Berkelbacteria - Berkelbacteria

Berkelbacteria
Vědecká klasifikace E
Doména:Bakterie
Infrakingdom:Kandidátské záření phyla
Kmen:Berkelbacteria

Berkelbacteria (dříve ACD58) je a bakteriální kmen s kandidát status, což znamená, že pro tuto skupinu neexistují žádní kultivovaní zástupci. Je součástí Kandidátské záření Phyla.

Berkelbacteria byla poprvé hlášena v roce 2012, kdy byla klasifikována jako divergentní linie parcubakterií (OD1) a označována jako ACD58.[1] To bylo navrženo jako kmen v roce 2014.[2] Zástupci tohoto kmene byli detekováni v různých prostředích, včetně hlubokých termokarst jezero v údolí řeky Sasapimakwananisikw (QC, Kanada),[3] acetátově upravená naplavená zvodněná vrstva přiléhající k řece Colorado (CO, USA),[2] a mořské sedimenty z mořského dna Peru Margin.[4]

Reference

  1. ^ Wrighton, Kelly C .; Thomas, Brian C .; Sharon, Itai; Miller, Christopher S .; Castelle, Cindy J .; VerBerkmoes, Nathan C .; Wilkins, Michael J .; Hettich, Robert L .; Lipton, Mary S .; Williams, Kenneth H .; Long, Philip E. (2012-09-28). „Fermentace, metabolismus vodíku a síry v mnoha nekultivovaných bakteriálních kmenech“. Věda. 337 (6102): 1661–1665. Bibcode:2012Sci ... 337.1661W. doi:10.1126 / science.1224041. ISSN  0036-8075. PMID  23019650.
  2. ^ A b Wrighton, Kelly C .; Castelle, Cindy J .; Wilkins, Michael J .; Hug, Laura A .; Sharon, Itai; Thomas, Brian C .; Handley, Kim M .; Mullin, Sean W .; Nicora, Carrie D .; Singh, Andrea; Lipton, Mary S. (červenec 2014). „Metabolické vzájemné závislosti mezi fylogeneticky novými fermentory a respiračními organismy v neomezené zvodnělé vrstvě“. Časopis ISME. 8 (7): 1452–1463. doi:10.1038 / ismej.2013.249. ISSN  1751-7370. PMC  4069391. PMID  24621521.
  3. ^ Vigneron, Adrien; Cruaud, Perrine; Langlois, Valérie; Lovejoy, Connie; Culley, Alexander I .; Vincent, Warwick F. (2020). „Extrémně malé a hojné: Kandidátní bakterie radiační fyly jsou potenciálními katalyzátory přeměny uhlíku v jezerním ekosystému termokrasů“. Limnologické a oceánografické dopisy. 5 (2): 212–220. doi:10,1002 / lol2.10132. ISSN  2378-2242.
  4. ^ Orsi, William D .; Richards, Thomas A .; Francis, Warren R. (leden 2018). „Predikované mikrobiální sekretomy a jejich cílové substráty v mořském sedimentu“. Přírodní mikrobiologie. 3 (1): 32–37. doi:10.1038 / s41564-017-0047-9. ISSN  2058-5276. PMID  29062087.