Dabie bandavirus - Dabie bandavirus

Dabie bandavirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Negarnaviricota
Třída:Ellioviricetes
Objednat:Bunyavirales
Rodina:Phenuiviridae
Rod:Bandavirus
Druh:
Dabie bandavirus
Synonyma[1]
  • Virus SFTS
  • SFTS flebovirus
  • Virus Dabie Mountain
  • SFTS bunyavirus
  • Huaiyangshan banyangvirus

Dabie bandavirus, také zvaný Virus SFTS, je klíště virus rodu Bandavirus v rodině Phenuiviridae, objednat Bunyavirales.[2] Klinický stav, který způsobil, je znám jako těžká horečka se syndromem trombocytopenie (SFTS).[2] SFTS je objevující se infekční onemocnění, které bylo poprvé popsáno na severovýchodě a střední Číně v roce 2009 a nyní bylo objeveno také v Japonsku, Jižní Koreji, Vietnamu a na Tchaj-wanu v roce 2015. SFTS má míru úmrtnosti 12% a až 30% některé oblasti. Hlavními klinickými příznaky SFTS jsou horečka, zvracení, průjem, selhání více orgánů, trombocytopenie (nízký počet krevních destiček), leukopenie (nízký počet bílých krvinek) a zvýšené hladiny jaterních enzymů. Další ohnisko došlo ve východní Číně na počátku poloviny roku 2020.

Dějiny

V roce 2009 izoloval Xue-jie Yu a jeho kolegové virus SFTS (SFTSV) z krve pacientů se SFTS.[2]

Genom

Genom byl sekvenován.[2] Existují tři segmenty - velký (L), střední (M) a malý (S). Bylo identifikováno pět proteinů - RNA dependentní RNA polymeráza (RdRp), glykoprotein N (Gn), glykoprotein C (Gc), jaderný protein (NP) a nestrukturální protein (NS).

L segment kóduje RNA polymerázu s 2084 aminokyselinovými zbytky.

Segment M kóduje jeden otevřený čtecí rámec kódující 1073 aminokyselinových prekurzorů glykoproteinů (Gn a Gc).

Segment S má 1746 nukleotidů ambisense RNA kódujících dva proteiny, proteiny N a NSs. Ty leží v opačných orientacích a jsou odděleny 54 nukleotidovou intergenní oblastí.[3]

Vývoj

Bylo identifikováno pět genotypů (A – E).[4] Kmeny z Čína mohly být seskupeny do všech pěti genotypů, zatímco izoláty z Jižní Korea ležely ve třech (typy A, D a E) a ty z Japonsko pouze v jednom (typ E). Zdá se, že virus pochází z Pohoří Dabie ve střední Číně mezi lety 1918 a 1995.

U bunyavirů se zdá, že to má užší vztah k Virus Uukuniemi séroskupina než skupina s horečkou písečnou.[2] Je členem sérokomplexu viru Bhanja.[5]

Životní cyklus

SFTSV je virus přenášený klíšťaty; není jasné, zda může být přenášen jinými členovci sajícími krev.[6] Může infikovat mnoho savčích hostitelů, včetně kočky, myši, ježci, lasice, Brushtail vačice a jaky. Lidé se zdají být náhodnými hostiteli a nehrají v životním cyklu SFTSV žádnou zásadní roli. Z ixodidu byl zjištěn SFTSV klíště, Haemaphysalis longicornis, Ixodes nipponensis, Amblyomma testudinarium[7] a Rhipicephalus microplus.[8] Kromě kousnutí klíštěte může být SFTSV přenášen z člověka na člověka kontaktem s krví nebo hlenem infikované osoby.[9][10]

Epidemiologie

Tento virus byl nalezen v čínských provinciích Anhui, Henane, Hubei, Jiangsu, Liaoning a Shandong. SFTS se vyskytuje ve venkovských oblastech od března do listopadu a většina případů se vyskytuje od dubna do července.

