Seznam taxonů se statusem candidatus - List of taxa with candidatus status - Wikipedia

Toto je seznam taxony s candidatus postavení.

Phyla

Absconditabacteria (dříve Kandidátský kmen SR1 )^[1]^[2]^[3]^[4]
ABY1^[5] aka OD1-ABY1, podskupina OD1 (Parcubacteria )^[6]
Kandidátský kmen AC1^[3]
Acetotermie (dříve Kandidátský kmen OP1 )^[5]^[2]^[3]^[4]
Aerophobetes (dříve kandidátský kmen CD12 nebo BHI80-139 )^[2]^[3]
Aminicenantes (dříve Kandidátský kmen OP8 )^[5]^[2]^[3]^[4]
aquifer1^[2]
aquifer2^[2]
Atribakterie (dříve Kandidátský kmen OP9 nebo JS1 )^[2]^[3]^[4]^[1]^[5]
Berkelbacteria (dříve kandidátský kmen ACD58 )^[3]^[7]
BRC1^[5]^[3]^[4]
CAB-I^[3]
Calescamantes (dříve kandidátský kmen EM19 )^[2]^[3]^[4]
Kmen kandidáta CPR2^[3]
Kmen kandidáta CPR3^[3]
Kandidátský kmen NC10^[5]^[3]
Kandidátský kmen OP2^[3]
Kandidátský kmen RF3^[3]
Kandidátský kmen SAM^[3]
Kandidátský kmen SPAM^[3]
Kandidátský kmen TG2^[3]
Kandidátský kmen VC2^[3]
Kandidátský kmen WS1^[3]
Kmen kandidáta WS2^[3]^[5]
Kandidátský kmen WS4^[3]
Kandidátský kmen WYO^[3]
CKC4^[2]
Cloacimonetes (dříve kandidátský kmen WWE1 )^[2]^[4]
CPR1^[3]
Závislé (dříve kandidátský kmen TM6 )^[2]^[3]^[5]^[8]
EM 3^[3]
„Ca. Endomikrobie " Stingl et al. 2005^[9]
Fermentibakterie (Hyd24-12 )^[3]^[2]^[10]
Fervidibakterie (dříve kandidátský kmen OctSpa1-106 )^[3]
GAL08^[2]
GAL15^[3]
GN01^[3]
GN03^[3]
GN04^[3]
GN05^[3]
GN06^[3]
GN07^[3]
GN08^[3]
GN09^[3]
GN10^[3]
GN11^[3]
GN12^[3]
GN13^[3]
GN14^[3]
GN15^[3]
GOUTA4^[2]
Gracilibacteria (dříve kandidátský kmen GN02, BD1-5 nebo Skupina BD1-5 )^[5]^[2]^[3]
Guaymas1^[5]
Hydrogenedentes (dříve kandidátský kmen NKB19 )^[5]^[2]^[3]^[4]
Ignavibacteriae (dříve kandidátský kmen ZB1 )^[4]^[11]
JL-ETNP-Z39^[2]^[3]
Katanobakterie (dříve kandidátský kmen WWE3 )^[1]^[3]
Kazan-3B-09^[2]
KD3-62^[3]
kpj58rc^[3]
KSA1^[3]
KSA2^[3]
KSB1^[3]
KSB2^[3]
KSB4^[3]
Latescibacteria (dříve Kandidátský kmen WS3 )^[5]^[2]^[3]^[4]
LCP-89^[2]
LD1-PA38^[2]
Marinamargulisbacteria (dříve kandidátská divize ZB3)^[12]

Kandidátský kmen OP10

Třídy

„Ca. Zetaproteobakterie " Emerson et al. 2007^[9]

Mariprofundus ferrooxydans, člen „Ca. Zetaproteobakterie "

Objednávky

„Ca. Nitrosopumilales " Könneke et al. 2005^[9]

Rodiny

„Ca. Midichloriaceae " Montagna et al. 2013^[9]
„Ca. Nitrosopumilaceae " Könneke et al. 2005^[9]
„Ca. Procabacteriaceae "
„Ca. Rhabdochlamydiaceae "

Rody

„Ca. Accumulibacter " Hesselmann et al. 1999^[9]
„Ca. Allobeggiatoa " Hincku et al. 2011^[9]
„Ca. Arthromitus " Snel et al. 1995^[9]
„Ca. Bacilloplasma " Kostanjšek et al. 2007^[9]
„Ca. Baumannia " Moran et al. 2003^[9]
„Ca. Blochmannia " Sauer et al. 2000^[9]
„Ca. Carsonella " Thao et al. 2000^[9]
„Ca. Chlorothrix " Klappenbach a Pierson 2004^[9]
„Ca. Competibacter " Crocetti et al. 2002^[9]
„Ca. Contubernalis " Zhilina et al. 2005^[9]
„Ca. Desulforudis
„Ca. Endomikrobium " Stingl et al. 2005^[9]
„Ca. Epixenosom "

Transmisní elektronový mikrofotografie etapy II epixenosomy.
„Ca. Giganthauma "
„Ca. Glomeribacter " Bianciotto et al. 2003^[9]
„Ca. Kleidoceria " Kuechler et al. 2010^[9]
„Ca. Kuenenia " Schmid et al. 2000^[9]
„Ca. Liberibacter "
„Ca. Lokiarchaeum "
„Ca. Lumbricincola " Nechitaylo et al. 2009^[9]
„Ca. Magnetobacterium " Murray a Stackebrandt 1995^[9]
„Ca. Methanoregula "
„Ca. Microthrix "
„Ca. Nardonella " Lefèvre et al. 2004^[9]
„Ca. Nitrosoarchaeum " Blainey et al. 2011^[9]
„Ca. Nitrosopumilus " Könneke et al. 2005^[9]
„Ca. Pelagibacter " Rappe et al. 2002^[9]
„Ca. Photodesmus " Hendry a Dunlap, 2011^[9]
„Ca. Phytoplasma " Firrao et al. 2004^[9]
„Ca. Portiera " Thao a Baumann 2004^[9]
„Ca. Procabacter " Roh et al. 2002^[9]
„Ca. Rhabdochlamydia "
„Ca. Riegeria " Gruber-Vodička et al. 2011^[9]
„Ca. Rohrkolberia " Kuechler et al. 2011^[9]
„Ca. Salinibacter " Antón et al. 2000^[9]
„Ca. Savagella " Thompson et al. 2012^[9]
„Ca. Scalindua "
„Ca. Similichlamydia " Krok et al. 2013^[9]
„Ca. Symbiothrix " Hongoh et al. 2007^[9]
„Ca. Tremblaya " Thao et al. 2002^[9]
„Ca. Xiphinematobacter " Vandekerckhove et al. 2000^[9]

Druhy a poddruhy

Pokud není uvedeno jinak (♦), tyto záznamy pocházejí z LPSN.^[9]

„Ca. Acaryochloris bahamiensis " López-Legentil et al. 2011
„Ca. Acidianus copahuensis " Giaveno et al. 2013
„Ca. Aciduliprofundum boonei " Schouten et al. 2008

Transmisní elektronový mikrofotografie z vezikuly nadějný "Ca. Aciduliprofundum boonei "buňky

„Ca. Accumulibacter fosfatis " Hesselmann et al. 1999

A RYBA obrázek a floc z laboratorního měřítka EBPR reaktor. K barvení „Ca. byla použita sonda PAOmix (Cy5). Accumulibacter fosfatis ", které se zobrazují modře
„Ca. Actinobaculum timonae " Drancourt et al. 2004
„Ca. Adiaceo aphidicola " Darby et al. 2005
„Ca. Allobeggiatoa salina " Hincku et al. 2011
„Ca. Alysiomicrobium bavaricum " Kragelund et al. 2006
„Ca. Alysiosphaera europaea " Kragelund et al. 2006
„Ca. Amoebinatus massiliae " Greub et al. 2004
„Ca. Amoebophilus asiaticus " Roh et al. 2001
„Ca. Amphibiichlamydia ranarum " Martel et al. 2013
„Ca. Anadelfobacter veles " Vannini et al. 2010
„Ca. Ancillula trichonymphae " Strassert et al. 2012
„Ca. Anammoxoglobus propionicus " Kartal et al. 2007
„Ca. Aquiluna rubra " Hahn 2009
„Ca. Aquirestis calciphila " Hahn a Schauer 2007
„Ca. Arcobacter sulfidicus " Wirsen et al. 2002
„Ca. Arsenophonus arthropodicus " Dale et al. 2002
„Ca. Arsenophonus phytopathogenicus " Bressan et al. 2012
„Ca. Arsenophonus triatominarum " Hypsa a Dale 1997
„Ca. Aschnera chinzeii " Hosokawa et al. 2012
„Ca. Atelocyanobacterium thalassa (♦)
„Ca. Bacteroides massiliae " Drancourt et al. 2004
„Ca. Bartonella ancashi " Blazes et al. 2013
„Ca. Bartonella antechini " Kaewmongkol et al. 2011
„Ca. Bartonella breitschwerdtii (♦)
„Ca. Bartonella bandicootii " Kaewmongkol et al. 2011
„Ca. Bartonella durdenii (♦)
„Ca. Bartonella eldjazairii (♦)
„Ca. Bartonella mayotimonensis " Lin et al. 2010
„Ca. Bartonella melophagi (♦)
„Ca. Bartonella merieuxii " Chomel et al. 2012
„Ca. Bartonella monaxi (♦)
„Ca. Bartonella rudakovii (♦)
„Ca. Bartonella thailandensis " Saisongkorh et al. 2009
„Ca. Bartonella volans (♦)
„Ca. Bartonella woyliei " Kaewmongkol et al. 2011
„Ca. Baumannia cicadellinicola " Moran et al. 2003
„Ca. Benitsuchiphilus tojoi " Hosokawa et al. 2010
„Ca. Berkiella aquae " Mehari et al. 2016
„Ca. Berkiella cookevillensis " Mehari et al. 2016
„Ca. Blochmannia floridanus " Sauer et al. 2000
„Ca. Blochmannia herculeanus " Sauer et al. 2000
„Ca. Blochmannia rufipes " Sauer et al. 2000
„Ca. Borrelia tachyglossi " Loh et al. 2017
„Ca. Borrelia texasensis " Lin et al. 2005
„Ca. Branchiomonas cysticola " Toenshoff et al. 2012
„Ca. Brocadia anammoxidans " Jetten et al. 2001
„Ca. Brocadia caroliniensis " Magrí et al. 2012
„Ca. Brocadia fulgida " Kartal et al. 2004
„Ca. Brocadia sinica " Hu et al. 2010
„Ca. Brownia rhizoecola " Gruwell et al. 2010
„Ca. Burkholderia andongensis " Lemaire et al. 2011
„Ca. Burkholderia calva " Van Oevelen et al. 2004
„Ca. Burkholderia crenata (♦)
„Ca. Burkholderia hispidae " Lemaire et al. 2012
„Ca. Burkholderia kirkii " Van Oevelen et al. 2002
„Ca. Burkholderia mamillata (♦)
„Ca. Burkholderia nigropunctata " Van Oevelen et al. 2004
„Ca. Burkholderia petitii " Lemaire et al. 2011
„Ca. Burkholderia rigidae " Lemaire et al. 2012
„Ca. Burkholderia schumannianae " Lemaire et al. 2012
„Ca. Burkholderia verschuerenii (♦)
„Ca. Burkholderia virens (♦)
„Ca. Caedibacter acanthamoebae " Roh et al. 1999
„Ca. Caldiarchaeum subterraneum " Nunoura et al. 2011
„Ca. Campylobacter hominis " Lawson et al. 1998
„Ca. Captivus acidiprotistae " Pekař et al. 2003
„Ca. Cardinium hertigii " Zchori-Fein et al. 2004
„Ca. Carsonella ruddii " Thao et al. 2000
„Ca. Chloracidobacterium thermophilum " Bryant et al. 2007
„Ca. Chlorothrix halophila " Klappenbach a Pierson 2004
„Ca. Chryseobacterium massiliae " Greub et al. 2004
„Ca. Chryseobacterium timonae " Drancourt et al. 2004
„Ca. Clavochlamydia salmonicola " Karlsen et al. 2008
„Ca. Cloacamonas acidaminovorans " Pelletier et al. 2008
„Ca. komici " Jacobi et al. 1996
„Ca. Competibacter fosfatis " Crocetti et al. 2002
„Ca. Consessoris aphidicola " Darby et al. 2005
„Ca. Contubernalis alkalaceticum " Zhilina et al. 2005
„Ca. Cryptoprodotis polytropus " Ferrantini et al. 2009
„Ca. Curculioniphilus buchneri " Toju et al. 2009
„Ca. Cyrtobacter přijde " Vannini et al. 2010
„Ca. Cyrtobacter zanobii " Boscaro et al. 2013
„Ca. Defluviella procrastinata " Boscaro et al. 2013
„Ca. Desulforudis audaxviator " Chivian et al. 2008

