PRKAR1B - PRKAR1B

PRKAR1B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4DIN, 4F9K
Identifikátory
Aliasy	PRKAR1B„PRKAR1, regulační podjednotka beta typu proteinkinázy cAMP závislá na typu
Externí ID	OMIM: 176911 MGI: 97759 HomoloGene: 37665 Genové karty: PRKAR1B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	727,650 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	139,150,001 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • vazba na katalytickou podjednotku protein kinázy A.; • cAMP vazba; • aktivita regulátoru proteinkinázy závislá na cAMP; • aktivita inhibitoru proteinkinázy závislá na cAMP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita 3 ', 5'-cyklické-GMP fosfodiesterázy;
Buněčná složka	• cytosol; • membrána; • buněčná membrána; • řasnatá základna; • komplex proteinkinázy závislý na cAMP; • synapse; • Schafferův kolaterál - CA1 synapse; • hipokampální mechové vlákno na CA3 synapse; • glutamátergická synapse;
Biologický proces	• regulace fosforylace bílkovin; • aktivace aktivity proteinkinázy A.; • buněčná odpověď na stimul glukagonu; • srážení krve; • negativní regulace aktivity proteinkinázy závislé na cAMP; • fosforylace bílkovin; • homeostáza ledvinové vody; • učení nebo paměť; • modulace chemického synaptického přenosu; • regulace cyklu synaptických vezikul; • cGMP zprostředkovaná signalizace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5575
	19085
	ENSG00000188191
	ENSMUSG00000025855
	P31321
	P12849
NM_001164758; NM_001164759; NM_001164760; NM_001164761; NM_001164762;
	NM_002735
NM_001253890; NM_008923; NM_001359097; NM_001359098; NM_001359099;
	NM_001359100; NM_001359101
NP_001158230; NP_001158231; NP_001158232; NP_001158233; NP_001158234;
	NP_002726
NP_001240819; NP_032949; NP_001346026; NP_001346027; NP_001346028;
	NP_001346029; NP_001346030
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

cAMP-dependentní proteinová kináza typu I-beta regulační podjednotka je enzym že u lidí je kódován PRKAR1B gen.^[5]^[6]^[7]

Klinický význam

Mutace v PRKAR1B způsobit neurodegenerativní porucha.^[8]

Interakce

PRKAR1B bylo prokázáno komunikovat s AKAP1^[9] a PRKAR1A.^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000188191 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025855 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Solberg R, Sistonen P, Träskelin AL, Bérubé D, Simard J, Krajci P, Jahnsen T, de la Chapelle A (prosinec 1992). "Mapování regulačních podjednotek RI beta a RII beta cAMP-dependentních proteinových kinázových genů na lidském chromozomu 7". Genomika. 14 (1): 63–9. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80284-8. PMID 1358799.
^ Scambler P, Oyen O, Wainwright B, Farrall M, Law HY, Estivill X, Sandberg M, Williamson R, Jahnsen T (prosinec 1987). „Vyloučení katalytických a regulačních podjednotek proteinkinázy závislé na cAMP jako kandidátských genů pro defekt způsobující cystickou fibrózu“. Jsem J Hum Genet. 41 (5): 925–32. PMC 1684338. PMID 3479018.
^ „Entrez Gene: PRKAR1B protein kinase, cAMP-dependent, regulační, typ I, beta“.
^ Wong TH, Chiu WZ, Breedveld GJ, Li KW, Verkerk AJ, Hondius D, Hukema RK, Seelaar H, Frick P, Severijnen LA, Lammers GJ, Lebbink JH, van Duinen SG, Kamphorst W, Rozemuller AJ, Bakker EB, Neumann M, Willemsen R, Bonifati V, Smit AB, van Swieten J (2014). „Mutace PRKAR1B spojená s novou neurodegenerativní poruchou s jedinečnou patologií“. Mozek. 137 (Pt 5): 1361–73. doi:10.1093 / brain / awu067. PMID 24722252.
^ ^A ^b Carlson CR, Ruppelt A, Taskén K (březen 2003). „Interakce proteinu kotvícího kinázu (AKAP) a dimerizace regulačních podjednotek RIalpha a RIbeta proteinové kinázy a in vivo pomocí hybridního systému kvasinek dva“. J. Mol. Biol. 327 (3): 609–18. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00093-7. PMID 12634056.
^ Taskén K, Skålhegg BS, Solberg R, Andersson KB, Taylor SS, Lea T, Blomhoff HK, Jahnsen T, Hansson V (říjen 1993). „Nové isozymy cAMP-dependentní protein kinázy existují v lidských buňkách v důsledku tvorby heterodimerních komplexů RI alfa-RI beta“. J. Biol. Chem. 268 (28): 21276–83. PMID 8407966.

