ECHS1 - ECHS1

ECHS1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2HW5
Identifikátory
Aliasy	ECHS1, SCEH, ECHS1D, enoyl-CoA hydratáza, krátký řetězec, 1, mitochondriální, enoyl-CoA hydratáza, krátký řetězec 1
Externí ID	OMIM: 602292 MGI: 2136460 HomoloGene: 3018 Genové karty: ECHS1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	133,373,354 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	140,116,476 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • katalytická aktivita; • aktivita lyázy; • aktivita enoyl-CoA hydratázy;
Buněčná složka	• mitochondriální matice; • mitochondrie;
Biologický proces	• metabolismus; • metabolický proces mastných kyselin; • metabolismus lipidů; • beta-oxidace mastných kyselin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1892
	93747
	ENSG00000127884
	ENSMUSG00000025465
	P30084
	Q8BH95
	NM_004092
	NM_053119
	NP_004083
	NP_444349
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Enoyl koenzym A hydratáza, krátký řetězec, 1, mitochondriální, také známý jako ECHS1, je člověk gen.^[5]

Protein kódovaný tímto genem funguje ve druhém kroku beta-oxidační dráhy mitochondriální mastné kyseliny. Katalyzuje hydrataci meziproduktů 2-trans-enoyl-koenzymu A (CoA) na L-3-hydroxyacyl-CoAs. Genový produkt je členem nadrodiny hydratázy / izomerázy. Lokalizuje se do mitochondriální matice. Varianty transkriptu využívající alternativní místa zahájení transkripce byly popsány v literatuře.^[5]

Struktura

Gen ECHS1 má délku přibližně 11 kb a skládá se z osmi exony s exony I a VIII obsahujícími 5'- a 3'-nepřekládané oblasti. Existují dvě hlavní místa zahájení transkripce, umístěná 62 a 63 bp před translačním kodonem, byla mapována analýzou extenze primeru. 5'-ohraničující oblast genu ECHS1 je bohatá na GC a obsahuje několik kopií motivu vázání SP1, ale nejsou patrné žádné typické rámečky TATA nebo CAAT. Alu repetiční prvky byly identifikovány v oblasti -1052 / -770 vzhledem k místu uzávěru a v intron 7.^[6] Předchůdce polypeptid obsahuje 290 aminokyselina zbytky s N-koncovou pre-sekvencí 29 zbytků, 5'-nepřekládanou sekvencí 21 bp a 3'-nepřekládanou sekvencí 391 bp.^[7]

Funkce

Enoyl-CoA hydratáza (ECH) katalyzuje druhý krok beta-oxidace cesta metabolismu mastných kyselin. Enzym se podílí na tvorbě p-hydroxyacyl-CoA thioester. Předpokládá se, že tyto dva zbytky katalytické kyseliny glutamové působí společně a aktivují molekulu vody, zatímco Gly-141 se navrhuje zapojit do aktivace substrátu. Existují dva silné inhibitory ECHS, které nevratně inaktivují enzym tvorbou kovalentního aduktu.^[8]

