FXR2 - FXR2

FXR2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3H8Z
Identifikátory
Aliasy	FXR2, FMR1L2, FXR2P, FMR1 autosomální homolog 2
Externí ID	OMIM: 605339 MGI: 1346074 HomoloGene: 21014 Genové karty: FXR2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	7,614,897 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	69,653,297 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita heterodimerizace proteinu; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • mRNA vazba; • aktivita homodimerizace proteinu; • identická vazba na protein; • Vazba RNA; • mRNA 3'-UTR vazba; • činnost regulačního orgánu překladu;
Buněčná složka	• polysome; • cytosolická velká ribozomální podjednotka; • extracelulární exosom; • membrána; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytosol; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • axon; • ribonukleoproteinová granule; • cytoplazmatická ribonukleoproteinová granule; • tělo neuronových buněk; • dendritická páteř;
Biologický proces	• negativní regulace překladu; • regulace překladu; • regulace stability mRNA; • pozitivní regulace překladu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9513
	23879
	ENSG00000129245
	ENSMUSG00000018765
	P51116
	Q9WVR4; Q6P5B5
	NM_004860
	NM_011814
	NP_004851
	NP_035944
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s syndromem křehkého X s mentálním postižením 2 je protein že u lidí je kódován FXR2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je protein vázající RNA obsahující dvě KH domény a jeden RCG box, který je podobný FMRP a FXR1. Sdružuje se s polyribozomy, převážně s 60S velkými ribozomálními podjednotkami. Tento kódovaný protein se může sám přidružit nebo interagovat s FMRP a FXR1. Může hrát roli ve vývoji křehkého syndromu mentální retardace X.^[7]

Interakce

FXR2 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129245 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018765 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Zhang Y, O'Connor JP, Siomi MC, Srinivasan S, Dutra A, Nussbaum RL, Dreyfuss G (listopad 1995). „Protein křehkého X syndromu mentální retardace interaguje s novými homology FXR1 a FXR2“. Časopis EMBO. 14 (21): 5358–66. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00220.x. PMC 394645. PMID 7489725.
^ Tamanini F, Willemsen R, van Unen L, Bontekoe C, Galjaard H, Oostra BA, Hoogeveen AT (srpen 1997). „Diferenciální exprese proteinů FMR1, FXR1 a FXR2 v lidském mozku a varlatech“. Lidská molekulární genetika. 6 (8): 1315–22. doi:10,1093 / hmg / 6,8,1315. PMID 9259278.
^ ^A ^b „Entrez Gene: FXR2 fragile X mental retardation, autosomal homolog 2“.
^ Schenck A, Bardoni B, Moro A, Bagni C, Mandel JL (červenec 2001). „Vysoce konzervovaná rodina proteinů interagující s křehkým X mentálním retardačním proteinem (FMRP) a vykazující selektivní interakce s proteiny FXR1P a FXR2P souvisejícími s FMRP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (15): 8844–9. doi:10.1073 / pnas.151231598. PMC 37523. PMID 11438699.
^ ^A ^b Siomi MC, Zhang Y, Siomi H, Dreyfuss G (červenec 1996). „Specifické sekvence v proteinu FMR1 křehkého syndromu X a proteiny FXR zprostředkovávají jejich vazbu na ribozomální podjednotky 60S a interakce mezi nimi“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (7): 3825–32. doi:10,1128 / mcb.16.7.3825. PMC 231379. PMID 8668200.
^ Ceman S, Brown V, Warren ST (prosinec 1999). „Izolace messengerové ribonukleoproteinové částice spojené s FMRP a identifikace nukleolinu a křehkých proteinů souvisejících s X jako složek komplexu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (12): 7925–32. doi:10,1128 / mcb.19.12.7925. PMC 84877. PMID 10567518.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Další čtení

