HOMER2 - HOMER2

HOMER2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1I7A
Identifikátory
Aliasy	HOMER2, ACPD, CPD, HOMER-2, VESL-2, DFNA68, homer scaffolding protein 2, homer scaffold protein 2
Externí ID	OMIM: 604799 MGI: 1347354 HomoloGene: 3560 Genové karty: HOMER2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	82,986,153 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	81,707,527 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita homodimerizace proteinu; • specifické vazby na proteinovou doménu; • Aktivita lešení GKAP / Homer; • aktinová vazba; • Vazba glutamátového receptoru na G-protein; • vazba na glutamátový receptor; • aktivita heterodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • tělo neuronových buněk; • postsynaptická membrána; • dendrit; • synapse; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • membrána; • apikální část buňky; • hrot stereocilium; • buněčná projekce; • stereocilium; • buněčná membrána; • buněčné spojení; • cytosol; • glutamátergická synapse; • neuronová projekce;
Biologický proces	• Signální dráha glutamátového receptoru spojená s G-proteinem; • chemická homeostáza v tkáni; • behaviorální reakce na kokain; • regulace signální dráhy receptorového proteinu spřaženého s G-proteinem; • smyslové vnímání zvuku; • vápníkem zprostředkovaná signalizace pomocí intracelulárního zdroje vápníku; • negativní regulace produkce interleukinu-2; • negativní regulace kalcineurin-NFAT signalizační kaskády; • regulace vstupu vápníku provozovaného v obchodě; • pozitivní regulace přenosu signálu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9455
	26557
	ENSG00000103942
	ENSMUSG00000025813
	Q9NSB8
	Q9QWW1
	NM_004839; NM_199330; NM_199331; NM_199332
	NM_001164086; NM_001164087; NM_011983; NM_177029
	NP_004830; NP_955362
	NP_001157558; NP_001157559; NP_036113
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Homerův proteinový homolog 2 je protein že u lidí je kódován HOMER2 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje člena rodiny homerů dendritických proteinů. Členové této rodiny regulují metabotropní skupinu 1 glutamátový receptor funkce. Kódovaný protein může být zapojen do buněčného růstu. Pro tento gen byly identifikovány čtyři varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[7]

Interakce

HOMER2 bylo prokázáno komunikovat s RYR1.^[8]

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000103942 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025813 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tu JC, Xiao B, Yuan JP, Lanahan AA, Leoffert K, Li M, Linden DJ, Worley PF (prosinec 1998). „Homer váže nový motiv bohatý na prolin a spojuje metabotropní glutamátové receptory skupiny 1 s receptory IP3“. Neuron. 21 (4): 717–26. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80589-9. PMID 9808459.
^ Xiao B, Tu JC, Petralia RS, Yuan JP, Doan A, Breder CD, Ruggiero A, Lanahan AA, Wenthold RJ, Worley PF (prosinec 1998). „Homer reguluje asociaci metabotropních glutamátových receptorů skupiny 1 s multivalentními komplexy synaptických proteinů souvisejících s homery“. Neuron. 21 (4): 707–16. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80588-7. PMID 9808458.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HOMER2 homer homolog 2 (Drosophila)“.
^ Feng, Wei; Tu Jiancheng; Yang Tianzhong; Vernon Patty Shih; Allen Paul D; Worley Paul F; Pessah Isaac N (listopad 2002). "Homer reguluje zisk komplexu kanálu typu 1 receptoru ryanodinu". J. Biol. Chem. Spojené státy. 277 (47): 44722–30. doi:10,1074 / jbc.M207675200. ISSN 0021-9258. PMID 12223488.

Další čtení

Soloviev MM, Ciruela F, Chan WY, McIlhinney RA (2000). "Molekulární charakterizace dvou strukturně odlišných skupin lidských obydlí, generovaná rozsáhlým alternativním sestřihem". J. Mol. Biol. 295 (5): 1185–200. doi:10.1006 / jmbi.1999.3436. PMID 10653696.
Feng W, Tu J, Yang T a kol. (2003). "Homer reguluje zisk komplexu kanálu typu 1 receptoru ryanodinu". J. Biol. Chem. 277 (47): 44722–30. doi:10,1074 / jbc.M207675200. PMID 12223488.
Kim JT, Park SH, Kim SK a kol. (2003). „Potenciální role Homeru-2a při kožní vaskulární anomálii“. J. Korean Med. Sci. 17 (5): 636–40. PMC 3054924. PMID 12378015.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Shiraishi Y, Mizutani A, Mikoshiba K, Furuichi T (2003). „Shoda v dendritickém shlukování a synaptickém cílení homerových proteinů a proteinů komplexu NMDA receptorů NR2B a PSD95 během vývoje kultivovaných hipokampálních neuronů“. Mol. Buňka. Neurosci. 22 (2): 188–201. doi:10.1016 / S1044-7431 (03) 00037-X. PMID 12676529.
Rong R, Ahn JY, Huang H a kol. (2003). „PI3 kinázový enhancer - Homerův komplex spojuje mGluRI s PI3 kinázou, čímž brání neuronální apoptóze“. Nat. Neurosci. 6 (11): 1153–61. doi:10.1038 / nn1134. PMID 14528310.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ishibashi T, Ogawa S, Hashiguchi Y a kol. (2005). „Nový protein specificky interagující s Homerem 2 reguluje ubikvitin-proteazomové systémy“. J. Biochem. 137 (5): 617–23. doi:10.1093 / jb / mvi074. PMID 15944415.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Dahl JP, Kampman KM, Oslin DW a kol. (2006). „Sdružení polymorfismu v genu Homer1 se závislostí na kokainu v afroamerické populaci“. Psychiatr. Genet. 15 (4): 277–83. doi:10.1097/00041444-200512000-00010. PMID 16314758.

Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000103942 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025813 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9808459-5] Tu JC, Xiao B, Yuan JP, Lanahan AA, Leoffert K, Li M, Linden DJ, Worley PF (prosinec 1998). „Homer váže nový motiv bohatý na prolin a spojuje metabotropní glutamátové receptory skupiny 1 s receptory IP3“. Neuron. 21 (4): 717–26. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80589-9. PMID 9808459.

[pmid9808458-6] Xiao B, Tu JC, Petralia RS, Yuan JP, Doan A, Breder CD, Ruggiero A, Lanahan AA, Wenthold RJ, Worley PF (prosinec 1998). „Homer reguluje asociaci metabotropních glutamátových receptorů skupiny 1 s multivalentními komplexy synaptických proteinů souvisejících s homery“. Neuron. 21 (4): 707–16. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80588-7. PMID 9808458.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: HOMER2 homer homolog 2 (Drosophila)“.

[pmid12223488-8] Feng, Wei; Tu Jiancheng; Yang Tianzhong; Vernon Patty Shih; Allen Paul D; Worley Paul F; Pessah Isaac N (listopad 2002). "Homer reguluje zisk komplexu kanálu typu 1 receptoru ryanodinu". J. Biol. Chem. Spojené státy. 277 (47): 44722–30. doi:10,1074 / jbc.M207675200. ISSN 0021-9258. PMID 12223488.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]