LGP2 - LGP2

DHX58
Protein DHX58 PDB 2RQA.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyDHX58, D11LGP2, D11lgp2e, LGP2, RLR-3, DEXH-box helicase 58
Externí IDOMIM: 608588 MGI: 1931560 HomoloGene: 69371 Genové karty: DHX58
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomické umístění pro DHX58
Genomické umístění pro DHX58
Kapela17q21.2Start42,101,404 bp[1]
Konec42,112,714 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE LGP2 219364 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

79132

80861

Ensembl

ENSG00000108771

ENSMUSG00000017830

UniProt

Q96C10

Q99J87

RefSeq (mRNA)

NM_024119

NM_030150

RefSeq (protein)

NP_077024

NP_084426

Místo (UCSC)Chr 17: 42,1 - 42,11 MbChr 11: 100,69 - 100,7 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Pravděpodobná ATP-dependentní RNA helikáza DHX58 také známý jako Receptor podobný RIG-I 3 (RLR-3) nebo RIG-I podobný receptor LGP2 (RLR) je a Receptor podobný RIG-I dsRNA helikáza enzym že u lidí je kódován DHX58 gen.[5][6] The protein kódovaný genem DHX58 je známý jako LGP2 (Laboratoř genetiky a fyziologie 2).[5][7][8]

Struktura a funkce

LGP2 byl poprvé identifikován a charakterizován v kontextu prsní tkáň v roce 2001,[5] ale bylo zjištěno, že jeho funkce je relevantnější pro oblast vrozená antivirová imunita. Bylo zjištěno, že LGP2 je nezbytný pro produkci účinných antivirových reakcí proti mnoha virům, které jsou rozpoznávány RIG-I a MDA5.[9]

Protože LGP2 chybí KARTU domén je jeho účinek na následnou antivirovou signalizaci pravděpodobně způsoben interakcí s virovou dsRNA ligand nebo další RLR (RIG-I a MDA5).[10]

Ukázalo se, že LGP2 přímo interaguje[10] s RIG-I prostřednictvím jeho C-terminální represorové domény (RD). Primární kontaktní místa v této interakci jsou pravděpodobně mezi RD LGP2 a doménou CARD nebo helikázou RIG-I, jak je vidět na samo-asociaci RIG-I,[10] ale toto nebylo potvrzeno. Bylo zjištěno, že aktivita helikázy LGP2 je nezbytná pro její pozitivní regulaci signalizace RIG-I.[9] Nadměrná exprese LGP2 je schopen inhibovat RIG-I zprostředkovanou antivirovou signalizaci jak v přítomnosti, tak v nepřítomnosti virových ligandů.[10][11][12] Tato inhibice signalizace RIG-I nezávisí na schopnosti LGP2 vázat virové ligandy, a proto není způsobena kompeticí ligandu.[7][13] Ačkoli se LGP2 váže na dsRNA s vyšší afinitou,[12] je postradatelný pro RIG-I zprostředkované rozpoznávání syntetických dsRNA ligandů.[9] RIG-I, když je nadměrně vyjádřen[7] a v LGP2 srazit studie,[14] Bylo prokázáno, že indukuje antivirovou reakci v nepřítomnosti virového ligandu.

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000108771 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017830 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b C Cui Y, Li M, Walton KD, Sun K, Hanover JA, Furth PA, Hennighausen L (prosinec 2001). „Lokus Stat3 / 5 kóduje nové endoplazmatické retikulum a proteiny podobné helikáze, které jsou přednostně exprimovány v normální a neoplastické prsní tkáni.“ Genomika. 78 (3): 129–34. doi:10.1006 / geno.2001.6661. PMID  11735219.
  6. ^ „Entrez Gene: LGP2 pravděpodobně ortolog myši D11lgp2“.
  7. ^ A b C Childs K, Randall R, Goodbourn S (duben 2012). „Paramyxovirus V proteiny interagují s RNA Helicase LGP2 a inhibují indukci interferonu závislou na RIG-I“. J. Virol. 86 (7): 3411–21. doi:10.1128 / JVI.06405-11. PMC  3302505. PMID  22301134.
  8. ^ Matsumiya T, Stafforini DM (2010). "Funkce a regulace genu I indukovaného kyselinou retinovou". Krit. Rev. Immunol. 30 (6): 489–513. doi:10.1615 / critrevimmunol.v30.i6.10. PMC  3099591. PMID  21175414.
  9. ^ A b C Satoh T, Kato H, Kumagai Y, Yoneyama M, Sato S, Matsushita K, Tsujimura T, Fujita T, Akira S, Takeuchi O (leden 2010). „LGP2 je pozitivní regulátor antivirových reakcí zprostředkovaných RIG-I a MDA5“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 107 (4): 1512–7. doi:10.1073 / pnas.0912986107. PMC  2824407. PMID  20080593.
  10. ^ A b C d Saito T, Hirai R, Loo YM, Owen D, Johnson CL, Sinha SC, Akira S, Fujita T, Gale M (leden 2007). „Regulace vrozené antivirové obrany prostřednictvím sdílené represorové domény v RIG-I a LGP2“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 104 (2): 582–7. doi:10.1073 / pnas.0606699104. PMC  1766428. PMID  17190814.
  11. ^ Rothenfusser S, Goutagny N, DiPerna G, Gong M, Monks BG, Schoenemeyer A, Yamamoto M, Akira S, Fitzgerald KA (říjen 2005). „RNA helikáza Lgp2 inhibuje na TLR nezávislé snímání virové replikace genem I indukovatelným kyselinou retinovou“. J. Immunol. 175 (8): 5260–8. doi:10,4049 / jimmunol.175.8.5260. PMID  16210631.
  12. ^ A b Yoneyama M, Kikuchi M, Matsumoto K, Imaizumi T, Miyagishi M, Taira K, Foy E, Loo YM, Gale M, Akira S, Yonehara S, Kato A, Fujita T (září 2005). „Sdílené a jedinečné funkce helixů DExD / H-box RIG-I, MDA5 a LGP2 v přirozené antivirové imunitě“. J. Immunol. 175 (5): 2851–8. doi:10,4049 / jimmunol.175.5.2851. PMID  16116171.
  13. ^ Wang Y, Ludwig J, Schuberth C, Goldeck M, Schlee M, Li H, Juranek S, Sheng G, Micura R, Tuschl T, Hartmann G, Patel DJ (červenec 2010). „Strukturální a funkční poznatky o rozpoznávání 5'-ppp RNA vzoru vrozeným imunitním receptorem RIG-I“. Nat. Struct. Mol. Biol. 17 (7): 781–7. doi:10.1038 / nsmb.1863. PMC  3744876. PMID  20581823.
  14. ^ Burel SA, Machemer T, Ragone FL, Kato H, Cauntay P, Greenlee S, Salim A, Gaarde WA, Hung G, Peralta R, Freier SM, Henry SP (červenec 2012). „Unikátní chimérický oligonukleotid O-methoxyethyl ribóza-DNA indukuje 5-závislou indukci atypické melanomové genové indukce reakce interferonu typu I“. J. Pharmacol. Exp. Ther. 342 (1): 150–62. doi:10.1124 / jpet.112.193789. PMID  22505629. S2CID  1899247.

Další čtení