RICS (gen) - RICS (gene)

ARHGAP32
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyARHGAP32GC-GAP, GRIT, PX-RICS, RICS, p200RhoGAP, p250GAP, protein aktivující Rho GTPázu 32
Externí IDOMIM: 608541 MGI: 2450166 HomoloGene: 8812 Genové karty: ARHGAP32
Umístění genu (člověk)
Chromozom 11 (lidský)
Chr.Chromozom 11 (lidský)[1]
Chromozom 11 (lidský)
Genomické umístění pro ARHGAP32
Genomické umístění pro ARHGAP32
Kapela11q24.3Start128,965,060 bp[1]
Konec129,279,324 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE RICS 203431 s na fs.png

PBB GE RICS 210791 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

9743

330914

Ensembl

ENSG00000134909

ENSMUSG00000041444

UniProt

A7KAX9

Q811P8

RefSeq (mRNA)

NM_001142685
NM_014715
NM_001378024
NM_001378025

NM_001195632
NM_177379
NM_001370957
NM_001370958

RefSeq (protein)

NP_001136157
NP_055530
NP_001364953
NP_001364954

NP_001182561
NP_796353
NP_001357886
NP_001357887

Místo (UCSC)Chr 11: 128,97 - 129,28 MbChr 9: 32,12 - 32,27 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Rho protein aktivující GTPázu 32 je protein že u lidí je kódován RICS gen.[5] RICS má dvě známé izoformy, RICS, které jsou primárně exprimovány na neurit růstové kužele a na post synaptické membrány a PX-RICS, který je obecněji vyjádřen v endoplazmatické retikulum, Golgiho aparát a endozomy.[6] Jedinou známou doménou RICS je RhoGAP doména, zatímco PX-RICS má další Homologie Phox a SH3 doména.

Funkce

RICS (aka GRIT / Arhgap32) je neuronem asociovaný protein aktivující GTPázu, který může regulovat morfologii a sílu dendritické páteře modulací Rho GTPáza aktivita.[5][6]

Izoformy

RICS

Experimenty ukázaly, že sražení RICS, nebo jen vyřazení jeho GAP nebo C-terminál TrkA vazebné místo, vede k abnormálně rozšířeným neuritům a blokům NGF regulovaný růst.[7]

Je známo, že GAP aktivita RICS je regulována dvěma fosforylačními místy, jedním řízeným CaMKII a druhým RPTPa. Když CaMKII je aktivován Ca.2+ vstup přes NMDA receptory a deaktivuje RICS fosforylace, což zase zvyšuje aktivní formy vázané na GTP Cdc42 a Rac1. To by tím vyvolalo například přestavbu dendritické trny. Protože v některých experimentech bylo prokázáno, že Cdc42 neovlivňuje morfologii páteře, zatímco jiné ukázaly, že Rac1 ano (prostřednictvím PAK1, LIMK, CFL1 cesta), nejpravděpodobnější cesta je přes Rac1. Na které se také váže RACS β-katenin a N-kadheriny, in vivo v rámci PSD (na které se váže PSD-95 a slabá vazba na podjednotky NR2) naznačuje, že může existovat i jiná cesta pro její modifikaci struktury páteře.[6] Místo fosforylace řízené RPTPa řídí specificitu aktivity GAP prostřednictvím mechanismu, o kterém se předpokládá, že zahrnuje pohyb c-terminální oblasti RICS. Ve fosforylovaném stavu může RICS ovlivnit Rac, Rho a Cdc42, ale po defosforylaci pomocí RPTPa může ovlivnit pouze Rac. Další fosforylační místo regulované FYN řídí vazbu RPTPa na RICS.[8]

PX-RICS

PX-RICS je dominantní izoforma exprimovaná během vývoje nervového systému. Je známo, že má mnohem nižší aktivitu GAP než RICS. Ačkoli je obecněji exprimován než RICS, je stále známo, že inhibuje prodloužení neuronů.[9] Další myšlenkou, že se jedná o synapticky relevantní izoformu, je skutečnost, že je známo, že se váže na NR2B a PSD95 in vivo.

Je známo, že PX-RICS se účastní transportu určitých synaptických proteinů, které postrádají ER exportní signály, z endoplazmatického retikula, do Golgiho aparátu. To bylo prokázáno pro β-katenin a N-kadherin, z nichž druhý postrádá exportní signál ER, a první, který se váže k pozdějšímu v rámci ER jako nezbytná, ale nedostatečná část jeho exportního procesu. Bylo zjištěno, že PX-RICS je nezbytnou složkou pro export tohoto komplexu do Golgi a poté do buněčné membrány. Předpokládá se, že PX-RICS to dělá tak, že nejprve lokalizuje membránu ER - to dělá vazbou GABARAP který váže ER a prostřednictvím své homologie domény Phox, která má vysokou vazebnou afinitu pro Pi4P, převládající fosfoinositid v endoplazmatickém retikulu a Golgiho aparátu. Pak se předpokládá, že PX-RICS váže heterodimer 14-3-3 proteinů kódovaných YWHAZ a YWHAQ geny. Místem, kde k této vazbě dochází, je místo RSKSDP v c-konci PX-RICS, které je fosforylováno CAMKII, aby se podpořilo navázání.[10] Nyní se také ukázalo, že membránový transport FGFR4, proteinu vázajícího N-kadherin, je ovlivněn knockdownem PX-RICS.[11]

