Seznam sekvenovaných genomů řas - List of sequenced algae genomes - Wikipedia
Tento seznam sekvenovaných genomů řas obsahuje druhy řas, o nichž je známo, že mají veřejně dostupné kompletní sekvence genomu, které byly shromážděny, anotovány a publikovány. Nejsou zahrnuty nesestavené genomy ani sekvence pouze pro organely. Pro rostlinné genomy viz seznam sekvenovaných rostlinných genomů. Sekvence plastidů viz seznam sekvenovaných plastomů. Pro všechna království viz seznam sekvenovaných genomů.
Dinoflageláty (Alveolata )
Viz také Seznam sekvenovaných protistických genomů.
| Organismus kmen | Typ | Relevantnost | Velikost genomu | Číslo genů předpovídal | Organizace | Rok dokončení | Shromáždění postavení | Odkazy |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Breviolum minutum (Symbiodinium minuta; klade B1) | Dinoflagellate | Korálový symbiont | 1,5 GB | 47,014 | Okinawa Institute of Science and Technology | 2013[1] | Návrh | OIST Marine Genomics[2] |
| Cladocopium goreaui (Symbiodinium goreaui; clade C, typ C1) | Dinoflagellate | Korálový symbiont | 1,19 GB | 35,913 | Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / University of Queensland | 2018[3] | Návrh | REFUGe 2020[4] |
| Cladocopium C92 kmen Y103 (Symbiodinium sp. clade C; předpokládaný typ C92) | Dinoflagellate | Foraminiferan symbiont | Neznámé (velikost sestavy 0,70 Gb) | 65,832 | Okinawa Institute of Science and Technology | 2018[5] | Návrh | OIST Marine Genomics[2] |
| Fugacium kawagutii CS156 = CCMP2468 (Symbiodinium kawagutii; clade F1) | Dinoflagellate | Korálový symbiont? | 1,07 GB | 26,609 | Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / University of Queensland | 2018[3] | Návrh | REFUGe 2020[4] |
| Fugacium kawagutii CCMP2468 (Symbiodinium kawagutii; clade F1) | Dinoflagellate | Korálový symbiont? | 1,18 GB | 36,850 | University of Connecticut / Xiamen University | 2015[6] | Návrh | S. kawagutii genomový projekt[7] |
| Polarella glacialis CCMP1383 | Dinoflagellate | Psychrofil, Antarktida | 3,02 Gb (diploidní), 1,48 Gbp (haploidní) | 58,232 | University of Queensland | 2020[8] | Návrh | UQ eSpace[9] |
| Polarella glacialis CCMP2088 | Dinoflagellate | Psychrofil, Arktida | 2,65 Gb (diploidní), 1,30 Gbp (haploidní) | 51,713 | University of Queensland | 2020[8] | Návrh | UQ eSpace[9] |
| Symbiodinium microadriaticum (klade A) | Dinoflagellate | Korálový symbiont | 1,1 GB | 49,109 | Univerzita vědy a technologie krále Abdulláha | 2016[10] | Návrh | Reef Genomics[11] |
| Symbiodinium A3 kmen Y106 (Symbiodinium sp. klade A3) | Dinoflagellate | symbiont | Neznámé (velikost sestavy 0,77 Gb) | 69,018 | Okinawa Institute of Science and Technology | 2018[5] | Návrh | OIST Marine Genomics[2] |
Kryptomonad
| Organismus kmen | Typ | Relevantnost | Velikost genomu | Číslo genů předpovídal | Organizace | Rok dokončení | Shromáždění postavení | Odkazy |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cryptophyceae sp. CCMP2293 | Nanoflagelát | Nucleomorph, Psychrofil | 534,5 Mb | 33,051 | Společný genomový institut | 2016[12] | Portál genomu JGI[13] | |
| Guillardia theta | Eukaryote Endosymbióza | 87,2 Mb | 24, 840 | Dalhousie University | 2012[14] | Skleník[15] |
Glaukofyt
| Organismus kmen | Typ | Relevantnost | Genom velikost | Číslo genů předpovídal | Organizace | Rok dokončení | Shromáždění postavení | Odkazy |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cyanophora | Modelka Organismus | 70,2 Mb | 3,900 | Rutgersova univerzita | 2012[16] | Koncept v1 | Skleník[15] Projekt genomu cyanophora[17] | |
| Cyanophora | Modelka Organismus | 99,94 Mb | 25,831 | Rutgersova univerzita | 2019[18] | Koncept v2 | Projekt genomu cyanophora[19] |
Zelené řasy
| Organismus kmen | Typ | Relevantnost | Genom velikost | Číslo genů předpovídal | Organizace | Rok dokončení | Shromáždění postavení | Odkazy |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Asterochloris sp. Cgr / DA1pho | Fotobiont | 55,8 Mb | 10,025 | Duke University | 2011[20] | Portál genomu JGI[13] | ||
| Auxenochlorella protothecoides | Biopaliva | 22,9 Mb | 7,039 | Univerzita Tsinghua | 2014[21] | Skleník[15] | ||
| Bathycoccus prasinos | Srovnávací analýza | 15,1 Mb | 7,900 | Společný genomový institut | 2012[22] | Portál genomu JGI[13] | ||
| Chlamydomonas reinhardtii CC-503 cw92 mt + | Modelový organismus | 111,1 Mb | 17,741 | Společný genomový institut | 2017[23] | Fytozom[24] Skleník[15] | ||
| Chlorella sorokiniana str. 1228 | Biopaliva | 61,4 Mb | Národní laboratoř Los Alamos | 2018[25] | Skleník[15] | |||
| Chlorella sorokiniana UTEX 1230 | Biopaliva | 58,5 Mb | Národní laboratoř Los Alamos | 2018[26] | Skleník[15] | |||
| Chlorella sorokiniana DOE1412 | Biopaliva | 57,8 Mb | Národní laboratoř Los Alamos | 2018[27] | Skleník[15] | |||
| Chlorella variabilis NC64A | Biopaliva | 46,2 Mb | 9,791 | 2010[28] | Skleník[15] | |||
| Chlorella vulgaris | Biopaliva | 37,3 Mb | Národní obnovitelné zdroje | 2015[29] | Skleník[15] | |||
| Coccomyxa subellipsoidea sp. C-169 | Biopaliva | 48,8 Mb | 9839 | Společný genomový institut | 2012[30] | Fytozom[24] Skleník[15] | ||
| Dunaliella salina CCAP19 / 18 | Halofil Biopaliva Beta-karoten a glycerol Výroba | 343,7 Mb | 16,697 | Společný genomový institut | 2017[31] | Fytozom[24] | ||
| Eudorina sp. | Mnohobuněčná řasa, modelový organismus | ~ 180 Mb | Tokijská univerzita | 2018[32] | ||||
| Micromonas commoda NOUM17 (RCC288) | Marine fytoplankton | 21,0 Mb | 10,262 | Monterey Bay Aquarium Research Institute | 2013[33][34] | Portál genomu JGI[13] | ||
| Micromonas pusilla CCMP-1545 | Marine | 21,9 Mb | 10,575 | Micromonas Genom Konsorcium | 2009[35] | Fytozom[24] Skleník[15] | ||
| Micromonas RCC299 / NOUM17 | Marine | 20,9 Mb | 10,056 | Společný genom | 2009[35] | Fytozom[24] The Skleník[15] | ||
| Monoraphidium | Biopaliva | 69,7 Mb | 16,755 | Bielefeld | 2013[36] | The Skleník[15] | ||
| Ostreococcus CCE9901 | Malý genom | 13,2 Mb | 7,603 | Společný genomový institut | 2007[37] | Fytozom[24] | ||
| Ostreococcus tauri OTH95 | Malý genom | 12,9 Mb | 7,699 | CNRS | 2014[38] | Skleník[15] | ||
| Ostreococcus sp. RCC809 | Malý genom | 13,3 Mb | 7,492 | Společný genom | 2009[39] | JGI[40] | ||
| Picochlorum DOE101 | Biopaliva | 15,2 Mb | 7,844 | Los Alamos | 2017[41] | Skleník[15] | ||
| Picochlorum SENEW3 | Biopaliva | 13,5 Mb | 7,367 | Rutgersova univerzita | 2014[42] | Skleník[15] | ||
| Scenedesmus šikmý DOE0152Z | Biopaliva | 210,3 Mb | Brooklyn College | 2017[43] | Skleník[15] | |||
| Symbiochloris reticulata (Metagenom) | Fotobiont | 58,6 Mb | 12,720 | Společný genomový institut | 2018[44] | Portál genomu JGI[13] | ||
| Tetraselmis sp. | Biopaliva | 228 Mb | Los Alamos | 2018[15] | Skleník[15] | |||
| Volvox carteri | Mnohobuněčná řasa, modelový organismus | 131,2 Mb | 14,247 | Společný genom | 2010[45] | Fytozom[24] The Skleník[15] | ||
| Yamagishiella unicocca | Mnohobuněčná řasa, modelový organismus | ~ 140 Mb | Tokijská univerzita | 2018[32] |
Haptophyte
| Organismus kmen | Typ | Relevantnost | Genom velikost | Číslo genů předpovídal | Organizace | Rok dokončení | Shromáždění postavení | Odkazy |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chrysochromulina | Biopaliva | 65,8 Mb | Národní laboratoř Los Alamos | 2018[46] | Skleník[15] | |||
| Chrysochromulina tobinii CCMP291 | Modelový organismus, biopaliva | 59,1 Mb | 16,765 | University of Washington | 2015[47] | Skleník[15] | ||
| Emiliania huxleyi | Coccolithophore | Produkce alkenonu, řasy kvete | 167,7 Mb | 38,554 | Společný genomový institut | 2013[48] | Skleník[15] | |
| Pavlovales sp. CCMP2436 | Psychrofil | 165,4 Mb | 26,034 | Společný genomový institut | 2016[49] | Portál genomu JGI[13] |
Heterokonts /Stramenopiles
| Organismus kmen | Typ | Relevantnost | Genom velikost | Číslo genů předpovídal | Organizace | Rok dokončení | Shromáždění postavení | Odkazy |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aureococcus | Škodlivá řasa Květ | 50,1 Mb | 11,522 | Společný genomový institut | 2011[50] | Skleník[15] | ||
| Ectocarpus siliculosus | Hnědé řasy | Modelový organismus | 198,5 Mb | 16,269 | Genoskop | 2012[51] | Skleník[15] | |
| Fragilariopsis cylindrus CCMP1102 | Psychrofil | 61,1 Mb | 21,066 | University of East Anglia, Společný genomový institut | 2017[52] | Portál genomu JGI[13] | ||
| Nannochloropsis | Biopaliva | 28,5 Mb | 10,486 | Univerzita v Padově | 2014[53] | Skleník[15] | ||
| Nannochloropsis | Biopaliva | 31,5 Mb | Čínská akademie věd, Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology | 2016[54] | Skleník[15] | |||
| Nannochloropsis Salina CCMP1766 | Biopaliva | 24,4 Mb | Čínská akademie věd, Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology | 2016[55] | Skleník[15] | |||
| Ochromonadaceae sp. CCMP2298 | Psychrofil | 61,1 Mb | 20,195 | Společný genomový institut | 2016[56] | Portál genomu JGI[13] | ||
| Pelagophyceae sp. CCMP2097 | Psychrofil | 85,2 Mb | 19,402 | Společný genomový institut | 2016[57] | Portál genomu JGI[13] | ||
| Phaeodactylum tricornutum | Modelový organismus | 27,5 Mb | 10,408 | Konsorcium Diatom | 2008[58] | Skleník[15] | ||
| Pseudo-nitzschia multiseries CLN-47 | 218,7 Mb | 19,703 | Společný genomový institut | 2011[59] | Portál genomu JGI[13] | |||
| Saccharina japonica | Hnědé řasy | Komerční plodina | 543,4 Mb | Čínská akademie věd, Pekingské ústavy věd o živé přírodě | 2015[60] | Skleník[15] | ||
| Thalassiosira oceanica CCMP 1005 | Modelový organismus | 92,2 Mb | 34,642 | Budoucí oceán | 2012[61] | Skleník[15] | ||
| Thalassiosira pseudonana | modelový organismus | 32,4 Mb | 11,673 | Konsorcium Diatom | 2009[62] | Skleník[15] |
Červené řasy (rudofyt)
| Organismus kmen | Typ | Relevantnost | Genom velikost | Číslo genů předpovídal | Organizace | Rok dokončení | Shromáždění postavení | Odkazy |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chondrus crispus | Karagenan produkce, modelový organismus | 105 Mb | 9,606 | Genoskop | 2013 | Skleník[15] | ||
