Rozpoznávání signálu částicové RNA - Signal recognition particle RNA - Wikipedia

RN7SL1
Identifikátory
AliasyRN7SL1, 7L1a, 7SL, RN7SL, RNSRP1, částice RNA pro rozpoznávání signálu, RNA, 7SL, cytoplazmatická 1, složka RNA částice pro rozpoznávání signálu 7SL1
Externí IDOMIM: 612177 Genové karty: RN7SL1
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

6029

n / a

Ensembl

ENSG00000276168

n / a

UniProt

n / a

n / a

RefSeq (mRNA)

n / a

n / a

RefSeq (protein)

n / a

n / a

Místo (UCSC)n / an / a
PubMed Vyhledávání[1]n / a
Wikidata
Zobrazit / upravit člověka
Sekundární struktura lidské SRP RNA. Helixy jsou očíslovány od 2 do 8. Šedé šroubovicové části jsou pojmenovány malými písmeny. Zbytky jsou očíslovány v přírůstcích po deseti. Jsou označeny 5'- a 3'-konce. Zvýrazněny jsou dva závěsy a malá (Alu) a velká (S, „specifická“) doména SRP RNA.

The signální rozpoznávací částicová RNA, (také známé jako 7SL, 6S, ffs nebo 4.5S RNA) je součástí částice pro rozpoznávání signálu (SRP) ribonukleoprotein komplex. SRP uznává signální peptid a váže se na ribozom, zastavení syntézy proteinů. SRP-receptor je protein zabudovaný do membrány, který obsahuje a transmembránový pór. Když SRP-ribozom komplex se váže na SRP-receptor„SRP uvolňuje ribozom a unáší se pryč. Ribozom obnovuje syntézu bílkovin, ale nyní se protein pohybuje přes SRP-receptor transmembránový pór.

Tímto způsobem SRP řídí pohyb bílkoviny v rámci buňka vázat se transmembránovými póry, které umožňují proteinu procházet membránou tam, kde je to potřeba. Složky RNA a bílkovin v tomto komplexu jsou vysoce konzervovaný ale liší se mezi různými království života.

Běžný SINUS rodina Alu pravděpodobně pochází z genu 7SL RNA po deleci centrální sekvence.[2]

The eukaryotický SRP se skládá z 300 nukleotidů 7S RNA a šest proteinů: SRP 72, 68, 54, 19, 14 a 9. Archaeal SRP se skládá z 7S RNA a homologů eukaryotických proteinů SRP19 a SRP54. Eukaryotické a archaální 7S RNA mají velmi podobné sekundární struktury.[3]

Ve většině bakterie, SRP sestává z molekuly RNA (4.5S) a proteinu Ffh (homolog eukaryotického proteinu SRP54). Nějaký Grampozitivní bakterie (např. Bacillus subtilis ) mají delší SRP RNA podobnou eukaryotům, která zahrnuje Alu doména.[4]

U eukaryot a archea se osm šroubovicových prvků vloží do Alu a S domény oddělené dlouhou linkerovou oblastí.[5][6] Má se za to, že Alu doména zprostředkovává retardační funkci SRP při prodloužení peptidového řetězce.[5] Univerzálně konzervovaná šroubovice, která interaguje s doménou SRP54 M, zprostředkovává rozpoznání signální sekvence.[6][7] Předpokládá se, že komplex SRP19-spirála 6 je zapojen do sestavování SRP a stabilizuje spirálu 8 pro SRP54. vazba[5] Lidé mají tři funkční geny SRP RNA, běžně pojmenované RN7SL1, RN7SL2 a RN7SL3. Zejména je známo, že lidský genom obsahuje velké množství sekvence související se SRP RNA, včetně Alu se opakuje.[4]

Objev

SRP RNA byla poprvé detekována u ptáků a myší onkogenní RNA (ocorna) virus částice.[8] Následně bylo zjištěno, že SRP RNA je stabilní složkou neinfikovaných buněk HeLa, kde je spojena s membrána a polysome zlomky.[9][10] V roce 1980 buněční biologové očistili od psí slinivka břišní 11S „protein rozpoznávající signál“ (náhodně také zkráceně „SRP“), který podporoval translokaci sekrečních proteinů přes membrána z endoplazmatické retikulum.[11] Poté bylo zjištěno, že SRP obsahoval RNA součástka.[12] Porovnání SRP RNA geny z různých druh odhalil, že šroubovice 8 SRP RNA je vysoce konzervovaný ve všech doménách život.[13] Oblasti v blízkosti 5'- a 3'konců savčí SRP RNA jsou podobné dominantní Alu rodině středních opakujících se sekvencí lidský genom.[14] Nyní se rozumí, že Alu DNA pochází ze SRP RNA excizí centrálního fragmentu specifického pro SRP RNA (S), po kterém následuje reverzní transkripce a integrace do více míst člověka chromozomy.[2] SRP RNA byly identifikovány také u některých organely, například v plastid SRP mnoha fotosyntetických organismů.[15]

Přepis a zpracování

Eukaryotické SRP RNA se přepisují DNA podle RNA polymeráza III (Pol III).[16] RNA polymeráza III také přepisuje geny na 5S ribozomální RNA, tRNA, 7SK RNA, a Spliceozomální RNA U6. The promotéři genů lidské SRP RNA zahrnuje prvky umístěné za transkripčním počátečním místem. Rostlina SRP RNA promotéři obsahovat upstream stimulační prvek (USE) a a TATA box.[Citace je zapotřebí ] Droždí Geny SRP RNA mají a TATA box a další intragenní promotorové sekvence (označované jako A- a B-bloky), které hrají roli při regulaci transkripce genu SRP Pol Pol III.[17] V bakterie, geny jsou organizovány v operony a přepsáno RNA polymeráza.[Citace je zapotřebí ] 5'-konec malé (4,5S) SRP RNA mnoha bakterií je štěpen RNáza P.[Citace je zapotřebí ] Konce Bacillus subtilis SRP RNA zpracovává RNáza III. Zatím žádná SRP RNA introny byly pozorovány.[Citace je zapotřebí ]

Funkce

Klasická funkce SRP při překladu-přemístění. Membrána odděluje cytosol z endoplazmatické retikulum. A ribozom (světle šedá s A, P a E místy) syntetizuje protein s a signální peptid (zelená) kódováno messenger RNA (označeno čarou s 5'- a 3'-konci). Podlouhlá SRP (modrá) se svými velkými (LD) a malými (SD) doménami tvoří komplex s membránovými rezidenty SRP receptor (SR). Když se SRP oddělí, protein prochází membránou kanálem nebo translocon. Signální peptid může být odstraněn pomocí signální peptid peptidáza (SP) a protein modifikovaný oligosacharyl transferáza (SZ).

Společná translokace

SRP RNA je nedílnou součástí malé a velké domény SRP. Funkce malé domény spočívá v oddálení translace proteinu, dokud nemá SRP vázaný na ribozomy příležitost spojit se s rezidentem membrány SRP receptor (SR). Ve velké doméně podporuje SRP RNA SRP nabitého signálním peptidem hydrolýzu dvou guanosin trifosfát (GTP) molekuly. Tato reakce uvolňuje SRP z receptoru SRP a ribozom, umožňující překlad pokračovat a protein vstoupit do translocon.[18] Protein transverzuje membránu kotranslačně (během translace) a vstupuje do jiného buněčného kompartmentu nebo extracelulárního prostoru. v eukaryoty, cílem je membrána z endoplazmatické retikulum (ER). v Archaea SRP dodává proteiny do plazmatická membrána.[19] V bakterie SRP primárně inkorporuje proteiny do vnitřní membrány.[20]

Posttranslační doprava

SRP se účastní také třídění bílkoviny po dokončení jejich syntézy (posttranslační třídění proteinů). v eukaryoty proteiny ukotvené v ocasu mající a hydrofobní inzertní sekvence na jejich C-konci jsou doručeny do endoplazmatické retikulum (ER) SRP.[21] Podobně SRP pomáhá posttranslačně při importu jaderně kódovaných proteinů do thylakoid membrána z chloroplasty.[22]

