Receptor částic rozpoznávající signál - Signal recognition particle receptor
| SRX | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura beta podjednotky receptoru částic eukaryotického rozpoznávání signálu.[1] | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | SRX | ||||||||
| Pfam | PF09201 | ||||||||
| InterPro | IPR015284 | ||||||||
| SCOP2 | 1nrj / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| OPM nadčeleď | 136 | ||||||||
| OPM protein | 1nrj | ||||||||
| Membranome | 38 | ||||||||
| |||||||||
Receptor částice rozpoznávající signál (SRP), také zvaný dokovací protein, je dimer složený ze 2 různých podjednotek, které jsou spojeny výhradně s hrubým ER v savčí buňky. Jeho hlavní funkcí je identifikovat SRP Jednotky. SRP (částice pro rozpoznávání signálu) je a molekula který pomáhá ribozom -mRNA-polypeptid komplexy se usadit na membrána z endoplazmatické retikulum.
SRP receptor
Eukaryotický SRP receptor (nazývaný SR) je heterodimer SR-alfa (70 kDa) a SR-beta (25 kDa), které oba obsahují doménu vázající GTP,[2] zatímco prokaryotický SRP receptor obsahuje pouze monomerní volně spojený s membránou spojený homolog SR-alfa FtsY. SR-alfa reguluje zacílení komplexů SRP-ribosom-rodící se polypeptidy na translocon.[3] SR-alfa se váže na podjednotku SRP54 komplexu SRP. Podjednotka SR-beta je transmembránová GTPáza, která ukotví podjednotku SR-alfa (periferní membránová GTPáza) k membráně ER.[4] SR-beta interaguje s N-koncovou SRX doménou SR-alfa, která není přítomna v bakteriálním FtsY homologu. SR-beta také funguje při náboru SRP-rodícího se polypeptidu do kanálu vedoucího protein.
Tato rodina představuje homology alfa podjednotky receptoru SR. Členové této položky se skládají z centrálního šestivláknového antiparalelního beta-listu sendviče se šroubovicí alfa1 na jedné straně a šroubovicemi alfa2-alfa4 na druhé straně. Interagují s malou GTPázou SR-beta a tvoří komplex, který odpovídá třídě malých komplexů G protein-efektor, včetně Rap-Raf, Ras-PI3K (gama), Ras-RalGDS a Arl2-PDE (delta).[2]
Částice pro rozpoznávání signálu (SRP)
The částice pro rozpoznávání signálu (SRP) je multimerní protein, který se spolu se svým konjugovaným receptorem (SR) podílí na cílení sekrečních proteinů na membránu drsného endoplazmatického retikula (RER) u eukaryot nebo na plazmatickou membránu u prokaryot.[5][6] SRP rozpoznává signální sekvenci rodícího se polypeptidu na ribozomu, zpomaluje jeho prodloužení a ukotví komplex SRP-ribozom-polypeptid na membránu RER prostřednictvím receptoru SR. SRP se skládá ze šesti polypeptidů (SRP9, SRP14, SRP19, SRP54, SRP68 a SRP72) a jedné 300 nukleotidové molekuly 7S RNA. Složka RNA katalyzuje interakci SRP s jeho SR receptorem.[7] U vyšších eukaryot se komplex SRP skládá z Alu domény a S domény spojené SRP RNA. Alu doména se skládá z heterodimeru SRP9 a SRP14 navázaného na 5 'a 3' koncové sekvence SRP RNA. Tato doména je nezbytná pro zpomalení prodloužení rodícího se polypeptidového řetězce, což dává SRP čas na ukotvení komplexu ribozom-polypeptid k RER membráně.
Reference
- ^ Schwartz T, Blobel G (březen 2003). "Strukturální základ pro funkci beta podjednotky eukaryotického receptoru pro rozpoznávání signálu částice". Buňka. 112 (6): 793–803. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00161-2. PMID 12654246.
- ^ A b Blobel G, Schwartz T (2003). "Strukturální základ pro funkci beta podjednotky eukaryotického receptoru pro rozpoznávání signálu částice". Buňka. 112 (6): 793–803. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00161-2. PMID 12654246.
- ^ Andrews DW, legát KR, Falcone D (2000). "Nukleotidově závislá vazba GTPázové domény beta-podjednotky receptoru pro rozpoznávání signálu na alfa-podjednotku". J. Biol. Chem. 275 (35): 27439–46. doi:10,1074 / jbc.M003215200. PMID 10859309.
- ^ Walter P, Miller JD, Tajima S, Lauffer L (1995). „Beta podjednotka částicového receptoru pro rozpoznávání signálu je transmembránová GTPáza, která kotví alfa podjednotku, GTPázu periferní membrány, k membráně endoplazmatického retikula“. J. Cell Biol. 128 (3): 273–282. doi:10.1083 / jcb.128.3.273. PMC 2120348. PMID 7844142.
- ^ Stroud RM, Walter P, Rutenber E, Reyes CL (2007). Zhang S (ed.). „Rentgenové struktury receptoru pro rozpoznávání signálu, částicové receptory, odhalují meziprodukty cyklu cílení“. PLOS ONE. 2 (7): e607. doi:10.1371 / journal.pone.0000607. PMC 1904258. PMID 17622352.
- ^ Dobberstein B, High S, Romisch K, Miller FW (2006). "Lidské autoprotilátky proti proteinu 54 kDa funkce blokování částic v několika fázích". Výzkum a terapie artritidy. 8 (2): R39. doi:10.1186 / ar1895. PMC 1526608. PMID 16469117.
- ^ Walter P, Bradshaw N (2007). „Částice rozpoznávající signál (SRP) RNA spojuje konformační změny v SRP s cílením na proteiny“. Mol. Biol. Buňka. 18 (7): 2728–2734. doi:10,1091 / mbc.E07-02-0117. PMC 1924838. PMID 17507650.
