CUL3 - CUL3
Cullin 3 je protein že u lidí je kódován CUL3 gen.[5][6][7]
Cullin 3 protein patří do rodiny cullins který u savců obsahuje osm proteinů (Cullin 1, Cullin 2, Cullin 3, Cullin 4A, Cullin 4B, Cullin 5, Cullin 7 a Cullin 9).[8] Cullinové proteiny jsou evolučně konzervovanou rodinou proteinů v kvasinkách, rostlinách a savcích.[9]
Funkce bílkovin
Cullin 3 je součástí Cullin-PRSTEN E3 ubikvitinové ligázy komplexy (CRL), které se účastní bílkovin ubikvitylace a představují součást systém ubikvitin-proteazom (UPS). Přidané ubikvitinové zbytky k lysinovému zbytku pomocí CRL pak cílí na protein pro proteazomální degradaci.[10] Cullin -PRSTEN E3 ubikvitinové ligázy podílejí se na mnoha buněčných procesech odpovědných za regulaci buněčného cyklu, stresovou reakci, přenos proteinů, signální transdukci, replikaci DNA, transkripci, kontrolu kvality bílkovin, cirkadiánní hodiny a vývoj.[11][12]
Vymazání CUL3 gen u myší způsobuje embryonální letalitu.[13]
Cullin 3-RING E3 ubikvitinové ligázy
Komplex Cullin 3-RING se skládá z proteinu Cullin 3, proteinu RING-box 1 (RBX1 ), který rekrutuje enzym konjugující s ubikvitinem (E2) a protein Bric-a-brac / Tramtrack / Broad (BTB), podjednotku rozpoznávající substrát. Protein Cullin 3 je základní protein lešení koordinující další složky komplexu CRL.[14] Cullin 3-RING komplexy mohou také dimerizovat prostřednictvím jejich BTB domény které vedou k vytvoření dvou receptorů substrátu a dvou katalytických domén RING.[15]
Aktivace komplexu je regulována připojením ubikvitin podobný protein NEDD8 na konzervovaný Lys zbytek v doméně cullin-homologie, proces se nazývá neddylace.[16] Deneddylace se provádí komplexem CSN s osmi podjednotkami, který zprostředkovává štěpení isopeptidové vazby mezi NEDD8 a cullinovým proteinem.[17] Další protein, který interaguje s cullinem, je CAND1 který se váže na deneddylovanou formu cullinového proteinu a narušuje interakci mezi cullinem a jinými podjednotkami komplexu, což vede k inhibici aktivity E3 ubikvitin ligázy.[18] Proto je pro regulaci aktivity komplexu CRL důležitá dynamická neddylace a deneddylace cullinu.[19]
Klinický význam
Rodinná hyperkalemická hypertenze
Mutace v CUL3 geny jsou spojeny s familiární hyperkalemickou hypertenzí. CRL komplex obsahující Cullin 3 řídí aktivitu Na+ Cl− kotransporter (NCC) v ledvinách regulací proteazomální degradace With-no-lysin [K] kináz WNK1 a WNK4. Ukázalo se, že mutace v CUL3 gen vedl k akumulaci WNK.[20] Nadbytek těchto kináz vede ke zvýšené fosforylaci NCC a její aktivaci. V důsledku toho Na+ reabsorpce se zvyšuje, což vede k vysokému krevnímu tlaku.[21]
Rakovina
Deregulace hladiny exprese Cullinu 3 byla pozorována u lidských rakovin. Ukázalo se, že Cullin 3 je nadměrně exprimován u invazivních rakovin a hladina exprese proteinu pozitivně koreluje s fází nádoru. U rakoviny prsu vede nadměrná exprese proteinu Cullin 3 ke snížení o Nrf2 hladina bílkovin. Tento protein je transkripční faktor regulující expresi některých detoxikačních a antioxidačních enzymů. Dalším substrátem komplexu CRL je kandidátský tumor supresorový protein RhoBTB2.[22]
Interakce
CUL3 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000036257 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004364 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Kipreos ET, Lander LE, Wing JP, He WW, Hedgecock EM (červen 1996). „cul-1 je vyžadován pro opuštění buněčného cyklu u C. elegans a identifikuje novou genovou rodinu“. Buňka. 85 (6): 829–39. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81267-2. PMID 8681378. S2CID 15805562.