Struktura

Vlastnosti a nomenklatura SRP RNA. Sekundární struktura lidské SRP RNA je vyznačena světle šedou barvou a jsou označeny 5'- a 3'-konce. Zachované motivy jsou zobrazeny tmavě šedě. Helixy jsou očíslovány od 1 do 12, šroubovicové části jsou označeny malými písmeny a vkládání šroubovice pomocí tečkovaných čísel. Terciární interakce mezi vrcholovými smyčkami šroubovic 3 a 4 a mezi šroubovicemi 6 a 8 jsou označeny tečkovanými čarami.

V roce 2005, a nomenklatura pro všechny SRP RNA navrhovaný systém číslování 12 šroubovic. Sekce šroubovice jsou pojmenovány malým písmenem přípona (např. 5a). Vložkám nebo šroubovicím „větvím“ jsou dána tečkovaná čísla (např. 9.1 a 12.1).

SRP RNA je široká fylogenetické spektrum s ohledem na velikost a počet jeho strukturních znaků (viz příklady sekundární struktury SRP RNA níže). Nejmenší funkční SRP RNA byly nalezeny v mykoplazma a příbuzné druhy. Escherichia coli SRP RNA (také nazývaná 4.5S RNA) se skládá ze 114 nukleotid zbytky a tvoří RNA kmenová smyčka. The grampozitivní bakterie Bacillus subtilis kóduje větší 6S SRP RNA, která se podobá Archaeal homology ale chybí mu šroubovice SRP RNA 6. Archaeal SRP RNA mají šroubovice 1 až 8, chybí jim šroubovice 7 a jsou charakterizovány a terciární struktura který zahrnuje apikální smyčky šroubovice 3 a šroubovice 4. The eukaryotický SRP RNA postrádají spirálu 1 a obsahují spirálu 7 proměnné velikosti. Nějaký prvoky SRP RNA mají redukované šroubovice 3 a 4. The ascomycota SRP RNA mají zcela omezenou malou doménu a postrádají šroubovice 3 a 4. Největší dosud známé SRP RNA se nacházejí v droždí (Saccharomycetes ), který získal šroubovice 9 až 12 jako inzerce do šroubovice 5, stejně jako prodlouženou šroubovice 7. Semeno rostliny exprimují řadu vysoce divergentních SRP RNA.[3]

Motivy

Byly identifikovány čtyři konzervované znaky (motivy) (na obrázku jsou zobrazeny tmavě šedě): (1) vazebný motiv SRP54, (2) motiv Helralo 6 GNAR tetraloop, (3) motiv 5e a (4) UGU (NR) motiv.[Citace je zapotřebí ]

Vazba SRP54

Asymetrická smyčka mezi spirálovitými sekcemi 8a a 8b a sousední bází spárovanou sekcí 8b jsou prominentní vlastností každé SRP RNA. Čelní část 8b obsahuje ne-Watson-Crickovo párování bází které přispívají k tvorbě zploštělé malá drážka v RNA vhodné pro vazbu protein SRP54 (v bakteriích nazývaný Ffh).[6] The apikální smyčka šroubovice 8 obsahuje čtyři, pět nebo šest zbytků, v závislosti na druh. Má velmi konzervované guanosin jako první a adenosin jako poslední zbytek smyčky. Tato funkce je vyžadována pro interakci s třetí adenosin zbytek motivu tetraloop šroubovice 6 GNAR.[23]

Helix 6 GNAR tetraloop

SRP RNA z eukaryoty a Archaea mít GNAR tetraloop (N je pro všechny nukleotid, R je pro a purin ) ve šroubovici 6. Je konzervovaný adenosin zbytek je důležitý pro vazbu protein SRP19.[24] Tento adenosin provádí terciární interakci s jiným adenosin zbytky nacházející se v apikální smyčka šroubovice 8.[25]