Klinický význam

Enoyl-CoA hydratáza s krátkým řetězcem byla potvrzena STAT3, takže ECHS1 specificky potlačuje aktivitu STAT3 inhibicí fosforylace STAT3.^[9] STAT3 může působit jako onkogen i jako supresor nádoru. Samotný ECHS1 se ukázal u mnoha druhů rakoviny, zejména u hypatocelulárního karcinomu (HCC) vývoj;^[10] exogenní i endogenní formy ECHS1 se vážou na HBs a ve výsledku indukují apoptózu. To znamená, že ECHS1 může být v budoucnu použit jako léčba pacientů s HBV hepatitida nebo HCC.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000127884 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025465 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ECHS1 enoyl Coenzyme A hydratase, short chain, 1, mitochondrial“.
^ Janssen, U; Davis, E. M .; Le Beau, M. M .; Stoffel, W (1997). „Gen lidského mitochondriálního enoyl-CoA hydratázy (ECHS1): Strukturální organizace a přiřazení chromozomu 10q26.2-q26.3“. Genomika. 40 (3): 470–5. doi:10.1006 / geno.1996.4597. PMID 9073515.
^ Kanazawa, M; Ach, A; Abe, H; Yamamoto, S; Satoh, Y; Takayanagi, M; Niimi, H; Mori, M; Hashimoto, T (1993). "Molekulární klonování a sekvenční analýza cDNA pro lidskou mitochondriální enoyl-CoA hydratázu s krátkým řetězcem". Enzym a bílkoviny. 47 (1): 9–13. doi:10.1159/000468650. PMID 8012501.
^ Agnihotri, G; Liu, H. W. (2003). "Enoyl-CoA hydratáza. Reakce, mechanismus a inhibice". Bioorganická a léčivá chemie. 11 (1): 9–20. doi:10.1016 / s0968-0896 (02) 00333-4. PMID 12467702.
^ Chang, Y; Wang, S. X .; Wang, Y. B .; Zhou, J; Li, W. H .; Wang, N; Fang, D. F .; Li, H. Y .; Li, A.L .; Zhang, X. M .; Zhang, W. N. (2013). "ECHS1 interaguje se STAT3 a negativně reguluje signalizaci STAT3". FEBS Dopisy. 587 (6): 607–13. doi:10.1016 / j.febslet.2013.02.005. PMID 23416296. S2CID 23233213.
^ Zhu, X. S .; Dai, Y. C .; Chen, Z. X .; Xie, J. P .; Zeng, W; Lin, Y. Y .; Tan, Q. H. (2013). „Omezení exprese proteinu ECHS1 inhibuje proliferaci buněk hepatocelulárního karcinomu potlačením aktivity Akt“. Kritické recenze v eukaryotické expresi genů. 23 (3): 275–82. doi:10.1615 / critreveukaryotgeneexpr.2013007531. PMID 23879543.
^ Xiao, C. X .; Yang, X. N .; Huang, Q. W .; Zhang, Y. Q .; Lin, B. Y .; Liu, J. J .; Liu, Y. P .; Jazag, A; Guleng, B; Ren, J. L. (2013). „ECHS1 funguje jako nová HBs Agvázající protein zvyšující apoptózu mitochondriální cestou v buňkách HepG2 ". Dopisy o rakovině. 330 (1): 67–73. doi:10.1016 / j.canlet.2012.11.030. PMID 23178449.

Další čtení

Hochstrasser DF, Frutiger S, Paquet N a kol. (1993). "Mapa lidských jaterních proteinů: referenční databáze vytvořená mikrosekvenováním a gelovým porovnáním". Elektroforéza. 13 (12): 992–1001. doi:10,1002 / elps.11501301201. PMID 1286669. S2CID 23518983.
Dawson SJ, White LA (1992). „Léčba endokarditidy Haemophilus aphrophilus ciprofloxacinem“. J. Infect. 24 (3): 317–20. doi:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Li J, Norwood DL, Mao LF, Schulz H (1991). "Mitochondriální metabolismus kyseliny valproové". Biochemie. 30 (2): 388–94. doi:10.1021 / bi00216a012. PMID 1988037.
Jackson S, Schaefer J, Middleton B, Turnbull DM (1995). „Charakterizace nového enzymu beta-oxidace lidských mastných kyselin: mitochondriální 2-enoyl-CoA hydratáza asociovaná s matricí“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 214 (1): 247–53. doi:10.1006 / bbrc.1995.2281. PMID 7669045.
Kanazawa M, Ohtake A, Abe H a kol. (1994). "Molekulární klonování a sekvenční analýza cDNA pro lidskou mitochondriální enoyl-CoA hydratázu s krátkým řetězcem". Enzym a bílkoviny. 47 (1): 9–13. doi:10.1159/000468650. PMID 8012501.
Janssen U, Davis EM, Le Beau MM, Stoffel W (1997). „Gen humánní mitochondriální enoyl-CoA hydratázy (ECHS1): strukturní organizace a přiřazení k chromozomu 10q26.2-q26.3“. Genomika. 40 (3): 470–5. doi:10.1006 / geno.1996.4597. PMID 9073515.
Hubbard MJ, McHugh NJ (2001). "Human ERp29: izolace, primární strukturní charakterizace a dvourozměrné gelové mapování". Elektroforéza. 21 (17): 3785–96. doi:10.1002 / 1522-2683 (200011) 21:17 <3785 :: AID-ELPS3785> 3.0.CO; 2-2. PMID 11271497.
Jiang LQ, Wen SJ, Wang HY, Chen LY (2003). "Screening proteinů, které interagují s calpainem v knihovně cDNA lidského srdce pomocí kvasinkového dvouhybridního systému". Hyperteny. Res. 25 (4): 647–52. doi:10,1291 / hypres.25,647. PMID 12358155.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV a kol. (2004). „Sekvence DNA a srovnávací analýza lidského chromozomu 10“. Příroda. 429 (6990): 375–81. Bibcode:2004 Natur.429..375D. doi:10.1038 / nature02462. PMID 15164054.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Bruneel A, Labas V, Mailloux A a kol. (2006). „Proteomika lidských endoteliálních buněk z pupečníkové žíly aplikovaná na apoptózu vyvolanou etoposidem“. Proteomika. 5 (15): 3876–84. doi:10.1002 / pmic.200401239. PMID 16130169. S2CID 26007149.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Takahashi M, Watari E, Shinya E a kol. (2007). „Potlačení replikace viru prostřednictvím down-modulace mitochondriální enoyl-CoA hydratázy s krátkým řetězcem v lidských buňkách glioblastomu“. Antiviral Res. 75 (2): 152–8. doi:10.1016 / j.antiviral.2007.02.002. PMID 17395278.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000127884 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025465 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: ECHS1 enoyl Coenzyme A hydratase, short chain, 1, mitochondrial“.