- ^ Wimuttisuk W, Singer JD (březen 2007). „Cullin3 ubikvitinová ligáza funguje jako heterodimer vázaný na Nedd8“. Molekulární biologie buňky. 18 (3): 899–909. doi:10,1091 / mbc.E06-06-0542. PMC 1805106. PMID 17192413.
- ^ „Entrez Gene: CUL3 cullin 3“.
- ^ Cheng J, Guo J, Wang Z, North BJ, Tao K, Dai X, Wei W (leden 2018). "Funkční analýza ligandů Cullin 3 E3 v tumorigenezi". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Recenze na rakovinu. 1869 (1): 11–28. doi:10.1016 / j.bbcan.2017.11.001. PMC 7076836. PMID 29128526.
- ^ Sarikas A, Hartmann T, Pan Z (2011). "Rodina proteinů cullin". Genome Biol. 12 (4): 220. doi:10.1186 / gb-2011-12-4-220. PMC 3218854. PMID 21554755.
- ^ Dubiel D, Bintig W, Kähne T, Dubiel W, Naumann M (srpen 2017). „Neddylace Cul3 je zásadní pro postupnou tvorbu kapiček lipidů během adipogeneze“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1864 (8): 1405–1412. doi:10.1016 / j.bbamcr.2017.05.009. PMID 28499918.
- ^ Chen HY, Chen RH (2016). „Cullin 3 ubikvitinové ligázy v biologii rakoviny: funkce a terapeutické důsledky“. Hranice v onkologii. 6: 113. doi:10.3389 / fonc.2016.00113. PMC 4852199. PMID 27200299.
- ^ Petroski MD, Deshaies RJ (leden 2005). "Funkce a regulace ubikvitinových ligáz cullin-RING" (PDF). Recenze přírody. Molekulární buněčná biologie. 6 (1): 9–20. doi:10.1038 / nrm1547. PMID 15688063. S2CID 24159190.
- ^ Cheng J, Guo J, Wang Z, North BJ, Tao K, Dai X, Wei W (leden 2018). "Funkční analýza ligandů Cullin 3 E3 v tumorigenezi". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Recenze na rakovinu. 1869 (1): 11–28. doi:10.1016 / j.bbcan.2017.11.001. PMC 7076836. PMID 29128526.
- ^ Cheng J, Guo J, Wang Z, North BJ, Tao K, Dai X, Wei W (leden 2018). „Funkční analýza liginů Cullin 3 E3 v tumorigenezi“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Recenze na rakovinu. 1869 (1): 11–28. doi:10.1016 / j.bbcan.2017.11.001. PMC 7076836. PMID 29128526.
- ^ Bulatov E, Ciulli A (květen 2015). „Cílení na ubikvitinové ligázy Cullin-RING E3 pro objev léků: struktura, sestavení a modulace s malými molekulami“. The Biochemical Journal. 467 (3): 365–86. doi:10.1042 / BJ20141450. PMC 4403949. PMID 25886174.
- ^ Petroski MD, Deshaies RJ (leden 2005). "Funkce a regulace ubikvitinových ligáz cullin-RING" (PDF). Recenze přírody. Molekulární buněčná biologie. 6 (1): 9–20. doi:10.1038 / nrm1547. PMID 15688063. S2CID 24159190.
- ^ Bulatov E, Ciulli A (květen 2015). „Cílení na ubikvitinové ligázy Cullin-RING E3 pro objev léků: struktura, sestavení a modulace s malými molekulami“. The Biochemical Journal. 467 (3): 365–86. doi:10.1042 / BJ20141450. PMC 4403949. PMID 25886174.