| Kyanidioschyzon merolae 10D | Modelka organismus | 16,5 Mb | 4,775 | Národní institut genetiky, Japonsko | 2007[63] | Skleník[15] | ||
| Galdieria sulphuraria | Extremophile | 12,1 Mb | University of York | 2016[64] | Skleník[15] | |||
| Gracilariopsis chorda | Mezofil | 92,1 Mb | 10,806 | Univerzita Sungkyunkwan | 2018[65] | |||
| Porphyridium purpureum | Mezofil | 19,7 Mb | 8,355 | Rutgersova univerzita | 2013[66] | |||
| Porphyra umbilicalis | Marikultura | 87,6 Mb | 13,360 | University of Maine | 2017[67] | Fytozom[24] | ||
| Pyropia yezoensis | Marikultura | 43,5 Mb | 10,327 | Národní výzkumný ústav pro rybářské vědy | 2013[68] |
Rhizaria
| Organismus kmen | Typ | Relevantnost | Genom velikost | Číslo genů předpovídal | Organizace | Rok dokončení | Shromáždění postavení | Odkazy |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Bigelowiella natans | Modelový organismus | 94. Mb | 21,708 | Dalhousie University | 2012[14] | Skleník[15] |
Reference
- ^ Shoguchi E, Shinzato C, Kawashima T, Gyoja F, Mungpakdee S, Koyanagi R a kol. (2013). "Návrh shromáždění Symbiodinium minutum jaderný genom odhaluje genovou strukturu dinoflagelátu ". Aktuální biologie. 25 (15): 1399–1408. doi:10.1016 / j.cub.2013.05.062. PMID 23850284.
- ^ A b C „OIST Marine Genomics“. Marinegenomics.oist.jp. Citováno 2018-08-22.
- ^ A b Liu H, Stephens TG, González-Pech RA, Beltran VH, Lapeyre B, Bongaerts P a kol. (2018). "Symbiodinium genomy odhalují adaptivní vývoj funkcí souvisejících s korálovo-dinoflagelátovou symbiózou “. Komunikační biologie. 1: 95. doi:10.1038 / s42003-018-0098-3. PMC 6123633. PMID 30271976.
- ^ A b „Datový web ReFuGe 2020“. útočiště2020.reefgenomics.org. Citováno 2018-08-22.
- ^ A b Shoguchi E, Beedessee G, Tada I, Hisata K, Kawashima T, Takeuchi T a kol. (2018). „Dva odlišné Symbiodinium genomy odhalují zachování genového klastru pro biosyntézu opalovacích krémů a nedávno ztracené geny ". BMC Genomics. 19 (1): 458. doi:10.1186 / s12864-018-4857-9. PMC 6001144. PMID 29898658.
- ^ Lin S, Cheng S, Song B, Zhong X, Lin X, Li W a kol. (2015). „The Symbiodinium kawagutii genom osvětluje expresi genu dinoflagelátu a korálovou symbiózu ". Věda. 350 (6261): 691–4. Bibcode:2015Sci ... 350..691L. doi:10.1126 / science.aad0408. PMID 26542574.
- ^ "S. kawagutii datový web ". web.malab.cn/symka_new. Citováno 2018-08-22.
- ^ A b Stephens TG, González-Pech RA, Cheng Y, Mohamed AR, Burt DW, Bhattacharya D a kol. (2020). „Genomy dinoflagelátu Polarella glacialis kódovat tandemově opakované geny pro jeden exon s adaptivními funkcemi ". Biologie BMC. 18 (1): 56. doi:10.1186 / s12915-020-00782-8. PMC 7245778. PMID 32448240.
- ^ A b Stephens, Timothy; Ragan, Mark; Bhattacharya, Debashish; Chan, Cheong Xin (2020). "Polarella datový web ". doi:10.14264 / uql.2020.222. Citovat deník vyžaduje
| deník =(Pomoc) - ^ Aranda M, Li Y, Liew YJ, Baumgarten S, Simakov O, Wilson MC a kol. (2016). „Genomy korálových dinoflagelátových symbiontů zdůrazňují evoluční adaptace vedoucí k symbiotickému životnímu stylu“. Vědecké zprávy. 6: 39734. Bibcode:2016NatSR ... 639734A. doi:10.1038 / srep39734. PMC 5177918. PMID 28004835.