5e

11 nukleotidů motivu 5e tvoří čtyři základní páry které jsou přerušeny smyčkou tří nukleotidy.[4] V eukaryoty, první nukleotid ve smyčce je adenosin který je potřebný pro vazbu protein SRP72.[26]

UGU (NR)

Motiv UGU (NR) spojuje šroubovice 3 a 4 v malé (Alu) doméně SRP. Houba SRP RNA bez helixů 3 a 4 obsahují motiv ve smyčce šroubovice 2.[4] Je to důležité ve vazbě SRP9 / 14 protein heterodimer jako součást RNA Otočit se.[27]

Sekundární

Příklady sekundárních struktur SRP RNA

Terciární

SRP RNA
Identifikátory
RfamCL00003
Další údaje
PDB strukturPDBe 2IY3​, 1Z43​, 1RY1​, 1QZW​, 1MFQ​, 1L9A​, 1LNG​,1JID​, 1E8S​, 1E8O​, 1DUL​, 1DUH​,1D4R​, 28SR​, 28SP​

Rentgenová krystalografie, nukleární magnetická rezonance (NMR) a kryo-elektronová mikroskopie (cryo-EM] byly použity k určení molekulární struktura částí SRP RNA z různých druh. Dostupné struktury PDB ukazují, že molekula RNA je volná nebo pokud je navázána na jeden nebo více SRP bílkoviny.

Krystalografické struktury reprezentativních SRP

Vazebné proteiny

Viz také: Částice pro rozpoznávání signálu

Jeden nebo více SRP bílkoviny vázat na SRP RNA sestavit funkční SRP. SRP proteiny jsou pojmenovány podle jejich přibližné hodnoty molekulová hmotnost měřeno v kilodalton.[29] Většina bakteriální SRP se skládají ze SRP RNA a SRP54 (také nazývané Ffh pro „Fifty-Fnáš homolog ") Archaeal SRP obsahuje proteiny SRP54 a SRP19. v eukaryoty se SRP RNA kombinuje s importovanými proteiny SRP SRP9 / 14, SRP19 a SRP68 / 72 v oblasti jádro. Tento pre-SRP je transportován do cytosol kde se váže na protein SRP54.[30] The molekulární struktury volné nebo vázané na SRP RNA bílkoviny SRP9 / 14, SRP19 nebo SRP54 jsou známy ve vysokém rozlišení.

SRP9 a SRP14

SRP9 a SRP14 jsou strukturálně související a tvoří SRP9 / 14 heterodimer který se váže na SRP RNA malé (Alu) domény.[27] Droždí SRP postrádá SRP9 a obsahuje strukturálně příbuzný protein SRP21. Droždí SRP14 tvoří a homodimer.[31] SRP9 / 14 chybí v SRP z trypanosoma které místo toho vlastní a tRNA -jako molekula.[32]

SRP19

SRP19 se nachází v SRP z eukaryoty a Archaea. Jeho primární rolí je příprava SRP RNA pro vazbu SRP54, SRP68 a SRP72 správným uspořádáním šroubovic SRP RNA 6 a 8.[28] Droždí SRP obsahuje Sec65p, větší homolog SRP19.[33]

SRP54

Protein SRP54 (pojmenovaný Ffh v bakterie ) je základní součástí každého SRP. Skládá se ze tří funkčních domén: N-koncová (N) doména, GTPáza (G) doména a methionin -rich (M) doména.[34][35]

SRP68 a SRP72

Proteiny SRP68 a SRP72 jsou složkami velké domény eukaryotický SRP. Tvoří stabilní SRP68 / 72 heterodimer. Ukázalo se, že asi jedna třetina lidského proteinu SRP68 se váže na SRP RNA.[36] Relativně malá oblast umístěná blízko C-konce SRP72 se váže na motiv 5e SRP RNA.[26][37]

Reference

  1. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  2. ^ A b Ullu E, Tschudi C (1984). "Alu sekvence jsou zpracovány 7SL RNA geny". Příroda. 312 (5990): 171–172. Bibcode:1984Natur.312..171U. doi:10.1038 / 312171a0. PMID  6209580. S2CID  4328237.
  3. ^ A b Rosenblad MA, Larsen N, Samuelsson T, Zwieb C (2009). „Příbuznost v rodině SRP RNA“. RNA Biology. 6 (5): 508–516. doi:10,4161 / rna.6.5.9753. PMID  19838050.
  4. ^ A b C d Regalia M, Rosenblad MA, Samuelsson T (srpen 2002). "Predikce genů RNA pro rozpoznávání signálu". Výzkum nukleových kyselin. 30 (15): 3368–3377. doi:10.1093 / nar / gkf468. PMC  137091. PMID  12140321.
  5. ^ A b C Wild K, Weichenrieder O, Strub K, Sinning I, Cusack S (únor 2002). "Směrem ke struktuře částice pro rozpoznávání signálu savců". Aktuální názor na strukturní biologii. 12 (1): 72–81. doi:10.1016 / S0959-440X (02) 00292-0. PMID  11839493.
  6. ^ A b C Batey RT, Rambo RP, Lucast L, Rha B, Doudna JA (únor 2000). "Krystalová struktura ribonukleoproteinového jádra částice pro rozpoznávání signálu". Věda. 287 (5456): 1232–1239. Bibcode:2000Sci ... 287.1232B. doi:10.1126 / science.287.5456.1232. PMID  10678824.
  7. ^ Batey RT, Sagar MB, Doudna JA (březen 2001). "Strukturální a energetická analýza rozpoznávání RNA univerzálně konzervovaným proteinem z částice rozpoznávající signál". Journal of Molecular Biology. 307 (1): 229–246. doi:10.1006 / jmbi.2000.4454. PMID  11243816.
  8. ^ Bishop JM, Levinson WE, Sullivan D, Fanshier L, Quintrell N, Jackson J (prosinec 1970). „Nízkomolekulární RNA viru Rousova sarkomu. II. 7 S RNA“. Virologie. 42 (4): 927–937. doi:10.1016/0042-6822(70)90341-7. PMID  4321311.
  9. ^ Walker TA, Pace NR, Erikson RL, Erikson E, Behr F (září 1974). „7S RNA společná pro oncornaviry a normální buňky je spojena s polyribozomy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 71 (9): 3390–3394. Bibcode:1974PNAS ... 71,3390W. doi:10.1073 / pnas.71.9.3390. PMC  433778. PMID  4530311.
  10. ^ Zieve G, Penman S (květen 1976). "Malé druhy RNA buňky HeLa: metabolismus a subcelulární lokalizace". Buňka. 8 (1): 19–31. doi:10.1016/0092-8674(76)90181-1. PMID  954090. S2CID  26928799.
  11. ^ Walter P, Ibrahimi I, Blobel G (listopad 1981). „Translokace proteinů přes endoplazmatické retikulum. I. Protein pro rozpoznávání signálu (SRP) se váže na polysomy syntetizované sekreční protein in-vitro“. The Journal of Cell Biology. 91 (2 Pt 1): 545–550. doi:10.1083 / jcb.91.2.545. PMC  2111968. PMID  7309795.
  12. ^ Walter P, Blobel G (říjen 1982). „Částice pro rozpoznávání signálu obsahuje 7S RNA nezbytnou pro translokaci proteinu přes endoplazmatické retikulum“. Příroda. 299 (5885): 691–698. Bibcode:1982Natur.299..691W. doi:10.1038 / 299691a0. PMID  6181418. S2CID  4237513.
  13. ^ Larsen N, Zwieb C (leden 1991). "Zarovnání sekvence SRP-RNA a sekundární struktura". Výzkum nukleových kyselin. 19 (2): 209–215. doi:10.1093 / nar / 19.2.209. PMC  333582. PMID  1707519.
