RAPGEF6 - RAPGEF6

RAPGEF6

Protein RAPGEF6 PDB 2d93.png

Dostupné struktury

Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2D93, 3LNY

Identifikátory

RAPGEF6, KIA001LB, PDZ-GEF2, PDZGEF2, RA-GEF-2, RAGEF2, Rap guaninový nukleotidový výměnný faktor 6

Externí ID

OMIM: 610499 MGI: 2384761 HomoloGene: 22968 Genové karty: RAPGEF6

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 5 (lidský)^[1]

Kapela	5q31.1	Start	131,423,921 bp^[1]
Kapela	5q31.1	Konec	131,635,236 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 11 (myš)^[2]

Kapela	11 \| 11 B1.3	Start	54,522,847 bp^[2]
Kapela	11 \| 11 B1.3	Konec	54,699,285 bp^[2]

Genová ontologie
Molekulární funkce	• vázání kyseliny fosfatidové • Vazba na protein závislá na GTP • GO: 0001948 vazba na proteiny • Vazba Ras GTPázy • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů
Buněčná složka	• cytoplazma • cytosol • buněčná membrána • endocytický váček • apikální plazmatická membrána • membrána • centrosome
Biologický proces	• GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 regulace aktivity GTPázy • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy • Transdukce signálu proteinu Ras • sestava microvillus • lokalizace proteinu na plazmatickou membránu • vytvoření endoteliální intestinální bariéry • signální transdukce
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


51735


192786


ENSG00000158987


ENSMUSG00000037533


Q8TEU7


n / a

RefSeq (mRNA)

NM_016340 NM_001164386 NM_001164387 NM_001164388 NM_001164389
NM_001164390


NM_001252494 NM_001252496 NM_001252497 NM_001252498 NM_175258

RefSeq (protein)

NP_001157858 NP_001157859 NP_001157860 NP_001157861 NP_001157862
NP_057424


n / a

Místo (UCSC)

Chr 5: 131,42 - 131,64 Mb

Chr 11: 54,52 - 54,7 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Faktor výměny guaninového nukleotidu 6 je protein že u lidí je kódován RAPGEF6 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158987 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037533 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gao X, Satoh T, Liao Y, Song C, Hu CD, Kariya Ki K, Kataoka T (listopad 2001). „Identifikace a charakterizace RA-GEF-2, rapanového guaninového nukleotidového výměnného faktoru, který slouží jako cílový cíl M-Ras“. J Biol Chem. 276 (45): 42219–42225. doi:10,1074 / jbc.M105760200. PMID 11524421.
^ Kozlov G, Banville D, Gehring K, Ekiel I (červenec 2002). „Struktura řešení domény PDZ2 z cytosolické lidské fosfatázy hPTP1E v komplexu s peptidem odhaluje příspěvek smyčky beta2-beta3 k interakcím doména-ligand PDZ“. J Mol Biol. 320 (4): 813–820. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00544-2. PMID 12095257.
^ „Entrez Gene: RAPGEF6 Rap guaninový nukleotidový výměnný faktor (GEF) 6“.

Další čtení

Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–648. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Chen X, Wang X, Hossain S a kol. (2006). „Haplotypy zahrnující geny SPEC2, PDZ-GEF2 a ACSL6 jsou spojeny se schizofrenií.“. Hučení. Mol. Genet. 15 (22): 3329–3342. doi:10,1093 / hmg / ddl409. PMID 17030554.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–12135. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–45. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Kuiperij HB, de Rooij J, Rehmann H a kol. (2003). "Charakterizace PDZ-GEF, rodiny guaninových nukleotidových výměnných faktorů specifických pro Rap1 a Rap2". Biochim. Biophys. Acta. 1593 (2–3): 141–149. doi:10.1016 / S0167-4889 (02) 00365-8. PMID 12581858.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.