Spektrin se opakuje - Spectrin repeat
Spektrin se opakuje | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() Struktura opakování spektrinu: levotočivá antiparalelní tříšneková spirálová cívka.[1] | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | Spektrin | ||||||||
Pfam | PF00435 | ||||||||
InterPro | IPR002017 | ||||||||
STRÁNKA | PDOC50083 | ||||||||
SCOP2 | 1aj3 / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd00176 | ||||||||
|
Spektrin se opakuje[2] se nacházejí v několika proteinech podílejících se na cytoskeletální struktura. Tyto zahrnují spektrin, alfa-aktinin, dystrofin a více nedávno plakin rodina. Opakování spektrinu tvoří třisvazek šroubovice. Ty odpovídají pravidlům heptad opakovat. Opakování spektrinu vede k vzniku lineárních proteinů. To však může být způsobeno zkreslením vzorku, ve kterém jsou lineární a tuhé struktury přístupnější krystalizaci. Existují však náznaky, že některé proteiny nesoucí opakování spektrinu mohou být také flexibilní. To je pravděpodobně způsobeno konkrétně vyvinutými funkčními účely.
Lidské proteiny obsahující tuto doménu
ACTN1; ACTN2; ACTN3; ACTN4; AKAP6; SYNE3; CATX-15; DMD;DRP2; DST; KALRN; MACF1; MCF2L; SPTA1; SPTAN1;SPTB; SPTBN1; SPTBN2; SPTBN4; SPTBN5; SYNE1; SYNE2;TRIO; UTRN;
Reference
- ^ Pascual J, Pfuhl M, Walther D, Saraste M, Nilges M (říjen 1997). „Struktura řešení spektrinové repetice: levák antiparalelní trojšneková spirálová cívka“. J. Mol. Biol. 273 (3): 740–51. doi:10.1006 / jmbi.1997.1344. PMID 9356261.
- ^ Harrison SC, Yan Y, Winograd E, Viel A, Cronin T, Branton D (1993). "Krystalová struktura opakujících se segmentů spektrinu". Věda. 262 (5142): 2027–2030. doi:10.1126 / science.8266097. PMID 8266097.
- Jefferson, JJ; Ciatto, C; Shapiro, L; Liem, RK (2007). „Strukturální analýza domény plakin bulózního pemfigoidního antigenu1 (BPAG1) naznačuje, že plakins jsou členy superrodiny spektrinu“. Journal of Molecular Biology. 366 (1): 244–57. doi:10.1016 / j.jmb.2006.11.036. PMC 1850962. PMID 17161423.
- Grum, VL; Li, D; MacDonald, RI; Mondragón, A (1999). "Struktury dvou opakování spektrinu naznačují modely flexibility". Buňka. 98 (4): 523–35. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81980-7. PMID 10481916. S2CID 1710820.
Další čtení
- Djinovic-Carugo K, Gautel M, Ylänne J, Young P (únor 2002). „Opakování spektrinu: strukturální platforma pro sestavy cytoskeletálních proteinů“. FEBS Lett. 513 (1): 119–23. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 03304-X. PMID 11911890. S2CID 10581541.
- Pascual J, Castresana J, Saraste M (září 1997). "Vývoj opakování spektrinu". BioEssays. 19 (9): 811–7. doi:10,1002 / bies. 950190911. PMID 9297972. S2CID 42145758.
- Al-Jassar, C; Knowles, T; Jeeves, M; Kami, K; Behr, E; Bikker, H; Overduin, M; Chidgey, M (2. července 2011). „Nelineární struktura domény Desmoplakin Plakin a účinky mutací spojených s kardiomyopatií“. Journal of Molecular Biology. 411 (5): 1049–61. doi:10.1016 / j.jmb.2011.06.047. PMID 21756917.
![]() | Tento membránový protein –Vztahující se článek je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |