ZFP36L1 - ZFP36L1

ZFP36L1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1W0V, 1W0W
Identifikátory
Aliasy	ZFP36L1, BRF1, Berg36, ERF-1, ERF1, RNF162B, TIS11B, cMG1, protein podobný prstenovému prstu 1, protein prstenového prstu ZFP36 jako 1
Externí ID	OMIM: 601064 MGI: 107946 HomoloGene: 31276 Genové karty: ZFP36L1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	68,796,253 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	80,113,013 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • Vazba prvků bohatých na AU; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • mRNA vazba; • Vazba 14-3-3 proteinů; • Vazba RNA; • Vazba na oblast bohatou na mRNA 3'-UTR AU; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • mRNA 3'-UTR vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • cytosol; • P-tělo; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• vývoj vrstvy spongiotrofoblastů; • mRNA katabolický proces; • růst mnohobuněčných organismů; • vývoj embryonálních orgánů; • chorio-alantoidní fúze; • vaskulogeneze; • vývoj proepikardu; • vývoj srdce; • jaderně transkribovaný katabolický proces mRNA, rozpad závislý na Deadenylation; • vývoj neurální trubice; • buněčná proliferace; • regulace překladu; • apoptotický proces; • Diferenciace T buněk v brzlíku; • regulace genové exprese; • negativní regulace diferenciace erytrocytů; • buněčná odpověď na inzulínový stimul; • buněčná odpověď na forbol 13-acetát 12-myristát; • Kaskáda ERK1 a ERK2; • pozitivní regulace intracelulární lokalizace mRNA; • buněčná odpověď na stimul glukokortikoidů; • buněčná odpověď na stimul transformujícího růstového faktoru beta; • regulace diferenciace keratinocytů; • reakce na zranění; • pozitivní regulace diferenciace monocytů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • buněčná odpověď na hypoxii; • regulace apoptotického procesu keratinocytů; • regulace množení keratinocytů; • signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy; • buněčná odpověď na faktor nekrózy nádoru; • buněčná odpověď na stimul epidermálního růstového faktoru; • regulace zpracování mRNA na 3'-konci; • Kaskáda MAPK; • Zpracování mRNA; • vývoj mnohobuněčných organismů; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, rozpad nezávislý na deadenylaci; • kaskáda p38MAPK; • regulace stability mRNA; • signalizace protein kinázy B.; • buněčná odpověď na stimul fibroblastového růstového faktoru; • regulace diferenciace B buněk; • pozitivní regulace diferenciace tukových buněk; • regulace diferenciace myoblastů; • vývoj mezendodermu; • transport mRNA; • Destabilizace mRNA zprostředkovaná 3'-UTR; • buněčná odpověď na cAMP; • buněčná odpověď na stimul peptidového hormonu; • buněčná odpověď na stres solí; • regulace proliferace kmenových buněk; • buněčná odpověď na rafinózu; • pozitivní regulace jaderně transkribovaného katabolického procesu mRNA, rozpad závislý na deadenylaci; • negativní regulace fázového přechodu mitotického buněčného cyklu; • doprava; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	677
	12192
	ENSG00000185650
	ENSMUSG00000021127
	Q07352
	P23950
	NM_004926; NM_001244698; NM_001244701
	NM_007564
	NP_001231627; NP_001231630; NP_004917
	NP_031590
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor reakce butyrátu 1 je protein že u lidí je kódován ZFP36L1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen je členem rodiny TIS11 z geny časné odezvy. Členové rodiny jsou indukováni různými agonisty, jako je forbolester TPA a polypeptidový mitogen EGF. Gen je dobře konzervován napříč druhy a má promotor, který obsahuje motivy pozorované v jiných genech s časnou odezvou. Kódovaný protein obsahuje rozlišovací údaj zinkový prst doména s opakujícím se cystickým motivem. Tento protein vázající RNA s největší pravděpodobností funguje při regulaci odpovědi na růstové faktory.^[6]

Interakce

ZFP36L1 bylo prokázáno komunikovat s MAPK14.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185650 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021127 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bustin SA, Nie XF, Barnard RC, Kumar V, Pascall JC, Brown KD, Leigh IM, Williams NS, McKay IA (srpen 1994). „Klonování a charakterizace ERF-1, lidského člena rodiny genů Tis11 genů pro časnou odezvu“. DNA Cell Biol. 13 (5): 449–59. doi:10.1089 / dna.1994.13.449. PMID 8024689.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ZFP36L1 protein se zinkovým prstem 36, typ podobný C3H 1“.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY „Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

Další čtení

Hodson DJ, Janas ML, Galloway A, Bell SE, Andrews S, Li CM, Pannell R, Siebel CW, MacDonald HR, De Keersmaecker K, Ferrando AA, Grutz G, Turner M (srpen 2010). „Delece proteinů vázajících RNA ZFP36L1 a ZFP36L2 vede k narušení thymického vývoje a T lymfoblastické leukémie“. Nat. Immunol. 11 (8): 717–24. doi:10.1038 / ni.1901. PMC 2953641. PMID 20622884.
Bell SE, Sanchez MJ, Spasic-Boskovic O, Santalucia T, Gambardella L, Burton GJ, Murphy JJ, Norton JD, Clark AR, Turner M (listopad 2006). „Protein vázající RNA Zfp36l1 je nutný pro normální vaskularizaci a post-transkripčně reguluje expresi VEGF.“ Dev. Dyn. 235 (11): 3144–55. doi:10.1002 / dvdy.20949. PMID 17013884.
Barnard RC, Pascall JC, Brown KD, McKay IA, Williams NS, Bustin SA (červenec 1993). „Kódující sekvence ERF-1, lidského homologu Tis11b / cMG1, členů rodiny genů rané odezvy Tis11“. Nucleic Acids Res. 21 (15): 3580. doi:10.1093 / nar / 21.15.3580. PMC 331466. PMID 8346037.
Maclean KN, viz CG, McKay IA, Bustin SA (listopad 1995). "Lidský okamžitý časný gen BRF1 se mapuje na chromozom 14q22-q24". Genomika. 30 (1): 89–90. doi:10.1006 / geno.1995.0014. PMID 8595910.
Ning ZQ, Norton JD, Li J, Murphy JJ (říjen 1996). „Výrazné mechanismy pro záchranu z apoptózy v lidských B buňkách Ramos signalizací prostřednictvím receptoru CD40 a interleukinu-4: role pro inhibici genu pro časnou odpověď, Berg36“. Eur. J. Immunol. 26 (10): 2356–63. doi:10.1002 / eji.1830261013. PMID 8898945.
Blackshear PJ, Phillips RS, Vazquez-Matias J, Mohrenweiser H (2003). „Polymorfismy v genech kódujících členy rodiny tristetraprolinu lidských tandemových proteinů CCCH se zinkovým prstem“. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Pokrok ve výzkumu nukleových kyselin a molekulární biologie. 75: 43–68. doi:10.1016 / S0079-6603 (03) 75002-8. ISBN 9780125400756. PMID 14604009.
Reppe S, Olstad OK, Rian E, Gautvik VT, Gautvik KM, Jemtland R (listopad 2004). „Faktor reakce 1 butyrátu je regulován paratyroidním hormonem a kostním morfogenetickým proteinem-2 v osteoblastických buňkách“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 324 (1): 218–23. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.09.030. PMID 15465005.
Ciais D, Cherradi N, Bailly S, Grenier E, Berra E, Pouyssegur J, Lamarre J, Feige JJ (listopad 2004). „Destabilizace mRNA vaskulárního endoteliálního růstového faktoru proteinem TIS11b se zinkovým prstem“. Onkogen. 23 (53): 8673–80. doi:10.1038 / sj.onc.1207939. PMID 15467755.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185650 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021127 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8024689-5] Bustin SA, Nie XF, Barnard RC, Kumar V, Pascall JC, Brown KD, Leigh IM, Williams NS, McKay IA (srpen 1994). „Klonování a charakterizace ERF-1, lidského člena rodiny genů Tis11 genů pro časnou odezvu“. DNA Cell Biol. 13 (5): 449–59. doi:10.1089 / dna.1994.13.449. PMID 8024689.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ZFP36L1 protein se zinkovým prstem 36, typ podobný C3H 1“.

[pmid16189514-7] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY „Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]