kolonie "Ca. Desulforudis audaxviator objeven v a Zlatý důl u Johannesburg, Jižní Afrika.
„Ca. Desulfovibrio trichonymphae " Sato et al. 2009
„Ca. Devosia euplotis " Vannini et al. 2004
„Ca. Ecksteinia adelgidicola " Toenshoff et al. 2012
„Ca. Ehrlichia walkerii " Brouqui et al. 2003
„Ca. Endobugula glebosa " Lim a Haygood 2004
„Ca. Endobugula sertula " Haygood a Davidson 1997
„Ca. Endolissoclinum faulkneri " Kwan et al. 2012
„Ca. Endoecteinascidia frumentensis " Pérez-Matos et al. 2007
„Ca. Endomicrobium pyrsonymphae " Stingl et al. 2005
„Ca. Endomicrobium trichonymphae " Stingl et al. 2005
„Ca. Endonucleobacter bathymodioli " Zielinski et al. 2009
„Ca. Endoriftia persephone " Robidart et al. 2008
„Ca. Endowatersipora palomitas " Anderson a Haygood 2007
„Ca. Endowatersipora rubus " Anderson a Haygood 2007
„Ca. Entotheonella palauensis " Schmidt et al. 2000
„Ca. Epiflobacter spp. " Xia et al. 2008
„Ca. Erwinia dacicola " Capuzzo et al. 2005
„Ca. Evansia muelleri " Kuechler et al. 2013
„Ca. Flaviluna lacus " Hahn 2009
„Ca. Fodinabacter communificans " Bertin et al. 2011
„Ca. Francisella noatunensis subsp. endociliophora " Schrallhammer et al. 2011
„Ca. Frankia datiscae " Persson et al. 2011
„Ca. Fritschea bemisiae " Everett et al. 2005
„Ca. Fritschea eriococci " Everett et al. 2005
„Ca. Gillettellia cooleyia " Toenshoff et al. 2012
„Ca. Gilliamella apicola " Martinson et al. 2012
„Ca. Glomeribacter gigasporarum " Bianciotto et al. 2003
„Ca. Gortzia infikuje " Boscaro et al. 2012
„Ca. Haliscomenobacter calcifugiens " Hahn a Schauer 2007
„Ca. Halomonas fosfatis " Nguyen et al. 2012
„Ca. Hamiltonella defensa " Moran et al. 2005
„Ca. Helicobacter bovis " De Groote et al. 1999
„Ca. Helicobacter heilmannii " O'Rourke et al. 2004
„Ca. Helicobacter suis " De Groote et al (zahrnuje kmeny dříve známé jako Helicobacter heilmannii typ jedna)
„Ca. Heliomonas lunata " Asao et al. 2012
„Ca. Hemipteriphilus asiaticus " Bing et al. 2013
„Ca. Hemobacterium ranarum " Zhang a Rikihisa 2004 (dříve známý jako Aegyptianella ranarum )
„Ca. Hepatincola porcellionum " Wang et al. 2004
„Ca. Hepatobacter penaei " Numan et al. 2013
„Ca. Hepatoplasma crinochetorum " Wang et al. 2004
„Ca. Hodgkinia cicadicola " McCutcheon et al. 2009
„Ca. Holdemania massiliensis (♦)
„Ca. Ishikawaella capsulata " Hosokawa et al. 2006
„Ca. Isobeggiatoa divolgata " Salmane et al. 2011
„Ca. Jettenia asiatica " Quan et al. 2008
„Ca. Kinetoplastibacterium blastocrithidii " Du et al. 1994
„Ca. Kinetoplastibacterium crithidii " Du et al. 1994
„Ca. Kleidoceria schneideri " Kuechler et al. 2010
„Ca. Kopriimonas aquarianus " Quinne et al. 2012
„Ca. Korarchaeum cryptofilum " Elkins et al. 2008
„Ca. Koribacter univerzální " Ward et al. 2009
„Ca. Kuenenia stuttgartiensis " Schmid et al. 2000
„Ca. Lariskella arthropodarum " Matsuura et al. 2012
„Ca. Legionella jeonii " Park et al. 2004
„Ca. Liberibacter americanus " Teixeira et al. 2005 - jedna příčina Onemocnění způsobené zelení citrusů

