David L. Nelson - David L. Nelson - Wikipedia

David L. Nelson
narozený1956
Washington DC
Alma materUniversity of Virginia (BA )
Massachusetts Institute of Technology MIT (PhD, Postdoc )
Baylor College of Medicine (Postdoc )
OceněníCena Williama Rosena (2000)
Huntington Disease Society of America Leadership Award (200)
Barbara Bowman Distinguished Geneticist (2010)
Vědecká kariéra
PoleMolekulární genetika, Lidský genom, Segmentová duplikace, Genová duplikace
InstituceUniversity of Virginia
Ústav biologie MIT
Národní institut neurologických poruch a mozkové mrtvice
Baylor College of Medicine
TezeChromozomový přenos zavedených selektovatelných markerů: použití při mapování a izolaci genů (projekt dizertační práce, MIT, s Dr. Davidem Housmanem) (1984)

David L. Nelson (narozený 1956) je americký genetik, v současné době náměstek ředitele Výzkumného centra pro intelektuální a vývojová postižení (1995) a profesor na Katedře molekulární a lidské genetiky na Baylor College of Medicine BCM od roku 1999. Od roku 2018 je ředitelem doktorského programu Cancer and Cell Biology PhD a ředitelem Integrative Molecular and Biomedical Sciences Ph.D od roku 2015 BMC.[1][2]

Vzdělání a kariéra

Nelson získal bakalářský titul z University of Virginia v roce 1978 získal doktorát z molekulární genetiky na Massachusetts Institute of Technology v roce 1984. Postgraduální výcvik absolvoval v Massachusetts Institute of Technology (1984–1985) a Národní institut zdraví před přesunem do Baylor College of Medicine.

Nelson se připojil k Centrum pro výzkum rakoviny MIT (CCR) skupina Davida Housmana na Massachusetts Institute of Technology jako postdoctoral trainee (1986–1989). Nelsonova práce využívající zavedené selekční geny rozšířila přístupy k mapování celého lidského genomu. Od roku 1984 do roku 1985, v intramurální Národní institut zdraví V laboratoři Roberta Lazzariniho studoval Nelson neurovědu a definoval geny kódující proteiny neurofilamentů. V roce 1986 nastoupil do laboratoře C. Thomase Caskeyho v Ústavu molekulární genetiky, Baylor College of Medicine.[3]

Uplatnění polymerázové řetězové reakce PCR, technika, která umožňuje rychlé mapování genů a izolaci specifických chromozomálních oblastí, Nelson et al. identifikované chromozomální polohy velkých fragmentů člověka X chromozom;[4] Nelson přispěl k referenční sekvenci člověka, myši a mouchy a byl spoluobjevitelem mutace, která způsobuje Syndrom křehkého X jako expanze trinukleotidového opakování v FMR1 gen.[5] Nelsonovy příspěvky vedly k popisu Loweho syndrom,[6] a identifikace FMR2 pro syndrom FRAXE.[7]

Příspěvky k vědě

Projekt lidského genomu

Nelsonovy molekulární techniky vedly k vývoji mapování a sekvenování genomu a objevování genů onemocnění, což přispělo k mapování a sekvenci lidského X chromozomu. Byl lídrem v genetických a genomických analýzách u všech druhů.[4][8][9][10]

Incontinentia Pigmenti (IP)

Se skupinou mezinárodních spolupracovníků dokázala Nelsonova výzkumná skupina identifikovat opakující se, homologně řízené vypuštění v NEMO gen v Inkontinentia pigmenti (IP), X-vázané genetické onemocnění.[11][12][13][14][15]

Syndrom křehkého X

Nestabilní repetice jako mutace v lidské genetické nemoci

Nelson a další spolupracovníci v BMC, Emory University, a Erasmus University Rotterdam identifikoval masivní expanzi opakování CGG (Porucha opakování trinukleotidů ) v FMR1. Toto bylo první, které bylo identifikováno jako základní mutace lidských genetických poruch. Jejich nálezy v FMR1 vysvětlil neobvyklé dědictví v Syndrom křehkého X a poskytl zásady pro všechny následující nestabilní poruchy opakování, jako je myotonická dystrofie, Huntingtonova choroba, a Amyotrofní laterální skleróza.[5][16][17][18]