- ^ Chew EH, Hagen T (červen 2007). „Substrátem zprostředkovaná regulace nedylace cullinu“. The Journal of Biological Chemistry. 282 (23): 17032–40. doi:10,1074 / jbc.M701153200. PMID 17439941.
- ^ Soucy TA, Smith PG, Rolfe M (červen 2009). „Cílení ligandů Cullin-RING aktivovaných NEDD8 pro léčbu rakoviny“. Klinický výzkum rakoviny. 15 (12): 3912–6. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-09-0343. PMID 19509147.
- ^ Ferdaus MZ, McCormick JA (červen 2016). „Cesta CUL3 / KLHL3-WNK-SPAK / OSR1 jako cíl antihypertenzní terapie“. American Journal of Physiology. Fyziologie ledvin. 310 (11): F1389–96. doi:10.1152 / ajprenal.00132.2016. PMC 4935775. PMID 27076645.
- ^ Ferdaus MZ, McCormick JA (květen 2018). "Mechanismy a kontroverze u mutantní Cul3 zprostředkované familiární hyperkalemické hypertenze". American Journal of Physiology. Fyziologie ledvin. 314 (5): F915 – F920. doi:10.1152 / ajprenal.00593.2017. PMC 6031903. PMID 29361671.
- ^ Haagenson KK, Tait L, Wang J, Shekhar MP, Polin L, Chen W, Wu GS (září 2012). „Hladiny exprese proteinu Cullin-3 korelují s progresí rakoviny prsu“. Biologie a terapie rakoviny. 13 (11): 1042–6. doi:10,4161 / cbt.21046. PMC 3461811. PMID 22825334.
- ^ Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (květen 2003). „TIP120A se asociuje s culliny a moduluje aktivitu ubikvitin ligázy“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (18): 15905–10. doi:10,1074 / jbc.M213070200. PMID 12609982.
- ^ Singer JD, Gurian-West M, Clurman B, Roberts JM (září 1999). "Cullin-3 cílí na cyklin E pro ubikvitinaci a kontroluje S fázi v buňkách savců". Geny a vývoj. 13 (18): 2375–87. doi:10.1101 / gad.13.18.2375. PMC 317026. PMID 10500095.
- ^ Kim AY, Bommeljé CC, Lee BE, Yonekawa Y, Choi L, Morris LG, Huang G, Kaufman A, Ryan RJ, Hao B, Ramanathan Y, Singh B (listopad 2008). „SCCRO (DCUN1D1) je základní složkou komplexu E3 pro neddylaci“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (48): 33211–20. doi:10,1074 / jbc.M804440200. PMC 2586271. PMID 18826954.
- ^ Wang XJ, Sun Z, Chen W, Li Y, Villeneuve NF, Zhang DD (srpen 2008). „Aktivace Nrf2 arsenitem a kyselinou monomethylarsonovou je nezávislá na Keap1-C151: vylepšená interakce Keap1-Cul3“. Toxikologie a aplikovaná farmakologie. 230 (3): 383–9. doi:10.1016 / j.taap.2008.03.003. PMC 2610481. PMID 18417180.
- ^ Rachakonda G, Xiong Y, Sekhar KR, Stamer SL, Liebler DC, Freeman ML (březen 2008). „Kovalentní modifikace na Cys151 disociuje elektrofilní senzor Keap1 od ubikvitinové ligázy CUL3“. Chemický výzkum v toxikologii. 21 (3): 705–10. doi:10.1021 / tx700302s. PMID 18251510.
- ^ Rondou P, Haegeman G, Vanhoenacker P, Van Craenenbroeck K (duben 2008). „BTB Protein KLHL12 se zaměřuje na dopaminový D4 receptor pro ubikvitinaci E3 ligázou na bázi Cul3“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (17): 11083–96. doi:10,1074 / jbc.M708473200. PMC 2431063. PMID 18303015.
Další čtení
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
- Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
- Michel JJ, Xiong Y (červen 1998). „Lidský CUL-1, ale ne další členové rodiny cullinů, selektivně interaguje s SKP1 za vzniku komplexu s SKP2 a cyklinem A“. Růst a diferenciace buněk. 9 (6): 435–49. PMID 9663463.
- Du M, Sansores-Garcia L, Zu Z, Wu KK (září 1998). „Klonování a analýza exprese nového genu potlačujícího salicyláty, Hs-CUL-3, člena rodiny cullin / Cdc53“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (38): 24289–92. doi:10.1074 / jbc.273.38.24289. PMID 9733711.
- Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (červen 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". Výzkum DNA. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.
- Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (duben 1999). „ROC1, homolog APC11, představuje rodinu partnerů cullinu s přidruženou aktivitou ubikvitin ligázy“. Molekulární buňka. 3 (4): 535–41. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7. PMID 10230407.
- Singer JD, Gurian-West M, Clurman B, Roberts JM (září 1999). "Cullin-3 cílí na cyklin E pro ubikvitinaci a kontroluje S fázi v buňkách savců". Geny a vývoj. 13 (18): 2375–87. doi:10.1101 / gad.13.18.2375. PMC 317026. PMID 10500095.
- Hori T, Osaka F, Chiba T, Miyamoto C, Okabayashi K, Shimbara N, Kato S, Tanaka K (listopad 1999). „Kovalentní modifikace všech členů proteinů lidské rodiny cullinů pomocí NEDD8“. Onkogen. 18 (48): 6829–34. doi:10.1038 / sj.onc.1203093. PMID 10597293.
- Maeda I, Ohta T, Koizumi H, Fukuda M (duben 2001). "In vitro ubikvitinace cyklinu D1 pomocí ROC1-CUL1 a ROC1-CUL3". FEBS Dopisy. 494 (3): 181–5. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02343-2. PMID 11311237. S2CID 40693441.
- Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, Wolf DA, Wei N, Shevchenko A, Deshaies RJ (květen 2001). "Podpora štěpení konjugátu NEDD-CUL1 signalosomem COP9". Věda. 292 (5520): 1382–5. doi:10.1126 / science.1059780. PMID 11337588. S2CID 14224920.
- Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (květen 2003). „TIP120A se asociuje s culliny a moduluje aktivitu ubikvitin ligázy“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (18): 15905–10. doi:10,1074 / jbc.M213070200. PMID 12609982.
- Kobayashi A, Kang MI, Okawa H, Ohtsuji M, Zenke Y, Chiba T, Igarashi K, Yamamoto M (srpen 2004). „Senzor oxidačního stresu Keap1 funguje jako adaptér pro E3 ligázu na bázi Cul3 k regulaci proteazomální degradace Nrf2“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (16): 7130–9. doi:10.1128 / MCB.24.16.7130-7139.2004. PMC 479737. PMID 15282312.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (leden 2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Furukawa M, Xiong Y (leden 2005). „BTB protein Keap1 se zaměřuje na antioxidační transkripční faktor Nrf2 pro ubikvitinaci ligandem Cullin 3-Roc1“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (1): 162–71. doi:10.1128 / MCB.25.1.162-171.2005. PMC 538799. PMID 15601839.
- Hernández-Muñoz I, Lund AH, van der Stoop P, Boutsma E, Muijrers I, Verhoeven E, Nusinow DA, Panning B, Marahrens Y, van Lohuizen M (květen 2005). „Stabilní inaktivace chromozomu X zahrnuje komplex PRC1 Polycomb a vyžaduje histon MACROH2A1 a ligand ubikvitin E3 CULLIN3 / SPOP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (21): 7635–40. doi:10.1073 / pnas.0408918102. PMC 1140410. PMID 15897469.
- Lu L, Zhou ZM, Huang XY, Xu M, Yin LL, Wang H, Xu ZY, Sha JH (červen 2005). „Identifikace a charakterizace cul-3b, nové varianty transkriptu homininu CUL-3“. Asijský deník andrologie. 7 (2): 205–11. doi:10.1111 / j.1745-7262.2005.00024.x. PMID 15897978.
externí odkazy
- Člověk CUL3 umístění genomu a CUL3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.