Onemocnění způsobené zelení citrusů na mandarinky
„Ca. Liberibacter africanus " Roberts et al. 2015 - jedna z příčin Onemocnění způsobené zelení citrusů
„Ca. Liberibacter africanus "oprava." Jagoueix et al. 1994 (dříve „Ca. Liberobacter africanum )
„Ca. Liberibacter africanus subsp. capensis " Garnier et al. 2000
„Ca. Liberibacter asiaticus "oprava." Jagoueix et al. 1994 (dříve „Ca. Liberobacter asiaticum ) - jedna z příčin Onemocnění způsobené zelení citrusů
„Ca. Liberibacter europaeus " Raddadi et al. 2011
„Ca. Liberibacter psyllaurous " Hansen et al. 2008
„Ca. Liberibacter solanacearum " Liefting et al. 2009 - příčina Psyllid žluté a Zebra čip

Brambůrky vystavovat Zebra čip
„Ca. Limnoluna rubra " Hahn 2009
„Ca. Macropleicola appendiculatae " Kölsch et al. 2009
„Ca. Macropleicola muticae " Kölsch et al. 2009
„Ca. Magnetobacterium bavaricum " Jaro et al. 1993
„Ca. Magnetoglobus multicellularis " Abreu et al. 2007
„Ca. Magnospira bakii " Snaidr et al. 1999
„Ca. Maribeggiatoa vulgaris " Salmane et al. 2011
„Ca. Marispirochaeta associata " Shivani et al. 2016
„Ca. Marithioploca araucae " Salmane et al
„Ca. Marithrix sessilis " Salmane et al. 2011
„Ca. Mesochlamydia elodeae " Corsaro et al. 2013
„Ca. Metachlamydia lacustris " Corsaro et al. 2010
„Ca. Methanogranum caenicola " Iino et al. 2013
„Ca. Methanomethylophilus alvus " Borrel et al. 2012
„Ca. Methanoregula boonei " Bräuer et al. 2006
„Ca. Methylacidiphilum infernorum " Hou et al. 2008
„Ca. Methylomirabilis oxyfera " Ettwig et al. 2010
„Ca. Micrarchaeum acidiphilum (♦)
„Ca. Microthrix calida " Levantesi et al. 2006
„Ca. Microthrix parvicella " Blackall et al. 1996
„Ca. Midichloria mitochondrii " Sassera et al. 2006
„Ca. Monilibacter batavus " Kragelund et al. 2006
„Ca. Moranella endobie " McCutcheon a von Dohlen 2011
„Ca. Mycoplasma aoti " Barker et al. 2011
„Ca. Mycoplasma corallicola " Neulinger et al. 2009
„Ca. Mycoplasma haematoparvum " Sykes et al. 2005
„Ca. Mycoplasma haemobos " Tagawa et al. 2008
„Ca. Mycoplasma haemodidelphidis " Messick et al. 2002
„Ca. Mycoplasma haemofelis " Neimark et al. 2001 (synonymum pro Haemobartonella felis )