FMR1 v neuronální funkci

Studiem lidí, myší, much a kvasinek Nelsonova výzkumná skupina charakterizovala počátky nestability opakování, důsledky „premutačních“ délkových expanzí a funkci FMR1 a související FXR1 a FXR2. Nelson a jeho výzkumná skupina definovali role pro FMR1 a paralogy v cirkadiánním rytmu, energetický metabolismus, vývoj neuronových kmenových buněk a mikroRNA funkce. Jejich výsledky výzkumu se používají ve výzkumu k definování role FMR1 ve vývoji a možné léčbě těchto onemocnění v dospělosti.[19][20][21][22][23]

Syndrom křehkého ataxie třesu X (FXTAS)

FXTAS jedinci nejsou kognitivně ovlivněni, dokud nedosáhnou 60 nebo 70 let, kdy během pitvy vykazují nervovou degeneraci a jaderné inkluze. Nelsonova výzkumná skupina použila mouchy a myši k identifikaci a charakterizaci modifikátorů, které ukázaly, že CGG opakovat je nezbytný a dostatečný k ovlivnění savčích neuronů. Modely vyvinuté Nelsonovou výzkumnou skupinou zlepšily pochopení mechanismů tohoto onemocnění, včetně role funkcí vázajících RNA, jako je TDP-43 a změny v 5-Hydroxymethylcytosin.[24][25][26][27]

Veřejná služba

Nelson je členem představenstva Americká společnost lidské genetiky, byl jeho prezidentem v roce 2018 a pracoval jako tajemník v letech 2003 až 2009.

Nelson působil v mnoha poradních výborech a výborech, včetně poradního výboru FRAXA Research Foundation (1999 - dosud), National Fragile X Foundation Advisory Board (1999 - dosud), March of Dimes Grant Review Board (2010–2015), Hungtinton Disease Society of America Steering Committee (1999–2010), United States NIH / NICHD Mental Retardation Review Committee (1998–2002) a US DOE Joint Genome Institute Advisory Board (1997–2000) .

Nelson působil v redakčních radách jedenácti akademických časopisů, včetně American Journal of Human Genetics, Savčí genom, Klinická genetika (časopis), a Výzkum genomu.