Další čtení

Harrich D, McMillan N, Munoz L, Apolloni A, Meredith L (2007). „Vedou různé Tat interakce k novým antiretrovirovým lékovým cílům?“. Aktuální drogové cíle. 7 (12): 1595–606. doi:10.2174/138945006779025338. PMID 17168834.
Solberg R, Taskén K, Keiserud A, Jahnsen T (1991). „Molekulární klonování, struktura cDNA a tkáňově specifická exprese lidské regulační podjednotky RI beta cAMP-závislých proteinových kináz“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 176 (1): 166–72. doi:10.1016 / 0006-291X (91) 90904-L. PMID 1708242.
Hofmann B, Nishanian P, Baldwin RL, Insixiengmay P, Nel A, Fahey JL (1991). „HIV inhibuje časné kroky aktivace lymfocytů, včetně zahájení metabolismu inositol fosfolipidů“. J. Immunol. 145 (11): 3699–705. PMID 1978848.
Hofmann B, Nishanian P, Nguyen T, Insixiengmay P, Fahey JL (1993). „Proteiny viru lidské imunodeficience indukují inhibiční dráhu cAMP / protein kinázu A v normálních lymfocytech“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (14): 6676–80. doi:10.1073 / pnas.90.14.6676. PMC 46995. PMID 7688126.
Solberg R, Taskén K, Wen W, Coghlan VM, Meinkoth JL, Scott JD, Jahnsen T, Taylor SS (1994). „Lidská regulační podjednotka RI beta cAMP-dependentních proteinových kináz: exprese, tvorba holoenzymu a mikroinjekce do živých buněk“. Exp. Cell Res. 214 (2): 595–605. doi:10.1006 / excr.1994.1297. PMID 7925653.
Hofmann B, Nishanian P, Fan J, Nguyen T, Fahey JL (1994). „Protein HIV Gag p17 zhoršuje proliferaci normálních lymfocytů in vitro“. AIDS. 8 (7): 1016–7. doi:10.1097/00002030-199407000-00025. PMID 7946090.
Taskén K, Skålhegg BS, Solberg R, Andersson KB, Taylor SS, Lea T, Blomhoff HK, Jahnsen T, Hansson V (1993). „Nové isozymy cAMP-dependentní protein kinázy existují v lidských buňkách v důsledku tvorby heterodimerních komplexů RI alfa-RI beta“. J. Biol. Chem. 268 (28): 21276–83. PMID 8407966.
Swingler S, Gallay P, Camaur D, Song J, Abo A, Trono D (1997). „Nef protein viru lidské imunodeficience typu 1 zvyšuje fosforylaci serinu virové matrice“. J. Virol. 71 (6): 4372–7. doi:10.1128 / JVI.71.6.4372-4377.1997. PMC 191654. PMID 9151826.
Chen P, Mayne M, Power C, Nath A (1997). „Tat protein HIV-1 indukuje produkci alfa-faktoru nekrotizujícího nádory. Důsledky pro neurologická onemocnění spojená s HIV-1“. J. Biol. Chem. 272 (36): 22385–8. doi:10.1074 / jbc.272.36.22385. PMID 9278385.
Zidovetzki R, Wang JL, Chen P, Jeyaseelan R, Hofman F (1998). „Tat protein viru lidské imunodeficience indukuje expresi mRNA interleukinu 6 v endoteliálních buňkách lidského mozku prostřednictvím proteinových kinázových C- a cAMP-závislých proteinových kinázových cest“. AIDS Res. Hučení. Retroviry. 14 (10): 825–33. doi:10.1089 / podpora.1998.14.825. PMID 9671211.
Mayne M, Bratanich AC, Chen P, Rana F, Nath A, Power C (1998). "HIV-1 tat molekulární rozmanitost a indukce TNF-alfa: důsledky pro HIV vyvolané neurologické onemocnění". Neuroimunomodulace. 5 (3–4): 184–92. doi:10.1159/000026336. PMID 9730685. S2CID 19529677.
Laxminarayana D, Khan IU, Mishra N, Olorenshaw I, Taskén K, Kammer GM (1999). „Snížené hladiny transkriptů a proteinů RI alfa a RI beta proteinkinázy A v T lymfocytech systémového lupus erythematosus“. J. Immunol. 162 (9): 5639–48. PMID 10228048.
Adachi M, Lewis EJ (2002). „Spárovaný homeodoménový protein Arix zprostředkovává transkripci genu dopamin beta-hydroxylázy stimulovanou proteinkinázou A prostřednictvím svého stavu fosforylace“. J. Biol. Chem. 277 (25): 22915–24. doi:10,1074 / jbc.M201695200. PMID 11943777.
Oliver CJ, Terry-Lorenzo RT, Elliott E, Bloomer WA, Li S, Brautigan DL, Colbran RJ, Shenolikar S (2002). „Cílení na proteinovou fosfatázu 1 (PP1) na aktinový cytoskelet: komplex neururinu I / PP1 reguluje buněčnou morfologii“. Mol. Buňka. Biol. 22 (13): 4690–701. doi:10.1128 / MCB.22.13.4690-4701.2002. PMC 133892. PMID 12052877.
Nguyen DT, Rovira II, Finkel T (2002). "Regulace Wernerovy helikázy přímou interakcí s podjednotkou protein kinázy A". FEBS Lett. 521 (1–3): 170–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 02868-5. PMID 12067711. S2CID 38098581.
Mucignat-Caretta C, Caretta A (2003). "Lokalizace triton nerozpustného cAMP závislého kinázy typu RIbeta v mozku potkana a myši". J. Neurocytol. 30 (11): 885–94. doi:10.1023 / A: 1020613132648. PMID 12373096. S2CID 30876154.
Carlson CR, Ruppelt A, Taskén K (2003). „Interakce proteinu kotvícího kinázu (AKAP) a dimerizace regulačních podjednotek RIalpha a RIbeta proteinové kinázy a in vivo pomocí hybridního systému kvasinek dva“. J. Mol. Biol. 327 (3): 609–18. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00093-7. PMID 12634056.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P31321 (Lidská cAMP-dependentní protein kináza typu I-beta regulační podjednotka) na PDBe-KB.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000188191 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025855 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1358799-5] Solberg R, Sistonen P, Träskelin AL, Bérubé D, Simard J, Krajci P, Jahnsen T, de la Chapelle A (prosinec 1992). "Mapování regulačních podjednotek RI beta a RII beta cAMP-dependentních proteinových kinázových genů na lidském chromozomu 7". Genomika. 14 (1): 63–9. doi:10.1016 / S0888-7543 (05) 80284-8. PMID 1358799.

