Cyklická doména vázající nukleotidy - Cyclic nucleotide-binding domain
| Cyklická doména vázající nukleotidy | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura komplexu CAP-DNA.[1] | |||||||||||
| Identifikátory | |||||||||||
| Symbol | cNMP_binding | ||||||||||
| Pfam | PF00027 | ||||||||||
| InterPro | IPR000595 | ||||||||||
| CHYTRÝ | SM00100 | ||||||||||
| STRÁNKA | PDOC00691 | ||||||||||
| SCOP2 | 1cgp / Rozsah / SUPFAM | ||||||||||
| CDD | cd00038 | ||||||||||
| |||||||||||
Proteiny, které vážou cyklické nukleotidy (tábor nebo cGMP ) sdílejí strukturální doménu asi 120 zbytků. Nejlépe studovaným z těchto proteinů je aktivátor genu prokaryotického katabolitu (také známý jako cAMP receptorový protein ) (gen crp), kde je známo, že taková doména je složena ze tří alfa-šroubovic a charakteristické osmiřetězcové, antiparalelní struktury beta-barelu. V této doméně je šest invariantních aminokyselin, z nichž tři jsou glycinové zbytky, o nichž se předpokládá, že jsou nezbytné pro udržení strukturní integrity beta-barelu. cAMP- a cGMP-závislé proteinové kinázy (cAPK a cGPK) obsahují dvě tandemové kopie domény vázající cyklický nukleotid. CAPK se skládají ze dvou různých podjednotek, katalytického řetězce a regulačního řetězce, který obsahuje obě kopie domény. CGPK jsou jednořetězcové enzymy, které obsahují dvě kopie domény v jejich N-terminální části. Tuto doménu také obsahují iontové kanály řízené cyklickými nukleotidy. Dva takovéto kationtové kanály byly plně charakterizovány, jeden se nachází v prutových buňkách, kde hraje roli ve vizuální transdukci signálu.
Lidské proteiny obsahující tuto doménu
CNBD1; CNGA1; CNGA2; CNGA3; CNGB1; CNGB3; HCN1;HCN2; HCN3; HCN4; KCNH1; KCNH2; KCNH3; KCNH4; KCNH5;KCNH6; KCNH7; KCNH8; PNPLA6; PNPLA7; PRKAR1A; PRKAR1B; PRKAR2A;PRKAR2B; PRKG1; PRKG2; RAPGEF2; RAPGEF3; RAPGEF4; 6. RAPGEF; RCNC2;SLC9A10; SLC9A11;
Reference
- ^ Schultz SC, Shields GC, Steitz TA (srpen 1991). „Krystalová struktura komplexu CAP-DNA: DNA je ohnutá o 90 stupňů“. Věda. 253 (5023): 1001–7. Bibcode:1991Sci ... 253.1001S. doi:10.1126 / science.1653449. PMID 1653449. S2CID 19723922.
Další čtení
- Yau, K. W. (1994). „Kanály řízené cyklickými nukleotidy: rozšiřující se nová rodina iontových kanálů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (9): 3481–3483. Bibcode:1994PNAS ... 91.3481Y. doi:10.1073 / pnas.91.9.3481. PMC 43603. PMID 7513422.