Patenty

6824972. Diagnostika a léčba zdravotních stavů spojených s defektem NFkappa B (NF-kB) aktivace.[28]

6107025. Diagnóza syndromu křehkého X.[29]

Ceny a vyznamenání

Reference

  1. ^ „David L Nelson - Citace Google Scholar“. scholar.google.com.
  2. ^ „My Bibliography - My NCBI Collection“. ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2019-06-26.
  3. ^ „Issue: The American Journal of Human Genetics“. www.cell.com.
  4. ^ A b Nelson, D.L .; Ledbetter, S. A .; Corbo, L .; Victoria, M. F .; Ramirez-Solis, R .; Webster, T. D .; Ledbetter, D. H .; Caskey, C. T. (1. září 1989). „Alu polymerázová řetězová reakce: metoda pro rychlou izolaci sekvencí specifických pro člověka z komplexních zdrojů DNA“. Sborník Národní akademie věd. 86 (17): 6686–6690. Bibcode:1989PNAS ... 86,6686N. doi:10.1073 / pnas.86.17.6686. PMC  297910. PMID  2771952.
  5. ^ A b Verkerk, Annemieke J.M.H .; Pieretti, Maura; Sutcliffe, James S .; Fu, Ying-Hui; Kuhl, Derek P.A .; Pizzuti, Antonio; Reiner, Orly; Richards, Stephen; Victoria, Maureen F .; Zhang, Fuping; Eussen, Bert E .; van Ommen, Gert-Jan B .; Blonden, Lau A.J .; Riggins, Gregory J .; Chastain, Jane L .; Kunst, Catherine B .; Galjaard, Hans; Thomas Caskey, C .; Nelson, David L .; Oostra, Ben A .; Warren, Stephen T. (květen 1991). „Identifikace genu (FMR-1) obsahujícího CGG repetici se shoduje s klastrovou oblastí zlomu vykazující variabilitu délky u syndromu křehkého X“. Buňka. 65 (5): 905–914. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90397-H. PMID  1710175.
  6. ^ Attree, Olivier; Olivos, Isabelle M .; Okabe, Ichiro; Bailey, L. Charles; Nelson, David L .; Lewis, Richard A .; Mclnnes, Roderick R .; Nussbaum, Robert L. (červenec 1992). „Loweův gen pro okulocerebrorenální syndrom kóduje protein vysoce homologní s inositol polyfosfát-5-fosfatázou“. Příroda. 358 (6383): 239–242. Bibcode:1992 Natur.358..239A. doi:10.1038 / 358239a0. PMID  1321346.
  7. ^ Gu, Yanghong; Shen, Ying; Gibbs, Richard A .; Nelson, David L. (květen 1996). "Identifikace FMR2, nového genu spojeného s opakováním FRAXE CCG a ostrovem CpG". Genetika přírody. 13 (1): 109–113. doi:10.1038 / ng0596-109.
  8. ^ Adams, Mark D., George L. Gabor Miklos, Angela Center, Robert D. C. Saunders, Susan E. Celniker, Robert A. Holt, Cheryl A. Evans a kol. 2000. „Sekvence genomu Drosophila melanogaster“. Věda. 287 (5461): 2185–2195. DOI: https://doi.org/10.1126/science.287.5461.2185
  9. ^ Lander, Eric S .; Linton, Lauren M .; Birren, Bruce; Nusbaum, Čad; Zody, Michael C .; Baldwin, Jennifer; Devon, Keri; Dewar, Ken; Doyle, Michael; Fitzhugh, William; Funke, Roel; Gage, Diane; Harris, Katrina; Heaford, Andrew; Howland, John; Kann, Lisa; Lehoczky, Jessica; Levine, Rosie; McEwan, Paul; McKernan, Kevin; Meldrim, James; Mesirov, Jill P .; Miranda, Cher; Morris, William; Naylor, Jerome; Raymond, Christina; Rosetti, Mark; Santos, Ralph; Sheridan, Andrew; et al. (Únor 2001). „Počáteční sekvenování a analýza lidského genomu“. Příroda. 409 (6822): 860–921. Bibcode:2001 Natur.409..860L. doi:10.1038/35057062.
  10. ^ Ross, Mark T .; Grafham, Darren V .; Coffey, Alison J .; Scherer, Steven; McLay, Kirsten; Muzny, Donna; Platzer, Matthias; Howell, Gareth R .; Burrows, Christine; Bird, Christine P .; Frankish, Adam; Lovell, Frances L .; Howe, Kevin L .; Ashurst, Jennifer L .; Fulton, Robert S .; Sudbrak, Ralf; Wen, Gaiping; Jones, Matthew C .; Hurles, Matthew E .; Andrews, T. Daniel; Scott, Carol E .; Searle, Stephen; Ramser, Juliane; Whittaker, Adam; Deadman, Rebecca; Carter, Nigel P .; Hunt, Sarah E .; Chen, Rui; Cree, Andrew; et al. (Březen 2005). „Sekvence DNA lidského chromozomu X“. Příroda. 434 (7031): 325–337. Bibcode:2005 Natur.434..325R. doi:10.1038 / nature03440. PMC  2665286. PMID  15772651.
