Seznam softwaru pro molekulární modelování v Monte Carlu - List of software for Monte Carlo molecular modeling - Wikipedia

Toto je seznam počítačových programů, které používají Metody Monte Carlo pro molekulární modelování.

Ušeň _{klasický hybridní MC}
ŠÉF _klasický
Cassandra _klasický^[1]
CP2K
FEASST _klasický^[2]
GOMC _klasický^[3]
MakroModel _klasický
Materiálové studio _klasický
RASPA _klasický^[4]
QMCPACK _kvantová^[5]
Spartan _klasický
Dráteník _klasický

Viz také

Reference

^ Shah, Jindal K .; Marin-Rimoldi, Eliseo; Mullen, Ryan Gotchy; Keene, Brian P .; Khan, Sandip; Paluch, Andrew S .; Rai, Neeraj; Romanielo, Lucienne L .; Rosch, Thomas W .; Yoo, Brian; Maginn, Edward J. (15. července 2017). „Cassandra: Otevřený balíček Monte Carlo pro molekulární simulaci“. Journal of Computational Chemistry. 38 (19): 1727–1739. doi:10.1002 / jcc.24807. PMID 28436594.
^ Hatch, Harold; Mahynski, Nathan; Shen, Vincent (1. března 2018). „FEASST: Free Energy and Advanced Sampling Simulation Toolkit“. Journal of Research of the National Institute of Standards and Technology. 123. doi:10,6028 / jres.123.004.
^ Nejahi, Younes; Soroush Barhaghi, Mohammad; Mick, Jason; Jackman, Brock; Rushaidat, Kamel; Li, Yuanzhe; Schwiebert, Loren; Potoff, Jeffrey (28. listopadu 2018). „GOMC: GPU optimalizované Monte Carlo pro simulaci fázových rovnováh a fyzikálních vlastností komplexních tekutin“. Software X. 9: 20–27. doi:10.1016 / j.softx.2018.11.005.
^ Dubbeldam, David; Calero, Sofía; Ellis, Donald E .; Snurr, Randall Q. (26. února 2015). „RASPA: software pro molekulární simulaci pro adsorpci a difúzi ve flexibilních nanoporézních materiálech“. Molekulární simulace. 42 (2): 81–101. doi:10.1080/08927022.2015.1010082.
^ Kim, J .; et al. (QMCPACK) (27. března 2018). „QMCPACK: Otevřený zdroj kvantového Monte Carlo balíčku ab initio pro elektronovou strukturu atomů, molekul a pevných látek“. Journal of Physics: Condensed Matter. V tisku (19): 195901. arXiv:1802.06922. Bibcode:2018JPCM ... 30s5901K. doi:10.1088 / 1361-648X / aab9c3. PMID 29582782.

[1] Shah, Jindal K .; Marin-Rimoldi, Eliseo; Mullen, Ryan Gotchy; Keene, Brian P .; Khan, Sandip; Paluch, Andrew S .; Rai, Neeraj; Romanielo, Lucienne L .; Rosch, Thomas W .; Yoo, Brian; Maginn, Edward J. (15. července 2017). „Cassandra: Otevřený balíček Monte Carlo pro molekulární simulaci“. Journal of Computational Chemistry. 38 (19): 1727–1739. doi:10.1002 / jcc.24807. PMID 28436594.

[2] Hatch, Harold; Mahynski, Nathan; Shen, Vincent (1. března 2018). „FEASST: Free Energy and Advanced Sampling Simulation Toolkit“. Journal of Research of the National Institute of Standards and Technology. 123. doi:10,6028 / jres.123.004.

[3] Nejahi, Younes; Soroush Barhaghi, Mohammad; Mick, Jason; Jackman, Brock; Rushaidat, Kamel; Li, Yuanzhe; Schwiebert, Loren; Potoff, Jeffrey (28. listopadu 2018). „GOMC: GPU optimalizované Monte Carlo pro simulaci fázových rovnováh a fyzikálních vlastností komplexních tekutin“. Software X. 9: 20–27. doi:10.1016 / j.softx.2018.11.005.

[4] Dubbeldam, David; Calero, Sofía; Ellis, Donald E .; Snurr, Randall Q. (26. února 2015). „RASPA: software pro molekulární simulaci pro adsorpci a difúzi ve flexibilních nanoporézních materiálech“. Molekulární simulace. 42 (2): 81–101. doi:10.1080/08927022.2015.1010082.

[5] Kim, J .; et al. (QMCPACK) (27. března 2018). „QMCPACK: Otevřený zdroj kvantového Monte Carlo balíčku ab initio pro elektronovou strukturu atomů, molekul a pevných látek“. Journal of Physics: Condensed Matter. V tisku (19): 195901. arXiv:1802.06922. Bibcode:2018JPCM ... 30s5901K. doi:10.1088 / 1361-648X / aab9c3. PMID 29582782.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]