  14. ^ Ullu E, Murphy S, Melli M (květen 1982). „Lidská 7SL RNA se skládá ze 140 nukleotidové středně opakující se sekvence vložené do alu sekvence.“ Buňka. 29 (1): 195–202. doi:10.1016/0092-8674(82)90103-9. PMID  6179628. S2CID  12709599.
  15. ^ Rosenblad MA, Samuelsson T (listopad 2004). „Identifikace genů RNA pro rozpoznávání signálu chloroplastů“. Fyziologie rostlin a buněk. 45 (11): 1633–1639. doi:10.1093 / pcp / pch185. PMID  15574839.
  16. ^ Dieci G, Fiorino G, Castelnuovo M, Teichmann M, Pagano A (prosinec 2007). "Expandující transkriptom RNA RNA polymerázy III". Trendy v genetice. 23 (12): 614–622. doi:10.1016 / j.tig.2007.09.001. hdl:11381/1706964. PMID  17977614.
  17. ^ Dieci G, Giuliodori S, Catellani M, Percudani R, Ottonello S (březen 2002). „Intragenní adaptace promotoru a usnadnění recyklace RNA polymerázy III při transkripci SCR1, genu 7SL RNA Saccharomyces cerevisiae“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (9): 6903–6914. doi:10,1074 / jbc.M105036200. PMID  11741971.
  18. ^ Shan SO, Walter P (únor 2005). "Cílení na ko-translační protein pomocí částice rozpoznávající signál". FEBS Dopisy. 579 (4): 921–926. doi:10.1016 / j.febslet.2004.11.049. PMID  15680975. S2CID  46046514.
  19. ^ Zwieb C, Eichler J (březen 2002). „Dostanete se na cíl: částice pro rozpoznávání signálu archaealu“. Archaea. 1 (1): 27–34. doi:10.1155/2002/729649. PMC  2685543. PMID  15803656.
  20. ^ Ulbrandt ND, Newitt JA, Bernstein HD (leden 1997). „Částice pro rozpoznávání signálu E. coli je nutná pro vložení podmnožiny proteinů vnitřní membrány“. Buňka. 88 (2): 187–196. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81839-5. PMID  9008159. S2CID  15246619.
  21. ^ Abell BM, Pool MR, Schlenker O, Sinning I, High S (červenec 2004). „Částice pro rozpoznávání signálu zprostředkovává post-translační cílení u eukaryotů“. Časopis EMBO. 23 (14): 2755–2764. doi:10.1038 / sj.emboj.7600281. PMC  514945. PMID  15229647.
  22. ^ Schuenemann D, Gupta S, Persello-Cartieaux F, Klimyuk VI, Jones JD, Nussaume L, Hoffman NE (srpen 1998). „Nová částice pro rozpoznávání signálu se zaměřuje na proteiny sběru světla do tylakoidních membrán“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (17): 10312–10316. Bibcode:1998PNAS ... 9510312S. doi:10.1073 / pnas.95.17.10312. PMC  21505. PMID  9707644.
  23. ^ Zwieb C, van Nues RW, Rosenblad MA, Brown JD, Samuelsson T (leden 2005). „Nomenklatura pro všechny RNA částice rozpoznávající signál“. RNA. 11 (1): 7–13. doi:10,1261 / rna.7203605. PMC  1370686. PMID  15611297.
  24. ^ Zwieb C (srpen 1992). "Rozpoznání tetranukleotidové smyčky částice RNA rozpoznávající signál proteinem SRP19". The Journal of Biological Chemistry. 267 (22): 15650–15656. PMID  1379233.
  25. ^ A b Hainzl T, Huang S, Sauer-Eriksson AE (červen 2002). "Struktura komplexu SRP19 RNA a důsledky pro sestavu částice pro rozpoznávání signálu". Příroda. 417 (6890): 767–771. Bibcode:2002 Natur.417..767H. doi:10.1038 / nature00768. PMID  12050674. S2CID  2509475.
  26. ^ A b Iakhiaeva E, Wower J, Wower IK, Zwieb C (červen 2008). „Motiv 5e eukaryotické částice RNA pro rozpoznávání signálu obsahuje konzervovaný adenosin pro vazbu SRP72“. RNA. 14 (6): 1143–1153. doi:10,1261 / rna.979508. PMC  2390789. PMID  18441046.