Interakce

Bylo prokázáno, že RICS (gen) komunikovat s:

The Mir-132 microRNA bylo popsáno jako cílení na mRNA z tohoto genu pro degradaci; toto je považováno za důležité při regulaci vývoje neuronů.[16]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134909 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041444 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b „Entrez Gene: RICS Rho GTPase-Activating Protein“.
  6. ^ A b C Okabe T, Nakamura T, Nishimura YN, Kohu K, Ohwada S, Morishita Y, Akiyama T (březen 2003). „RICS, nový protein aktivující GTPázu pro Cdc42 a Rac1, je zapojen do signalizace beta-katenin-N-kadherinu a N-methyl-D-aspartátu“. J. Biol. Chem. 278 (11): 9920–7. doi:10,1074 / jbc.M208872200. PMID  12531901.
  7. ^ A b C d E F G Nakamura T, Komiya M, Sone K, Hirose E, Gotoh N, Morii H, Ohta Y, Mori N (prosinec 2002). „Grit, protein aktivující GTPázu pro rodinu Rho, reguluje extenzi neuritů prostřednictvím asociace s receptorem TrkA a molekulami adaptéru N-Shc a CrkL / Crk“. Mol. Buňka. Biol. 22 (24): 8721–34. doi:10.1128 / MCB.22.24.8721-8734.2002. PMC  139861. PMID  12446789.
  8. ^ Chagnon MJ, Wu CL, Nakazawa T, Yamamoto T, Noda M, Blanchetot C, Tremblay ML (listopad 2010). „Receptorová tyrosin fosfatáza sigma (RPTPσ) reguluje p250GAP, nový substrát, který tlumí Rac signalizaci“. Buňka. Signál. 22 (11): 1626–33. doi:10.1016 / j.cellsig.2010.06.001. PMID  20550964.
  9. ^ Hayashi T, Okabe T, Nasu-Nishimura Y, Sakaue F, Ohwada S, Matsuura K, Akiyama T, Nakamura T (srpen 2007). „PX-RICS, nová sestřihová varianta RICS, je hlavní izoforma vyjádřená během neurálního vývoje“. Geny buňky. 12 (8): 929–39. doi:10.1111 / j.1365-2443.2007.01101.x. PMID  17663722. S2CID  22118853.
  10. ^ Nakamura T, Hayashi T, Mimori-Kiyosue Y, Sakaue F, Matsuura K, Iemura S, Natsume T, Akiyama T (květen 2010). „Komplex PX-RICS-14-3-3zeta / theta spojuje N-kadherin-beta-katenin s dynein-dynaktinem za účelem zprostředkování jeho exportu z endoplazmatického retikula.“. J. Biol. Chem. 285 (21): 16145–54. doi:10.1074 / jbc.M109.081315. PMC  2871483. PMID  20308060.
  11. ^ Nakamura T, Hayashi T, Nasu-Nishimura Y, Sakaue F, Morishita Y, Okabe T, Ohwada S, Matsuura K, Akiyama T (květen 2008). „PX-RICS zprostředkovává transport komplexu N-kadherin / beta-katenin ER-to-Golgi“. Genes Dev. 22 (9): 1244–56. doi:10.1101 / gad.1632308. PMC  2335319. PMID  18451111.
  12. ^ A b C d E F Zhao C, Ma H, Bossy-Wetzel E, Lipton SA, Zhang Z, Feng GS (září 2003). „GC-GAP, protein aktivující GTPázu rodiny Rho, který interaguje se signálními adaptéry Gab1 a Gab2“. J. Biol. Chem. 278 (36): 34641–53. doi:10,1074 / jbc.M304594200. PMID  12819203.
  13. ^ A b C Nakazawa T, Watabe AM, Tezuka T, Yoshida Y, Yokoyama K, Umemori H, Inoue A, Okabe S, Manabe T, Yamamoto T (červenec 2003). „p250GAP, nový mozekem obohacený protein aktivující GTPázu pro GTPasy rodiny Rho, je zapojen do signalizace N-methyl-d-aspartátového receptoru“. Mol. Biol. Buňka. 14 (7): 2921–34. doi:10,1091 / mbc.E02-09-0623. PMC  165687. PMID  12857875.
  14. ^ A b C d Moon SY, Zang H, Zheng Y (únor 2003). „Charakterizace mozkového specifického proteinu aktivujícího Rho GTPázu, p200RhoGAP“. J. Biol. Chem. 278 (6): 4151–9. doi:10,1074 / jbc.M207789200. PMID  12454018.
  15. ^ Taniguchi S, Liu H, Nakazawa T, Yokoyama K, Tezuka T, Yamamoto T (červen 2003). „p250GAP, nervový protein RhoGAP, je asociován s Fyn a fosforylován“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306 (1): 151–5. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00923-9. PMID  12788081.
  16. ^ Vo N, Klein ME, Varlamova O, Keller DM, Yamamoto T, Goodman RH, Impey S (listopad 2005). „CAMP-response element binding protein-induced microRNA reguluje neuronální morfogenezi“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (45): 16426–31. doi:10.1073 / pnas.0508448102. PMC  1283476. PMID  16260724.

Další čtení