„Ca. Mycoplasma haemofelis „s Wright-Giemsova skvrna
„Ca. Mycoplasma haemolamae " Messick et al. 2002
„Ca. Mycoplasma haemomacaque " Maggi et al. 2013
„Ca. Mycoplasma haemominutum " Foley a Pedersen 2001 (dříve „Haemobartonella felis malá forma (Hfsm) ")
„Ca. Mycoplasma haemomuris " Neimark et al. 2001 (synonymum pro Haemobartonella muris )
„Ca. Mycoplasma haemomuris subsp. musculi " Harasawa et al. 2015
„Ca. Mycoplasma haemomuris subsp. Ratti " Harasawa et al. 2015
„Ca. Mycoplasma haemosuis " Neimark et al. 2001 (synonymum pro Eperythrozoon suis a Mycoplasma suis )
„Ca. Mycoplasma haemovis " Hornok et al. 2009
„Ca. Mycoplasma haemozalophi " Volokhov et al. 2011
„Ca. Mycoplasma kahanei " Neimark et al. 2002
„Ca. Mycoplasma ravipulmonis " Neimark et al. 1998
„Ca. Mycoplasma turicensis " Willi et al. 2006
„Ca. Mycoplasma wenyonii " Neimark et al. 2001 (synonymum pro Eperythrozoon wenyonii )
„Ca. Nebulobacter yamunensis " Boscaro et al. 2012
„Ca. Neoehrlichia arcana " Gofton et al. 2016
„Ca. Neoehrlichia australis " Gofton et al. 2016
„Ca. Neoehrlichia lotoris " Yabsley et al. 2008
„Ca. Neoehrlichia mikurensis " Kawahara et al. 2004
„Ca. Nitrosoarchaeum koreensis " Kim et al. 2011
„Ca. Nitrosoarchaeum limnia " Blainey et al. 2011
„Ca. Nitrosocaldus yellowstonii " de la Torre et al. 2008
„Ca. Nitrosopelagicus brevis (♦)
„Ca. Nitrosopumilus koreensis " Park et al. 2012
„Ca. Nitrosopumilus maritimus " Könneke et al. 2005
„Ca. Nitrosopumilus salaria " Mosier et al. 2012
„Ca. Nitrosopumilus sediminis " Park et al. 2012
„Ca. Nitrososphaera gargensis " Hatzenpichler et al. 2008
„Ca. Nitrososphaera viennensis " Tourna et al. 2011
„Ca. Nitrospira bockiana " Lebedeva et al. 2008
„Ca. Nitrospira defluvii " Spieck et al. 2006
„Ca. Nitrosotalea devanaterra " Lehtovirta-morley et al. 2011
„Ca. Nitrotoga arctica " Alawi et al. 2007
„Ca. Nostocoida limicola " Blackall et al. 2000 (kmeny Ben 17, Ben 18, Ben 67, Ben 68 a Ben 74 jsou nyní Tetrasphaera jenkinsii, kmen Ben 70 je Tetrasphaera vanveenii a kmeny Ver 1 a Ver 2 jsou Tetrasphaera veronensis )
„Ca. Odyssella thessalonicensis " Birtles et al. 2000
„Ca. Ovobacter propellens " Fenchel a Thar 2004
„Ca. Paenicardinium endonii " Noel a Atibalentja 2006
„Ca. Parabeggiatoa communis " Salmane et al. 2011
„Ca. Paracaedibacter acanthamoebae " Roh et al. 1999
„Ca. Paracaedibacter symbiosus " Roh et al. 1999
„Ca. Paraholospora nucleivisitans " Eschbach et al. 2009
„Ca. Parilichlamydia carangidicola " Krok et al. 2013
„Ca. Parvarchaeum acidophilus (♦)
„Ca. Pasteuria aldrichii " Giblin-Davis et al. 2011
„Ca. Pasteuria usgae " Giblin-Davis et al. 2003
„Ca. Pelagibacter všudypřítomný " Rappe et al. 2002
„Ca. Peptostreptococcus massiliae " Drancourt et al. 2004
„Ca. Phlomobacter fragariae " Zreik et al. 1998
„Ca. Photodesmus katoptron " Hendry a Dunlap, 2011
„Ca. Phytoplasma 16SrII-U " Yang et al. 2016
„Ca. Phytoplasma allocasuarinae " Marcone et al. 2004
„Ca. Phytoplasma americanum " Závětří et al. 2006
„Ca. Phytoplasma asteris " Závětří et al. 2004
„Ca. Phytoplasma aurantifolia " Zreik et al. 1995
„Ca. Phytoplasma australiense " Davise et al. 1997
„Ca. Phytoplasma balanitae " Vyhrát et al. 2013
„Ca. Phytoplasma brasiliense " Montano et al. 2001
„Ca. Phytoplasma caricae " Arocha et al. 2005
„Ca. Phytoplasma castaneae " Jung et al. 2002
„Ca. Phytoplasma cirsii " Šafářová et al. 2016
„Ca. Phytoplasma convolvuli " Martini et al. 2012
„Ca. Phytoplasma costaricanum " Závětří et al. 2011
„Ca. Phytoplasma cynodontis " Marcone et al. 2004
„Ca. Phytoplasma fragariae " Valiunas et al. 2006
„Ca. Phytoplasma fraxini " Griffithové et al. 1999 - příčina Lila čarodějnické koště

Příznaky nemoci popelově žluté způsobené „Ca. Phytoplasma fraxini „zapnuto zelený popel
„Ca. Phytoplasma graminis " Arocha et al. 2005
„Ca. Phytoplasma hispanicum " Davise et al. 2016
„Ca. Phytoplasma japonicum " Sawayanagi et al. 1999
„Ca. Phytoplasma lycopersici " Arocha et al. 2007
„Ca. Phytoplasma malaysianum " Nejat et al. 2013
„Ca. Phytoplasma mali " Seemüller a Schneider 2004
„Ca. Phytoplasma meliae " Fernandez et al. 2016
„Ca. Phytoplasma omanense " Al-Saady et al. 2008
„Ca. Phytoplasma oryzae " Jung et al. 2003
„Ca. Phytoplasma palmicola " Harrison et al. 2014
„Ca. Phytoplasma phoenicium " Verdin et al. 2003
„Ca. Phytoplasma pini " Schneider et al. 2005
„Ca. Phytoplasma pruni " Davise et al. 2013
„Ca. Phytoplasma prunorum " Seemüller a Schneider 2004
„Ca. Phytoplasma pyri " Seemüller a Schneider 2004
„Ca. Phytoplasma rhamni " Marcone et al. 2004
„Ca. Phytoplasma rubi " Malembic-Maher et al. 2011
„Ca. Phytoplasma rubi " Franova et al. 2016
„Ca. Phytoplasma solani " Quaglino et al. 2013
„Ca. Phytoplasma spartii " Marcone et al. 2004
„Ca. Phytoplasma sudamericanum " Davise et al. 2012
„Ca. Phytoplasma tamaricis " Zhao et al
„Ca. Phytoplasma trifolii " Hiruki a Wang 2004
„Ca. Phytoplasma ulmi " Závětří et al. 2004
„Ca. Phytoplasma vitis " Marzorati et al. 2006 - příčina Flavescence dorée

Flavescence dorée na vinná réva
„Ca. Phytoplasma ziziphi " Jung et al. 2003
„Ca. Piscichlamydia salmonis " Draghi et al. 2004
„Ca. Planktoluna difficilis " Hahn 2009
„Ca. Planktomarina temperata " Giebel et al. 2011
„Ca. Planktophila limnetica " Jezbera et al. 2009
„Ca. Portiera aleyrodidarum " Thao a Baumann 2004
„Ca. Prevotella massiliensis " Drancourt et al. 2004
„Ca. Procabacter acanthamoebae " Roh et al. 2002
„Ca. Profftia tarda " Toenshoff et al. 2012
„Ca. Profftia virida " Toenshoff et al. 2012
„Ca. Protochlamydia amoebophila " Collingro et al. 2005
„Ca. Puchtella pedicinophila " Fukatsu et al. 2009
„Ca. Puniceispirillum marinum " Ach et al. 2010
„Ca. Purcelliella pentastirinorum " Bressan et al. 2009
„Ca. Regiella insecticola " Moran et al. 2005
„Ca. Renichlamydia lutjani " Corsaro a Práce, 2012
„Ca. Rhabdochlamydia crassificans " Corsaro et al. 2006
„Ca. Rhabdochlamydia porcellionis " Kostanjšek (morfologie odpovídá popisu Chlamydia isopodii )
„Ca. Rhizobium massiliae " Greub et al. 2004
„Ca. Rhodoluna limnophila " Hahn 2009
„Ca. Rhodoluna planktonica " Hahn 2009
„Ca. Rickettsia amblyommii " Labruna et al. 2004
„Ca. Rickettsia andeanae " Jiang et al. 2005
„Ca. Rickettsia asemboensis " Jiang et al. 2013
„Ca. Rickettsia barbariae " Mura et al. 2008
„Ca. Rickettsia hebeiii " Yaxue et al. 2011
„Ca. Rickettsia hungarica " Hornok et al. 2010
„Ca. Rickettsia hoogstraalii „Mattila a kol., 2007^[25]
„Ca. Rickettsia kellyi " Rolain et al. 2006
„Ca. Rickettsia kingi " Anstead a Chilton 2013
„Ca. Rickettsia kotlanii " Sréter-Lancz et al. 2006
„Ca. Rickettsia liberiensis " Mediannikov et al. 2012
„Ca. Rickettsia principis " Mediannikov et al. 2006
„Ca. Rickettsia senegalensis „Mediannikov, Aubadie-Ladrix a Raoult, 2015^[26]
„Ca. Rickettsia tarasevichiae " Shpynov et al. 2003
„Ca. Rickettsia tasmanensis " Izzard et al. 2009
„Ca. Rickettsia vini " Palomar et al. 2012
„Ca. Riegeria galateiae " Gruber-Vodička et al. 2011
„Ca. Riesia pediculicola " Sasaki-Fukatsu et al. 2006
„Ca. Rohrkolberia cinguli " Kuechler et al. 2011
„Ca. Roseomonas massiliae " Greub et al. 2004
„Ca. Ruthia magnifica " Newton et al. 2007
„Ca. Scalindua arabica " Woebken et al. 2008
„Ca. Scalindua brodae " Schmid et al. 2003
„Ca. Scalindua pacifica " Dang et al. 2003
„Ca. Scalindua profunda " Van De Vossenberg et al. 2008
„Ca. Scalindua richardsii " Fuchsman et al. 2012
„Ca. Scalindua sorokinii " Kuypers et al. 2003
„Ca. Scalindua wagneri " Schmid et al. 2003
„Ca. Serratia symbiotica " Moran et al. 2005
„Ca. Similichlamydia latridicola " Krok et al. 2013
„Ca. Snodgrassella alvi " Martinson et al. 2012
„Ca. Snodgrassella alvi " Martinson et al. 2012
„Ca. Sodalis melophagi " Chrudimský et al. 2012
„Ca. Sodalis pierantonius " Oakesone et al. 2014
„Ca. Sphaeronema italicum " Kragelund et al. 2006
„Ca. Stammerula tephritidis " Mazzon et al. 2008
„Ca. Steffania adelgidicola " Toenshoff et al. 2012
„Ca. Streptomyces philanthi " Kaltenpoth et al. 2006
„Ca. Sulcia muelleri " Moran et al. 2005
„Ca. Sulfurovum sediminum " Park et al. 2012
„Ca. Symbiothrix dinenymphae " Hongoh et al. 2007
„Ca. Synechococcus spongiarum " Usher et al. 2004
„Ca. Tammella caduceiae " Hongoh et al. 2007
„Ca. Tenderia electrophaga " Eddie et al. 2016
„Ca. Thermochlorobacter aerophilum " Liu et al. 2012
„Ca. Thiobios zoothamnicoli " Rinke et al. 2006
„Ca. Thiodictyon syntrophicum " Peduzzi et al. 2012
„Ca. Thioglobus singularis " Marshalle a Morris, 2013
„Ca. Thiomargarita joergensenii " Salmane et al. 2011
„Ca. Thiomargarita nelsonii " Salmane et al. 2011
„Ca. Thiophysa hinzei " Salmane et al. 2011
„Ca. Thiopilula aggregata " Salmane et al. 2011
„Ca. Thioturbo danicus " Muyzer et al. 2005
„Ca. Tremblaya phenacola " Gruwell et al. 2010
„Ca. Tremblaya princeps " Thao et al. 2002
„Ca. Troglogloea absoloni " Kostanjšek et al. 2013
„Ca. Uzinura diaspidicola " Gruwell et al. 2007
„Ca. Vallotia cooleyia " Toenshoff et al. 2012
„Ca. Vallotia tarda " Toenshoff et al. 2012
„Ca. Vallotia virida " Toenshoff et al. 2012
„Ca. Veillonella atypica " Drancourt et al. 2004
„Ca. Vesicomyosocius okutanii " Kuwahara et al. 2007
„Ca. Vestibaculum illigatum " Stingl et al. 2004
„Ca. Vidania fulgoroideae " Gonella et al. 2011
„Ca. Wolinella africanus " Bohr et al. 2003
„Ca. Xenohaliotis californiensis " Friedman et al. 2000.
„Ca. Xiphinematobacter americani " Vandekerckhove et al. 2000
„Ca. Xiphinematobacter brevicolli " Vandekerckhove et al. 2000
„Ca. Xiphinematobacter rivesi " Vandekerckhove et al. 2000
„Ca. Zinderia insecticola " McCutcheon a Moran, 2010

