BTF3 - BTF3

BTF3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3LKX, 3 MB
Identifikátory
Aliasy	BTF3, BETA-NAC, BTF3a, BTF3b, NACB, základní transkripční faktor 3
Externí ID	OMIM: 602542 MGI: 1202875 HomoloGene: 37453 Genové karty: BTF3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	73,505,635 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	98,317,006 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • cytosol; • vznikající komplex spojený s polypeptidem; • polysomální ribozom;
Biologický proces	• transport bílkovin; • v embryonálním vývoji dělohy; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	689
	218490
	ENSG00000145741
	ENSMUSG00000021660
	P20290
	Q64152
	NM_001207; NM_001037637
	NM_001170540; NM_145455
	NP_001032726; NP_001198
	NP_001164011; NP_663430
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor BTF3 je protein že u lidí je kódován BTF3 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

Tento gen kóduje základní transkripční faktor 3. Tento protein tvoří stabilní komplex s RNA polymerázou IIB a je nezbytný pro iniciaci transkripce. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy. Tento gen má několik pseudogenů.^[8]

Interakce

BTF3 bylo prokázáno komunikovat s CSNK2B.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145741 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021660 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zheng XM, Black D, Chambon P, Egly JM (květen 1990). "Sekvenování a exprese komplementární DNA pro obecný transkripční faktor BTF3". Příroda. 344 (6266): 556–9. doi:10.1038 / 344556a0. PMID 2320128. S2CID 4227320.
^ Kanno M, Chalut C, Egly JM (září 1992). "Genomická struktura předpokládaného transkripčního faktoru BTF3". Gen. 117 (2): 219–28. doi:10.1016/0378-1119(92)90732-5. PMID 1386332.
^ Freire MA (duben 2005). „Translační iniciační faktor (iso) 4E interaguje s BTF3, beta podjednotkou rodícího se komplexu spojeného s polypeptidem“. Gen. 345 (2): 271–7. doi:10.1016 / j.gene.2004.11.030. PMID 15716105.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BTF3 basic transkripční faktor 3“.
^ Grein S, Pyerin W (leden 1999). „BTF3 je potenciální nový substrát proteinové kinázy CK2“. Mol. Buňka. Biochem. 191 (1–2): 121–8. doi:10.1023 / A: 1006806226764. PMID 10094400. S2CID 1057554.

externí odkazy

Člověk BTF3 umístění genomu a BTF3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro lidský transkripční faktor BTF3

Další čtení

Wiedmann B, Sakai H, Davis TA, Wiedmann M (1994). "Proteinový komplex potřebný pro třídění a translokaci specifickou pro signální sekvenci". Příroda. 370 (6489): 434–40. doi:10.1038 / 370434a0. PMID 8047162. S2CID 4353902.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Grein S, Pyerin W (1999). „BTF3 je potenciální nový substrát proteinové kinázy CK2“. Mol. Buňka. Biochem. 191 (1–2): 121–8. doi:10.1023 / A: 1006806226764. PMID 10094400. S2CID 1057554.
Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). "Vytvoření knihoven exprese proteinů v celém genomu pomocí náhodné aktivace genové exprese". Nat. Biotechnol. 19 (5): 440–5. doi:10.1038/88107. PMID 11329013. S2CID 25064683.
Kusumawidjaja G, Kayed H, Giese N, Bauer A, Erkan M, Giese T, Hoheise JD, Friess H, Kleeff J (2007). „Základní transkripční faktor 3 (BTF3) reguluje transkripci genů asociovaných s nádorem v buňkách rakoviny pankreatu“. Cancer Biol. Ther. 6 (3): 367–76. CiteSeerX 10.1.1.410.5257. doi:10,4161 / cbt. 6.3.3704. PMID 17312387. S2CID 9044882.
Symes AJ, Eilertsen M, Millar M, Nariculam J, Freeman A, Notara M, Feneley MR, Patel HR, Patel HR, Masters JR, Ahmed A (2013). „Kvantitativní analýza nadměrné exprese proteinů BTF3, HINT1, NDRG1 a ODC1 v tkáni lidské rakoviny prostaty“. PLOS ONE. 8 (12): e84295. doi:10.1371 / journal.pone.0084295. PMC 3874000. PMID 24386364.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000145741 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021660 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2320128-5] Zheng XM, Black D, Chambon P, Egly JM (květen 1990). "Sekvenování a exprese komplementární DNA pro obecný transkripční faktor BTF3". Příroda. 344 (6266): 556–9. doi:10.1038 / 344556a0. PMID 2320128. S2CID 4227320.

[pmid1386332-6] Kanno M, Chalut C, Egly JM (září 1992). "Genomická struktura předpokládaného transkripčního faktoru BTF3". Gen. 117 (2): 219–28. doi:10.1016/0378-1119(92)90732-5. PMID 1386332.

[pmid15716105-7] Freire MA (duben 2005). „Translační iniciační faktor (iso) 4E interaguje s BTF3, beta podjednotkou rodícího se komplexu spojeného s polypeptidem“. Gen. 345 (2): 271–7. doi:10.1016 / j.gene.2004.11.030. PMID 15716105.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: BTF3 basic transkripční faktor 3“.

[pmid10094400-9] Grein S, Pyerin W (leden 1999). „BTF3 je potenciální nový substrát proteinové kinázy CK2“. Mol. Buňka. Biochem. 191 (1–2): 121–8. doi:10.1023 / A: 1006806226764. PMID 10094400. S2CID 1057554.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]