HuD (protein) - HuD (protein)

ELAVL4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1FXL, 1G2E
Identifikátory
Aliasy	ELAVL4, HUD, PNEM, HuD, ELAV jako protein vázající neuron specifický pro RNA 4, ELAV jako protein vázající RNA 4
Externí ID	OMIM: 168360 MGI: 107427 HomoloGene: 40729 Genové karty: ELAVL4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	50,203,786 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	110,351,909 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
	1996
	15572
	ENSG00000162374
	ENSMUSG00000028546
	P26378
	Q61701
NM_001144774; NM_001144775; NM_001144776; NM_001144777; NM_001294348;
	NM_021952; NM_001324208; NM_001324209; NM_001324212; NM_001324213; NM_001324214; NM_001324215; NM_001324216; NM_001324217
NM_001038698; NM_001163397; NM_001163399; NM_010488; NM_001347178;
	NM_001357190
NP_001138246; NP_001138247; NP_001138248; NP_001138249; NP_001281277;
	NP_001311137; NP_001311138; NP_001311141; NP_001311142; NP_001311143; NP_001311144; NP_001311145; NP_001311146; NP_068771
NP_001033787; NP_001156869; NP_001156871; NP_001334107; NP_034618;
	NP_001344119
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

HuD jinak známý jako ELAV-like protein 4 je protein že u lidí je kódován ELAVL4 gen.^[5]^[6]

Protein HuD / ELAVL4 je Protein vázající RNA.^[7] HuD obsahuje tři RRM proteinové domény, umožňující vazbu RNA.^[8]

HuD je exprimován pouze v neuronech a váže se na Element bohatý na AU - obsahující mRNA. Výsledkem této interakce je prodloužení poločasu přepisu. HuD je důležitý v neuronech během vývoje mozku a plasticity.^[9]^[10]

Interakce

Bylo prokázáno, že HuD (protein) komunikovat s NXF1.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162374 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028546 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Muresu R, Baldini A, Gress T, Posner JB, Furneaux HM, Siniscalco M (prosinec 1993). "Mapování genu kódujícího antigen paraneoplastické encefalomyelitidy (HuD) na místo lidského chromozomu 1p34". Cytogenet Cell Genet. 65 (3): 177–8. doi:10.1159/000133626. PMID 8222755.
^ „Entrez Gene: ELAVL4 ELAV (embryonální letální, abnormální vidění, Drosophila) podobné 4 (Hu antigen D)“.
^ Szabo A, Dalmau J, Manley G a kol. (1991). „HuD, antigen paraneoplastické encefalomyelitidy, obsahuje domény vázající RNA a je homologní s Elav a Sex-lethal“. Buňka. 67 (2): 325–33. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90184-Z. PMID 1655278.
^ Lukong, Kiven E .; Chang, Kai-wei; Khandjian, Edouard W .; Richard, Stéphane (2008-08-01). "Proteiny vázající RNA u lidských genetických chorob". Trendy v genetice. 24 (8): 416–425. doi:10.1016 / j.tig.2008.05.004. ISSN 0168-9525. PMID 18597886.
^ Nora Perrone-Bizzozero; Federico Bolognani (2002). "Role HuD a dalších proteinů vázajících RNA v nervovém vývoji a plasticitě". J Neurosci Res. 68 (2): 121–126. doi:10.1002 / jnr.10175. PMID 11948657.
^ Federico Bolognani; Nora Perrone-Bizzozero (2008). "Interakce RNA-protein a řízení stability mRNA v neuronech". J Neurosci Res. 86 (3): 481–489. doi:10.1002 / jnr.21473. PMID 17853436.
^ Saito, Kuniaki; Fujiwara Toshinobu; Katahira Jun; Inoue Kunio; Sakamoto Hiroshi (srpen 2004). „TAP / NXF1, primární exportní receptor mRNA, specificky interaguje s proteinem HuD vázajícím se na neuronovou RNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. Spojené státy. 321 (2): 291–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.06.140. ISSN 0006-291X. PMID 15358174.

Další čtení

Dalmau J, Furneaux HM, Cordon-Cardo C. Posner JB (1992). „Exprese antigenu Hu (paraneoplastická encefalomyelitida / senzorická neuronopatie) v lidské a nádorové tkáni“. Dopoledne. J. Pathol. 141 (4): 881–6. PMC 1886624. PMID 1415481.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
Szabo A, Dalmau J, Manley G a kol. (1991). „HuD, antigen paraneoplastické encefalomyelitidy, obsahuje domény vázající RNA a je homologní s Elav a Sex-lethal“. Buňka. 67 (2): 325–33. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90184-Z. PMID 1655278.
Graus F, Ferrer I (1990). „Analýza exprese neuronového antigenu (Hu) ve vyvíjejícím se potkaním mozku detekovaná autoprotilátkami od pacientů s paraneoplastickou encefalomyelitidou“. Neurosci. Lett. 112 (1): 14–8. doi:10.1016 / 0304-3940 (90) 90314-Y. PMID 2166930.
Sekido Y, Bader SA, Carbone DP a kol. (1994). „Molekulární analýza genu HuD kódujícího paraneoplastický antigen encefalomyelitidy v buněčných liniích lidské rakoviny plic“. Cancer Res. 54 (18): 4988–92. PMID 8069866.
Torà M, Graus F, de Bolòs C, Real FX (1997). „Exprese paraneoplastické encefalomyelitidy / Hu antigenů asociovaných se senzorickou neuronopatií na buněčném povrchu u malobuněčných plicních nádorů a neuroblastomů“. Neurologie. 48 (3): 735–41. doi:10.1212 / mn. 48.3.735. PMID 9065557.
Lazarova DL, Spengler BA, Biedler JL, Ross RA (1999). „HuD, neuronově specifický protein vázající RNA, je domnělým regulátorem zpracování / stability pre-mRNA N-myc u maligních lidských neuroblastů“. Onkogen. 18 (17): 2703–10. doi:10.1038 / sj.onc.1202621. PMID 10348344.
Park S, Myszka DG, Yu M a kol. (2000). „Motivy rozpoznávání HuD RNA hrají odlišnou roli při tvorbě stabilního komplexu s RNA bohatou na AU“. Mol. Buňka. Biol. 20 (13): 4765–72. doi:10.1128 / MCB.20.13.4765-4772.2000. PMC 85909. PMID 10848602.
Wang X, Tanaka Hall TM (2001). "Strukturální základna pro rozpoznávání RNA prvků bohatých na AU proteinem HuD". Nat. Struct. Biol. 8 (2): 141–5. doi:10.1038/84131. PMID 11175903.
Beckel-Mitchener AC, Miera A, Keller R, Perrone-Bizzozero NI (2002). „Stabilizace GAP-43 mRNA závislou na délce ocasu na poly (A) pomocí proteinu HuD vázajícího RNA“. J. Biol. Chem. 277 (31): 27996–8002. doi:10,1074 / jbc.M201982200. PMID 12034726.
Behrends U, Jandl T, Golbeck A a kol. (2002). „Nové produkty genů HUD, HUC, NNP-1 a alfa-internexinu identifikované autologním screeningem protilátek v knihovně pediatrických neuroblastomů“. Int. J. Cancer. 100 (6): 669–77. doi:10.1002 / ijc.10550. PMID 12209604.
Aronov S, Aranda G, Behar L, Ginzburg I (2003). „Vizualizace přeloženého tau proteinu v axonech neuronálních buněk P19 a charakterizace granulí tau RNP“. J. Cell Sci. 115 (Pt 19): 3817–27. doi:10,1242 / jcs.00058. PMID 12235292.
Angenstein F, Evans AM, Settlage RE a kol. (2002). „Receptor pro aktivovanou C kinázu je součástí messengerových ribonukleoproteinových komplexů asociovaných s polyA-mRNA v neuronech“. J. Neurosci. 22 (20): 8827–37. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-20-08827.2002. PMID 12388589.
Deschenes-Furry J, Belanger G, Perrone-Bizzozero N, Jasmin BJ (2003). „Post-transkripční regulace mRNA acetylcholinesterázy v buňkách PC12 ošetřených nervovým růstovým faktorem pomocí proteinu HuD vázajícího RNA“. J. Biol. Chem. 278 (8): 5710–7. doi:10,1074 / jbc.M209383200. PMID 12468554.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Plonquet A, Garcia-Pons F, Fernandez E a kol. (2004). „Peptidy odvozené od onkourálního proteinu HuD mohou vyvolat cytotoxické reakce u HHD myší a lidí“. J. Neuroimmunol. 142 (1–2): 93–100. doi:10.1016 / S0165-5728 (03) 00269-8. PMID 14512168.
Saito K, Fujiwara T, Katahira J a kol. (2004). „TAP / NXF1, primární exportní receptor mRNA, specificky interaguje s proteinem HuD vázajícím se na neuronovou RNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321 (2): 291–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.06.140. PMID 15358174.
Rousseau A, Benyahia B, Dalmau J a kol. (2005). "Odpověď T buněk na Hu-D peptidy u pacientů s anti-Hu syndromem". J. Neurooncol. 71 (3): 231–6. doi:10.1007 / s11060-004-1723-1. PMC 2586925. PMID 15735910.
Noureddine MA, Qin XJ, Oliveira SA a kol. (2005). „Asociace mezi neuronově specifickým proteinem vázajícím RNA ELAVL4 a Parkinsonovou chorobou“. Hučení. Genet. 117 (1): 27–33. doi:10.1007 / s00439-005-1259-2. PMID 15827745.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162374 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028546 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8222755-5] Muresu R, Baldini A, Gress T, Posner JB, Furneaux HM, Siniscalco M (prosinec 1993). "Mapování genu kódujícího antigen paraneoplastické encefalomyelitidy (HuD) na místo lidského chromozomu 1p34". Cytogenet Cell Genet. 65 (3): 177–8. doi:10.1159/000133626. PMID 8222755.