  11. ^ Julia E. Parrish, Angela E. Scheuerle, Richard A. Lewis, Moise L. Levy, David L. Nelson (1996). Selekce proti mutantním alelám v krevních leukocytech je konzistentní funkcí u inkontinentních pigmentů typu 2. Human Molecular Genetics, 5 (11): 1777–1783. DOI: https://doi.org/10.1093/hmg/5.11.1777
  12. ^ Smahi, Asmae; Courtois, G .; Vabres, P .; Yamaoka, S .; Heuertz, S .; Munnich, A .; Israël, A .; Heiss, Nina S .; Klauck, S. M .; Kioschis, P .; Wiemann, S .; Poustka, A .; Esposito, Teresa; Bardaro, T .; Gianfrancesco, F .; Ciccodicola, A .; d'Urso, M .; Woffendin, Hayley; Jakins, T .; Donnai, D .; Stewart, H .; Kenwrick, S. J .; Aradhya, Swaroop; Yamagata, T .; Levy, M .; Lewis, R. A .; Nelson, D. L. (květen 2000). „Genomické přeskupení v NEMO zhoršuje aktivaci NF-κB a je příčinou inkontinentní pigmenti“. Příroda. 405 (6785): 466–472. Bibcode:2000Natur.405..466T. doi:10.1038/35013114. PMID  10839543.
  13. ^ Aradhya, S. (1. září 2001). „Opakující se delece v všudypřítomně exprimovaném genu NEMO (IKK-gama) tvoří velkou většinu inkontinentních mutací pigmentu“. Lidská molekulární genetika. 10 (19): 2171–2179. doi:10,1093 / hmg / 10,19,2171. PMID  11590134.
  14. ^ Swaroop Aradhya, Hayley Woffendin, Tracy Jakins, Tiziana Bardaro, Teresa Esposito, Asmae Smahi, Christine Shaw, Moise Levy, Arnold Munnich, Michele D’Urso, Richard A. Lewis, Sue Kenwrick, David L. Nelson (2001). Opakující se delece v všudypřítomně exprimovaném genu NEMO (IKK-γ) představuje drtivou většinu inkontinentních mutací pigmenti, Human Molecular Genetics. 10 (19): 2171–2179, https://doi.org/10.1093/hmg/10.19.2171
  15. ^ Swaroop Aradhya, Tiziana Bardaro, Petra Galgóczy, Takanori Yamagata, Teresa Esposito, Henry Patlan, Alfredo Ciccodicola, Arnold Munnich, Sue Kenwrick, Matthias Platzer, Michele D’Urso, David L. Nelson (2001). Mnohočetné patogenní a benigní genomové přesmyky se vyskytují při duplikaci 35 kb zahrnující geny NEMO a LAGE2. Human Molecular Genetics 10 (22): 2557–2567. DOI: https://doi.org/10.1093/hmg/10.22.2557
  16. ^ Pieretti, Maura; Zhang, Fuping; Fu, Ying-Hui; Warren, Stephen T .; Oostra, Ben A .; Caskey, C. Thomas; Nelson, David L. (srpen 1991). "Absence exprese genu FMR-1 u syndromu křehkého X". Buňka. 66 (4): 817–822. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90125-I.
  17. ^ Fu, Ying-Hui; Kuhl, Derek P.A .; Pizzuti, Antonio; Pieretti, Maura; Sutcliffe, James S .; Richards, Stephen; Verkert, Annemieke J.M.H .; Holden, Jeanette J.A .; Fenwick, Raymond G .; Warren, Stephen T .; Oostra, Ben A .; Nelson, David L .; Caskey, C. Thomas (prosinec 1991). „Variace opakování CGG na křehkém místě X vede ke genetické nestabilitě: rozlišení Shermanova paradoxu“. Buňka. 67 (6): 1047–1058. doi:10.1016/0092-8674(91)90283-5.
  18. ^ Eichler, Evan E .; Holden, Jeanette J.A .; Popovich, Bradley W .; Reiss, Allan L .; Sníh, Karen; Thibodeau, Stephen N .; Richards, C. Sue; Ward, Patricia A .; Nelson, David L. (září 1994). "Délka nepřerušovaných CGG opakování určuje nestabilitu v genu FMR1". Genetika přírody. 8 (1): 88–94. doi:10.1038 / ng0994-88.
  19. ^ Jin, Peng; Zarnescu, Daniela C; Ceman, Stephanie; Nakamoto, Mika; Mowrey, Julie; Jongens, Thomas A; Nelson, David L; Mojžíš, Kevin; Warren, Stephen T (4. ledna 2004). „Biochemická a genetická interakce mezi křehkým X mentálním retardačním proteinem a cestou mikroRNA“. Přírodní neurovědy. 7 (2): 113–117. doi:10.1038 / nn1174.
