DCUN1D1 - DCUN1D1

DCUN1D1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3TDU, 3TDZ, 4P5O
Identifikátory
Aliasy	DCUN1D1, DCNL1, DCUN1L1, RP42, SCCRO, SCRO, Tes3, defektní v cullin neddylaci 1 doména obsahující 1
Externí ID	OMIM: 605905 MGI: 2150386 HomoloGene: 10773 Genové karty: DCUN1D1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	182,985,953 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	35,937,445 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba proteinů rodiny cullinů; • vazba na ubikvitin podobný protein; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba enzymu konjugujícího ubikvitin;
Buněčná složka	• komplex ubikvitin ligázy; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• proteinová neddylace; • pozitivní regulace aktivity ubikvitin-protein transferázy; • posttranslační modifikace; • pozitivní regulace neddylace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54165
	114893
	ENSG00000043093
	ENSMUSG00000027708
	Q96GG9
	Q9QZ73
	NM_001308101; NM_020640
	NM_001205361; NM_001205362; NM_033623
	NP_001295030; NP_065691
	NP_001192290; NP_001192291; NP_296372
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein podobný DCN1 1 je protein že u lidí je kódován DCUN1D1 gen.^[5]^[6]^[7]

DCUN1D1 je amplifikován u několika typů rakoviny, včetně rakoviny dlaždicových buněk, a může působit jako onkogenní hnací síla v rakovinových buňkách.^[8]^[9]^[10]

Interakce

DCUN1D1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000043093 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027708 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Mas C, Bourgeois F, Bulfone A, Levacher B, Mugnier C, Simonneau M (duben 2000). "Klonování a analýza exprese nového genu, RP42, mapování na lokus náchylnosti k autismu na 6q16". Genomika. 65 (1): 70–4. doi:10,1006 / geno.2000.6126. PMID 10777668.
^ Kurz T, Ozlü N, Rudolf F, O'Rourke SM, Luke B, Hofmann K, Hyman AA, Bowerman B, Peter M (červen 2005). „Konzervovaný protein DCN-1 / Dcn1p je vyžadován pro neddylaci cullinu u C. elegans a S. cerevisiae“. Příroda. 435 (7046): 1257–61. doi:10.1038 / nature03662. PMID 15988528. S2CID 4328225.
^ „Entrez Gene: DCUN1D1 DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1 (S. cerevisiae)“.
^ Broderick SR, Golas BJ, Pham D, Towe CW, Talbot SG, Kaufman A, Bains S, Huryn LA, Yonekawa Y, Carlson D, Hambardzumyan D, Ramanathan Y, Singh B (červen 2010). „SCCRO podporuje tvorbu gliomu a maligní progresi u myší“. Neoplazie. 12 (6): 476–84. doi:10.1593 / neo.10202. PMC 2887088. PMID 20563250.
^ Sarkaria I, O-charoenrat P, Talbot SG, Reddy PG, Ngai I, Maghami E, Patel KN, Lee B, Yonekawa Y, Dudas M, Kaufman A, Ryan R, Ghossein R, Rao PH, Stoffel A, Ramanathan Y, Singh B (říjen 2006). „Onkogen / DUN1D1 související s karcinomem dlaždicových buněk je vysoce konzervovaný a aktivovaný amplifikací v karcinomech dlaždicových buněk“. Výzkum rakoviny. 66 (19): 9437–44. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2074. PMID 17018598.
^ Chen Y, McGee J, Chen X, Doman TN, Gong X, Zhang Y, Hamm N, Ma X, Higgs RE, Bhagwat SV, Buchanan S, Peng SB, Staschke KA, Yadav V, Yue Y, Kouros-Mehr H ( 2014). „Identifikace genů řiditelných pro rakovinu zesílených napříč datovými sadami TCGA“. PLOS ONE. 9 (5): e98293. doi:10.1371 / journal.pone.0098293. PMC 4038530. PMID 24874471.
^ ^A ^b ^C ^d ^E Kim AY, Bommeljé CC, Lee BE, Yonekawa Y, Choi L, Morris LG, Huang G, Kaufman A, Ryan RJ, Hao B, Ramanathan Y, Singh B (listopad 2008). „SCCRO (DCUN1D1) je základní složkou komplexu E3 pro neddylaci“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (48): 33211–20. doi:10,1074 / jbc.M804440200. PMC 2586271. PMID 18826954.

Další čtení

Sarkaria IS, Pham D, Ghossein RA, Talbot SG, Hezel M, Dudas ME, Ebright MI, Chuai S, Memoli N, Venkatraman ES, Miller VA, Kris MG, Zakowski MF, Rusch VW, Singh B (listopad 2004). "SCCRO exprese koreluje s invazivní progresí v bronchioloalveolárním karcinomu". Annals of Thoracic Surgery. 78 (5): 1734–41. doi:10.1016 / j.athoracsur.2004.05.056. PMID 15511464.
Estilo CL, O-Charoenrat P, Ngai I, Patel SG, Reddy PG, Dao S, Shaha AR, Kraus DH, Boyle JO, Wong RJ, Pfister DG, Huryn JM, Zlotolow IM, Shah JP, Singh B (červen 2003) . "Role nových onkogenů spinocelulárního karcinomu souvisejícího s onkogenem a fosfatidylinositol 3-kinázou p110alfa v spinocelulárním karcinomu ústního jazyka". Klinický výzkum rakoviny. 9 (6): 2300–6. PMID 12796399.
Talbot SG, O-charoenrat P, Sarkaria IS, Ghossein R, Reddy P, Ngai I, Cordeiro CN, Wong RJ, Kris MG, Rusch VW, Singh B (květen 2004). „Onkogen související s karcinomem dlaždicových buněk reguluje angiogenezi prostřednictvím vaskulárního endoteliálního růstového faktoru-A“. Annals of Surgical Oncology. 11 (5): 530–4. doi:10.1245 / ASO.2004.03.014. PMID 15123463. S2CID 7962781.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Jacques C, Baris O, Prunier-Mirebeau D, Savagner F, Rodien P, Rohmer V, Franc B, Guyetant S, Malthiery Y, Reynier P (duben 2005). „Dvoustupňová diferenciální analýza exprese odhaluje novou sadu genů podílejících se na onkocytárních nádorech štítné žlázy“. The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 90 (4): 2314–20. doi:10.1210 / jc. 2004-1337. PMID 15623817.
Sarkaria IS, Stojadinovic A, Talbot SG, Hoos A, Dudas ME, Brennan MF, Ghossein RA, Singh B (prosinec 2004). „Onkogen související s karcinomem dlaždicových buněk je vysoce exprimován ve vyvíjející se, normální a adenomatózní tkáni nadledvin, ale ne v agresivních adrenokortikálních karcinomech.“ Chirurgická operace. 136 (6): 1122–8. doi:10.1016 / j.surg.2004.06.041. PMID 15657565.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Sarkaria I, O-charoenrat P, Talbot SG, Reddy PG, Ngai I, Maghami E, Patel KN, Lee B, Yonekawa Y, Dudas M, Kaufman A, Ryan R, Ghossein R, Rao PH, Stoffel A, Ramanathan Y, Singh B (říjen 2006). „Onkogen / DUN1D1 související s karcinomem dlaždicových buněk je vysoce konzervovaný a aktivovaný amplifikací v karcinomech dlaždicových buněk“. Výzkum rakoviny. 66 (19): 9437–44. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2074. PMID 17018598.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000043093 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027708 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10777668-5] Mas C, Bourgeois F, Bulfone A, Levacher B, Mugnier C, Simonneau M (duben 2000). "Klonování a analýza exprese nového genu, RP42, mapování na lokus náchylnosti k autismu na 6q16". Genomika. 65 (1): 70–4. doi:10,1006 / geno.2000.6126. PMID 10777668.

[pmid15988528-6] Kurz T, Ozlü N, Rudolf F, O'Rourke SM, Luke B, Hofmann K, Hyman AA, Bowerman B, Peter M (červen 2005). „Konzervovaný protein DCN-1 / Dcn1p je vyžadován pro neddylaci cullinu u C. elegans a S. cerevisiae“. Příroda. 435 (7046): 1257–61. doi:10.1038 / nature03662. PMID 15988528. S2CID 4328225.

[entrez-7] „Entrez Gene: DCUN1D1 DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1 (S. cerevisiae)“.

[8] Broderick SR, Golas BJ, Pham D, Towe CW, Talbot SG, Kaufman A, Bains S, Huryn LA, Yonekawa Y, Carlson D, Hambardzumyan D, Ramanathan Y, Singh B (červen 2010). „SCCRO podporuje tvorbu gliomu a maligní progresi u myší“. Neoplazie. 12 (6): 476–84. doi:10.1593 / neo.10202. PMC 2887088. PMID 20563250.

[9] Sarkaria I, O-charoenrat P, Talbot SG, Reddy PG, Ngai I, Maghami E, Patel KN, Lee B, Yonekawa Y, Dudas M, Kaufman A, Ryan R, Ghossein R, Rao PH, Stoffel A, Ramanathan Y, Singh B (říjen 2006). „Onkogen / DUN1D1 související s karcinomem dlaždicových buněk je vysoce konzervovaný a aktivovaný amplifikací v karcinomech dlaždicových buněk“. Výzkum rakoviny. 66 (19): 9437–44. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-2074. PMID 17018598.

[10] Chen Y, McGee J, Chen X, Doman TN, Gong X, Zhang Y, Hamm N, Ma X, Higgs RE, Bhagwat SV, Buchanan S, Peng SB, Staschke KA, Yadav V, Yue Y, Kouros-Mehr H ( 2014). „Identifikace genů řiditelných pro rakovinu zesílených napříč datovými sadami TCGA“. PLOS ONE. 9 (5): e98293. doi:10.1371 / journal.pone.0098293. PMC 4038530. PMID 24874471.

[pmid18826954-11] A ^b ^C ^d ^E Kim AY, Bommeljé CC, Lee BE, Yonekawa Y, Choi L, Morris LG, Huang G, Kaufman A, Ryan RJ, Hao B, Ramanathan Y, Singh B (listopad 2008). „SCCRO (DCUN1D1) je základní složkou komplexu E3 pro neddylaci“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (48): 33211–20. doi:10,1074 / jbc.M804440200. PMC 2586271. PMID 18826954.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]