  27. ^ A b Weichenrieder O, Wild K, Strub K, Cusack S (listopad 2000). "Struktura a sestavení Alu domény savčí částice pro rozpoznávání signálu". Příroda. 408 (6809): 167–173. Bibcode:2000Natur.408..167W. doi:10.1038/35041507. PMID  11089964. S2CID  4427070.
  28. ^ A b Kuglstatter A, Oubridge C, Nagai K (2002). "Indukované strukturální změny 7SL RNA během montáže částice pro rozpoznávání lidského signálu". Nat Struct Biol. 9 (10): 740–744. doi:10.1038 / nsb843. PMID  12244299. S2CID  9543041.
  29. ^ Walter P, Blobel G (září 1983). Msgstr "Demontáž a rekonstituce částice pro rozpoznávání signálu". Buňka. 34 (2): 525–533. doi:10.1016/0092-8674(83)90385-9. PMID  6413076. S2CID  17907778.
  30. ^ Politz JC, Yarovoi S, Kilroy SM, Gowda K, Zwieb C, Pederson T (leden 2000). "Součásti rozpoznávání signálu v jádře". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (1): 55–60. Bibcode:2000PNAS ... 97 ... 55P. doi:10.1073 / pnas.97.1.55. PMC  26615. PMID  10618370.
  31. ^ Brooks MA, Ravelli RB, McCarthy AA, Strub K, Cusack S (květen 2009). "Struktura SRP14 z částice pro rozpoznávání signálu Schizosaccharomyces pombe". Acta Crystallographica oddíl D. 65 (Pt 5): 421–433. doi:10.1107 / S0907444909005484. PMID  19390147.
  32. ^ Liu L, Ben-Shlomo H, Xu YX, Stern MZ, Goncharov I, Zhang Y, Michaeli S (květen 2003). „Částice pro rozpoznávání signálu trypanosomatid se skládá ze dvou molekul RNA, homologu 7SL RNA a nové molekuly podobné tRNA“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (20): 18271–18280. doi:10,1074 / jbc.M209215200. PMID  12606550.
  33. ^ Hann BC, Stirling CJ, Walter P (duben 1992). „Produkt genu SEC65 je podjednotkou částice rozpoznávající signál kvasinek, která je nutná pro její integritu.“ Příroda. 356 (6369): 532–533. Bibcode:1992 Natur.356..532H. doi:10.1038 / 356532a0. PMID  1313947. S2CID  4287636.
  34. ^ Römisch K, Webb J, Herz J, Prehn S, Frank R, Vingron M, Dobberstein B (srpen 1989). „Homologie 54K proteinu částice rozpoznávající signál, dokovacího proteinu a dvou proteinů E. coli s domnělými doménami vázajícími GTP“ (PDF). Příroda. 340 (6233): 478–482. Bibcode:1989 Natur.340..478R. doi:10.1038 / 340478a0. PMID  2502717. S2CID  4343347.
  35. ^ Bernstein HD, Poritz MA, Strub K, Hoben PJ, Brenner S, Walter P (srpen 1989). "Model pro rozpoznávání signální sekvence z aminokyselinové sekvence 54K podjednotky částice pro rozpoznávání signálu". Příroda. 340 (6233): 482–486. Bibcode:1989 Natur.340..482B. doi:10.1038 / 340482a0. PMID  2502718. S2CID  619959.
  36. ^ Iakhiaeva E, Bhuiyan SH, Yin J, Zwieb C (červen 2006). „Protein SRP68 částice rozpoznávající lidský signál: identifikace vazebných domén RNA a SRP72“. Věda o bílkovinách. 15 (6): 1290–1302. doi:10.1110 / ps.051861406. PMC  2242529. PMID  16672232.
  37. ^ Iakhiaeva E, Yin J, Zwieb C (leden 2005). "Identifikace domény vázající RNA v lidském SRP72". Journal of Molecular Biology. 345 (4): 659–666. doi:10.1016 / j.jmb.2004.10.087. PMID  15588816.

Další čtení

externí odkazy