Methylacidiphilum infernorum - Methylacidiphilum infernorum

Methylacidiphilum infernorum
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Verukomikrobie
Třída:
Nezařazeno
Objednat:
Methylacidiphilales
Rodina:
Methylacidiphilaceae
Rod:
Methylacidiphilum
Druh:
M. infernorum
Binomické jméno
Methylacidiphilum infernorum
Hou a kol. 2008
Typ kmene
Izolovat V4
Synonyma

Methylokorus infernorum Dunfield a kol. 2007
Kmen V4 Dunfield a kol. 2007
Candidatus Methylacidiphilum infernorum Hou a kol.

Methylacidiphilum infernorum je extrémně acidofilní metanotropní aerobní bakterie poprvé izolovány a popsány v roce 2007, kdy rostly na půdě a sedimentovaly Pekelná brána, Nový Zéland.[1][2][3] Podobné organismy byly také izolovány z geotermálních míst na Itálie a Rusko.

A polyextremofil, tyto nepohyblivé tyče rostou optimálně při pH mezi 2,0 a 2,5 a teplota 60 ° C. Je to metanotropní povinné bakterie, které rostou 25% (v / v) z metan ve vzduchu. Je také velmi závislá na oxid uhličitý koncentrace rostou, optimálně na 8% (v / v) CO2 ve vzduchu.[1]

Díky své klasifikaci v kmeni Verukomikrobie a jeho extrémní acidofilní fenotyp M. infernorum je jedinečný mezi všemi známými methanotrofy.[1]

Biologie

Genom

Má jediný kruhový chromozom 2287145 základní páry. Při analýze genomu bylo zjištěno, že M. infernorum může použít román methylotrofní cesta protože kóduje methan monooxygenáza enzymy, ale postrádají známé genetické moduly pro oxidaci methanolu a formaldehydu.[1][4]

Všechny enzymy potřebné pro Cyklus Calvina Bensona Basshama byly identifikovány genetickou analýzou.[5]

Metabolismus

To se předpovídalo M. infernorum vlastní většinu klíčových metabolických drah pro biosyntézu všech aminokyselin, nukleotidů a kofaktorů, s jedinou výjimkou kobalamin kofaktor.[5]

Genetické studie ukázaly, že enzymy, které používá v několika metabolických cestách, se liší od těch, které používají jiné methylotrofy jako například v biosyntéze aromatických aminokyselin, biosyntéza kyseliny lipoové, močovinový cyklus a v počtu a rozmanitosti kódovaných transportérů.[5]

Bakterie jsou schopny působit proti extrémně kyselému prostředí díky přítomnosti různých enzymů glutamát dekarboxyláza, antiporter glutamát / γ-aminobutyrát, arginin dekarboxyláza a antiporter arginin / agmatin.[5]

Reference

  1. ^ A b C d Peter D a kol. (2007). „Oxidace metanu extrémně acidofilní bakterií kmene Verrucomicrobia“. Příroda. 450 (7171): 879–882. Bibcode:2007 Natur.450..879D. doi:10.1038 / nature06411. PMID  18004300.
  2. ^ Noel R. Krieg; Wolfgang Ludwig; William Whitman; Brian P. Hedlund; Bruce J. Paster; James T. Staley; Naomi Ward; Daniel Brown, eds. (2011). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: Volume 4: The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes. Springer Science & Business Media. str. 795–6. ISBN  978-0-387-68572-4.
  3. ^ Malgorzata Pawlowska (22. dubna 2014). Snižování emisí ze skládkových plynů. CRC Press. str. 64. ISBN  978-0-415-63077-1.
  4. ^ Hanson R, Hanson T. (1996). "Methanotrophic bakterie". Microbiol. Rev. 60 (2): 439–471. doi:10.1128 / MMBR.60.2.439-471.1996. PMC  239451. PMID  8801441.
  5. ^ A b C d Hou S a kol. (2008). „Kompletní genomová sekvence extrémně acidofilního methanotrofního izolátu V4, Methylacidiphilum infernorum, zástupce bakteriálního kmene Verrucomicrobia“. Biol. Přímo. 3 (26): 26. doi:10.1186/1745-6150-3-26. PMC  2474590. PMID  18593465.

externí odkazy