  20. ^ Zhang, Jing; Fang, Zhe; Jud, Corinne; Vansteensel, Mariska J .; Kaasik, Krista; Lee, Cheng Chi; Albrecht, Urs; Tamanini, Filippo; Meijer, Johanna H .; Oostra, Ben A .; Nelson, David L. (červenec 2008). „Křehké proteiny související s X regulují cirkadiánní behaviorální rytmy savců“. American Journal of Human Genetics. 83 (1): 43–52. doi:10.1016 / j.ajhg.2008.06.003. PMC  2443847.
  21. ^ Guo, Weixiang; Allan, Andrea M; Zong, Ruiting; Zhang, Li; Johnson, Eric B; Schaller, Eric G; Murthy, Adeline C; Goggin, Samantha L; Eisch, Amelia J; Oostra, Ben A; Nelson, David L; Jin, Peng; Zhao, Xinyu (24. dubna 2011). „Ablace Fmrp v dospělých nervových kmenových buňkách narušuje učení závislé na hipokampu“. Přírodní medicína. 17 (5): 559–565. doi:10,1038 / nm.2336. PMC  3140952. PMID  21516088.
  22. ^ Lumaban, J. G .; Nelson, D. L. (30. prosince 2014). „Fragilní proteiny X Fmrp a Fxr2p spolupracují na regulaci metabolismu glukózy u myší“. Lidská molekulární genetika. 24 (8): 2175–2184. doi:10,1093 / hmg / ddu737. PMC  4380067. PMID  25552647.
  23. ^ Higashimori, H .; Schin, C. S .; Chiang, M. S. R .; Morel, L .; Shoneye, T. A .; Nelson, D.L .; Yang, Y. (6. července 2016). „Selektivní delece astrogliálních FMRP dysregulácí glutamátového transportéru GLT1 a přispívá k fenotypům syndromu křehkého X in vivo“. Journal of Neuroscience. 36 (27): 7079–7094. doi:10.1523 / JNEUROSCI.1069-16.2016. PMC  4938857. PMID  27383586.
  24. ^ Sofola, Oyinkan A .; Jin, Peng; Qin, Yunlong; Duan, Ranhui; Liu, Huijie; de Haro, Maria; Nelson, David L .; Botas, Juan (srpen 2007). „Proteiny vázající RNA hnRNP A2 / B1 a CUGBP1 potlačují křehkou X CGG premutaci opakovanou indukovanou neurodegeneraci v modelu Drosophila FXTAS“. Neuron. 55 (4): 565–571. doi:10.1016 / j.neuron.2007.07.021. PMC  2215388. PMID  17698010.
  25. ^ Nelson, David L .; Paylor, Richard; Oostra, Ben A .; Willemsen, Rob; Mori, Mayra; Galloway, Jocelyn N .; Hashem, Vera (1. července 2009). „Ektopická exprese mRNA obsahující CGG je u savců neurotoxická“. Lidská molekulární genetika. 18 (13): 2443–2451. doi:10,1093 / hmg / ddp182. ISSN  0964-6906. PMID  19377084.
  26. ^ Yao, Bing; Lin, Li; Street, R. Craig; Zalewski, Zachary A .; Galloway, Jocelyn N .; Wu, Hao; Nelson, David L .; Jin, Peng (15. února 2014). „Genome-alteration of 5-hydroxymethylcytosine in a mouse model of fragile X-associated tremor / ataxia syndrom“. Lidská molekulární genetika. 23 (4): 1095–1107. doi:10,1093 / hmg / ddt504. PMID  24108107.
  27. ^ Galloway, Jocelyn N .; Shaw, Čad; Yu, Peng; Parghi, Deena; Poidevin, Mickael; Jin, Peng; Nelson, David L. (15. listopadu 2014). „CGG repetice v RNA modulují expresi TDP-43 v myších a mouchových modelech syndromu křehkého X tremor ataxie“. Lidská molekulární genetika. 23 (22): 5906–5915. doi:10,1093 / hmg / ddu314. PMID  24986919.
  28. ^ Kenwrick, Sue J .; Woffendin, Hayley; Munnich, Arnold; Smahi, Asmae; Izrael, Alain; Poustka, Annemarie; Heiss, Nina; D'Urso, Michele; Lewis, Richard A .; Nelson, David L .; Aradhya, Swaroop; Levy, Moise (2004). „Patent USA: 6824972 - Diagnostika a léčba zdravotních stavů spojených s vadnou aktivací NFkappa B (NF-.kappa.B)“.
  29. ^ Caskey, C. Thomas; Nelson, David L .; Pieretti, Maura; Warren, Stephen T .; Oostra, Ben A. (2000). „Patent USA: 6107025 - Diagnóza syndromu křehkého X“.
  30. ^ http://www.texasgeneticssociety.org/wp-content/uploads/2019/04/Barabara-Bowman-Award-Recipients.pdf