Transmembránová doména transportérů ABC - Transmembrane domain of ABC transporters
| Transmembránová oblast transportéru ABC | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | ABC_membrane | ||||||||
| Pfam | PF00664 | ||||||||
| InterPro | IPR011527 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00364 | ||||||||
| SCOP2 | 1pf4 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.A.1 | ||||||||
| OPM nadčeleď | 17 | ||||||||
| OPM protein | 2hyd | ||||||||
| |||||||||
Transmembránová doména transportéru ABC je hlavní transmembrána strukturální jednotka z Transportér kazety vázající ATP bílkoviny, skládající se ze šesti alfa šroubovice které procházejí plazmatickou membránou. Mnoho členů rodiny transportérů ABC (Pfam PF00005 ) mají dva takové regiony.[1][2][3][4][5][6]
Zdá se, že tato rodina odpovídá ABC1 podle klasifikace TCDB.
Podskupiny
- Síranový ABC transportní permeátový protein 2 InterPro: IPR005667
- Fosfátový transportní systém prostupuje proteinem 2 InterPro: IPR005672
- Transportér absorpce fosfonátů InterPro: IPR005769
- Dusičnanová transportní permeáza InterPro: IPR005889
- Nosič ABC typu NifC InterPro: IPR006469
- Fosfátový ABC transportér, permeátový protein PstC InterPro: IPR011864
- Transportér ABC molybdenanu, protein permeázy InterPro: IPR011867
- Transportér ABC niklu, permeátová podjednotka NikB InterPro: IPR014156
- Transportér ABC niklu, permeátová podjednotka NikC InterPro: IPR014157
- Transportér ektoin / hydroxyektoin ABC, permeátový protein EhuD InterPro: IPR014341
- Transportér ektoin / hydroxyektoin ABC, permeátový protein EhuC InterPro: IPR014342
Lidské proteiny obsahující tuto doménu
ABCB1; ABCB10; ABCB11; ABCB4; ABCB5; ABCB6; ABCB7; ABCB8;ABCB9; ABCC1; ABCC10; ABCC11; ABCC12; ABCC13; ABCC2; ABCC3;ABCC4; ABCC5; ABCC6; ABCC8; ABCC9; CFTR; TAP1; TAP2; TAPL;
Reference
- ^ Kerr ID (2002). "Struktura a asociace domén vázajících nukleotidy vázajících kazetu na ATP". Biochim. Biophys. Acta. 1561 (1): 47–64. doi:10.1016 / s0304-4157 (01) 00008-9. PMID 11988180.
- ^ Hunt JF, Yuan YR, Martsinkevich O, Millen L, Thomas PJ, Karpowich N, Dai PL, MacVey K (2001). „Krystalové struktury vazebné kazety MJ1267 ATP odhalují účinek indukovaného uložení na aktivním místě ATPázy transportéru ABC“. Struktura. 9 (7): 571–86. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00617-7. PMID 11470432.
- ^ Hunt JF, Yuan YR, Blecker S, Martsinkevich O, Millen L, Thomas PJ (2001). „Krystalová struktura kazety vázající MJ0796ATP. Důsledky pro strukturální důsledky hydrolýzy ATP v aktivním místě transportéru ABC“. J. Biol. Chem. 276 (34): 32313–21. doi:10,1074 / jbc.M100758200. PMID 11402022.
- ^ Kim SH, Hung LW, Wang IX, Nikaido K, Liu PQ, Ames GF (1998). "Krystalová struktura podjednotky vázající ATP transportéru ABC". Příroda. 396 (6712): 703–707. Bibcode:1998 Natur.396..703H. doi:10.1038/25393. PMID 9872322. S2CID 204996524.
- ^ Welte W, Breed J, Boos W, Diederichs K, Vonrhein C, Muller C, Diez J, Greller G, Schnell C (2000). „Krystalová struktura MalK, podjednotky ATPázy transportéru ABC trehalózy / maltózy archaeona Thermococcus litoralis“. EMBO J.. 19 (22): 5951–61. doi:10.1093 / emboj / 19.22.5951. PMC 305842. PMID 11080142.
- ^ Wiley DC, Gaudet R (2001). „Struktura domény ABC ATPázy lidského TAP1, transportéru spojeného se zpracováním antigenu“. EMBO J.. 20 (17): 4964–72. doi:10.1093 / emboj / 20.17.4964. PMC 125601. PMID 11532960.
 | Tento membránový protein –Vztahující se článek je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |