Geranylgeranyltransferáza typu 1 - Geranylgeranyltransferase type 1
| protein geranylgeranyltransferáza typu I | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 2.5.1.59 | ||||||||
| Číslo CAS | 135371-29-8 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Α-podjednotka GGTázy 1 (farnesyltransferáza, CAAX box ) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||
| Symbol | FNTA | ||||||
| Gen NCBI | 2339 | ||||||
| HGNC | 3782 | ||||||
| OMIM | 134635 | ||||||
| PDB | 1S64 | ||||||
| RefSeq | NM_002027 | ||||||
| UniProt | P49354 | ||||||
| Další údaje | |||||||
| EC číslo | 2.5.1.59 | ||||||
| Místo | Chr. 8 p11.21 | ||||||
| |||||||
| Β-podjednotka GGTázy 1 (protein geranylgeranyl- transferáza typu I, β podjednotka) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||
| Symbol | PGGT1B | ||||||
| Gen NCBI | 5229 | ||||||
| HGNC | 8895 | ||||||
| OMIM | 602031 | ||||||
| PDB | 1S64 | ||||||
| RefSeq | NM_005023 | ||||||
| UniProt | P53609 | ||||||
| Další údaje | |||||||
| EC číslo | 2.5.1.59 | ||||||
| Místo | Chr. 5 q23.1 | ||||||
| |||||||
Geranylgeranyltransferáza typu 1 nebo jednoduše geranylgeranyltransferáza je jedním ze tří enzymy v prenyltransferáza skupina. Konkrétně Geranylgeranyltransferáza (GGTáza 1) přidává 20-uhlíkatý izoprenoid zvaný geranylgeranylová skupina k proteinům nesoucím motiv CaaX: sekvenci čtyř aminokyselin na karboxylovém konci proteinu. Inhibitory geranylgeranyltransferázy jsou zkoumány jako protinádorové látky.[1]
Funkce
Prenyltransferázy, včetně geranylgeranyltransferázy, posttranslačně upravit proteiny přidáním isoprenoidového lipidu nazývaného prenylová skupina na karboxylový konec cílového proteinu. Tento proces se nazývá prenylace, způsobuje, že se prenylované proteiny stávají asociovanými s membránou v důsledku hydrofobní povahy prenylové skupiny. Většina prenylovaných proteinů se účastní buněčné signalizace, přičemž membránová asociace je pro funkci rozhodující.[1]
Struktura
Geranylgeranyltransferáza obsahuje dva podjednotky, α a β, které jsou kódovány pomocí FNTA a PGGT1B geny. Obě podjednotky se skládají převážně z alfa helixy. Geranylgeranyltransferáza koordinuje zinkový kation na své β podjednotce na okraji aktivního místa. Geranylgeranyltransferáza má hydrofobní vázací kapsu pro geranylgeranyl difosfát, molekula dárce lipidů. Všechny substráty Geranylgeranyltransferázy mají jako svůj čtvrtý předposlední zbytek cystein. Tento cystein, koordinovaný zinkem, se účastní SN2 typu útoku na geranylgeranyl difosfát, vytlačující difosfát.[2][3]
Viz také
- Farnesyltransferáza
- Prenylace
- Rab geranylgeranyltransferáza - Geranylgeranyltransferáza typu 2
Reference
- ^ A b Lane KT, Beese LS (duben 2006). "Tematická revizní řada: lipidové posttranslační modifikace. Strukturní biologie proteinové farnesyltransferázy a geranylgeranyltransferázy typu I". J. Lipid Res. 47 (4): 681–99. doi:10.1194 / jlr.R600002-JLR200. PMID 16477080.
- ^ Reid TS, Terry KL, Casey PJ, Beese LS (říjen 2004). "Krystalografická analýza CaaX prenyltransferáz komplexovaných se substráty definuje pravidla selektivity proteinového substrátu". J. Mol. Biol. 343 (2): 417–33. doi:10.1016 / j.jmb.2004.08.056. PMID 15451670.
- ^ Long SB, Casey PJ, Beese LS (říjen 2002). "Reakční cesta proteinové farnesyltransferázy při atomovém rozlišení". Příroda. 419 (6907): 645–50. doi:10.1038 / nature00986. PMID 12374986. S2CID 4412580.
Další čtení
- Eastman RT, Buckner FS, Yokoyama K, Gelb MH, Van Voorhis WC (únor 2006). "Tematická revizní řada: posttranslační modifikace lipidů. Boj proti parazitární chorobě blokováním farnesylace proteinů". J. Lipid Res. 47 (2): 233–40. doi:10.1194 / jlr.R500016-JLR200. PMID 16339110.
- El Oualid F, Cohen LH, van der Marel GA, Overhand M (2006). "Inhibitory bílkovin: geranylgeranyl transferázy". Curr. Med. Chem. 13 (20): 2385–427. doi:10.2174/092986706777935078. PMID 16918362.