Bývalí taxony candidatus

Armatimonadetes, dříve kandidátský kmen OP10^[5]^[27]^[28]
Caldiserica, dříve kandidátský kmen OP5^[5]^[29]
Elusimikrobie, dříve skupina termitů 1^[30]
Lentisphaerae, dříve vadinBE97^[5]^[31]

Viz také

Nekultivovaná bakteriální kmen a metagenomika
Otevřená nomenklatura, systém notací používaných v taxonomii k označení úsudku taxonoma o příbuznosti k taxonu
Glosář vědeckého pojmenování
incertae sedis, taxon nejisté polohy v klasifikaci
nomen dubium, název neznámé nebo pochybné aplikace

Reference

^ ^A ^b ^C Hug LA; et al. (2016). „Nový pohled na strom života“. Přírodní mikrobiologie. Článek 16048 (5): 16048. doi:10,1038 / nmicrobiol.2016,48. PMID 27572647.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^Ó ^str ^q ^r ^s ^t ^u ^proti ^w ^X ^y ^z ^aa ^ab ^ac ^inzerát ^ae ^af ^ag ^ah ^ai ^aj ^ak „ARB-Silva: komplexní databáze ribozomálních RNA“. Vývojový tým ARB. Citováno 2. ledna 2016.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^Ó ^str ^q ^r ^s ^t ^u ^proti ^w ^X ^y ^z ^aa ^ab ^ac ^inzerát ^ae ^af ^ag ^ah ^ai ^aj ^ak ^al ^dopoledne ^an ^ao ^ap ^vod ^ar ^{tak jako} ^na ^au ^av ^aw ^sekera ^ano ^az ^ba ^bb ^{před naším letopočtem} ^bd ^být ^bf ^bg ^bh ^bi ^bj ^bk ^bl ^bm ^bn ^bo ^bp ^bq ^br ^bs ^bt ^bu ^bv ^bw ^bx ^podle ^{B z} ^ca. ^cb ^cc ^CD ^ce ^srov ^srov ^ch ^ci ^cj „Prohlížeč taxonomie“. NCBI. Citováno 2. ledna 2016.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^Ó ^str ^q ^r ^s „Hierarchický prohlížeč“. Projekt ribozomální databáze. Citováno 2. ledna 2016.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^Ó ^str ^q ^r ^s ^t ^u ^proti ^w ^X ^y Rappé, Michael S .; Giovannoni, Stephen J. (2003). „Nekultivovaná mikrobiální většina“. Výroční přehled mikrobiologie. 57: 369–94. doi:10.1146 / annurev.micro.57.030502.090759. PMID 14527284.
^ ^A ^b Kenly A. Hiller, Kenneth H. Foreman, David Weisman, Jennifer L. Bowen: Propustné reaktivní bariéry navržené ke zmírnění eutrofizace mění složení bakteriálních komunit a podmínky aquifer redox. In: Appl Environ Microbiol v.81 (20); 2015 říjen; s. 7114–7124. doi: 10,1128 / AEM.01986-15. PMC 4579450. PMID 26231655.
^ Wrighton KC; et al. (2014). „Metabolické vzájemné závislosti mezi fylogeneticky novými fermentory a respiračními organismy v neomezené zvodnělé vrstvě“. Časopis ISME. 8 (7): 1452–1463. doi:10.1038 / ismej.2013.249. PMC 4069391. PMID 24621521.
^ Yeoh YK; et al. (2015). „Srovnávací genomika kandidátského kmene TM6 naznačuje, že parazitismus je v této linii rozšířený a rodový“. Mol Biol Evol. 33 (4): 915–927. doi:10.1093 / molbev / msv281. PMC 4776705. PMID 26615204.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F ^G ^h ⁱ ^j ^k ^l ^m ⁿ ^Ó ^str ^q ^r ^s ^t ^u ^proti ^w ^X ^y ^z ^aa ^ab ^ac ^inzerát ^ae ^af ^ag ^ah ^ai ^aj ^ak ^al Parte, A.C .; Euzéby, J.P. (2017). "Jména zahrnutá v kategorii Candidatus". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře. Citováno 4. ledna 2018.
^ Kirkegaard, Rasmus Hansen; Dueholm, Morten Simonsen; McIlroy, Simon Jon; Nierychlo, Marta; Kras, Sören Michael; Albertsen, Mads; Nielsen, Per Halkjör (2016-10-01). „Genomické poznatky o členech kandidátského kmene Hyd24-12 běžné v mezofilních anaerobních digestorech“. Časopis ISME. 10 (10): 2352–2364. doi:10.1038 / ismej.2016.43. ISSN 1751-7370. PMC 5030696. PMID 27058503.
^ Podosokorskaya OA; et al. (2013). "Charakterizace Melioribacter roseus gen. nov., sp. nov., nová fakultativně anaerobní termofilní celulolytická bakterie ze třídy Ignavibakteriea návrh nového bakteriálního kmene Ignavibacteriae". Environ. Microbiol. 15 (6): 1759–71. doi:10.1111/1462-2920.12067. PMID 23297868.
^ NCBI: Kandidátská divize ZB3 (třída), skupina sinic / melainabakterií
^ Sekiguchi Y; et al. (2015). „První genomické poznatky o členech kandidátního bakteriálního kmene odpovědného za spojování odpadních vod“. PeerJ. 3: e740. doi:10,7717 / peerj.740. PMC 4312070. PMID 25650158.
^ Lucker S; et al. (2013). "Genom Nitrospina gracilis osvětluje metabolismus a vývoj hlavního mořského oxidátoru dusitanů ". Přední. Microbiol. 4: 27. doi:10.3389 / fmicb.2013.00027. PMC 3578206. PMID 23439773.
^ Christopher T. Brown, Laura A. Hug, Brian C. Thomas et al.; et al. (2015). „Neobvyklá biologie ve skupině zahrnující více než 15% doménových bakterií“. Příroda. 523 (7559): 208–11. Bibcode:2015 Natur.523..208B. doi:10.1038 / příroda14486. PMID 26083755.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