Virus byl také nalezen v Jižní Koreji, Japonsku, Vietnamu a na Tchaj-wanu.[11][12][13]

Reference

  1. ^ „Historie taxonomie ICTV: Dabie bandavirus" (html). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Citováno 6. srpna 2020.
  2. ^ A b C d E Yu XJ, Liang MF, Zhang SY, Liu Y, Li JD, Sun YL a kol. (Duben 2011). „Horečka s trombocytopenií spojená s novým bunyavirem v Číně“. N. Engl. J. Med. 364 (16): 1523–32. doi:10.1056 / NEJMoa1010095. PMC  3113718. PMID  21410387.
  3. ^ Brennan, Benjamin; Rezelj, Veronica V .; Elliott, Richard M. (15. srpna 2017). "Mapování ukončení transkripce v rámci S segmentu SFTS flebovirů usnadnilo generaci virů delečních NS". Journal of Virology. 91 (16): 1–18. doi:10.1128 / JVI.00743-17.
  4. ^ Liu JW, Zhao L, Luo LM, Liu MM, Sun Y, Su X, Yu XJ (2016). „Molekulární evoluce a prostorový přenos těžké horečky u viru trombocytopénního syndromu na základě kompletních sekvencí genomu“. PLOS ONE. 11 (3): e0151677. Bibcode:2016PLoSO..1151677L. doi:10.1371 / journal.pone.0151677. PMC  4801363. PMID  26999664.
  5. ^ Matsuno K, Weisend C, Travassos da Rosa AP, Anzick SL, Dahlstrom E, Porcella SF a kol. (Duben 2013). „Charakterizace virů séroskupiny Bhanja (Bunyaviridae): nový druh rodu Phlebovirus a jeho vztah k dalším nově vznikajícím flebovirům přenášeným klíšťaty“. J. Virol. 87 (7): 3719–28. doi:10.1128 / JVI.02845-12. PMC  3624231. PMID  23325688.
  6. ^ Luo LM, Zhao L, Wen HL, Zhang ZT, Liu JW, Fang LZ a kol. (Říjen 2015). „Haemaphysalis longicornis klíšťata jako rezervoár a vektor těžké horečky s virem trombocytopenie syndrom v Číně“. Vznikající infekce. Dis. 21 (10): 1770–6. doi:10.3201 / eid2110.150126. PMC  4593435. PMID  26402039.
  7. ^ Suh JH, Kim HC, Yun SM, Lim JW, Kim JH, Chong ST a kol. (Květen 2016). „Detekce viru SFTS u Ixodes nipponensis a Amblyomma testudinarium (Ixodida: Ixodidae) shromážděných od plazů v Korejské republice“. J. Med. Entomol. 53 (3): 584–590. doi:10.1093 / jme / tjw007. PMID  26957392.
  8. ^ Zhang YZ, Zhou DJ, Qin XC, Tian JH, Xiong Y, Wang JB a kol. (Březen 2012). „Ekologie, genetická rozmanitost a fylogeneze viru Huaiyangshan v Číně“. J. Virol. 86 (5): 2864–8. doi:10.1128 / JVI.06192-11. PMC  3302241. PMID  22190717.
  9. ^ Liu Y, Li Q, Hu W, Wu J, Wang Y, Mei L a kol. (Únor 2012). „Přenos těžké horečky z člověka na člověka s virem syndromu trombocytopenie“. Vector Borne Zoonotic Dis. 12 (2): 156–60. doi:10.1089 / vbz.2011.0758. PMID  21955213.
  10. ^ Bao CJ, Guo XL, Qi X, Hu JL, Zhou MH, Varma JK a kol. (Prosinec 2011). „Rodinná skupina infekcí nově rozpoznaným bunyavirem ve východní Číně, 2007: další důkazy o přenosu z člověka na člověka“. Clin. Infikovat. Dis. 53 (12): 1208–14. doi:10.1093 / cid / cir732. PMID  22028437.
  11. ^ Tran XC, Yun Y, Van An L, Kim SH, Thao NT, Man PK a kol. (Květen 2019). „Endemická těžká horečka se syndromem trombocytopenie, Vietnam“. Vznikající infekce. Dis. 25 (5): 1029–1031. doi:10,3201 / eid2505,181463. PMC  6478219. PMID  31002059.
  12. ^ Kim KH, Yi J, Kim G, Choi SJ, Jun KI, Kim NH a kol. (Listopad 2013). „Těžká horečka se syndromem trombocytopenie, Jižní Korea, 2012“. Vznikající infekce. Dis. 19 (11): 1892–4. doi:10.3201 / eid1911.130792. PMC  3837670. PMID  24206586.
  13. ^ Takahashi T, Maeda K, Suzuki T, Ishido A, Shigeoka T, Tominaga T a kol. (Březen 2014). „První identifikace a retrospektivní studie těžké horečky se syndromem trombocytopenie v Japonsku“. J. Infect. Dis. 209 (6): 816–27. doi:10.1093 / infdis / jit603. PMID  24231186.