Korticovirus - Corticovirus
| Korticovirus | |
|---|---|
 | |
| Sestavené kapsid vyrobený z proteinů P2 a P3.[1] | |
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Varidnaviria |
| Království: | Bamfordvirae |
| Kmen: | Preplasmiviricota |
| Objednat: | Vinavirales |
| Rodina: | Corticoviridae |
| Rod: | Korticovirus |
| Zadejte druh | |
| Virus Pseudoalteromonas PM2 | |
Korticovirus je rod viry v rodině Corticoviridae.[2] Kortikoviry jsou bakteriofágy; to znamená jejich přirozenost hostitelé jsou bakterie. Rod obsahuje dva druhy, včetně druh druhu Virus Pseudoalteromonas PM2 (také známý jako Fág Pseudoalteromonas PM2 nebo bakteriofág PM2).[2][3] Název je odvozen z latiny kůra, corticis (což znamená „kůra“ nebo „kůra“). Nicméně, proroci úzce související s PM2, jsou hojně přítomny v genomech vodních bakterií, což naznačuje, že by mohl být podceňován ekologický význam kortovirů.[4] Bakteriofág PM2 byl poprvé popsán v roce 1968 po izolaci z mořská voda odebrány vzorky z pobřeží Chile.[5]
Taxonomie
Skupina: dsDNA
- Rodina: Corticoviridae
- Rod: Corticovirus
Virologie
Virony se skládají z kola, icosahedral, neobalené kapsid o průměru 60 nm a interní lipid membrána nachází se mezi vnějším a vnitřním protein skořápka.[6] Mušle se skládají ze tří vrstev, jejichž povrch odhaluje vzor s charakteristickými rysy,[7] včetně keřovitých hrotů vyčnívajících z dvanácti vrcholy.[8]
Ikosahedrální kapsida (T = 21) je 56 nanometry (nm) v průměru a skládá se z 1200 P1 (špice) a 60 P2 (kapsidy) proteinů. Hroty vázající pentamerní receptor vyčnívají z 12 pětinásobných os. Kapsida obklopuje vnitřní lipidové jádro obsahující strukturní proteiny P3 až P10.
Genom
Genom není segmentovaný, tvoří 13% hmotnosti viru a obsahuje jedinou molekulu kruhového, nadšroubovicový, dvouvláknová DNA 10 kilogramůzákladny v délce. Genom má G + C obsah 43%.[9] Kóduje ~ 21 proteinů.
Přepis je organizován do tří operonů.
Replikace genomu probíhá prostřednictvím mechanismu klouzavého kruhu, iniciovaného virem kódovanou endonukleázou P12.
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Korticovirus | Polyhedrální | T = 21 | Neobalené | Oběžník | Monopartitní |
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne adsorpcí na povrch hostitelské buňky s následnou fúzí virové membrány s vnější membránou hostitelské buňky a následným dodáním genomu do vnitřku buňky.[10] Transkripce založená na DNA je metoda transkripce. Bakterie rodu Pseudoalteromonas sloužit jako přirozený hostitel. Corticovirus PM2 je lytický virus a na konci infekčního cyklu narušuje hostitelskou buňku pomocí jedinečného systému lýzy, který se skládá z fágem kódovaných proteinů P17 a P18 a neidentifikovaného hostitelského autolysinu.[11] Identifikace provirů podobných PM2 v bakteriálních genomech však naznačuje, že dalšími členy této rodiny mohou být mírné viry. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[3]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Korticovirus | Bakterie | Žádný | Injekce | Lyza | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
Reference
- ^ Abrescia, Nicola G.A .; Grimes, Jonathan M .; Kivelä, Hanna M .; Assenberg, Rene; Sutton, Geoff C .; Butcher, Sarah J .; Bamford, Jaana K.H .; Bamford, Dennis H .; Stuart, David I. (září 2008). „Insights into Virus Evolution and Membrane Biogenesis from the Structure of the Marine Lipid-obsahující Bacteriophage PM2“. Molekulární buňka. 31 (5): 749–761. doi:10.1016 / j.molcel.2008.06.026. PMID 18775333.
- ^ A b C "Corticoviridae". Zpráva o ICTV online (10.).
- ^ A b „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ Krupovic M, Bamford DH (2007). „Předpokládané profágy související s lytickým bezocasým mořským dsDNA fágem PM2 jsou rozšířené v genomech vodních bakterií“ (PDF). BMC Genomics. 8: 236. doi:10.1186/1471-2164-8-236. PMC 1950889. PMID 17634101.
- ^ Espejo, Romilio T .; Canelo, Eliana S. (duben 1968). "Vlastnosti bakteriofága PM2: Bakteriální virus obsahující lipidy". Virologie. 34 (4): 738–747. doi:10.1016/0042-6822(68)90094-9.
- ^ Kiveld, H. M., Kalkkinen, N. a Bamford, D. H. (2002). Bacteriophage PM2 má proteinovou kapsidu obklopující sférické lipid-proteinové jádro " J. Virol. 76, 8169-8178.
- ^ Kiveld, H. M., Männistö, R. H., Kalkkinen, N. a Bamford, D. H. (1999). Čištění a proteinové složení PM2, prvního izolovaného bakteriálního viru obsahujícího lipidy " Virologie 262, 364-374.
- ^ Harrison, S.C., Caspar, D.L., Camerini-Otero, R.D. a Franklin, R.M. (1971). Uspořádání lipidů a proteinů v bakteriofágu PM2. Nat. New Biol., 229, 197-201.
- ^ Männistö, R.H., Kivelä, H.M., Paulin, L., Bamford, D.H. a Bamford, J.K.H. (1999). Kompletní genomová sekvence PM2, prvního izolovaného bakteriálního viru obsahujícího lipidy " Virologie 262, 355-363.
- ^ Cvirkaite-Krupovic V, Krupovic M, Daugelavicius R, Bamford DH (2010). „Vstup vápníku závislý na iontu bakteriofága PM2 obsahujícího membránu do svého hostitele Pseudoalteromonas“. Virologie. 405 (1): 120–128. doi:10.1016 / j.virol.2010.05.021. PMID 20646729.
- ^ Krupovic M, Daugelavicius R, Bamford DH (2007). „Nový lyzační systém v PM2, mořském dvouřetězcovém DNA bakteriofágu obsahujícím lipidy“. Mol Microbiol. 64 (6): 1635–48. doi:10.1111 / j.1365-2958.2007.05769.x. PMID 17555443.