- ^ „Reef Genomics Data Site“. smic.reefgenomics.org. Citováno 2018-08-22.
- ^ "Info - Cryptophyceae sp. CCMP2293 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-31.
- ^ A b C d E F G h i j "Řasy". genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-31.
- ^ A b Curtis BA, Tanifuji G, Burki F, Gruber A, Irimia M, Maruyama S, et al. (Prosinec 2012). "Řasové genomy odhalují evoluční mozaicismus a osud nukleomorfů". Příroda. 492 (7427): 59–65. Bibcode:2012Natur.492 ... 59C. doi:10.1038 / příroda11681. PMID 23201678.
- ^ A b C d E F G h i j k l m n Ó p q r s t u proti w X y z aa ab ac inzerát ae af ag ah ai aj "Domů | Skleník". skleník.lanl.gov. Citováno 2018-07-11.
- ^ Cena DC, Chan CX, Yoon HS, Yang EC, Qiu H, Weber AP a kol. (Únor 2012). „Genom Cyanophora paradoxa objasňuje původ fotosyntézy v řasách a rostlinách“. Věda. 335 (6070): 843–7. Bibcode:2012Sci ... 335..843P. doi:10.1126 / science.1213561. PMID 22344442. S2CID 17190180.
- ^ „Cyanophora Genome Project“. cyanophora.rutgers.edu. Citováno 2018-07-12.
- ^ Cena DC, Goodenough UW, Roth R, Lee JH, Kariyawasam T, Mutwil M a kol. (Srpen 2019). "Analýza vylepšeného Cyanophora paradoxa shromáždění genomu ". Výzkum DNA. 26 (4): 289–299. doi:10.1093 / dnares / dsz009. PMC 6704402. PMID 31098614.
- ^ „Projekt Cyanophora Genome v2“. cyanophora.rutgers.edu/cyanophora_v2018. Citováno 2019-08-01.
- ^ „Info - Asterochloris sp. Cgr / DA1pho v2.0“. genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-31.
- ^ Gao C, Wang Y, Shen Y, Yan D, He X, Dai J, Wu Q (červenec 2014). „Mechanismy akumulace oleje olejové mikrořasy Chlorella protothecoides odhalené prostřednictvím jejího genomu, transkriptomů a proteomů“. BMC Genomics. 15: 582. doi:10.1186/1471-2164-15-582. PMC 4111847. PMID 25012212.
- ^ Moreau H, Verhelst B, Couloux A, Derelle E, Rombauts S, Grimsley N, et al. (Srpen 2012). "Genové funkce a struktura genomu u Bathycoccus prasinos odrážejí buněčné specializace na základně zelené linie". Genome Biology. 13 (8): R74. doi:10.1186 / gb-2012-13-8-r74. PMC 3491373. PMID 22925495.
- ^ "Phytozome". phytozome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-12.
- ^ A b C d E F G h "Phytozome". phytozome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-12.
- ^ „CSI_1228 - genom - shromáždění - NCBI“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-13.
- ^ "ASM313072v1 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-13.
- ^ "ASM311615v1 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-13.
- ^ Blanc G, Duncan G, Agarkova I, Borodovsky M, Gurnon J, Kuo A a kol. (Září 2010). „Genom Chlorella variabilis NC64A odhaluje adaptaci na fotosymbiózu, koevoluci s viry a kryptický sex“. Rostlinná buňka. 22 (9): 2943–55. doi:10.1105 / tpc.110.076406. PMC 2965543. PMID 20852019.
- ^ "ASM102112v1 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-13.
- ^ "Coccomyxa subellipsoidae v2.0 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-13.
- ^ "Dsal_v1.0 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-13.
- ^ A b Hamaji, Takashi; Kawai-Toyooka, Hiroko; Uchimura, Haruka; Suzuki, Masahiro; Noguchi, Hideki; Minakuchi, Yohei; Toyoda, Atsushi; Fujiyama, Asao; Miyagishima, Shin-ya (08.03.2018). „Anisogamie se vyvinula se sníženou oblastí určující pohlaví u volvocénních zelených řas“. Komunikační biologie. 1 (1): 17. doi:10.1038 / s42003-018-0019-5. ISSN 2399-3642. PMC 6123790. PMID 30271904.
- ^ „Info - Micromonas commoda NOUM17 (RCC 299)“. genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-31.
