Sinorhizobium medicae - Sinorhizobium medicae - Wikipedia

Sinorhizobium medicae
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Proteobakterie
Třída:
Alphaproteobacteria
Objednat:
Rhizobiales
Rodina:
Rhizobiaceae
Rod:
Sinorhizobium
Druh:
S. medicae
Binomické jméno
Sinorhizobium medicae
Rome a kol. 1996

Sinorhiozbium medicae je druh gramnegativní, fixace dusíkem, ve tvaru tyče bakterie. Mohou být volně žijící nebo symbionty luštěniny v kořenové uzliny. S.medicae byl poprvé izolován z kořenových uzlin na rostlinách rodu Medicago.[1] Některé kmeny S.medicae, jako WSM419, jsou aerobní. Jsou chemoorganotrofní mezofily kteří dávají přednost teplotám kolem 28 ° C. Kromě svého primárního genomu mají tyto organismy také tři známé plazmidy o velikosti 1 570 951 bp, 1 245 408 bp a 219 313 bp.[2]

Kolonie Sinorhiozbium medicae jsou mukoidní a prstencové a lze je zobrazit tady.

Fylogeneze / taxonomie

Rod je někdy označován jako Ensifer (starší termín) místo Sinorhizobium. Mezi dvě hlavní podskupiny patří S.medicae kmen A321 a S. medicae kmen WSM419. tento fylogenetický strom ukazuje příbuznost ke zbytku Rhizobiaceae rodina založená na 16s rRNA genových sekvencích.

Ekologická role a symbióza s luštěninami

Tato bakterie je často součástí mutualistic vztahy s luštěninami. Působí atmosféricky fixace dusíkem pro rostliny a výměnou za to přijímá organický uhlík procesem rozkladu. Volně žijící bakterie se nacházejí uvnitř specializovaných kořenových buněk kořenové uzliny, který vytváří anaerobní mikrohabitat, ve kterém může dojít k účinné N-fixaci. Tento vzájemný vztah byl pozorován u mnoha druhů rostlin, včetně Medicago polymorpha a Medicago truncatula rostliny z celého světa.[3] Rozsah vzájemnosti může záviset pH půdy, protože se předpokládalo, že kyselost může omezovat Sinorhizobium medicae. Současná myšlenka je, že odolnost vůči kyselinám, zejména u kmene WSM419, může být přenesena na plazmidy.[4]

Zemědělský význam

Protože S. medicae dobře se sdružuje s rostlinami rodu Medicago a zvyšuje růst rostlin, pole plodin jsou běžně naočkována bakteriemi navíc nebo jako náhrada syntetických hnojiv.[5]

Reference

  1. ^ Chen, WX; Yan, GH; Li, JL (1988). „Numerická taxonomická studie rychle rostoucí rhizobie sóji a návrh, aby byl Rhizobium fredii přidělen Sinorhizobium gen. Nov“. International Journal of Systematic Bacteriology. 38: 392–397. doi:10.1099/00207713-38-4-392.
  2. ^ Reeve, W; Řetěz, P; O'Hara, G; Ardley, J; Nandesena, K; Bräu, L; Tiwari, R; Malfatti, S; Kiss, H; Lapidus, A; Copeland, A; Nolan, M; Land, M; Hauser, L; Chang, YJ; Ivanova, N; Mavromatis, K; Markowitz, V; Kyrpides, N; Gollagher, M; Yates, R; Dilworth, M; Howieson, J (2010). "Kompletní sekvence genomu kmene Medicago microsymbiont Ensifer (Sinorhizobium) medicae WSM419". Standardy v genomických vědách. 2: 77–86. doi:10,4056 / sigs. 43526. PMC  3035259. PMID  21304680.
  3. ^ Řím, S; Fernandez, MP; Brunel, B; Normand, P; Cleyet-Marel, JC (1996). "Sinorhizobium medicae sp. Nov., Izolovaný z ročního Medicago spp.". International Journal of Systematic Bacteriology. 46: 972–980. doi:10.1099/00207713-46-4-972. PMID  8863426.
  4. ^ "Sinorhizobium medicae WSM419". Portál genomu JGI. Americké ministerstvo energetiky.
  5. ^ Shi, Ruihua. „Sekvenování, anotace a fixace dusíku genomem Sinorhizoibum“. University of Oklahoma.