WH1 doména - WH1 domain

WH1 doména
Identifikátory
SymbolWH1
PfamPF00568
InterProIPR000697
CHYTRÝWH1
SCOP21 / Rozsah / SUPFAM
CDDcd01205

WH1 doména je evoluční konzervovaný proteinová doména.[1] Proto má důležitou funkci.

Funkce

WH1 domény se nacházejí na WASP proteinech, které se často účastní polymerace aktinu. WH1 je tedy důležitý pro všechny buněčné procesy zahrnující aktin, to zahrnuje buněčnou motilitu, buněčné obchodování, buněčné dělení a cytokinézu, buněčnou signalizaci a vytváření a udržování buněčných spojů a buněčného tvaru.[2]

Struktura

Terciární struktura domény WH1 domény Mena protein odhalen struktura podobnosti s pleckstrin (PH) doména. Celkově složit sestává z kompaktního paralelního beta sendviče, uzavřeného podél jedné hrany dlouhou alfa šroubovice. Velmi konzervovaný shluk tří povrchově exponovaných aromatických látek postranní řetězy tvoří rozpoznávací místo pro cíl molekuly ligandy.[3]

Interakce

Rodina proteinů WASP řídí polymeraci aktinů aktivací komplexu Arp2 / 3. WASP je vadný Wiskott – Aldrichův syndrom (WAS), přičemž u většiny pacientů se většina bodových mutací vyskytuje v N-koncové doméně WH1. Metabotropní glutamátové receptory mGluRlalfa a mGluR5 vážou protein nazývaný homer, který je homologem domény WH1.[4][5]

Proteiny rodiny WASP obsahují na svých N-zakončeních EVH1 (WH1), které vážou sekvence bohaté na prolin v proteinu interagujícím s WASP. Proteiny rodiny RanBP1 obsahují ve své N-koncové oblasti doménu WH1, která, jak se zdá, váže odlišný sekvenční motiv přítomný v C-koncové části proteinu RanGTP.[6][7]

Terciární struktura domény WH1 proteinu Mena odhalila strukturní podobnosti s doménou pleckstrinové homologie (PH). Celkový záhyb se skládá z kompaktního paralelního beta sendviče, uzavřeného podél jedné hrany dlouhou alfa-šroubovicí. Vysoce konzervativní shluk tří povrchově exponovaných aromatických postranních řetězců tvoří rozpoznávací místo pro cílové ligandy molekul.[3]

EVH1

EVH1
PDB 1mke EBI.jpg
struktura komplexu n-vosa evh1 domény a utírání
Identifikátory
SymbolEVH1
PfamPF00568
Pfam klanCL0266
InterProIPR000697
CHYTRÝWH1
SCOP21 / Rozsah / SUPFAM
CDDcd00837

Podskupina domén WH1 byla nazvána Doména EVH1 vázat polyprolinový motiv. Doména EVH1 (také známá jako WH1, RanBP1-WASPnebo povoleno / VASP homologie 1 doména) je také zachována evoluce proteinová doména. Domény EVH1 rozpoznávají a váží se na prolin bohatý motiv FPPPP s nízkou afinitou, poté se tvoří další interakce mezi sousedními zbytky.[5][8]

Doména EVH1 se nachází ve více doménách Homologické proteiny Ena / Vasp podílí se na rozmanité škále signalizace, jaderná doprava a cytoskeletální Události. Tato doména kolem 115 aminokyseliny je přítomen v druzích od droždí na savci. Mnoho proteinů obsahujících EVH1 se sdružuje s aktiny struktur a hrát roli v cytoskeletální organizace. EVH1 domén rozpoznat a svázat prolin bohatý motiv FPPPP s nízkou afinitou, poté se tvoří další interakce mezi sousedními zbytky.[8][9][10]

Příklady

Lidské geny kódující proteiny obsahující doménu WH1 (EVH1) zahrnují:

Reference

  1. ^ Symons M, Derry JM, Karlak B, Jiang S, Lemahieu V, Mccormick F, Francke U, Abo A (březen 1996). „Protein Wiskott-Aldrichova syndromu, nový efektor pro GTPázu CDC42Hs, se podílí na polymeraci aktinu“. Buňka. 84 (5): 723–34. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81050-8. PMID  8625410. S2CID  17838931.
  2. ^ Veltman DM, Insall RH (2010). „Proteiny rodiny WASP: jejich vývoj a jeho fyziologické důsledky“. Mol Biol Cell. 21 (16): 2880–93. doi:10,1091 / mbc.E10-04-0372. PMC  2921111. PMID  20573979.
  3. ^ A b Prehoda KE, Lee DJ, Lim WA (květen 1999). "Struktura aktivovaného / VASP homologie 1 komplex domény a peptidu: klíčová složka v prostorové kontrole sestavy aktinu". Buňka. 97 (4): 471–80. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80757-6. PMID  10338211. S2CID  17078939.
  4. ^ Ponting CP, Phillips C (1997). „Identifikace homeru jako homologu proteinu Wiskott-Aldrichova syndromu naznačuje vazebnou funkci receptoru pro domény WH1“. J. Mol. Med. 75 (11–12): 769–71. doi:10,1007 / s001090050166. PMID  9428607. S2CID  39958754.
  5. ^ A b Niebuhr K, Ebel F, Frank R, Reinhard M, Domann E, Carl UD, Walter U, Gertler FB, Wehland J, Chakraborty T (září 1997). „Nový motiv bohatý na prolin přítomný v ActA Listeria monocytogenes a cytoskeletálních proteinů je ligandem pro doménu EVH1, proteinový modul přítomný v rodině Ena / VASP“. EMBO J.. 16 (17): 5433–44. doi:10.1093 / emboj / 16.17.5433. PMC  1170174. PMID  9312002.
  6. ^ Callebaut I, Cossart P, Dehoux P (prosinec 1998). „Domény EVH1 / WH1 proteinů VASP a WASP patří do velké rodiny včetně Ran-vazebných domén rodiny RanBP1“. FEBS Lett. 441 (2): 181–5. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 01541-5. PMID  9883880. S2CID  8527080.
  7. ^ Beddow AL, Richards SA, Orem NR, Macara IG (duben 1995). „Doména vázající Ran / TC4 GTPázu: identifikace expresním klonováním a charakterizace konzervativního sekvenčního motivu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (8): 3328–32. doi:10.1073 / pnas.92.8.3328. PMC  42159. PMID  7724562.
  8. ^ A b Ball LJ, Jarchau T, Oschkinat H, Walter U (únor 2002). "Domény EVH1: struktura, funkce a interakce". FEBS Lett. 513 (1): 45–52. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 03291-4. PMID  11911879. S2CID  10368115.
  9. ^ Pawson T. „Doména EVH1“. Pawsonova laboratoř. Citováno 2011-06-09.
  10. ^ PDB: 1QC6​; Fedorov AA, Fedorov E, Gertler F, Almo SC (červenec 1999). „Struktura EVH1, nového modulu vázajícího ligand bohatého na prolin, zapojeného do cytoskeletální dynamiky a neurální funkce“. Nat. Struct. Biol. 6 (7): 661–5. doi:10.1038/10717. PMID  10404224. S2CID  22881412.

externí odkazy

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR000697
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR007875