Phaeodactylum tricornutum - Phaeodactylum tricornutum

Phaeodactylum tricornutum
Phaeodactylum tricornutum.png
Vědecká klasifikace
(bez hodnocení):
SAR
Nadkmen:
Heterokonta
Třída:
Bacillariophyceae
Objednat:
Bacillariales
Podřád:
Phaeodactylineae
Rodina:
Phaeodactylaceae
Rod:
Phaeodactylum
Druh:
P. tricornutum
Binomické jméno
Phaeodactylum tricornutum
Bohlin, 1897

Phaeodactylum tricornutum je rozsivka. Je to jediný druh rodu Phaeodactylum. Na rozdíl od jiných rozsivek P. tricornutum mohou existovat v různých morfotypech (fusiform, triradiate a oval) a změny ve tvaru buněk mohou být stimulovány podmínkami prostředí.[1] Tuto vlastnost lze použít k prozkoumání molekulárního základu kontroly tvaru buněk a morfogeneze. Na rozdíl od většiny rozsivek P. tricornutum může růst v nepřítomnosti křemíku a může přežít bez vytváření silicifikovaných frustulí. To poskytuje příležitosti pro experimentální průzkum nanofabrikace na bázi křemíku v rozsivkách.

Další zvláštností je, že při asexuální reprodukci frustule Nezdá se, že by se zmenšily. To umožňuje kontinuální kultivaci bez potřeby sexuální reprodukce. Není známo, zda P. tricornutum se může pohlavně rozmnožovat. Doposud nebyly nalezeny žádné podstatné důkazy podporující sexuální reprodukci v laboratoři nebo jiném prostředí. Ačkoli P. tricornutum lze považovat za atypické pennata rozsivka je to jeden z hlavních druhů rozsivkových modelů. Byl zaveden transformační protokol a jsou k dispozici vektory RNAi.[2][3] Díky tomu jsou molekulárně genetické studie mnohem jednodušší.

Dějiny

Originální kresby P. tricornutum Bohlin

Phaeodactylum tricornutum byl poprvé popsán v triradiate morphotype Bohlin v roce 1897.[4] Nahrávky prvních kultur z P. tricornutum byly publikovány Allenem a Nelsonem v roce 1910, ačkoli bylo nesprávně identifikováno jako Nitzschia colsterium, W. Sm., Forma miuntissima.[5] Izolát byl později správně revidován jako P. tricorntum J.C.Lewinem v roce 1958.[6] Tento kmen mimo jiné pozdější izoláty se stále udržuje v kulturních sbírkách po celém světě.[7]

Sekvenování genomu

Phaeodactylum tricornutum je jedním ze tří rozsivek, jejichž genom byl sekvenován (ostatní jsou Thalassiosira pseudonana a Fragilariopsis cylindrus ). Genom obsahuje přibližně 10% genů podobných prokaryotům, což je neobvykle velký podíl. Více než 30000 vyjádřených sekvenčních značek (EST) bylo uspořádáno do Databáze Eiat Diatom.[8]

Phaeodactylum tricornutum se ukázal jako potenciální zdroj energie pro řasy. Růstá rychle a skladovací lipidy tvoří asi 20 - 30% hmotnosti suché buňky za standardních kultivačních podmínek.[9][10] Omezení dusíkem může vyvolat akumulaci neutrálních lipidů v P. tricornutum, což naznačuje možné strategie pro zlepšení výroby bionafty z mikrořas.

Viz také

Reference

  1. ^ De Martino, A; Meichenin, A; Shi, J; Pan, KH; Bowler, C (2007). "Genetická a fenotypová charakterizace přistoupení Phaeodactylum tricornutum (Bacillariophyceae)". Journal of Phycology. 43 (5): 992–1009. doi:10.1111 / j.1529-8817.2007.00384.x.
  2. ^ Apt, K. E .; et al. (1996). „Molekulární a obecná genetika Stabilní jaderná transformace rozsivky Phaeodactylum tricornutum“. Molekulární a obecná genetika. 252 (5): 572–579. doi:10.1007 / BF02172403. PMID  8914518.
  3. ^ De Riso, V; Raniello, R .; Maumus, F .; Rogato, A .; Bowler, C .; Falciatore, A. (2009). „Umlčení genů v mořském rozsivce Phaeodactylum tricornutum“. Nucleic Acids Res. 37 (14): e96. doi:10.1093 / nar / gkp448. PMC  2724275. PMID  19487243.
  4. ^ Bohlin, von K. (1897). Zur Morphologie und Biologie einzelliger Algen. p. 520.
  5. ^ Allen, E. J .; Nelson, E.W. (1910). O umělé kultuře organismů mořského planktonu. str. 421–74.
  6. ^ Lewin, J.C. (1958). "Taxonomické postavení Phaeodactylum tricornutum". J. Gen. Microb. (18): 427–32.
  7. ^ De Martino, Alessandra; Meichenin, Agnes; Shi, Juan; Pan, Kehou; Bowler, Chris. "Genetická a fenotypová charakterizace přistoupení Phaeodactylum tricornutum (Bacillariophyceae)". Journal of Phycology (43): 992–1009.
  8. ^ Maheswari, U. a kol. 2005. Databáze Diatom EST. Výzkum nukleových kyselin 33: D344-D347.
  9. ^ Chisti, Y (květen - červen 2007). "Bionafta z mikrořas". Biotechnologické pokroky. 25 (3): 294–306. doi:10.1016 / j.biotechadv.2007.02.001. PMID  17350212.
  10. ^ Yang, ZK; Niu, YF; Ma, YH; Xue, J; Zhang, MH; Yang, WD; Liu, JS; Lu, SH; Guan, Y; Li, HY (4. května 2013). "Molekulární a buněčné mechanismy akumulace neutrálních lipidů v rozsivce po deprivaci dusíku". Biotechnologie pro biopaliva. 6 (1): 67. doi:10.1186/1754-6834-6-67. PMC  3662598. PMID  23642220.

externí odkazy