- ^ Worden AZ, Lee JH, Mock T, Rouzé P, Simmons MP, Aerts AL a kol. (Duben 2009). „Zelená evoluce a dynamické adaptace odhalené genomy mořských pikoeukaryotů Micromonas“. Věda. 324 (5924): 268–72. Bibcode:2009Sci ... 324..268W. doi:10.1126 / science.1167222. PMID 19359590. S2CID 206516961.
- ^ A b Worden AZ, Lee JH, Mock T, Rouzé P, Simmons MP, Aerts AL a kol. (Duben 2009). „Zelená evoluce a dynamické adaptace odhalené genomy mořských pikoeukaryotů Micromonas“. Věda. 324 (5924): 268–72. Bibcode:2009Sci ... 324..268W. doi:10.1126 / science.1167222. PMID 19359590. S2CID 206516961.
- ^ Bogen C, Al-Dilaimi A, Albersmeier A, Wichmann J, Grundmann M, Rupp O a kol. (Prosinec 2013). „Rekonstrukce metabolismu lipidů u mikrořas Monoraphidium neglectum z jejich genomové sekvence odhaluje vlastnosti vhodné pro výrobu biopaliv.“. BMC Genomics. 14: 926. doi:10.1186/1471-2164-14-926. PMC 3890519. PMID 24373495.
- ^ Palenik B, Grimwood J, Aerts A, Rouzé P, Salamov A, Putnam N a kol. (Květen 2007). „Malý eukaryot Ostreococcus poskytuje genomický pohled na paradox speciace planktonu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (18): 7705–10. Bibcode:2007PNAS..104,7705P. doi:10.1073 / pnas.0611046104. PMC 1863510. PMID 17460045.
- ^ Blanc-Mathieu R, Verhelst B, Derelle E, Rombauts S, Bouget FY, Carré I a kol. (Prosinec 2014). „Vylepšený genom modelové mořské řasy Ostreococcus tauri se odvíjí hodnocením sestav Illumina de novo“. BMC Genomics. 15 (1): 1103. doi:10.1186/1471-2164-15-1103. PMC 4378021. PMID 25494611.
- ^ "Info - Ostreococcus sp. RCC809". genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-16.
- ^ "Home - Ostreococcus sp. RCC809". genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-26.
- ^ Gonzalez-Esquer CR, Twary SN, Hovde BT, Starkenburg SR (leden 2018). „Picochlorum soloecismus“. Oznámení o genomu. 6 (4): e01498–17. doi:10.1128 / genomA.01498-17. PMC 5786678. PMID 29371352.
- ^ Foflonker F, Price DC, Qiu H, Palenik B, Wang S, Bhattacharya D (únor 2015). „Genom halotolerantní zelené řasy Picochlorum sp. Odhaluje strategie pro prosperitu za kolísajících podmínek prostředí“. Mikrobiologie prostředí. 17 (2): 412–26. doi:10.1111/1462-2920.12541. PMID 24965277. S2CID 23615707.
- ^ Starkenburg SR, Polle JE, Hovde B, Daligault HE, Davenport KW, Huang A a kol. (Srpen 2017). "Scenedesmus obliquus Strain DOE0152z". Oznámení o genomu. 5 (32). doi:10.1128 / genomA.00617-17. PMC 5552973. PMID 28798164.
- ^ "Informace - Symbiochloris reticulata Africa extrahuje metagenom v1.0". genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-31.
- ^ Prochnik SE, Umen J, Nedelcu AM, Hallmann A, Miller SM, Nishii I a kol. (Červenec 2010). „Genomická analýza složitosti organismu u mnohobuněčné zelené řasy Volvox carteri“. Věda. 329 (5988): 223–6. Bibcode:2010Sci ... 329..223P. doi:10.1126 / science.1188800. PMC 2993248. PMID 20616280.
- ^ "ASM288719v1 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-11.
- ^ „Ctobinv2 - genom - shromáždění - NCBI“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-27.
- ^ Přečtěte si BA, Kegel J, Klute MJ, Kuo A, Lefebvre SC, Maumus F a kol. (Červenec 2013). „Pan genom fytoplanktonu Emiliania podporuje jeho globální distribuci“. Příroda. 499 (7457): 209–13. Bibcode:2013Natur.499..209.. doi:10.1038 / příroda12221. PMID 23760476.
- ^ „Info - Pavlovales sp. CCMP2436 v1.0“. genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-07-31.
- ^ Gobler CJ, Berry DL, Dyhrman ST, Wilhelm SW, Salamov A, Lobanov AV a kol. (Březen 2011). „Niche škodlivých řas Aureococcus anophagefferens odhalen prostřednictvím ekogenomiky“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 108 (11): 4352–7. Bibcode:2011PNAS..108.4352G. doi:10.1073 / pnas.1016106108. PMC 3060233. PMID 21368207.
- ^ "ASM31002v1 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-11.
- ^ Mock T, Otillar RP, Strauss J, McMullan M, Paajanen P, Schmutz J a kol. (Leden 2017). "Evoluční genomika studeného adaptovaného rozsivky Fragilariopsis cylindrus". Příroda. 541 (7638): 536–540. Bibcode:2017Natur.541..536M. doi:10.1038 / příroda20803. hdl:10754/622831. PMID 28092920.
- ^ Corteggiani Carpinelli E, Telatin A, Vitulo N, Forcato C, D'Angelo M, Schiavon R a kol. (Únor 2014). „Shromažďování genomu v měřítku chromosomu a profilování transkriptomu Nannochloropsis gaditana při vyčerpání dusíku“. Molekulární rostlina. 7 (2): 323–35. doi:10,1093 / mp / sst120. PMID 23966634.
- ^ "ASM187094v1 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-26.
- ^ "ASM161424v1 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-26.
- ^ "Info - Ochromonadaceae sp. CCMP2298 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-08-02.
- ^ "Info - Pelagophyceae sp. CCMP2097 v1.0". genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-08-02.
- ^ „Phaeodactylum tricornutum (ID 418) - Genome - NCBI“. www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-26.
- ^ „Info - Pseudo-nitzschia multiseries CLN-47“. genome.jgi.doe.gov. Citováno 2018-08-02.
- ^ "SJ6.1 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-27.
- ^ Jiang Z, Liu S, Wu Y, Jiang X, Zhou K (2017). „Čínská rozmanitost savců (2. vydání)“. Věda o biologické rozmanitosti. 25 (8): 886–895. doi:10.17520 / biods.2017098.
- ^ "ASM14940v2 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-27.
- ^ Nozaki H, Takano H, Misumi O, Terasawa K, Matsuzaki M, Maruyama S a kol. (Červenec 2007). „100% úplná sekvence odhaluje neobvykle jednoduché genomické rysy zřídelní červené řasy Cyanidioschyzon merolae“. Biologie BMC. 5: 28. doi:10.1186/1741-7007-5-28. PMC 1955436. PMID 17623057.
- ^ "ASM170485v1 - genom - shromáždění - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2018-07-30.
- ^ Lee J, Yang EC, Graf L, Yang JH, Qiu H, Zelzion U a kol. (2018-04-23). „Analýza návrhu genomu červených mořských řas Gracilariopsis chorda poskytuje pohled na vývoj velikosti genomu v Rhodophyta ". Molekulární biologie a evoluce. 35 (8): 1869–1886. doi:10.1093 / molbev / msy081. PMID 29688518.
- ^ Bhattacharya D, Price DC, Chan CX, Qiu H, Rose N, Ball S a kol. (2013-06-17). "Genom červené řasy Porphyridium purpureum". Příroda komunikace. 4 (1): 1941. Bibcode:2013NatCo ... 4.1941B. doi:10.1038 / ncomms2931. PMC 3709513. PMID 23770768.
- ^ Brawley SH, Blouin NA, Ficko-Blean E, Wheeler GL, Lohr M, Goodson HV a kol. (Srpen 2017). "Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta)". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 114 (31): E6361 – E6370. doi:10.1073 / pnas.1703088114. PMC 5547612. PMID 28716924.
- ^ Nakamura Y, Sasaki N, Kobayashi M, Ojima N, Yasuike M, Shigenobu Y a kol. (2013-03-11). „První sekvence genomu mořské červené řasy bez symbiontu, Susabi-nori (Pyropia yezoensis)“. PLOS ONE. 8 (3): e57122. Bibcode:2013PLoSO ... 857122N. doi:10.1371 / journal.pone.0057122. PMC 3594237. PMID 23536760.