Sirohydrochlorin ferochelatáza - Sirohydrochlorin ferrochelatase
| sirohydrochlorin ferochelatáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 4.99.1.4 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie, a sirohydrochlorin ferochelatáza (ES 4.99.1.4 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- sirohydrochlorin + Fe2+ siroheme + 2H+
Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou sirohydrochlorin a Fe2+, zatímco jeho dva produkty jsou sirohaem a H+.[1][2][3]
Tento enzym patří do rodiny lyázy, konkrétně třída „chytacích“ všech lyáz, které se nehodí do žádné jiné podtřídy. The systematické jméno této třídy enzymů je siroheme ferolýza (tvořící sirohydrochlorin). Enzym je také známý jako SirB a je přítomen ve všech rostlinách a bakteriích asimilujících / disimilujících dusičnany a sírany. Siroheme je kofaktorem asimilačních i disimilačních nitritových a siřičitanových reduktáz. Sirohém je syntetizován z centrální molekuly tetrapyrrolu uroporfyrinogenu III, který tvoří první bod větvení biosyntetické dráhy tetrapyrrolu, přičemž druhou větví je větev hem / chlorofyl. Silohémová větev se skládá ze tří kroků, methylace, dehydrogenace a ferochelace, přičemž poslední krok se provádí sirohydrochlorin-ferochelatázou.
Sirohydrochlorin ferochelatáza je chelatáza třídy II, tj. Nevyžaduje ATP pro svou aktivitu na rozdíl od chelatáz třídy I, jako je Mg-chelatáza. v E-coli, všechny tři kroky biosyntézy sirohemu jsou prováděny jediným multifunkčním enzymem zvaným CysG, zatímco v kvasinkách Saccharomyces cerevisiae poslední dva kroky jsou prováděny bifunkčním enzymem zvaným Met8p. CysG a Met8p sdílejí společné záhyby, ale nesouvisí se SirB a tvoří takzvanou chelatasu třídy III. SirB patří do proteinu rodiny CbiX a rostlina SirB má poloviční délku než bakteriální SirB a srovnává se svými N- a C-koncovými polovinami, což naznačuje, že delší forma se vyvinula z duplikace genu a fúze kratší formy.
Sirohydrochlorin ferochelatáza ze všeho suchozemské rostliny a jisté zelené řasy ale ne bakterie nebo jiné řasy se skládají z shluk železné síry, které mohou přepínat mezi formami [2Fe-2S] a [4Fe-4S] v závislosti na redoxním stavu buněčného prostředí. Ačkoli není jasně stanoveno, jakou roli by toto přepínání klastru mohlo hrát, předpokládá se jeho zapojení do kritické redoxní regulace biosyntézy sirohému.
Reference
- ^ Saha, Kaushik; Webb, Michael E .; Rigby, Stephen E. J .; Leech, Helen K .; Warren, Martin J .; Smith, Alison G. (2012). „Charakterizace evolučně konzervovaného shluku železo-síra sirohydrochlorin ferrochelatázy z Arabidopsis thaliana“. Biochemical Journal. 444 (2): 227–237. doi:10.1042 / BJ20111993. ISSN 0264-6021. PMID 22414210.
- ^ Warren MJ; Raux, E; Brindley, AA; Leech, HK; Wilson, KS; Hill, CP; Warren, MJ (2002). „Struktura Saccharomyces cerevisiae Met8p, bifunkční dehydrogenázy a ferrochelatázy“. EMBO J.. 21 (9): 2068–75. doi:10.1093 / emboj / 21.9.2068. PMC 125995. PMID 11980703.
- ^ Warren MJ, Raux E, Schubert HL, Escalante-Semerena JC (2002). "Biosyntéza adenosylkobalaminu (vitamin B12)". Nat. Prod. Rep. 19 (4): 390–412. doi:10.1039 / b108967f. PMID 12195810.
 | Tento enzym související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |