Alloherpesviridae - Alloherpesviridae
| Alloherpesviridae | |
|---|---|
 | |
| TEM mikrofotografie na aloherpesviru, „Pilchard herpesvirus“ | |
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Duplodnaviria |
| Království: | Heunggongvirae |
| Kmen: | Peploviricota |
| Třída: | Herviviricetes |
| Objednat: | Herpesvirales |
| Rodina: | Alloherpesviridae |
| Rody | |
Viz text | |
Alloherpesviridae je rodina virů v objednat Herpesvirales. Tato rodina zahrnuje druhy, které infikují ryby a obojživelníky. Fylogenetické studie potvrdily platnost této rodiny a naznačují, že ji lze rozdělit do dvou subtypů: jednu tvoří viry od cyprinidových a anguillidových hostitelů a druhou viry od ictaluridových, lososovitých, acipenseridových a ranidových hostitelů.[1] V současné době existuje 13 druhů v této rodině, rozdělených mezi čtyři rody. Onemocnění spojené s touto rodinou zahrnuje onemocnění sumců.[2][3]
Taxonomie
Alloherpesviridae byla založena jako rodina v roce 2005.
Rody
Rodina obsahuje následující čtyři rody:[3]
Struktura
Viry v Alloherpesviridae jsou obaleny, s ikosahedrickou a sférickou až pleomorfní geometrií a T = 16 symetrie. Průměr je kolem 150-200 nm. Genomy jsou lineární a nesegmentované, mají délku přibližně 134–248 kB. [2]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Ictalurivirus | Sférická pleomorfní | T = 16 | Obal | Oběžník | Monopartitní |
| Cyprinivirus | Sférická pleomorfní | T = 16 | Obal | Lineární | Monopartitní |
| Batrachovirus | Sférická pleomorfní | T = 16 | Obal | Lineární | Monopartitní |
| Salmonivirus | Sférická pleomorfní | T = 16 | Obal | Lineární | Monopartitní |
Životní cyklus
Virová replikace je jaderná a je lysogenní. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne připojením virových glykoproteinů k hostitelským receptorům, které zprostředkovávají endocytózu. Transkripce s templátem DNA je metoda transkripce. Ryby slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou pasivní šíření.[2]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ictalurivirus | Ryba | Žádný | Glycoprotiens | Pučící | Jádro | Jádro | Pasivní difúze |
| Cyprinivirus | Sladkovodní úhoř | Žádný | Glycoprotiens | Pučící | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
| Batrachovirus | Žáby | Žádný | Glycoprotiens | Pučící | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
| Salmonivirus | Lososovití | Žádný | Glycoprotiens | Pučící | Jádro | Jádro | Pasivní difúze |
Genomika
Bylo sekvenováno několik genomů.[4] Cyprinidové herpesviry 1, 2 a 3 (CyHV1, CyHV2 a CyHV3) způsobují onemocnění u běžných kaprů, zlatých ryb a koi. Jejich genomy mají velikost 291144, 290304 a 295146 párů bází. Celková organizace společná pro všechny tři a skládá se z jedinečné centrální oblasti lemované přímým opakováním na každém konci. V jedinečných oblastech je přítomno 137, 150 a 155 jedinečných funkčních genů kódujících proteiny: z těchto šesti, čtyř a osmi jsou duplikovány v terminální repetici. Genomy sdílejí 120 ortologních genů v převážně kolineárním uspořádání. Až 55 z těchto posledních genů je také konzervováno u druhého člena Cyprinivirus; Anguillidový herpesvirus 1. CyHV1, CyHV2 a CyHV3 mají pět, šest a pět rodin paralogních genů.
Reference
- ^ Waltzek TB, Kelley GO, Alfaro ME, Kurobe T, Davison AJ, Hedrick RP (2009). "Fylogenetické vztahy v rodině Alloherpesviridae". Dis. Aquat. Org. 84 (3): 179–94. doi:10.3354 / dao02023. PMID 19565695.
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 12. června 2015.
- ^ A b „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 9. května 2020.
- ^ Davison AJ, Kurobe T, Gatherer D, Cunningham C, Korf I, Fukuda H, Hedrick RP, Waltzek TB (2013). "Srovnávací genomika kaprových herpesvirů". J. Virol. 87 (5): 2908–22. doi:10.1128 / JVI.03206-12. PMC 3571366. PMID 23269803.
Další čtení
- Inoue, Saga, Aikawa, Kumagai, Shimada, Kawaguchi, Naruse, Morishita, Koga, Takeda (2017). „Kompletní fúze transpozonu a herpesviru vytvořila mobilní prvek Teratorn v rybách medaka“. Příroda komunikace. 8 (1): 551. doi:10.1038 / s41467-017-00527-2. PMC 5601938. PMID 28916771.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
