GHKL doména - GHKL domain

Histidinkináza, DNA gyráza B a ATPáza podobná HSP90
PDB 1ah6 EBI.jpg
Struktura N-terminální domény kvasinkového chaperonu Hsp90.[1]
Identifikátory
SymbolHATPase_c
PfamPF02518
InterProIPR003594
CHYTRÝHATPase_c
SCOP21ei1 / Rozsah / SUPFAM
CDDcd00075

The GHKL doména (Gvýrok, Hsp90, Histidin K.inase, MutL ) je evoluční konzervovaný proteinová doména.[2]

Tato rodina představuje strukturálně příbuzné ATPáza domény histidinkinázy, DNA gyrázy B a HSP90. Tato doména se nachází v několika proteinech vázajících ATP, například: histidinkináza, DNA gyráza B, topoizomerázy,[3] protein tepelného šoku HSP90,[4][5][6] fytochromové ATPázy a opravné proteiny nesouladu DNA. Více informací o tomto proteinu najdete na Protein měsíce: DNA topoizomeráza.[7]

Podskupiny

Členové

Reference

  1. ^ Prodromou C, Roe SM, Piper PW, Pearl LH (červen 1997). „Molekulární svorka v krystalové struktuře N-koncové domény kvasinkového chaperonu Hsp90“. Nat. Struct. Biol. 4 (6): 477–82. doi:10.1038 / nsb0697-477. PMID  9187656. S2CID  38764610.
  2. ^ Dutta R, Inouye M (leden 2000). "GHKL, vznikající nadrodina ATPázy / kinázy". Trends Biochem. Sci. 25 (1): 24–8. doi:10.1016 / S0968-0004 (99) 01503-0. PMID  10637609.
  3. ^ Bellon S, Parsons JD, Wei Y, Hayakawa K, Swenson LL, Charifson PS, Lippke JA, Aldape R, Gross CH (květen 2004). „Krystalové struktury podjednotky ParE topoizomerázy IV Escherichia coli (24 a 43 kilodaltonů): jediný zbytek určuje rozdíly v účinnosti novobiocinu proti topoizomeráze IV a DNA gyře“. Antimicrob. Agenti Chemother. 48 (5): 1856–64. doi:10.1128 / AAC.48.5.1856-1864.2004. PMC  400558. PMID  15105144.
  4. ^ Immormino RM, Dollins DE, Shaffer PL, Soldano KL, Walker MA, Gewirth DT (říjen 2004). „Ligandem indukovaný konformační posun v N-koncové doméně GRP94, chaperonu Hsp90“. J. Biol. Chem. 279 (44): 46162–71. doi:10,1074 / jbc.M405253200. PMID  15292259.
  5. ^ Roe SM, Ali MM, Meyer P, Vaughan CK, Panaretou B, Piper PW, Prodromou C, Pearl LH (leden 2004). "Mechanismus regulace Hsp90 proteinově specifickým kochaperonem p50 (cdc37)". Buňka. 116 (1): 87–98. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 01027-4. PMID  14718169. S2CID  797232.
  6. ^ Wright L, Barril X, Dymock B, Sheridan L, Surgenor A, Beswick M, Drysdale M, Collier A, Massey A, Davies N, Fink A, Fromont C, Aherne W, Boxall K, Sharp S, Workman P, Hubbard RE (Červen 2004). "Vztahy mezi strukturou a aktivitou ve vazbě inhibitoru na bázi purinu na izoformy HSP90". Chem. Biol. 11 (6): 775–85. doi:10.1016 / j.chembiol.2004.03.033. PMID  15217611.
  7. ^ McDowall J (2006). "DNA topoizomeráza". Protein měsíce. InterPro.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR003594