[6] Janssen, U; Davis, E. M .; Le Beau, M. M .; Stoffel, W (1997). „Gen lidského mitochondriálního enoyl-CoA hydratázy (ECHS1): Strukturální organizace a přiřazení chromozomu 10q26.2-q26.3“. Genomika. 40 (3): 470–5. doi:10.1006 / geno.1996.4597. PMID 9073515.

[Kanazawa-7] Kanazawa, M; Ach, A; Abe, H; Yamamoto, S; Satoh, Y; Takayanagi, M; Niimi, H; Mori, M; Hashimoto, T (1993). "Molekulární klonování a sekvenční analýza cDNA pro lidskou mitochondriální enoyl-CoA hydratázu s krátkým řetězcem". Enzym a bílkoviny. 47 (1): 9–13. doi:10.1159/000468650. PMID 8012501.

[8] Agnihotri, G; Liu, H. W. (2003). "Enoyl-CoA hydratáza. Reakce, mechanismus a inhibice". Bioorganická a léčivá chemie. 11 (1): 9–20. doi:10.1016 / s0968-0896 (02) 00333-4. PMID 12467702.

[9] Chang, Y; Wang, S. X .; Wang, Y. B .; Zhou, J; Li, W. H .; Wang, N; Fang, D. F .; Li, H. Y .; Li, A.L .; Zhang, X. M .; Zhang, W. N. (2013). "ECHS1 interaguje se STAT3 a negativně reguluje signalizaci STAT3". FEBS Dopisy. 587 (6): 607–13. doi:10.1016 / j.febslet.2013.02.005. PMID 23416296. S2CID 23233213.

[10] Zhu, X. S .; Dai, Y. C .; Chen, Z. X .; Xie, J. P .; Zeng, W; Lin, Y. Y .; Tan, Q. H. (2013). „Omezení exprese proteinu ECHS1 inhibuje proliferaci buněk hepatocelulárního karcinomu potlačením aktivity Akt“. Kritické recenze v eukaryotické expresi genů. 23 (3): 275–82. doi:10.1615 / critreveukaryotgeneexpr.2013007531. PMID 23879543.

[11] Xiao, C. X .; Yang, X. N .; Huang, Q. W .; Zhang, Y. Q .; Lin, B. Y .; Liu, J. J .; Liu, Y. P .; Jazag, A; Guleng, B; Ren, J. L. (2013). „ECHS1 funguje jako nová HBs Agvázající protein zvyšující apoptózu mitochondriální cestou v buňkách HepG2 ". Dopisy o rakovině. 330 (1): 67–73. doi:10.1016 / j.canlet.2012.11.030. PMID 23178449.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]