CSNK2B - CSNK2B

CSNK2B
Protein CSNK2B PDB 1jwh.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyCSNK2B, CK2B, CK2N, CSK2B, G5A, kasein kináza 2 beta, Ckb2, Ckb1, POBINDS
Externí IDOMIM: 115441 MGI: 88548 HomoloGene: 55572 Genové karty: CSNK2B
Umístění genu (člověk)
Chromozom 6 (lidský)
Chr.Chromozom 6 (lidský)[1]
Chromozom 6 (lidský)
Genomic location for CSNK2B
Genomic location for CSNK2B
Kapela6p21.33Start31,665,236 bp[1]
Konec31,670,343 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE CSNK2B 201390 s at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

1460

13001

Ensembl

ENSMUSG00000024387

UniProt

P67870

P67871

RefSeq (mRNA)

NM_001320
NM_001282385

NM_009975
NM_001303445
NM_001303446
NM_001303476

RefSeq (protein)

NP_001269314
NP_001311

NP_001290374
NP_001290375
NP_001290405
NP_034105

Místo (UCSC)Chr 6: 31,67 - 31,67 MbChr 17: 35,12 - 35,12 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš
Regulační podjednotka kasein kinázy II
PDB 1rqf EBI.jpg
struktura ck2 beta podjednotky krystalizovala v přítomnosti peptidu p21waf1
Identifikátory
SymbolCK_II_beta
PfamPF01214
InterProIPR000704
STRÁNKAPDOC00845
SCOP21qf8 / Rozsah / SUPFAM

Kasein kináza II podjednotka beta je protein že u lidí je kódován CSNK2B gen.[5][6]

Tento gen kóduje beta podjednotku kasein kinázy II, všudypřítomnou proteinovou kinázu, která reguluje metabolické dráhy, signální transdukci, transkripci, translaci a replikaci. Enzym se lokalizuje do endoplazmatického retikula a Golgiho aparátu.[7]

Kasein kináza, všudypřítomná, dobře konzervovaná protein kináza zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho buňka metabolismus a diferenciace, se vyznačuje svou preferencí pro Serine nebo Threonin v kyselých úsecích aminokyseliny. Enzym je a tetramer 2 alfa- a 2 beta-podjednotek.[8][9] Někteří však druh (např. savci) mají 2 příbuzné formy alfa podjednotky (alfa a alfa '), zatímco jiné (např. houby) mají 2 příbuzné beta podjednotky (beta a beta').[10] Alfa podjednotka je katalytické jednotka a obsahuje oblasti charakteristické pro serin / threoninové proteinové kinázy. Předpokládá se, že beta-podjednotka je regulační a má N-terminální auto-fosforylační místo, vnitřní kyselou doménu a potenciální vazbu kovu motiv.[10] Beta podjednotka je a vysoce konzervativní protein asi 25 kDa, který ve své střední části obsahuje motiv bohatý na cystein CX (n) C, který by se mohl podílet na vazba kov jako např zinek.[11] The savčí beta podjednotka gen promotér sdílí společné rysy s ostatními savčí proteinové kinázy a úzce souvisí s promotér regulační podjednotky cAMP-dependentní protein kinázy.[10]

Interakce

CSNK2B bylo prokázáno komunikovat s CD163,[12] CSNK2A2,[13][14][15][16] Kasein kináza 2, alfa 1,[14][15][16][17][18] FGF1,[19] TRIB3,[20] CDC34,[21] Ribozomální protein L5,[13][17][22][23] BTF3,[24] BRCA1,[25] RNF7,[17] Kináza P70-S6 1[26] a APC.[27]