[entrez-6] „Entrez Gene: ELAVL4 ELAV (embryonální letální, abnormální vidění, Drosophila) podobné 4 (Hu antigen D)“.

[7] Szabo A, Dalmau J, Manley G a kol. (1991). „HuD, antigen paraneoplastické encefalomyelitidy, obsahuje domény vázající RNA a je homologní s Elav a Sex-lethal“. Buňka. 67 (2): 325–33. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90184-Z. PMID 1655278.

[8] Lukong, Kiven E .; Chang, Kai-wei; Khandjian, Edouard W .; Richard, Stéphane (2008-08-01). "Proteiny vázající RNA u lidských genetických chorob". Trendy v genetice. 24 (8): 416–425. doi:10.1016 / j.tig.2008.05.004. ISSN 0168-9525. PMID 18597886.

[9] Nora Perrone-Bizzozero; Federico Bolognani (2002). "Role HuD a dalších proteinů vázajících RNA v nervovém vývoji a plasticitě". J Neurosci Res. 68 (2): 121–126. doi:10.1002 / jnr.10175. PMID 11948657.

[10] Federico Bolognani; Nora Perrone-Bizzozero (2008). "Interakce RNA-protein a řízení stability mRNA v neuronech". J Neurosci Res. 86 (3): 481–489. doi:10.1002 / jnr.21473. PMID 17853436.

[pmid15358174-11] Saito, Kuniaki; Fujiwara Toshinobu; Katahira Jun; Inoue Kunio; Sakamoto Hiroshi (srpen 2004). „TAP / NXF1, primární exportní receptor mRNA, specificky interaguje s proteinem HuD vázajícím se na neuronovou RNA“. Biochem. Biophys. Res. Commun. Spojené státy. 321 (2): 291–7. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.06.140. ISSN 0006-291X. PMID 15358174.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]