Fibronektin typu II - Fibronectin type II domain

Fibronektin typu II
1h8p opm.png
Kolagen vázající doména typu II semenného plazmatického proteinu PDC-109.[1]
Identifikátory
Symbolfn2
PfamPF00040
InterProIPR000562
CHYTRÝSM00059
STRÁNKAPDOC00022
SCOP21ks / Rozsah / SUPFAM
OPM nadčeleď115
OPM protein1h8p
CDDcd00062

Fibronektin typu II je kolagen -vazba proteinová doména.

Fibronektin je více domén glykoprotein, nacházející se v rozpustné formě v plazmě, a v nerozpustné formě ve volné formě pojivová tkáň a bazální membrány, který váže buněčné povrchy a různé sloučeniny včetně kolagen, fibrin, heparin, DNA, a aktin. Fibronektiny se účastní řady důležitých funkcí, např. hojení ran; buněčná adheze; srážení krve; diferenciace buněk a migrace; údržba buňky cytoskelet; a nádor metastáza.[2] Hlavní část sekvence fibronektinu spočívá v opakování tří typů domén, které se nazývají typ I, II a III.[3]

Doména typu II je přibližně šedesát aminokyselin dlouhá,[4] obsahuje čtyři konzervované cysteiny zapojené do disulfidových vazeb a je součástí oblasti vázající kolagen fibronektinu. Domény typu II se ve fibronektinu vyskytují dvakrát. Domény typu II byly také nalezeny v řadě proteinů včetně krevní koagulační faktor XII; bovinní semenné plazmatické proteiny PDC-109 (BSP-A1 / A2) a BSP-A3;[5] na kationu nezávislý receptor manózy-6-fosfátu;[6] manosový receptor makrofágů;[7] 180 Kd sekreční fosfolipázový receptor A2;[8] Receptor DEC-205;[9] 72 Kd a 92 Kd kolagenáza typu IV (ES 3.4.24.24 );[10] a aktivátor růstového faktoru hepatocytů.[11]

Interakce domény fibronektinu typu II a lipidové dvojvrstvy

Fibronektin typu II je součástí extracelulárních částí proteinů receptoru EphA2. Doména FN2 na receptorech EphA2 nese kladně nabité složky, konkrétně K441 a R443, které přitahují a téměř výlučně váží na aniontové lipidy, jako je lipid fosfatidylglycerolu aniontové membrány.[12] K441 a R443 společně tvoří motiv vázající membránu, který umožňuje receptorům EphA2 připojit se k buněčné membráně.[12]

Lidské proteiny obsahující tuto doménu

BSPH1; ELSPBP1; F12; FN1; HGFAC; IGF2R; LY75; MMP2;MMP9; MRC1; MRC1L1; MRC2; PLA2R1; SEL1L;

Reference

  1. ^ Wah DA, Fernández-Tornero C, Sanz L, Romero A, Calvete JJ (duben 2002). „Mechanismus potahování spermií z krystalové struktury komplexu PDC-109-fosforylcholin 1,8 A“. Struktura. 10 (4): 505–14. doi:10.1016 / S0969-2126 (02) 00751-7. PMID  11937055.
  2. ^ Dean DC, Bowlus CL, Bourgeois S (1987). „Klonování a analýza promotorové oblasti genu pro lidský fibronektin“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 84 (7): 1876–1880. doi:10.1073 / pnas.84.7.1876. PMC  304544. PMID  3031656.
  3. ^ Skorstengaard K, Jensen MS, Sahl P, Petersen TE, Magnusson S (1986). "Kompletní primární struktura fibronektinu hovězí plazmy". Eur. J. Biochem. 161 (2): 441–453. doi:10.1111 / j.1432-1033.1986.tb10464.x. PMID  3780752.
  4. ^ Pankov R, Yamada KM (2002). "Fibronektin v kostce". J Cell Sci. 115 (20): 3861–3863. doi:10,1242 / jcs.00059. PMID  12244123.
  5. ^ Chretien M, Seidah NG, Manjunath P, Rochemont J, Sairam MR (1987). „Kompletní aminokyselinová sekvence BSP-A3 z hovězí semenné plazmy. Homologie s PDC-109 a s doménou fibronektinu vázající kolagen“. Biochem. J. 243 (1): 195–203. doi:10.1042 / bj2430195. PMC  1147832. PMID  3606570.
  6. ^ Kornfeld S (1992). "Struktura a funkce receptorů růstového faktoru II manózy 6-fosfátu / inzulínu". Annu. Biochem. 61 (1): 307–330. doi:10.1146 / annurev.bi.61.070192.001515. PMID  1323236.
  7. ^ Drickamer K, Taylor ME, Conary JT, Lennartz MR, Stahl PD (1990). „Primární struktura receptoru manózy obsahuje více motivů připomínajících domény rozpoznávající sacharidy“. J. Biol. Chem. 265 (21): 12156–12162. PMID  2373685.
  8. ^ Lazdunski M, Barhanin J, Lambeau G, Ancian P (1994). "Klonování a exprese membránového receptoru pro sekreční fosfolipázy A2". J. Biol. Chem. 269 (3): 1575–1578. PMID  8294398.
  9. ^ Jiang W, Swiggard WJ, Heufler C, Peng M, Mirza A, Steinman RM, Nussenzweig MC (1995). „Receptor DEC-205 exprimovaný dendritickými buňkami a buňkami epitelu brzlíku je zapojen do zpracování antigenu“. Příroda. 375 (6527): 151–155. doi:10.1038 / 375151a0. PMID  7753172. S2CID  4244472.
  10. ^ Grant GA, Collier IE, Wilhelm SM, Eisen AZ, Marmer BL, Seltzer JL, Kronberger A, Bauer EA, Goldberg GI, He CS (1988). „H-ras onkogenem transformované lidské bronchiální epiteliální buňky (TBE-1) vylučují jednu metaloproteázu schopnou degradovat kolagen bazální membrány“. J. Biol. Chem. 263 (14): 6579–6587. PMID  2834383.
  11. ^ Miyazawa K, Shimomura T, Kitamura A, Kondo J, Morimoto Y, Kitamura N (1993). "Molekulární klonování a sekvenční analýza cDNA pro lidskou serinproteázu zodpovědnou za aktivaci růstového faktoru hepatocytů. Strukturní podobnost prekurzoru proteázy s faktorem XII srážení krve". J. Biol. Chem. 268 (14): 10024–10028. PMID  7683665.
  12. ^ A b Chavent M, Seiradake E, Jones EY, Sansom MS (únor 2016). „Struktury receptoru EphA2 na membráně: role lipidových interakcí“. Struktura. 24 (2): 337–47. doi:10.1016 / j.str.2015.11.008. PMC  4744086. PMID  26724997.

externí odkazy