CAND1 - CAND1

CAND1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1U6G, 4A0C
Identifikátory
Aliasy	CAND1, TIP120, TIP120A, s cullinem asociovaná a neddylace disociována 1
Externí ID	OMIM: 607727 MGI: 1261820 HomoloGene: 10202 Genové karty: CAND1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	67,319,953 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	119,240,055 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba na protein třídy TBP; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Cullin-RING ubikvitin ligasový komplex; • Golgiho aparát; • extracelulární exosom; • membrána; • buněčné jádro; • komplex ubikvitin ligázy; • extracelulární oblast; • lumen sekreční granule; • lumen granule bohaté na ficolin-1; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • SCF komplexní montáž; • diferenciace buněk; • pozitivní regulace sestavy transkripčního preiniciačního komplexu RNA polymeráza II; • GO: 0048553 negativní regulace katalytické aktivity; • ubikvitinace bílkovin; • degranulace neutrofilů; • homeostáza buněčných iontů železa; • posttranslační modifikace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55832
	71902
	ENSG00000111530
	ENSMUSG00000020114
	Q86VP6
	Q6ZQ38
	NM_001329674; NM_001329675; NM_001329676; NM_018448
	NM_027994
	NP_001316603; NP_001316604; NP_001316605; NP_060918
	NP_082270
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cullin-asociovaný NEDD8-disociovaný protein 1 je protein že u lidí je kódován CAND1 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

CAND1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111530 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020114 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 5 (6): 355–64. doi:10.1093 / dnares / 5.6.355. PMID 10048485.
^ Yogosawa S, Makino Y, Yoshida T, Kishimoto T, Muramatsu M, Tamura T (prosinec 1996). „Molekulární klonování nového proteinu interagujícího s TBP 120 kDa“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 229 (2): 612–7. doi:10.1006 / bbrc.1996.1852. PMID 8954946.
^ „Entrez Gene: CAND1 cullin-associated and neddylation-dissociated 1“.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (květen 2003). „TIP120A se asociuje s culliny a moduluje aktivitu ubikvitin ligázy“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (18): 15905–10. doi:10,1074 / jbc.M213070200. PMID 12609982.
^ ^A ^b Menon S, Tsuge T, Dohmae N, Takio K, Wei N (2008). „Sdružení SAP130 / SF3b-3 s komplexy ubikvitin ligázy Cullin-RING a jeho regulace signalosomem COP9“. BMC biochemie. 9: 1. doi:10.1186/1471-2091-9-1. PMC 2265268. PMID 18173839.
^ ^A ^b Kim AY, Bommeljé CC, Lee BE, Yonekawa Y, Choi L, Morris LG, Huang G, Kaufman A, Ryan RJ, Hao B, Ramanathan Y, Singh B (listopad 2008). „SCCRO (DCUN1D1) je základní složkou komplexu E3 pro neddylaci“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (48): 33211–20. doi:10,1074 / jbc.M804440200. PMC 2586271. PMID 18826954.

externí odkazy

Člověk CAND1 umístění genomu a CAND1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Yogosawa S, Kayukawa K, Kawata T, Makino Y, Inoue S, Okuda A, Muramatsu M, Tamura T (prosinec 1999). „Indukovaná exprese, lokalizace a chromozomové mapování genu pro protein 120A interagující s TBP“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 266 (1): 123–8. doi:10.1006 / bbrc.1999.1773. PMID 10581176.
Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R „Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (srpen 2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (17): 9543–8. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Liu J, Furukawa M, Matsumoto T, Xiong Y (prosinec 2002). "NEDD8 modifikace CUL1 disociuje p120 (CAND1), inhibitor vazby CUL1-SKP1 a SCF ligáz". Molekulární buňka. 10 (6): 1511–8. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00783-9. PMID 12504025.
Zheng J, Yang X, Harrell JM, Ryzhikov S, Shim EH, Lykke-Andersen K, Wei N, Sun H, Kobayashi R, Zhang H (prosinec 2002). „CAND1 se váže na nededylovaný CUL1 a reguluje tvorbu komplexu ligázy SCF ubikvitinu E3“. Molekulární buňka. 10 (6): 1519–26. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00784-0. PMID 12504026.
Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (květen 2003). „TIP120A se asociuje s culliny a moduluje aktivitu ubikvitin ligázy“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (18): 15905–10. doi:10,1074 / jbc.M213070200. PMID 12609982.
Feng S, Shen Y, Sullivan JA, Rubio V, Xiong Y, Sun TP, Deng XW (červenec 2004). „Arabidopsis CAND1, nemodifikovaný protein interagující s CUL1, je zapojen do mnoha vývojových cest řízených degradací proteinu zprostředkovanou ubikvitinem / proteazomem“. Rostlinná buňka. 16 (7): 1870–82. doi:10.1105 / tpc.021949. PMC 514167. PMID 15208391.
Goldenberg SJ, Cascio TC, Shumway SD, Garbutt KC, Liu J, Xiong Y, Zheng N (listopad 2004). „Struktura komplexu Cand1-Cul1-Roc1 odhaluje regulační mechanismy pro sestavení multisubunitních cullin-dependentních ubikvitinových ligáz.“ Buňka. 119 (4): 517–28. doi:10.1016 / j.cell.2004.10.019. PMID 15537541. S2CID 1606360.
Min KW, Kwon MJ, Park HS, Park Y, Yoon SK, Yoon JB (září 2005). "CAND1 zvyšuje deneddylaci CUL1 signalosomem COP9". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 334 (3): 867–74. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.06.188. PMID 16036220.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K , Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2007). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". Výzkum DNA. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111530 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020114 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10048485-5] Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 5 (6): 355–64. doi:10.1093 / dnares / 5.6.355. PMID 10048485.

[pmid8954946-6] Yogosawa S, Makino Y, Yoshida T, Kishimoto T, Muramatsu M, Tamura T (prosinec 1996). „Molekulární klonování nového proteinu interagujícího s TBP 120 kDa“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 229 (2): 612–7. doi:10.1006 / bbrc.1996.1852. PMID 8954946.

[entrez-7] „Entrez Gene: CAND1 cullin-associated and neddylation-dissociated 1“.

[pmid12609982-8] A ^b ^C ^d ^E ^F Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (květen 2003). „TIP120A se asociuje s culliny a moduluje aktivitu ubikvitin ligázy“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (18): 15905–10. doi:10,1074 / jbc.M213070200. PMID 12609982.

[pmid18173839-9] A ^b Menon S, Tsuge T, Dohmae N, Takio K, Wei N (2008). „Sdružení SAP130 / SF3b-3 s komplexy ubikvitin ligázy Cullin-RING a jeho regulace signalosomem COP9“. BMC biochemie. 9: 1. doi:10.1186/1471-2091-9-1. PMC 2265268. PMID 18173839.

[pmid18826954-10] A ^b Kim AY, Bommeljé CC, Lee BE, Yonekawa Y, Choi L, Morris LG, Huang G, Kaufman A, Ryan RJ, Hao B, Ramanathan Y, Singh B (listopad 2008). „SCCRO (DCUN1D1) je základní složkou komplexu E3 pro neddylaci“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (48): 33211–20. doi:10,1074 / jbc.M804440200. PMC 2586271. PMID 18826954.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]