který se nachází v mitochondriální vnitřní membrána a je největším z pěti komplexů elektronový transportní řetězec.[8][9] Mutace v tomto genu byly spojeny závažné nedostatky komplexu I a Leighův syndrom.[5][9][10]

Struktura

NDUFAF3 se nachází na p rameno z chromozóm 3 v poloze 21,31 a má 7 exony.[5] The NDUFAF3 Gen produkuje 20,4 kDa protein složený z 184 aminokyseliny.[11][12] NDUFAF3 kóduje dva izoformy které mají společný DUF498 doména. Předpovědi naznačují, že izoforma A obsahuje dalších 35 aminokyselin N-terminál sekvence a je tedy delší než izoforma B. Může být zahrnuta další sekvence mitochondriální cílení, podpora funkce NDUFAF3 v mitochondriální sestavě.[9]

Funkce

NADH: ubichinon oxidoreduktáza (komplex I) katalyzuje přenos elektronů z NADH na ubichinon (koenzym Q) v prvním kroku mitochondriální dýchací řetězec, což má za následek přemístění protony přes mitochondriální vnitřní membránu.[13] The NDUFAF3 Gen kóduje mitochondriální komplex I protein, který se lokalizuje do mitochondriální vnitřní membrány a interaguje s komplexními I podjednotkami a je důležitý pro správnou funkci mitochondriálního respiračního řetězce.[5][9]

NDUFAF3 kolokalizuje, přechází na několik montážních meziproduktů a je spoluzávislá na NDUFAF4 od rané do pozdní fáze složité montáže. Kromě úzkých vzájemných interakcí s nimi NDUFAF3 a NDUFAF4 interagují NDUFS2, NDUFS3, 8. NDUFS, a NDUFA5 v překlad -závislý mechanismus včasné montáže. Rovněž se navrhuje, aby se NDUFAF3 podílel na spojování mitochondriální translace s vložením membrány v procesu složité montáže I.[9]

Klinický význam

Mutace v NDUFAF3 byly spojeny s komplexním nedostatkem I a mitochondriální nemoci. Tyto poruchy jsou výsledkem dysfunkce mitochondriálního dýchacího řetězce a mohou způsobit celou řadu klinických projevů od smrtelného novorozeneckého onemocnění až po nástup dospělého neurodegenerativní poruchy. Fenotypy zahrnují makrocefalie s progresivním leukodystrofie, nespecifické encefalopatie, kardiomyopatie, myopatie, nemoc jater, Leighův syndrom, Leber dědičná optická neuropatie a některé formy Parkinsonova choroba.[6][7] Mutace zahrnovaly homozygotní varianty c.494C> T; p. (Ala165Val),[10] c.365 G → C vedoucí k R122P a c.2 T → C vedoucí k M1T.[9] Klinicky NDUFAF3 mutace byly spojeny s Leighovým syndromem[10] a závažný nedostatek komplexu I.[9] Mezi běžné příznaky patří laktátová acidóza, nystagmus, hypotonie, a mozkové léze.[9][10]

Interakce

Kromě ko-komplexů má NDUFAF3 interakce protein-protein NDUFAF4[14] a SNRPA.[15]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178057 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000070283 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C d „NDUFAF3 NADH: faktor sestavy komplexu ubichinon oxidoreduktázy 3 [Homo sapiens (člověk)] - gen - NCBI“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-25.
  6. ^ A b „NDUFAF3 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 alfa subkomplexní montážní faktor 3 - Homo sapiens (člověk) - gen a protein NDUFAF3“. www.uniprot.org. Citováno 2018-07-25.
  7. ^ A b „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  8. ^ Donald Voet; Judith G. Voet; Charlotte W. Pratt (2013). „18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN  9780470547847.
  9. ^ A b C d E F G h Saada A, Vogel RO, Hoefs SJ, van den Brand MA, Wessels HJ, Willems PH, Venselaar H, Shaag A, Barghuti F, Reish O, Shohat M, Huynen MA, Smeitink JA, van den Heuvel LP, Nijtmans LG (červen 2009). „Mutace v NDUFAF3 (C3ORF60), kódující NDUFAF4 (C6ORF66) -interagující komplex I montážního proteinu, způsobují fatální neonatální mitochondriální onemocnění“. American Journal of Human Genetics. 84 (6): 718–27. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.04.020. PMC  2694978. PMID  19463981.
  10. ^ A b C d Baertling F, Sánchez-Caballero L, Timal S, van den Brand MA, Ngu LH, Distelmaier F, Rodenburg RJ, Nijtmans LG (březen 2017). "Mutace v mitochondriálním komplexu I montážní faktor NDUFAF3 způsobují Leighův syndrom". Molekulární genetika a metabolismus. 120 (3): 243–246. doi:10.1016 / j.ymgme.2016.12.005. PMID  27986404.
  11. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  12. ^ Jao, Danieli. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-07-25.
  13. ^ Reference, Genetics Home. "Gen NDUFAF1". Genetická domácí reference. Citováno 2018-07-25.
  14. ^ „ndufaf3-ndufaf4“. IntAct. EMBL-EBI.
  15. ^ „ndufaf3-snrpa-1“. IntAct. EMBL-EBI.

Další čtení

externí odkazy

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.