NDUFAF5 - NDUFAF5
NADH: faktor sestavy komplexu ubichinon oxidoreduktázy 5, také známý jako Arginin-hydroxyláza NDUFAF5nebo Předpokládaná methyltransferáza NDUFAF5, je protein že u lidí je kódován NDUFAF5 gen.[1] NADH-ubichinon oxidoreduktáza komplex (komplex I) mitochondriálního dýchacího řetězce katalyzuje přenos elektronů z NADH na ubichinon, a skládá se z nejméně 43 podjednotek. Komplex se nachází ve vnitřní mitochondriální membráně. Tento gen kóduje mitochondriální protein, který je spojen s matricovým povrchem mitochondriální vnitřní membrána a je vyžadován pro složitou montáž I. A mutace v tomto genu vede k deficitu mitochondriálního komplexu I. Násobek varianty přepisu kódování odlišné izoformy byly nalezeny pro tento gen.[1]
Struktura
NDUFAF5 se nachází na p rameno z Chromozom 20 na pozici 12,1 a rozpětí 36 554 párů bází.[1] The NDUFAF5 Gen produkuje 30 kDa protein složený z 267 aminokyselin.[2][3] Předpokládaná struktura c-terminál Bylo zjištěno, že množství proteinu se podobá proteinu známého sekundární struktura RdmB. NDUFAF5 obsahuje S-adenosylmethionin závislý methyltransferáza doména, která obsahuje sekvenci podpisu GxGxG, a doménu S-adenosylmethionin - vazebný motiv, který je běžný ve většině methyltransferáz závislých na SAM.[4][5] Tento arginin -hydroxyláza podílí se na sestavování mitochondriálního NADH: ubichinonu oxidoreduktáza komplex (komplex I, MT-ND1) v raných fázích.[6] Komplex I se skládá ze 45 evolučně konzervovaných základních podjednotek, včetně obou mitochondriální DNA a nukleární kódované podjednotky. Jedno z jeho ramen je zality do vnitřní membrány mitochondrií a druhé je zanořeno do organela. Obě ramena jsou uspořádána do tvaru písmene L. Celkem molekulární váha komplexu je 1MDa.[4]
Funkce
The NDUFAF5 Gen kóduje mitochondriální protein, který je spojen s matricovým povrchem mitochondriální vnitřní membrána a je vyžadován pro složitou montáž I.[4] Jejich role je nedílnou součástí vložení kofaktorů a při využívání podsestav pro budování komplexu I. Činí tak katalyzující the hydroxylace Arg-73 v NDUFS7 podjednotka lidského komplexu I, ke kterému dochází před vytvořením spoje periferního a membránového ramene v počátečních fázích montáže komplexu I.[4] The NADH -ubichinon oxidoreduktáza komplex (komplex I) mitochondriální dýchací řetězec katalyzuje přenos elektronů z NADH na ubichinon, a skládá se z nejméně 43 podjednotek. Komplex se nachází v vnitřní mitochondriální membrána. Ačkoli přesná biochemická funkce NDUFAF5 ještě není známa, mutace v tomto genu vedou k deficitu mitochondriálního komplexu I. Je také známo, že NDUFAF5 je členem rodiny 7β-řetězců závislých na SAM methyltransferázy.[1][6]
Klinický význam
Mutace v NDUFAF5 je známo, že vede k mitochondriálním chorobám a souvisejícím poruchám. Je to většinou spojeno s nedostatkem komplexu I, nedostatkem prvního komplexu mitochondriální dýchací řetězec.[7] Potlačení NDUFAF5 Bylo zjištěno, že tento gen vede ke ztrátě jak periferních, tak membránových ramen komplexu I spojeného s NDUFS7 a ND1. To pak vede k postupné ztrátě komplexu I, což způsobuje nedostatek.[4] Takové poruchy zahrnující dysfunkci mitochondriální dýchací řetězec může způsobit širokou škálu klinických projevů od smrtelného novorozeneckého onemocnění až po neurodegenerativní poruchy začínající u dospělých. Fenotypy zahrnují makrocefalie s progresivním leukodystrofie, nespecifické encefalopatie, kardiomyopatie, myopatie, nemoc jater, Leber dědičná optická neuropatie a některé formy Parkinsonova choroba. Mutace v NDUFAF5 byl také běžný pacient s Leighův syndrom, časný nástup progresivní neurodegenerativní porucha charakterizována přítomností ohniskových, bilaterálních léze.[4][6]
Interakce
Kromě ko-podjednotek komplexu I má NDUFAF5 interakce protein-protein NDUFAF8 (pro stabilizaci) a NDUFS7.[6]
Reference
- ^ A b C d "Entrez Gene: NADH: ubichinon oxidoreduktázový komplex 5". Citováno 2018-07-26.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečního proteomu pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ Yao, Daniel. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. amino.heartproteome.org. Citováno 2018-07-23.