Reference

  1. ^ A b C ENSG00000204435, ENSG00000232960, ENSG00000206406, ENSG00000224774, ENSG00000230700, ENSG00000224398 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000228875, ENSG00000204435, ENSG00000232900, ENSG00000232900, ENSG00000232900, ENSG00000232900, ENSG00000232900, - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024387 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Yang-Feng TL, Teitz T, Cheung MC, Kan YW, Canaani D (březen 1991). „Přiřazení genu beta-podjednotky lidské kaseinkinázy II k 6p12 ---- p21“. Genomika. 8 (4): 741–2. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90266-W. PMID  2276748.
  6. ^ Mucher G, Becker J, Knapp M, Buttner R, Moser M, Rudnik-Schoneborn S, Somlo S, Germino G, Onuchic L, Avner E, Guay-Woodford L, Zerres K (duben 1998). „Jemné mapování autosomálně recesivního lokusu polycystických ledvin (PKHD1) a genů MUT, RDS, CSNK2 beta a GSTA1 na 6p21.1-p12“. Genomika. 48 (1): 40–5. doi:10.1006 / geno.1997.5145. PMID  9503014.
  7. ^ „Entrez Gene: CSNK2B kasein kináza 2, beta polypeptid“.
  8. ^ Jakobi R, Voss H, Pyerin W (červenec 1989). "Lidský fosvitin / kasein kináza typu II. Molekulární klonování a sekvenování plné délky cDNA kódující podjednotku beta". Eur. J. Biochem. 183 (1): 227–33. doi:10.1111 / j.1432-1033.1989.tb14917.x. PMID  2666134.
  9. ^ Voss H, Wirkner U, Jakobi R, Hewitt NA, Schwager C, Zimmermann J, Ansorge W, Pyerin W (červenec 1991). "Struktura genu kódujícího podjednotku beta lidské kasein kinázy II". J. Biol. Chem. 266 (21): 13706–11. PMID  1856204.
  10. ^ A b C Bidwai AP, Reed JC, Glover CV (květen 1995). „Klonování a narušení CKB1, genu kódujícího 38-kDa beta podjednotku kasein kinázy II Saccharomyces cerevisiae (CKII). Odstranění regulačních podjednotek CKII vyvolává fenotyp citlivý na sůl“. J. Biol. Chem. 270 (18): 10395–404. doi:10.1074 / jbc.270.18.10395. PMID  7737972.
  11. ^ Reed JC, Bidwai AP, Glover CV (červenec 1994). „Klonování a narušení CKB2, genu kódujícího regulační beta-podjednotku 32 kDa kasein kinázy II Saccharomyces cerevisiae“. J. Biol. Chem. 269 (27): 18192–200. PMID  8027080.
  12. ^ Ritter, M; Buechler C; Kapinsky M; Schmitz G (duben 2001). "Interakce CD163 s regulační podjednotkou kasein kinázy II (CKII) a závislost signalizace CD163 na CKII a proteinkináze C". Eur. J. Immunol. Německo. 31 (4): 999–1009. doi:10.1002 / 1521-4141 (200104) 31: 4 <999 :: AID-IMMU999> 3.0.CO; 2-R. ISSN  0014-2980. PMID  11298324.
  13. ^ A b Lehner, Ben; Semple Jennifer I; Brown Stephanie E; Counsell Damian; Campbell R Duncan; Sanderson Christopher M (leden 2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. Spojené státy. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. ISSN  0888-7543. PMID  14667819.
  14. ^ A b Kim, MS; Lee Y T; Kim J M; Cha J Y; Bae Y S (únor 1998). "Charakterizace proteinové interakce mezi podjednotkami proteinové kinázy CKII in vivo a in vitro". Mol. Buňky. KOREA. 8 (1): 43–8. ISSN  1016-8478. PMID  9571630.
  15. ^ A b Marin, O; Meggio F; Sarno S; Pinna L A (červen 1997). „Fyzická disekce strukturních prvků odpovědných za regulační vlastnosti a mezipodjednotkové interakce proteinové kinázy CK2 beta-podjednotky“. Biochemie. SPOJENÉ STÁTY. 36 (23): 7192–8. doi:10.1021 / bi962885q. ISSN  0006-2960. PMID  9188720.
  16. ^ A b Bosc, DG; Graham K C; Saulnier R B; Zhang C; Prober D; Gietz RD; Litchfield D W (květen 2000). „Identifikace a charakterizace CKIP-1, nového proteinu obsahujícího homologní doménu pleckstrin, který interaguje s proteinkinázou CK2“. J. Biol. Chem. SPOJENÉ STÁTY. 275 (19): 14295–306. doi:10.1074 / jbc.275.19.14295. ISSN  0021-9258. PMID  10799509.