[pmid3479018-6] Scambler P, Oyen O, Wainwright B, Farrall M, Law HY, Estivill X, Sandberg M, Williamson R, Jahnsen T (prosinec 1987). „Vyloučení katalytických a regulačních podjednotek proteinkinázy závislé na cAMP jako kandidátských genů pro defekt způsobující cystickou fibrózu“. Jsem J Hum Genet. 41 (5): 925–32. PMC 1684338. PMID 3479018.

[entrez-7] „Entrez Gene: PRKAR1B protein kinase, cAMP-dependent, regulační, typ I, beta“.

[8] Wong TH, Chiu WZ, Breedveld GJ, Li KW, Verkerk AJ, Hondius D, Hukema RK, Seelaar H, Frick P, Severijnen LA, Lammers GJ, Lebbink JH, van Duinen SG, Kamphorst W, Rozemuller AJ, Bakker EB, Neumann M, Willemsen R, Bonifati V, Smit AB, van Swieten J (2014). „Mutace PRKAR1B spojená s novou neurodegenerativní poruchou s jedinečnou patologií“. Mozek. 137 (Pt 5): 1361–73. doi:10.1093 / brain / awu067. PMID 24722252.

[pmid12634056-9] A ^b Carlson CR, Ruppelt A, Taskén K (březen 2003). „Interakce proteinu kotvícího kinázu (AKAP) a dimerizace regulačních podjednotek RIalpha a RIbeta proteinové kinázy a in vivo pomocí hybridního systému kvasinek dva“. J. Mol. Biol. 327 (3): 609–18. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00093-7. PMID 12634056.

[pmid8407966-10] Taskén K, Skålhegg BS, Solberg R, Andersson KB, Taylor SS, Lea T, Blomhoff HK, Jahnsen T, Hansson V (říjen 1993). „Nové isozymy cAMP-dependentní protein kinázy existují v lidských buňkách v důsledku tvorby heterodimerních komplexů RI alfa-RI beta“. J. Biol. Chem. 268 (28): 21276–83. PMID 8407966.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]