- ^ A b C d E F Rhein VF, Carroll J, Ding S, Fearnley IM, Walker JE (červenec 2016). „NDUFAF5 Hydroxyláty NDUFS7 v rané fázi montáže lidského komplexu I“. The Journal of Biological Chemistry. 291 (28): 14851–60. doi:10.1074 / jbc.M116.734970. PMC 4938201. PMID 27226634.
- ^ Elurbe DM, Huynen MA (červenec 2016). „Původ nadpočetných podjednotek a montážních faktorů komplexu I: Poklad evoluce dráhy“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bioenergetika. 1857 (7): 971–9. doi:10.1016 / j.bbabio.2016.03.027. PMID 27048931.
- ^ A b C d "NDUFAF5 - Arginin-hydroxyláza NDUFAF5, mitochondriální". www.uniprot.org. Citováno 2018-07-18.
- ^ Saada A, Edvardson S, Shaag A, Chung WK, Segel R, Miller C, Jalas C, Elpeleg O (leden 2012). "Kombinovaná vada komplexu OXPHOS I a IV, kvůli mutovanému komplexu I komplexního faktoru C20ORF7". Journal of Inherited Metabolic Disease. 35 (1): 125–31. doi:10.1007 / s10545-011-9348-r. PMID 21607760. S2CID 29241633.
Další čtení
- Sugiana C, Pagliarini DJ, McKenzie M, Kirby DM, Salemi R, Abu-Amero KK, Dahl HH, Hutchison WM, Vascotto KA, Smith SM, Newbold RF, Christodoulou J, Calvo S, Mootha VK, Ryan MT, Thorburn DR ( Října 2008). „Mutace C20orf7 narušuje sestavu komplexu I a způsobuje smrtelné neonatální mitochondriální onemocnění“. American Journal of Human Genetics. 83 (4): 468–78. doi:10.1016 / j.ajhg.2008.09.009. PMC 2561934. PMID 18940309.
- Gerards M, Sluiter W, van den Bosch BJ, de Wit LE, Calis CM, Frentzen M, Akbari H, Schoonderwoerd K, Scholte HR, Jongbloed RJ, Hendrickx AT, de Coo IF, Smeets HJ (srpen 2010). „Vadný komplex I sestavy způsobený mutacemi C20orf7 jako nová příčina Leighova syndromu“. Journal of Medical Genetics. 47 (8): 507–12. doi:10.1136 / jmg.2009.067553. PMC 2921275. PMID 19542079.
- Rose JE, Behm FM, Drgon T, Johnson C, Uhl GR (2010). „Personalizované odvykání kouření: interakce mezi dávkou nikotinu, závislostí a skóre genotypu při ukončení léčby“. Molekulární medicína. 16 (7–8): 247–53. doi:10.2119 / molmed.2009.00159. PMC 2896464. PMID 20379614.
- Saada A, Edvardson S, Shaag A, Chung WK, Segel R, Miller C, Jalas C, Elpeleg O (leden 2012). "Kombinovaná vada komplexu OXPHOS I a IV v důsledku mutovaného komplexu I komplexního faktoru C20ORF7". Journal of Inherited Metabolic Disease. 35 (1): 125–31. doi:10.1007 / s10545-011-9348-r. PMID 21607760. S2CID 29241633.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.