Siomi MC, Zhang Y, Siomi H, Dreyfuss G (červenec 1996). „Specifické sekvence v proteinu FMR1 křehkého syndromu X a proteiny FXR zprostředkovávají jejich vazbu na ribozomální podjednotky 60S a interakce mezi nimi“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (7): 3825–32. doi:10,1128 / mcb.16.7.3825. PMC 231379. PMID 8668200.
Joseph DR (leden 1998). „Gen krysího proteinu vázajícího androgen (ABP / SHBG) obsahuje opakování tripletů podobné nestabilním tripletům: důkaz, že ABP / SHBG a křehké 2 geny související s X se překrývají.“ Steroidy. 63 (1): 2–4. doi:10.1016 / S0039-128X (97) 00087-1. PMID 9437788. S2CID 12825993.
Tamanini F, Bontekoe C, Bakker CE, van Unen L, Anar B, Willemsen R, Yoshida M, Galjaard H, Oostra BA, Hoogeveen AT (květen 1999). „Různé cíle pro křehké proteiny související s X odhalené jejich odlišnými jadernými lokalizacemi“. Lidská molekulární genetika. 8 (5): 863–9. doi:10,1093 / hmg / 8,5863. PMID 10196376.
Bardoni B, Schenck A, Mandel JL (prosinec 1999). „Nový nukleární protein vázající RNA, který interaguje s křehkým X proteinem mentální retardace (FMR1)“. Lidská molekulární genetika. 8 (13): 2557–66. doi:10,1093 / hmg / 8,13,2557. PMID 10556305.
Ceman S, Brown V, Warren ST (prosinec 1999). „Izolace messengerové ribonukleoproteinové částice spojené s FMRP a identifikace nukleolinu a křehkých proteinů souvisejících s X jako složek komplexu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (12): 7925–32. doi:10,1128 / mcb.19.12.7925. PMC 84877. PMID 10567518.
Bratranec P, Billotte J, Chaubert P, Shaw P (leden 2000). "Fyzická mapa 17p13 a genů sousedících s p53". Genomika. 63 (1): 60–8. doi:10.1006 / geno.1999,6062. PMID 10662545.
Tamanini F, Kirkpatrick LL, Schonkeren J, van Unen L, Bontekoe C, Bakker C, Nelson DL, Galjaard H, Oostra BA, Hoogeveen AT (červen 2000). „Křehké proteiny FXR1P a FXR2P související s X obsahují funkční signál zaměřený na nukleární cílení ekvivalentní regulačním proteinům HIV-1“. Lidská molekulární genetika. 9 (10): 1487–93. doi:10,1093 / hmg / 9.10.1487. PMID 10888599.
Schenck A, Bardoni B, Moro A, Bagni C, Mandel JL (červenec 2001). „Vysoce konzervovaná rodina proteinů interagující s křehkým X mentálním retardačním proteinem (FMRP) a vykazující selektivní interakce s proteiny FXR1P a FXR2P souvisejícími s FMRP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (15): 8844–9. doi:10.1073 / pnas.151231598. PMC 37523. PMID 11438699.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (květen 2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Analytická chemie. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (leden 2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129245 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000018765 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7489725-5] A ^b ^C Zhang Y, O'Connor JP, Siomi MC, Srinivasan S, Dutra A, Nussbaum RL, Dreyfuss G (listopad 1995). „Protein křehkého X syndromu mentální retardace interaguje s novými homology FXR1 a FXR2“. Časopis EMBO. 14 (21): 5358–66. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00220.x. PMC 394645. PMID 7489725.

[pmid9259278-6] Tamanini F, Willemsen R, van Unen L, Bontekoe C, Galjaard H, Oostra BA, Hoogeveen AT (srpen 1997). „Diferenciální exprese proteinů FMR1, FXR1 a FXR2 v lidském mozku a varlatech“. Lidská molekulární genetika. 6 (8): 1315–22. doi:10,1093 / hmg / 6,8,1315. PMID 9259278.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: FXR2 fragile X mental retardation, autosomal homolog 2“.

[pmid11438699-8] Schenck A, Bardoni B, Moro A, Bagni C, Mandel JL (červenec 2001). „Vysoce konzervovaná rodina proteinů interagující s křehkým X mentálním retardačním proteinem (FMRP) a vykazující selektivní interakce s proteiny FXR1P a FXR2P souvisejícími s FMRP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (15): 8844–9. doi:10.1073 / pnas.151231598. PMC 37523. PMID 11438699.

[pmid8668200-9] A ^b Siomi MC, Zhang Y, Siomi H, Dreyfuss G (červenec 1996). „Specifické sekvence v proteinu FMR1 křehkého syndromu X a proteiny FXR zprostředkovávají jejich vazbu na ribozomální podjednotky 60S a interakce mezi nimi“. Molekulární a buněčná biologie. 16 (7): 3825–32. doi:10,1128 / mcb.16.7.3825. PMC 231379. PMID 8668200.

[pmid10567518-10] Ceman S, Brown V, Warren ST (prosinec 1999). „Izolace messengerové ribonukleoproteinové částice spojené s FMRP a identifikace nukleolinu a křehkých proteinů souvisejících s X jako složek komplexu“. Molekulární a buněčná biologie. 19 (12): 7925–32. doi:10,1128 / mcb.19.12.7925. PMC 84877. PMID 10567518.

[pmid16189514-11] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]