POLG2 - POLG2
DNA polymerázová podjednotka gama-2, mitochondriální je protein že u lidí je kódován POLG2 gen. The POLG2 Gen kóduje 55 kDa doplňkovou podjednotkovou bílkovinu, která dodává katalytické podjednotce vysoké procesivity a tolerance vůči solím DNA polymeráza gama, kódováno POLG gen.[5][6] Mutace v tomto genu vedou k autosomálně dominantní progresivní vnější oftalmoplegie s mitochondriální DNA vypuštění.[7]
Struktura
POLG2 se nachází na q rameno z chromozom 17 na pozici 23,3 a má 8 exony.[7] POLG2, protein kódovaný tímto genem obsahuje a fosfoserin modifikovaný zbytek na str. 38 a a tranzitní peptid. Jeho struktura se skládá z 25 beta vlákna, 21 alfa šroubovice a 8 otáček.[8][9]
Funkce
POLG2 kóduje podjednotku procesivity mitochondrií DNA polymeráza gama. Kódovaný protein tvoří heterotrimer obsahující jednu katalytickou podjednotku a dvě procesní podjednotky. Tento protein zvyšuje Vazba DNA stimuluje polymeráza a exonukleáza činnost a podporuje procesivitu Syntéza DNA.[7][8][9]
Katalytická aktivita
Deoxynukleosid trifosfát + DNA (n) = difosfát + DNA (n + 1)[8][9]
Klinický význam
Mutace v POLG2 byly spojeny s progresivní vnější oftalmoplegie s delecemi mitochondriální DNA. Toto onemocnění vede k postupné slabosti oční svaly a levatorní sval horního víčka a pacienti s ním se mohou také projevit kosterně myopatie, otrhaná červená vlákna a atrofie zobrazené na svalové biopsii, šedý zákal, ztráta sluchu, senzorická axonální neuropatie, ataxie, Deprese, hypogonadismus, a parkinsonismus. Toto mutlisystemické onemocnění bylo spojeno s mutací G451E, která narušuje gama podjednotky DNA polymerázy.[8][9][10]
U pacientů s chronickými hepatitida C., kteří přepravují DDX5 Předpokládá se, že haplotypy vedlejší alely nebo DDX5-POLG2 mají zvýšené riziko pokročilého vývoje fibróza. Je však důležité poznamenat, že ti, kteří přepravují CPT1A Předpokládá se, že menší alela má snížené riziko.[11]
Interakce
Bylo prokázáno, že POLG2 má 39 binárních interakce protein-protein včetně 19 společných interakcí. Zdá se, že POLG2 interaguje POLG.[12]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000256525 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020718 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Wang Y, Farr CL, Kaguni LS (květen 1997). "Doplňková podjednotka mitochondriální DNA polymerázy z embryí Drosophila. Klonování, molekulární analýza a asociace v nativním enzymu". The Journal of Biological Chemistry. 272 (21): 13640–6. doi:10.1074 / jbc.272.21.13640. PMID 9153213.
- ^ Lim SE, Longley MJ, Copeland WC (prosinec 1999). „Doplňková podjednotka mitochondriálního p55 lidské DNA polymerázy gama zvyšuje vazbu DNA, podporuje procesní syntézu DNA a propůjčuje rezistenci vůči N-ethylmaleimidu.“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (53): 38197–203. doi:10.1074 / jbc.274.53.38197. PMID 10608893.
- ^ A b C „Entrez Gene: POLG2 polymeráza (řízená DNA), gama 2, doplňková podjednotka“.
Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména. - ^ A b C d „POLG2 - DNA polymerázová podjednotka gama-2, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - POLG2 gen a protein“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-31.
Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence. - ^ A b C d „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622.
- ^ Longley MJ, Clark S, Yu Wai Man C, Hudson G, Durham SE, Taylor RW, Nightingale S, Turnbull DM, Copeland WC, Chinnery PF (červen 2006). „Mutant POLG2 narušuje gama podjednotky DNA polymerázy a způsobuje progresivní vnější oftalmoplegii“. American Journal of Human Genetics. 78 (6): 1026–34. doi:10.1086/504303. PMC 1474082. PMID 16685652.
- ^ Huang H, Shiffman ML, Cheung RC, Layden TJ, Friedman S, Abar OT, Yee L, Chokkalingam AP, Schrodi SJ, Chan J, Catanese JJ, Leong DU, Ross D, Hu X, Monto A, McAllister LB, Broder S , White T, Sninsky JJ, Wright TL (květen 2006). „Identifikace dvou genových variant spojených s rizikem pokročilé fibrózy u pacientů s chronickou hepatitidou C“. Gastroenterologie. 130 (6): 1679–87. doi:10.1053 / j.gastro.2006.02.032. PMID 16697732.
- ^ „Bylo nalezeno 39 binárních interakcí pro hledaný výraz POLG2“. IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2019-09-04.
Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v 
Další čtení
- Michiels S, Danoy P, Dessen P, Bera A, Boulet T, Bouchardy C, Lathrop M, Sarasin A, Benhamou S (srpen 2007). „Objev polymorfismu v 62 genech pro opravu DNA a asociacích haplotypů s rizikem rakoviny plic a hlavy a krku“. Karcinogeneze. 28 (8): 1731–9. doi:10.1093 / carcin / bgm111. PMID 17494052.
- Huang H, Shiffman ML, Cheung RC, Layden TJ, Friedman S, Abar OT, Yee L, Chokkalingam AP, Schrodi SJ, Chan J, Catanese JJ, Leong DU, Ross D, Hu X, Monto A, McAllister LB, Broder S , White T, Sninsky JJ, Wright TL (květen 2006). „Identifikace dvou genových variant spojených s rizikem pokročilé fibrózy u pacientů s chronickou hepatitidou C“. Gastroenterologie. 130 (6): 1679–87. doi:10.1053 / j.gastro.2006.02.032. PMID 16697732.
- Longley MJ, Clark S, Yu Wai Man C, Hudson G, Durham SE, Taylor RW, Nightingale S, Turnbull DM, Copeland WC, Chinnery PF (červen 2006). „Mutant POLG2 narušuje gama podjednotky DNA polymerázy a způsobuje progresivní vnější oftalmoplegii“. American Journal of Human Genetics. 78 (6): 1026–34. doi:10.1086/504303. PMC 1474082. PMID 16685652.
- Yakubovskaya E, Chen Z, Carrodeguas JA, Kisker C, Bogenhagen DF (leden 2006). „Funkční lidská mitochondriální DNA polymeráza gama tvoří heterotrimer“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (1): 374–82. doi:10,1074 / jbc.M509730200. PMID 16263719.
- Carrodeguas JA, Pinz KG, Bogenhagen DF (prosinec 2002). "Vazebné vlastnosti DNA lidského pol gammaB". The Journal of Biological Chemistry. 277 (51): 50008–14. doi:10,1074 / jbc.M207030200. PMID 12379656.
- Johnson AA, Tsai Y, Graves SW, Johnson KA (únor 2000). "Lidský mitochondriální DNA polymerázový holoenzym: rekonstituce a charakterizace". Biochemie. 39 (7): 1702–8. doi:10.1021 / bi992104w. PMID 10677218.
- Carrodeguas JA, Bogenhagen DF (březen 2000). „Proteinové sekvence konzervované v prokaryotických aminoacyl-tRNA syntetázách jsou důležité pro aktivitu faktoru procesivity lidské mitochondriální DNA polymerázy“. Výzkum nukleových kyselin. 28 (5): 1237–44. doi:10.1093 / nar / 28.5.1237. PMC 102604. PMID 10666468.
- Lim SE, Longley MJ, Copeland WC (prosinec 1999). „Doplňková podjednotka mitochondriálního p55 lidské DNA polymerázy gama zvyšuje vazbu DNA, podporuje procesní syntézu DNA a propůjčuje rezistenci vůči N-ethylmaleimidu.“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (53): 38197–203. doi:10.1074 / jbc.274.53.38197. PMID 10608893.
externí odkazy
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9UHN1 (Podjednotka lidské DNA polymerázy gama-2, mitochondriální) na PDBe-KB.
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9QZM2 (Myší DNA polymerázová podjednotka gama-2, mitochondriální) na PDBe-KB.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.