^ NCBI: Candidatus Peregrinibacteria (kmen)
^ UniProt: Taxonomie - Candidatus Peregrinibacteria (FYLUM)
^ Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, David Burstein, Cindy Castelle: Analýza pěti kompletních genomových sekvencí pro členy třídy Peribacteria v nedávno rozpoznaném bakteriálním kmeni Peregrinibacteria. V: PeerJ 4 (8): e1607; Ledna 2016; doi: 10,7717 / peerj.1607
^ Fieseler L; et al. (2004). "Objev nového kandidátského kmene" Poribacteria "v mořských houbách". Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 70 (6): 3724–32. doi:10.1128 / AEM.70.6.3724-3732.2004. PMC 427773. PMID 15184179.
^ Albertsen M; et al. (2013). "Sekvence genomu vzácných, nekulturních bakterií získaných diferenčním pokrytím binningu více metagenomů". Nat. Biotechnol. 31 (6): 533–8. doi:10.1038 / nbt.2579. PMID 23707974.
^ Hugenholtz P; et al. (1998). „Dopad studií nezávislých na kultuře na vznikající fylogenetický pohled na bakteriální rozmanitost“. Journal of Bacteriology. 180 (18): 4765–74. doi:10.1128 / JB.180.18.4765-4774.1998. PMC 107498. PMID 9733676.
^ Marcy Y; et al. (2007). „Disekující biologická„ temná hmota “s jednobuněčnou genetickou analýzou vzácných a nekultivovaných mikrobů TM7 z lidských úst“. Proc Natl Acad Sci U S A. 104 (29): 11889–94. doi:10.1073 / pnas.0704662104.
^ Wilson MC; et al. (2014). „Environmentální bakteriální taxon s velkým a výrazným metabolickým repertoárem“ (PDF). Příroda. 506 (7486): 58–62. Bibcode:2014Natur.506 ... 58W. doi:10.1038 / příroda12959. PMID 24476823.
^ Dojka MA; et al. (2000). „Rozšíření známé rozmanitosti a distribuce nekulturního fylogenetického rozdělení bakterií v životním prostředí“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 66 (4): 1617–21. doi:10.1128 / AEM.66.4.1617-1621.2000. PMC 92031. PMID 10742250.
^ Mattila, J. T., N. Y. Burkhardt, H. J. Hutcheson, U. G. Munderloh a T. J. Kurtti. 2007. Izolace buněčných linií a rickettsiální endosymbiont z měkkého klíštěte Carios capensis (Neumann) (Acari: Argasidae: Ornithodorinae). Journal of Medical Entomology 44: 1091–1101. „Navrhujeme, aby se izolovaný RCCE3 jmenoval Candidatus Rickettsia hoogstraalii na počest Harry Hoogstraal kteří tolik přispěli k naší znalosti klíšťat. “
^ Ó. Mediannikov O, Aubadie-Ladrix M, Raoult D (2015). „Candidatus 'Rickettsia senegalensis' v kočičích blechách v Senegalu“. Nové mikroby, nová infekce. 3: 24–8. doi:10.1016 / j.nmni.2014.10.005. PMC 4337942. PMID 25755888.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)„Izolovali jsme tři rickettsiální kmeny a genetická analýza prokázala, že tyto kmeny představují pravděpodobný nový druh, dočasně nazývaný Candidatus Rickettsia senegalensis tady."
^ Tamaki H; et al. (2010). "Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., gramnegativní, aerobní, chemoheterotrofní bakterie nového bakteriálního kmene Armatimonadetes phyl. nov., formálně nazývaný kandidátský kmen OP10 ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 6): 1442–7. doi:10.1099 / ijs.0.025643-0. PMID 20622056.
^ Lee KCY; et al. (2010). "Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., aerobní, pigmentovaný, termofilní mikroorganismus nové bakteriální třídy, Chthonomonadetes classis. listopadu, nově popsaného kmene Armatimonadetes původně označeného jako kandidátská divize OP10 " (PDF). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 10): 2482–90. doi:10.1099 / ijs.0.027235-0. PMID 21097641.
^ Mori K; et al. (2009). "Caldisericum exil gen. nov., sp. nov., anaerobní, termofilní, vláknitá bakterie nového bakteriálního kmene, Caldiserica phyl. listopadu, původně nazývaný kandidátský kmen OP5, a popis Caldisericaceae fam. listopadu. Caldisericales ord. listopad. a Caldisericia classis nov ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 59 (Pt 11): 2894–8. doi:10.1099 / ijs.0.010033-0. PMID 19628600.
^ Geissinger O; et al. (2009). „Ultramicrobacterium Elusimicrobium minutum gen. nov., sp. nov., první kultivovaný zástupce kmene Termite Group 1 ". Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 75 (9): 2831–40. doi:10.1128 / AEM.02697-08. PMC 2681718. PMID 19270135.
^ Cho JC; et al. (2004). "Lentisphaera araneosa gen. nov., sp. nov, transparentní exopolymer produkující mořské bakterie, a popis nového bakteriálního kmene Lentisphaerae “. Mikrobiologie prostředí. 6 (6): 611–21. doi:10.1111 / j.1462-2920.2004.00614.x. PMID 15142250.