RNF7 - RNF7

RNF7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 ECL
Identifikátory
Aliasy	RNF7, CKBBP1, ROC2, SAG, protein prstového prstu 7, rbx2
Externí ID	OMIM: 603863 MGI: 1337096 HomoloGene: 84476 Genové karty: RNF7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	141,747,560 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	96,478,675 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba iontů zinku; • vazba iontů mědi; • vazba proteinu z rodiny cullinů; • vazba kovových iontů; • Aktivita NEDD8 transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • Komplex ubikvitin ligázy Cul5-RING; • cytoplazma; • cytosol; • Komplex ubikvitin ligázy Cul2-RING; • Komplex ubikvitin ligázy Cul3-RING; • Komplex ubikvitin ligázy Cul7-RING; • komplex jaderného SCF ubikvitin ligázy; • Komplex ubikvitin ligázy Cul4-RING E3; • Cullin-RING ubikvitin ligasový komplex;
Biologický proces	• reakce na redoxní stav; • ubikvitinace bílkovin; • proteinová neddylace; • posttranslační modifikace; • SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9616
	19823
	ENSG00000114125
	ENSMUSG00000051234
	Q9UBF6
	Q9WTZ1
	NM_001201370; NM_014245; NM_183063; NM_183237
	NM_011279; NM_001311135
	NP_001188299; NP_055060; NP_899060
	NP_001298064; NP_035409
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

RING-box protein 2 je protein že u lidí je kódován RNF7 gen.^[5]^[6]^[7]

Protein kódovaný tímto genem je vysoce konzervovaný protein prstového prstu. Jedná se o základní podjednotku SKP1-cullin / CDC53-F box proteinových ubikvitinových ligáz, které jsou součástí aparátu degradace proteinů důležitého pro progresi buněčného cyklu a signální transdukci. Tento protein interaguje s kasein kinázou II (CSNK2A1 / CKII) a je jejím substrátem. Ukázalo se, že fosforylace tohoto proteinu pomocí CSNK2A1 podporuje degradaci IkappaBalpha (CHUK / IKK-alfa / IKBKA) a p27Kip1 (CDKN1B). Alternativně byly hlášeny sestřihové varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že RNF7 komunikovat s CSNK2B.^[8]

Viz také

Prst doména prsten

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000114125 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000051234 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Duan H, Wang Y, Aviram M, Swaroop M, Loo JA, Bian J, Tian Y, Mueller T, Bisgaier CL, Sun Y (duben 1999). „SAG, nový prstový protein zinku RING, který chrání buňky před apoptózou vyvolanou redoxními látkami“. Mol Cell Biol. 19 (4): 3145–55. doi:10.1128 / MCB.19.4.3145. PMC 84108. PMID 10082581.
^ Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (květen 1999). „ROC1, homolog APC11, představuje rodinu partnerů cullinu s přidruženou aktivitou ubikvitin ligázy“. Mol Cell. 3 (4): 535–41. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7. PMID 10230407.
^ ^A ^b "Entrez Gene: RNF7 protein prstového proteinu 7".
^ Ahn, BH; Kim TH; Bae Y S (říjen 2001). "Mapování interakční domény proteinové kinázy CKII beta podjednotky s cílovými proteiny". Mol. Buňky. Jižní Korea). 12 (2): 158–63. ISSN 1016-8478. PMID 11710515.

Další čtení

Tan P, Fuchs SY, Chen A a kol. (1999). „Nábor ubikvitinové ligázy ROC1-CUL1 pomocí Skp1 a HOS pro katalyzování ubikvitinace I kappa B alfa“. Mol. Buňka. 3 (4): 527–33. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80481-5. PMID 10230406.
Swaroop M, Bian J, Aviram M a kol. (1999). "Exprese, čištění a biochemická charakterizace SAG, proteinu citlivého na redox prsten". Free Radic. Biol. Med. 27 (1–2): 193–202. doi:10.1016 / S0891-5849 (99) 00078-7. PMID 10443936.
Sun Y (1999). „Změny SAG mRNA v lidských buněčných liniích rakoviny: požadavek na prstovou doménu RING pro ochranu apoptózy“. Karcinogeneze. 20 (10): 1899–903. doi:10.1093 / carcin / 20.10.1899. PMID 10506102.
Son MY, Park JW, Kim YS a kol. (1999). „Protein kináza CKII interaguje s a fosforyluje SAG protein obsahující motiv prsten-H2 prst“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 263 (3): 743–8. doi:10.1006 / bbrc.1999.1460. PMID 10512750.
Chen A, Wu K, Fuchs SY a kol. (2000). „Pro ligaci ubikvitinu je vyžadován konzervovaný prst RING-H2 ROC1“. J. Biol. Chem. 275 (20): 15432–9. doi:10,1074 / jbc.M907300199. PMID 10748083.
Swaroop M, Wang Y, Miller P a kol. (2000). „Kvasnicový homolog lidského SAG / ROC2 / Rbx2 / Hrt2 je nezbytný pro růst buněk, ale ne pro klíčivost: profilování čipů implikuje jeho roli v regulaci buněčného cyklu.“. Onkogen. 19 (24): 2855–66. doi:10.1038 / sj.onc.1203635. PMID 10851089.
Furukawa M, Zhang Y, McCarville J a kol. (2000). „C-koncová sekvence CUL1 a ROC1 jsou potřebné pro účinnou akumulaci jader, modifikaci NEDD8 a aktivitu ubikvitin ligázy CUL1“. Mol. Buňka. Biol. 20 (21): 8185–97. doi:10.1128 / MCB.20.21.8185-8197.2000. PMC 86428. PMID 11027288.
Duan H, Tsvetkov LM, Liu Y a kol. (2001). „Podpora vstupu do S-fáze a buněčného růstu při hladovění séra SAG / ROC2 / Rbx2 / Hrt2, složkou E3 ubikvitin ligázy: asociace s inhibicí akumulace p27“. Mol. Karcinogen. 30 (1): 37–46. doi:10.1002 / 1098-2744 (200101) 30: 1 <37 :: AID-MC1011> 3.0.CO; 2-7. PMID 11255262.
Swaroop M, Gosink M, Sun Y (2001). „SAG / ROC2 / Rbx2 / Hrt2, součást SCF E3 ubikvitin ligázy: genomová struktura, sestřihová varianta a dva rodinné pseudogeny“ (PDF). DNA Cell Biol. 20 (7): 425–34. doi:10.1089/104454901750361488. hdl:2027.42/63441. PMID 11506706.
Ahn BH, Kim TH, Bae YS (2002). "Mapování interakční domény proteinové kinázy CKII beta podjednotky s cílovými proteiny". Mol. Buňky. 12 (2): 158–63. PMID 11710515.
Furukawa M, Ohta T, Xiong Y (2002). "Aktivace UBC5 ubikvitin-konjugujícího enzymu prstenem RING ROC1 a sestavení aktivních ubikvitinových ligáz všemi culliny". J. Biol. Chem. 277 (18): 15758–65. doi:10,1074 / jbc.M108565200. PMID 11861641.
Kim SY, Bae YS, Park JW (2002). „Thiol-vázaná peroxidázová aktivita lidského proteinu citlivého na gen pro apoptózu (SAG)“. Free Radic. Res. 36 (1): 73–8. doi:10.1080/10715760210164. PMID 11999705. S2CID 39810540.
Kim YS, Ha KS, Kim YH, Bae YS (2003). „Motiv prstu Ring-H2 CKBBP1 / SAG je nezbytný pro interakci s proteinkinázou CKII a optimální buněčnou proliferaci“. J. Biochem. Mol. Biol. 35 (6): 629–36. doi:10,5483 / bmbrep.2002.35.6.629. PMID 12470599.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kim SY, Lee JH, Yang ES a kol. (2003). „Lidský gen citlivý na apoptózu inhibuje poškození DNA vyvolané peroxynitritem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301 (3): 671–4. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00018-4. PMID 12565832.
Kim YS, Lee JY, Son MY a kol. (2003). „Fosforylace threoninu 10 na CKBBP1 / SAG / ROC2 / Rbx2 proteinovou kinázou CKII podporuje degradaci IkappaBalpha a p27Kip1“. J. Biol. Chem. 278 (31): 28462–9. doi:10,1074 / jbc.M302584200. PMID 12748192.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

externí odkazy

RNF7 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000114125 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000051234 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10082581-5] Duan H, Wang Y, Aviram M, Swaroop M, Loo JA, Bian J, Tian Y, Mueller T, Bisgaier CL, Sun Y (duben 1999). „SAG, nový prstový protein zinku RING, který chrání buňky před apoptózou vyvolanou redoxními látkami“. Mol Cell Biol. 19 (4): 3145–55. doi:10.1128 / MCB.19.4.3145. PMC 84108. PMID 10082581.

[pmid10230407-6] Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (květen 1999). „ROC1, homolog APC11, představuje rodinu partnerů cullinu s přidruženou aktivitou ubikvitin ligázy“. Mol Cell. 3 (4): 535–41. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7. PMID 10230407.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: RNF7 protein prstového proteinu 7".

[pmid11710515-8] Ahn, BH; Kim TH; Bae Y S (říjen 2001). "Mapování interakční domény proteinové kinázy CKII beta podjednotky s cílovými proteiny". Mol. Buňky. Jižní Korea). 12 (2): 158–63. ISSN 1016-8478. PMID 11710515.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]