Bocaparvovirus - Bocaparvovirus

Bocaparvovirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Monodnaviria
Království:Shotokuvirae
Kmen:Cossaviricota
Třída:Quintoviricetes
Objednat:Piccovirales
Rodina:Parvoviridae
Podčeleď:Parvovirinae
Rod:Bocaparvovirus
Zadejte druh
Kopytník bocaparvovirus 1
Druh

viz text

Bocaparvovirus je rod viry v podčeledi Parvovirinae rodiny virů Parvoviridae.[1][2] Lidé, dobytek a psi slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje 25 druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Kopytník bocaparvovirus 1.[3] Mezi nemoci spojené s tímto rodem patří u lidí akutní respirační onemocnění a u skotu průjem a mírné respirační příznaky.[4][5]

Dějiny

Bocaviry byly poprvé popsány u zvířat na počátku 60. let.

Genom

Stejně jako ostatní členové této rodiny mají i bocaparvoviry dva otevřené čtecí rámce —ORF1 a 2. Bocaparvoviry, jedinečné mezi parvoviry, obsahují třetí otevřený čtecí rámec mezi nestrukturálními a strukturálními kódujícími oblastmi.[6] Tento gen kóduje vysoce fosforylovaný nestrukturální protein (NP1).

ORF1 kóduje nestrukturní protein (NS1), který se podílí na replikaci virového genomu. ORF2 kóduje dva kapsidové proteiny - VP1 a VP2.

Stejně jako ostatní parvoviry obsahuje VP1 jedinečná oblast a fosfolipáza Motiv (2) se zakonzervováním Histidin –Kyselina asparagová -XXY motiv v katalytickém centru.[7]

Taxonomie

Skupina: ssDNAObjednávka: Piccovirales

[5]

Podrobnosti o viru

v ParvoviridaeDruhy jsou nyní obecně definovány jako shluk virů, které kódují proteiny iniciátoru replikace (nazývané NS1), které mají aminokyselinové sekvence, které jsou alespoň z 85% identické s těmi, které jsou kódovány všemi ostatními členy druhu.[8]

V současné době existuje 25 uznávaných druhů Bocaparvovirus. Jsou to bocaparvovirus masožravec 1–6, chiropteran bocaparvovirus 1–4, pinakonožký bocaparvovirus 1 a 2, Lagomorph bocaparvovirus 1, primát bocaparvovirus 1 a 2, hlodavec bocaparvovirus 1 a 2 a kopytník bocaparvovirus 1–8. The lidské bocaviry patří ke dvěma druhům primátů. Bývalý (před rokem 2014) „typový druh“ rodu, hovězí bocavirus, je nyní uznáván jako zakladatelská virová sekvence v širším druhu zvaném Kopytník bocaparvovirus 1, což je nový druh. Virus psí minuty je nyní u tohoto druhu klasifikován jako virus Masožravec bocaparvovirus 1.

Sviští byli také identifikováni jako hostitelé nových bocaparvovirů.[9]

Virologie

Hovězí bocaviry využívají pro vstup do buněk endocytózu ve vezikulích potažených klatrinem; jsou závislé na okyselení a zdá se, že jsou spojeny se závislostí na aktinu a mikrotubulech.[10]

Všechny bocaparvoviry kódují nový protein zvaný NP1, který není přítomen v parvovirech z jiných rodů. v Virus psí minuty Ukázalo se, že NP1 je nezbytný pro raný krok replikace viru a je také nutný pro čtení vnitřního polyadenylačního místa, které je nezbytné pro expresi kapsidových proteinů.[11]

Životní cyklus

Virová replikace je jaderná. Vstupu do hostitelské buňky je dosaženo připojením k hostitelským receptorům, které zprostředkovávají klatrinem zprostředkovanou endocytózu. