RBX1 - RBX1

RBX1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1LDJ, 1LDK, 1U6G, 2HYE, 2LGV, 3DPL, 3DQV, 3RTR, 4F52, 4P5O
Identifikátory
Aliasy	RBX1, BA554C12.1, RNF75, ROC1, ring-box 1
Externí ID	OMIM: 603814 MGI: 3710517 HomoloGene: 6872 Genové karty: RBX1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	40,973,309 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba proteinů rodiny cullinů; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-ubikvitin ligázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • Aktivita NEDD8 transferázy; • vazba transkripčního faktoru; • aktivita transferázy; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Cullin-RING ubikvitin ligasový komplex; • cytosol; • Komplex ubikvitin ligázy SCF; • Komplex VCB; • Komplex ubikvitin ligázy Cul2-RING; • Komplex ubikvitin ligázy Cul3-RING; • Komplex ubikvitin ligázy Cul5-RING; • Komplex ubikvitin ligázy Cul7-RING; • Komplex ubikvitinové ligázy Cul4A-RING E3; • Komplex ubikvitinové ligázy Cul4B-RING E3; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • komplex jaderného SCF ubikvitin ligázy; • Komplex ubikvitin ligázy Cul4-RING E3;
Biologický proces	• nukleotidová excize, rozpoznání poškození DNA; • monoubikvitinace bílkovin; • Kaskáda MAPK; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • proteinová neddylace; • oprava nukleotidů excizí globálního genomu; • proteinový katabolický proces; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na hypoxii; • oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • Reakce poškození DNA, detekce poškození DNA; • oprava nukleotidovou excizí, stabilizace preincision komplexu; • Oprava DNA; • GO: virový proces 0022415; • polyubikvitinace bílkovin; • oprava nukleotidovou excizí, preincision komplexní sestava; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 5'-k lézi; • Wnt signální cesta; • SCF komplexní montáž; • negativní regulace přechodu G2 / M mitotického buněčného cyklu; • posttranslační modifikace; • pozitivní regulace katabolického procesu proteinu závislého na proteinu závislém na ubikvitinu; • interleukin-1 zprostředkovaná signální dráha; • ubikvitinace bílkovin; • SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • oprava nukleotidovou excizí, odvíjení duplexu DNA; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 3'-k lézi;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9978
	100043674
	ENSG00000100387
	n / a
	P62877
	n / a
	NM_014248
	XM_006525232; XM_006536722; XM_006537452
	NP_055063
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

RING-box protein 1 je protein že u lidí je kódován RBX1 gen.^[4]^[5]

Funkce

Tento gen kóduje evolučně konzervovaný protein, který s ním interaguje cullins. Protein hraje jedinečnou roli v ubikvitinační reakci heterodimerizací s cullinem-1 za účelem katalyzace polymerace ubikvitinu. Může se také podílet na regulaci obratu bílkovin.^[6]

Interakce

RBX1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100387 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kamura T, Koepp DM, Conrad MN, Skowyra D, Moreland RJ, Iliopoulos O, Lane WS, Kaelin WG, Elledge SJ, Conaway RC, Harper JW, Conaway JW (duben 1999). „Rbx1, součást komplexu potlačujícího nádory VHL a ubikvitin ligázy SCF“. Věda. 284 (5414): 657–61. doi:10.1126 / science.284.5414.657. PMID 10213691.
^ ^A ^b ^C ^d ^E Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (duben 1999). „ROC1, homolog APC11, představuje rodinu partnerů cullinu s přidruženou aktivitou ubikvitin ligázy“. Molekulární buňka. 3 (4): 535–41. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7. PMID 10230407.
^ „Entrez Gene: RBX1 ring-box 1“.
^ ^A ^b Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (květen 2003). „TIP120A se asociuje s culliny a moduluje aktivitu ubikvitin ligázy“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (18): 15905–10. doi:10,1074 / jbc.M213070200. PMID 12609982.
^ ^A ^b ^C Kim AY, Bommeljé CC, Lee BE, Yonekawa Y, Choi L, Morris LG, Huang G, Kaufman A, Ryan RJ, Hao B, Ramanathan Y, Singh B (listopad 2008). „SCCRO (DCUN1D1) je základní složkou komplexu E3 pro neddylaci“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (48): 33211–20. doi:10,1074 / jbc.M804440200. PMC 2586271. PMID 18826954.
^ ^A ^b ^C ^d Dias DC, Dolios G, Wang R, Pan ZQ (prosinec 2002). "CUL7: Cullin obsahující doménu DOC se selektivně váže na Skp1.Fbx29 a vytváří komplex podobný SCF". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (26): 16601–6. doi:10.1073 / pnas.252646399. PMC 139190. PMID 12481031.
^ Kim J, Kim JH, Lee SH, Kim DH, Kang HY, Bae SH, Pan ZQ, Seo YS (červenec 2002). „Nová lidská DNA helikáza hFBH1 je protein F-boxu“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (27): 24530–7. doi:10,1074 / jbc.M201612200. PMID 11956208.
^ Zheng N, Schulman BA, Song L, Miller JJ, Jeffrey PD, Wang P, Chu C, Koepp DM, Elledge SJ, Pagano M, Conaway RC, Conaway JW, Harper JW, Pavletich NP (duben 2002). „Struktura komplexu ubikvitin ligázy Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF“. Příroda. 416 (6882): 703–9. doi:10.1038 / 416703a. PMID 11961546.
^ Guerrero-Santoro J, Kapetanaki MG, Hsieh CL, Gorbachinsky I, Levine AS, Rapić-Otrin V (červenec 2008). „Cullin 4B na bázi UV poškození DNA vazebné proteinové ligázy se váže na UV poškozený chromatin a ubikvitinuje histon H2A“. Výzkum rakoviny. 68 (13): 5014–22. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6162. PMID 18593899.
^ Duda DM, Borg LA, Scott DC, Hunt HW, Hammel M, Schulman BA (září 2008). „Strukturální pohledy na NEDD8 aktivaci cullin-RING ligáz: konformační kontrola konjugace“. Buňka. 134 (6): 995–1006. doi:10.1016 / j.cell.2008.07.022. PMC 2628631. PMID 18805092.
^ Panasyuk G, Nemazanyy I, Filonenko V, Dna I (květen 2008). „Ribozomální protein S6 kináza 1 interaguje a je ubikvitinován ubikvitin ligázou ROC1“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 369 (2): 339–43. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.02.016. PMID 18279656.

Další čtení

Skowyra D, Koepp DM, Kamura T, Conrad MN, Conaway RC, Conaway JW, Elledge SJ, Harper JW (duben 1999). "Rekonstituce ubikvitinace cyklinu G1 s komplexy obsahujícími SCFGrr1 a Rbx1". Věda. 284 (5414): 662–5. doi:10.1126 / science.284.5414.662. PMID 10213692.
Tan P, Fuchs SY, Chen A, Wu K, Gomez C, Ronai Z, Pan ZQ (duben 1999). „Nábor ubikvitinové ligázy ROC1-CUL1 pomocí Skp1 a HOS pro katalyzování ubikvitinace I kappa B alfa“. Molekulární buňka. 3 (4): 527–33. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80481-5. PMID 10230406.
Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (říjen 1999). "Rodina savčích proteinů F-boxu". Aktuální biologie. 9 (20): 1180–2. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4. PMID 10531037.
Kamura T, Conrad MN, Yan Q, Conaway RC, Conaway JW (listopad 1999). „Rbx1 podjednotka SCF a VHL E3 ubikvitinová ligáza aktivuje Rub1 modifikaci cullinů Cdc53 a Cul2“. Geny a vývoj. 13 (22): 2928–33. doi:10,1101 / gad.13.22.2928. PMC 317157. PMID 10579999.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN „Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (prosinec 1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Seddiqi N, Charbonnier F, Goudou D, Belkadi L, Rieger F, Alliel PM (prosinec 1999). „Genomická organizace a exprese proteinu Rbx1 / ROC1 / Hrt1 asociovaného s komplexem ubikvitin-proteazom.“. Buněčná a molekulární biologie. 45 (8): 1131–7. PMID 10643962.
Přečtěte si MA, Brownell JE, Gladysheva TB, Hottelet M, Parent LA, Coggins MB, Pierce JW, Podust VN, Luo RS, Chau V, Palombella VJ (duben 2000). „Úprava Nedd8 cul-1 aktivuje SCF (beta (TrCP)) - závislá ubikvitinace IkappaBalpha“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (7): 2326–33. doi:10.1128 / MCB.20.7.2326-2333.2000. PMC 85397. PMID 10713156.
Furukawa M, Zhang Y, McCarville J, Ohta T, Xiong Y (listopad 2000). „C-koncová sekvence CUL1 a ROC1 jsou potřebné pro účinnou akumulaci jader, modifikaci NEDD8 a aktivitu ubikvitin ligázy CUL1“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (21): 8185–97. doi:10.1128 / MCB.20.21.8185-8197.2000. PMC 86428. PMID 11027288.
Maeda I, Ohta T, Koizumi H, Fukuda M (duben 2001). "In vitro ubikvitinace cyklinu D1 pomocí ROC1-CUL1 a ROC1-CUL3". FEBS Dopisy. 494 (3): 181–5. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02343-2. PMID 11311237.
Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, Wolf DA, Wei N, Shevchenko A, Deshaies RJ (květen 2001). "Podpora štěpení konjugátu NEDD-CUL1 signalosomem COP9". Věda. 292 (5520): 1382–5. doi:10.1126 / science.1059780. PMID 11337588.
Fukuchi M, Imamura T, Chiba T, Ebisawa T, Kawabata M, Tanaka K, Miyazono K (květen 2001). „Na ligandu závislá degradace Smad3 komplexem ubikvitin ligázy ROC1 a souvisejících proteinů“. Molekulární biologie buňky. 12 (5): 1431–43. doi:10,1091 / mbc. 12.5.1431. PMC 34595. PMID 11359933.
Kamura T, Burian D, Yan Q, Schmidt SL, Lane WS, Querido E, Branton PE, Shilatifard A, Conaway RC, Conaway JW (srpen 2001). „Muf1, nový opakující se protein bohatý na leucin BC, který může interagovat s Cul5 a Rbx1 za účelem rekonstituce ubikvitinové ligázy“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (32): 29748–53. doi:10,1074 / jbc.M103093200. PMID 11384984.
Wu K, Chen A, Tan P, Pan ZQ (leden 2002). „Ubiquitinová ligáza konjugovaná s Nedd8 ROC1-CUL1 jádrem využívá povrchové zbytky nabité Nedd8 pro efektivní sestavu polyubiquitinového řetězce katalyzovanou Cdc34“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (1): 516–27. doi:10,1074 / jbc.M108008200. PMID 11675391.
Gomes MD, Lecker SH, Jagoe RT, Navon A, Goldberg AL (prosinec 2001). „Atrogin-1, svalový specifický protein F-boxu vysoce exprimovaný během svalové atrofie“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (25): 14440–5. doi:10.1073 / pnas.251541198. PMC 64700. PMID 11717410.
Kim J, Kim JH, Lee SH, Kim DH, Kang HY, Bae SH, Pan ZQ, Seo YS (červenec 2002). „Nová lidská DNA helikáza hFBH1 je protein F-boxu“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (27): 24530–7. doi:10,1074 / jbc.M201612200. PMID 11956208.
Zheng N, Schulman BA, Song L, Miller JJ, Jeffrey PD, Wang P, Chu C, Koepp DM, Elledge SJ, Pagano M, Conaway RC, Conaway JW, Harper JW, Pavletich NP (duben 2002). "Struktura komplexu ubikvitin ligázy Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF". Příroda. 416 (6882): 703–9. doi:10.1038 / 416703a. PMID 11961546.
Yoshida Y, Chiba T, Tokunaga F, Kawasaki H, Iwai K, Suzuki T, Ito Y, Matsuoka K, Yoshida M, Tanaka K, Tai T (červenec 2002). "E3 ubikvitinová ligáza, která rozpoznává cukerné řetězce". Příroda. 418 (6896): 438–42. doi:10.1038 / nature00890. PMID 12140560.
Brower CS, Sato S, Tomomori-Sato C, Kamura T, Pause A, Stearman R, Klausner RD, Malik S, Lane WS, Sorokina I, Roeder RG, Conaway JW, Conaway RC (srpen 2002). „Savčí podjednotka mediátoru mMED8 je protein interagující s Elongin BC, který se může shromáždit s Cul2 a Rbx1 za účelem rekonstituce ubikvitinové ligázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (16): 10353–8. doi:10.1073 / pnas.162424199. PMC 124918. PMID 12149480.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100387 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10213691-4] Kamura T, Koepp DM, Conrad MN, Skowyra D, Moreland RJ, Iliopoulos O, Lane WS, Kaelin WG, Elledge SJ, Conaway RC, Harper JW, Conaway JW (duben 1999). „Rbx1, součást komplexu potlačujícího nádory VHL a ubikvitin ligázy SCF“. Věda. 284 (5414): 657–61. doi:10.1126 / science.284.5414.657. PMID 10213691.

[pmid10230407-5] A ^b ^C ^d ^E Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (duben 1999). „ROC1, homolog APC11, představuje rodinu partnerů cullinu s přidruženou aktivitou ubikvitin ligázy“. Molekulární buňka. 3 (4): 535–41. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80482-7. PMID 10230407.

[entrez-6] „Entrez Gene: RBX1 ring-box 1“.

[pmid12609982-7] A ^b Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (květen 2003). „TIP120A se asociuje s culliny a moduluje aktivitu ubikvitin ligázy“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (18): 15905–10. doi:10,1074 / jbc.M213070200. PMID 12609982.

[pmid18826954-8] A ^b ^C Kim AY, Bommeljé CC, Lee BE, Yonekawa Y, Choi L, Morris LG, Huang G, Kaufman A, Ryan RJ, Hao B, Ramanathan Y, Singh B (listopad 2008). „SCCRO (DCUN1D1) je základní složkou komplexu E3 pro neddylaci“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (48): 33211–20. doi:10,1074 / jbc.M804440200. PMC 2586271. PMID 18826954.

[pmid12481031-9] A ^b ^C ^d Dias DC, Dolios G, Wang R, Pan ZQ (prosinec 2002). "CUL7: Cullin obsahující doménu DOC se selektivně váže na Skp1.Fbx29 a vytváří komplex podobný SCF". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (26): 16601–6. doi:10.1073 / pnas.252646399. PMC 139190. PMID 12481031.

[pmid11956208-10] Kim J, Kim JH, Lee SH, Kim DH, Kang HY, Bae SH, Pan ZQ, Seo YS (červenec 2002). „Nová lidská DNA helikáza hFBH1 je protein F-boxu“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (27): 24530–7. doi:10,1074 / jbc.M201612200. PMID 11956208.

[pmid11961546-11] Zheng N, Schulman BA, Song L, Miller JJ, Jeffrey PD, Wang P, Chu C, Koepp DM, Elledge SJ, Pagano M, Conaway RC, Conaway JW, Harper JW, Pavletich NP (duben 2002). „Struktura komplexu ubikvitin ligázy Cul1-Rbx1-Skp1-F boxSkp2 SCF“. Příroda. 416 (6882): 703–9. doi:10.1038 / 416703a. PMID 11961546.

[pmid18593899-12] Guerrero-Santoro J, Kapetanaki MG, Hsieh CL, Gorbachinsky I, Levine AS, Rapić-Otrin V (červenec 2008). „Cullin 4B na bázi UV poškození DNA vazebné proteinové ligázy se váže na UV poškozený chromatin a ubikvitinuje histon H2A“. Výzkum rakoviny. 68 (13): 5014–22. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6162. PMID 18593899.

[pmid18805092-13] Duda DM, Borg LA, Scott DC, Hunt HW, Hammel M, Schulman BA (září 2008). „Strukturální pohledy na NEDD8 aktivaci cullin-RING ligáz: konformační kontrola konjugace“. Buňka. 134 (6): 995–1006. doi:10.1016 / j.cell.2008.07.022. PMC 2628631. PMID 18805092.

[pmid18279656-14] Panasyuk G, Nemazanyy I, Filonenko V, Dna I (květen 2008). „Ribozomální protein S6 kináza 1 interaguje a je ubikvitinován ubikvitin ligázou ROC1“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 369 (2): 339–43. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.02.016. PMID 18279656.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]