FASTKD3 - FASTKD3 - Wikipedia

FASTKD3
Identifikátory
Aliasy	FASTKD3, FAST kinázové domény 3
Externí ID	OMIM: 617530 MGI: 1916827 HomoloGene: 11457 Genové karty: FASTKD3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	7,869,037 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	68,592,338 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita proteinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• mitochondrie; • buněčné jádro;
Biologický proces	• fosforylace bílkovin; • buněčné dýchání; • mitochondriální komplex dýchacích řetězců IV; • regulace stability mitochondriální mRNA; • pozitivní regulace mitochondriálního překladu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	79072
	69577
	ENSG00000124279
	ENSMUSG00000021532
	Q14CZ7
	Q8BSN9
	NM_024091
	NM_027123; NM_001330423
	NP_076996
	NP_001317352; NP_081399
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující FAST kinázovou doménu 3 (FASTKD3) je a protein že u lidí je kódován FASTKD3 gen na chromozomu 5.^[5]^[6] Tento protein je součástí Fas aktivované serin / threoninkinázové domény (FASTKD) obsahující proteinovou rodinu, která je známá pro regulaci energetické rovnováhy mitochondrií při stresu.^[7]^[8]

Struktura

FASTKD3 sdílí strukturální charakteristiky rodiny FASTKD, včetně N-terminál mitochondriální doména cílení a tři C-terminál domény: dvě domény podobné FAST kinázám (FAST_1 a FAST_2) a doména vázající RNA (RAP).^[7]^[8] Mitochondriální cílová doména směruje FASTKD3 k importu do mitochondrií. I když funkce C-koncových domén nejsou známy, RAP pravděpodobně váže RNA během trans-sestřihu.^[7]

Funkce

Jako člen rodiny FASTKD se FASTKD3 lokalizuje do mitochondrií za účelem modulace jejich energetické bilance, zejména za stresových podmínek. Ačkoli je FASTKD3 všudypřítomně exprimován ve všech tkáních, objevuje se hojněji v kosterním svalu, srdečním svalu a dalších tkáních obohacených o mitochondrie. FASTKD3 bylo navrženo k regulaci produkce energie tím, že slouží jako protein lešení, který spojuje zpracování / translaci RNA a respirační složky.^[7]

Klinický význam

V současné době není FASTKD3 spojen s žádným onemocněním. (Datum: 17. září 2015)

Interakce

FASTKD3 bylo prokázáno komunikovat s:

FASTKD2;
Proteiny beta oxidační dráhy mastných kyselin (ACADVL, ECHS1, HADHA, HADHB, ACAA2 );
Aminokyselinové katabolické dráhy bílkoviny (MCCC1, MCCC2, GLUD1, HIBÁD, CPS1 );
Proteiny biosyntézy aminokyselin (PYCR1, PYCR2, ALDH18A1, SHMT2, GLS );
Proteiny cyklu TCA (IDH3A, IDH2, SUCLG2, DLST );
Proteiny dýchacího řetězce (NDUFS1, SDHA, ATP5A1, ETFA, ETFB );
Mitochondriální RNA zpracovávající proteiny (LRPPRC, DHX30, PNPT1 ); a
Mitochondriální translační proteiny (TUFM, GFM1, IARS2, MRPS22, TARS2, MRPS2, PTCD1, MTO1, MRPS31 ).^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124279 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021532 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ UniProt: Q9NYY8
^ „Entrez Gene: FAST kinase domains 2“.
^ ^A ^b ^C ^d ^E Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (říjen 2010). „Protein 3 obsahující rychlou kinázovou doménu je mitochondriální protein nezbytný pro buněčné dýchání“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 401 (3): 440–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.
^ ^A ^b Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (červen 2011). „Nový transkripční komplex, který selektivně moduluje apoptózu buněk rakoviny prsu prostřednictvím regulace FASTKD2“. Molekulární a buněčná biologie. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128 / MCB.01381-10. PMC 3133243. PMID 21444724.

Další čtení

Lai Y, Song M, Hakala K, Weintraub ST, Shiio Y (listopad 2011). „Proteomická disekce interaktomu von Hippel-Lindau (VHL)“. Journal of Proteome Research. 10 (11): 5175–82. doi:10.1021 / pr200642c. PMC 3208728. PMID 21942715.
Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (říjen 2010). „Protein 3 obsahující rychlou kinázovou doménu je mitochondriální protein nezbytný pro buněčné dýchání“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 401 (3): 440–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124279 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021532 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[uniprot-5] UniProt: Q9NYY8

[entrez-6] „Entrez Gene: FAST kinase domains 2“.

[pmid20869947-7] A ^b ^C ^d ^E Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (říjen 2010). „Protein 3 obsahující rychlou kinázovou doménu je mitochondriální protein nezbytný pro buněčné dýchání“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 401 (3): 440–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.

[pmid21444724-8] A ^b Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (červen 2011). „Nový transkripční komplex, který selektivně moduluje apoptózu buněk rakoviny prsu prostřednictvím regulace FASTKD2“. Molekulární a buněčná biologie. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128 / MCB.01381-10. PMC 3133243. PMID 21444724.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]