Rodina genů lipoproteinových receptorů s nízkou hustotou - Low-density lipoprotein receptor gene family - Wikipedia

Doména receptoru pro lipoproteiny s nízkou hustotou třídy A
PDB 1ldl EBI.jpg
Struktura repetíce bohaté na cysteiny z lipoproteinového receptoru s nízkou hustotou.[1]
Identifikátory
SymbolLdl_recept_a
PfamPF00057
InterProIPR002172
CHYTRÝSM00192
STRÁNKAPS50068
SCOP21ldl / Rozsah / SUPFAM
Membranome5
Doména receptoru lipoproteinů s nízkou hustotou třídy B
PDB 1n7d EBI.jpg
Struktura extracelulární domény LDL receptoru při endozomálním pH.[2]
Identifikátory
SymbolLdl_recept_b
PfamPF00058
Pfam klan6CL0186
InterProIPR000033
CHYTRÝSM00135
STRÁNKAPS51120
SCOP21lrx / Rozsah / SUPFAM

The rodina genů receptoru pro lipoproteiny s nízkou hustotou kódy pro třídu strukturálně souvisejících buněčné povrchové receptory které plní různé biologické funkce v různých orgánech, tkáních a typech buněk.[3] Role, která je nejčastěji spojována s touto evolučně starověkou rodinou, je cholesterol homeostáza (udržování vhodné koncentrace cholesterolu). U lidí je přebytečný cholesterol v krvi zachycen lipoprotein s nízkou hustotou (LDL) a odstraněny játry prostřednictvím endocytóza z LDL receptor.[4] Nedávné důkazy naznačují, že členové rodiny genů LDL receptorů jsou aktivní v buněčná signalizace cesty mezi specializovanými buňkami v mnoha, ne-li všech, mnohobuněčných organismech.[5][6]

Existuje sedm členů rodiny LDLR u savců, jmenovitě:

Lidské proteiny obsahující tuto doménu

Níže jsou uvedeny lidské proteiny obsahující domény receptorů lipoproteinů s nízkou hustotou:

Třída A

C6; C7; 8A; 8B; C9; CD320; CFI;CORIN; DGCR2; HSPG2; LDLR; LDLRAD2; LDLRAD3; LRP1; LRP10;LRP11; LRP12; LRP1B; LRP2; LRP3; LRP4; LRP5; LRP6;LRP8; MAMDC4; MFRP; PRSS7; RXFP1; RXFP2; SORL1; SPINT1;SSPO; ST14; TMPRSS4; TMPRSS6; TMPRSS7; TMPRSS9 (seráza-1B ); VLDLR;

Třída B

EGF; LDLR; LRP1; LRP10; LRP1B; LRP2; LRP4; LRP5;LRP5L; LRP6; LRP8; NID1; NID2; SORL1; VLDLR;

Viz také

Struktura

Modulární struktura členů rodiny LDL receptorů. Vylíhnuté domény jsou odlišně spojeny a vyskytují se pouze v některých izoformách receptoru

Členové rodiny LDLR jsou charakterizováni odlišnými funkčními doménami přítomnými v charakteristických počtech. Jedná se o tyto moduly:

  • LDL receptor typu A (LA) se opakuje po 40 zbytcích, vykazující záporně nabitý povrch stabilizovaný triple-disulfidovou vazbou; předpokládá se, že určité kombinace těchto opakování od hlavy k patě specifikují interakce ligandu;
  • LDL receptor typu B se opakuje, známé také jako homologické oblasti prekurzoru EGF, obsahující repetice podobné EGF a YWTD beta vrtulové domény;
  • transmembránová doména a
  • the cytoplazmatická oblast se (a) signálem (signály) pro internalizaci receptoru prostřednictvím potažených jamek, obsahující konsensuální tetrapeptid Asn-Pro-Xaa-Tyr (NPxY). Tento cytoplazmatický ocas řídí jak endocytózu, tak signalizaci interakcí s proteiny obsahujícími doménu vázající fosfotyrosin (PTB).

Kromě těchto domén, které se nacházejí ve všech receptorech genové rodiny, obsahuje LDL receptor a určité izoformy ApoER2 a VLDLR krátkou oblast, která může podstoupit O-vázaná glykosylace, známá jako O-vázaná cukrová doména. ApoER2 může navíc obsahovat místo štěpení proteázy furin mezi opakováním typu A a typu B, které umožňuje produkci rozpustného fragmentu receptoru zpracováním zprostředkovaným furinem.

Reference

  1. ^ Daly NL, Scanlon MJ, Djordjevic JT, Kroon PA, Smith R (červenec 1995). „Trojrozměrná struktura repetice bohaté na cysteiny z lipoproteinového receptoru s nízkou hustotou“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (14): 6334–8. Bibcode:1995PNAS ... 92.6334D. doi:10.1073 / pnas.92.14.6334. PMC  41512. PMID  7603991.
  2. ^ Rudenko G, Henry L, Henderson K a kol. (Prosinec 2002). "Struktura extracelulární domény LDL receptoru při endozomálním pH" (PDF). Věda. 298 (5602): 2353–8. Bibcode:2002Sci ... 298.2353R. doi:10.1126 / science.1078124. PMID  12459547. S2CID  17712211.
  3. ^ Nykjaer A, Willnow TE (červen 2002). „Rodina genů pro lipoproteinové receptory s nízkou hustotou: buněčný švýcarský armádní nůž?“. Trends Cell Biol. 12 (6): 273–80. doi:10.1016 / S0962-8924 (02) 02282-1. PMID  12074887.
  4. ^ Li Y, Lu W, Marzolo MP, Bu G (květen 2001). „Diferenciální funkce členů rodiny lipoproteinových receptorů s nízkou hustotou naznačené jejich odlišnými rychlostmi endocytózy“. J. Biol. Chem. 276 (21): 18000–6. doi:10,1074 / jbc.M101589200. PMID  11279214.
  5. ^ Gotthardt M, Trommsdorff M, Nevitt MF, Shelton J, Richardson JA, Stockinger W, Nimpf J, Herz J (srpen 2000). „Interakce rodiny genů pro lipoproteinové receptory s nízkou hustotou s cytosolickým adaptérem a proteiny lešení naznačují různé biologické funkce v buněčné komunikaci a signální transdukci“. J. Biol. Chem. 275 (33): 25616–24. doi:10,1074 / jbc.M000955200. PMID  10827173.
  6. ^ Beffert U, Stolt PC, Herz J (březen 2004). "Funkce lipoproteinových receptorů v neuronech". J. Lipid Res. 45 (3): 403–9. doi:10.1194 / jlr.R300017-JLR200. PMID  14657206.

externí odkazy