MakroModel - MacroModel

MakroModel
VývojářiSchrödinger, LLC
První vydání1990; Před 30 lety (1990)
Stabilní uvolnění
11.3 / březen 2016; Před 4 lety (2016-03)
Operační systémLinux, Okna, Operační Systém Mac, IRIX, AIX
K dispozici vAngličtina
TypVýpočetní chemie
LicenceProprietární komerční software
webová stránkawww.schrodinger.com/ makromodel

MakroModel je počítačový program pro molekulární modelování z organické sloučeniny a biopolymery. Obsahuje různé chemická silová pole plus algoritmy minimalizující energii k předpovědi geometrie a relativní konformační energie molekuly.[1] MacroModel je udržován Schrödinger, LLC.

Provádí simulace v rámci klasická mechanika, také nazývané molekulární mechanika a může hrát molekulární dynamika simulace modelování systémů při konečných teplotách pomocí stochastická dynamika a smíšené Monte Carlo algoritmy. MakroModel podporuje Okna, Linux, Operační Systém Mac, Křemíková grafika (SGI) IRIX, a IBM AIX.

Softwarový balíček Macromodel byl poprvé popsán ve vědecké literatuře v roce 1990,[2] a byla následně získána společností Schrödinger, Inc. v roce 2000.[3]

Klíčové vlastnosti

Známá historie verzí

  • 2013: verze 10.0
  • 2012: verze 9.9.2
  • 2011: verze 9.9.1
  • 2010: verze 9.8
  • 2009: verze 9.7
  • 2008: verze 9.6
  • 2007: verze 9.5
  • 2006: verze 9.1
  • 2005: verze 9.0
  • 2004: verze 8.5
  • 2003: verze 8.1

Viz také

Reference

  1. ^ Mohamadi F, Richard NG, Guida WC, Liskamp R, Lipton M, Caufield C, Chang G, Hendrickson T, Still WC (květen 1990). „MacroModel - integrovaný softwarový systém pro modelování organických a bioorganických molekul pomocí molekulární mechaniky“. J. Comput. Chem. 11 (4): 440–467. doi:10.1002 / jcc.540110405.
  2. ^ Mohamadi, Fariborz; Richards, Nigel G. J .; Guida, Wayne C .; Liskamp, ​​Rob; Lipton, Mark; Caufield, Craig; Chang, George; Hendrickson, Thomas; Přesto, W. Clark (01.05.1990). „Makromodel - integrovaný softwarový systém pro modelování organických a bioorganických molekul pomocí molekulární mechaniky“. Journal of Computational Chemistry. 11 (4): 440–467. doi:10.1002 / jcc.540110405. ISSN  1096-987X.
  3. ^ "Přehled | Schrödinger". www.schrodinger.com. Citováno 2017-11-30.
  4. ^ Stále WC, Tempczyk A, Hawley RC, Hendrickson T (1990). "Semianalytické zpracování solvatace pro molekulární mechaniku a dynamiku". J Am Chem Soc. 112 (16): 6127–6129. doi:10.1021 / ja00172a038.
  5. ^ Guimarães CR, Cardozo M (květen 2008). "MM-GB / SA rescoring dokovacích pozic v optimalizaci vedení založené na struktuře". J Chem Inf Model. 48 (5): 958–70. doi:10.1021 / ci800004w. PMID  18422307.

externí odkazy