  17. ^ A b C Ahn, BH; Kim TH; Bae Y S (říjen 2001). "Mapování interakční domény proteinové kinázy CKII beta podjednotky s cílovými proteiny". Mol. Buňky. Jižní Korea). 12 (2): 158–63. ISSN  1016-8478. PMID  11710515.
  18. ^ Kusk, M; Ahmed R; Thomsen B; Bendixen C; Issinger O G; Boldyreff B (leden 1999). "Interakce podjednotky proteinkinázy CK2beta v holoenzymu a s jinými proteiny". Mol. Buňka. Biochem. HOLANDSKO. 191 (1–2): 51–8. doi:10.1023 / A: 1006840613986. ISSN  0300-8177. PMID  10094392. S2CID  257329.
  19. ^ Skjerpen, Camilla Skiple; Nilsen Trine; Wesche Jørgen; Olsnes Sjur (srpen 2002). „Vazba variant FGF-1 na protein kinázu CK2 koreluje s mitogenicitou“. EMBO J.. Anglie. 21 (15): 4058–69. doi:10.1093 / emboj / cdf402. ISSN  0261-4189. PMC  126148. PMID  12145206.
  20. ^ Zhou, Ying; Li Lu; Liu Qiongming; Xing Guichun; Kuai Xuezhang; Sun Jing; Yin Xiushan; Wang Jian; Zhang Lingqiang; He Fuchu (květen 2008). „E3 ubikvitinová ligáza SIAH1 zprostředkovává ubikvitinaci a degradaci TRB3“. Buňka. Signál. Anglie. 20 (5): 942–8. doi:10.1016 / j.cellsig.2008.01.010. ISSN  0898-6568. PMID  18276110.
  21. ^ Block, K; Boyer T G; Yew P R (listopad 2001). „Fosforylace lidského enzymu konjugujícího s ubikvitinem, CDC34, kasein kinázou 2“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 276 (44): 41049–58. doi:10,1074 / jbc.M106453200. ISSN  0021-9258. PMID  11546811.
  22. ^ Boldyreff, B; Issinger O G (únor 1997). „A-Raf kináza je novým interagujícím partnerem beta podjednotky proteinkinázy CK2“. FEBS Lett. HOLANDSKO. 403 (2): 197–9. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 00010-0. ISSN  0014-5793. PMID  9042965. S2CID  84557809.
  23. ^ Kim, J. M.; Cha J Y; Marshak D R; Bae Y S (září 1996). "Interakce beta podjednotky kasein kinázy II s ribozomálním proteinem L5". Biochem. Biophys. Res. Commun. SPOJENÉ STÁTY. 226 (1): 180–6. doi:10.1006 / bbrc.1996.1330. ISSN  0006-291X. PMID  8806611.
  24. ^ Grein, S; Pyerin W (leden 1999). „BTF3 je potenciální nový substrát proteinové kinázy CK2“. Mol. Buňka. Biochem. HOLANDSKO. 191 (1–2): 121–8. doi:10.1023 / A: 1006806226764. ISSN  0300-8177. PMID  10094400. S2CID  1057554.
  25. ^ O'Brien, Ka; Lemke S J; Cocke KS; Rao RN; Beckmann R P (červenec 1999). „Kasein kináza 2 se váže na BRCA1 a fosforyluje“. Biochem. Biophys. Res. Commun. SPOJENÉ STÁTY. 260 (3): 658–64. doi:10.1006 / bbrc.1999.0892. ISSN  0006-291X. PMID  10403822.
  26. ^ Panasyuk, Ganna; Nemazanyy Ivan; Zhyvoloup Alexander; Bretner Maria; Litchfield David W; Filonenko Valeriy; Dna Ivan T (říjen 2006). „Jaderný export S6K1 II je regulován fosforylací proteinkinázy CK2 na Ser-17“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 281 (42): 31188–201. doi:10,1074 / jbc.M602618200. ISSN  0021-9258. PMID  16895915.
  27. ^ Homma, Miwako Kato; Li Dongxia; Krebs Edwin G; Yuasa Yasuhito; Homma Yoshimi (duben 2002). „Sdružení a regulace aktivity kaseinkinázy 2 proteinem adenomatózní polypózy coli“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA Spojené státy. 99 (9): 5959–64. Bibcode:2002PNAS ... 99,5959K. doi:10.1073 / pnas.092143199. ISSN  0027-8424. PMC  122884. PMID  11972058.

externí odkazy

  • Člověk CSNK2B umístění genomu a CSNK2B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
  • PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro beta podjednotku lidské kasein kinázy II (CSNK2B)

Další čtení

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR000704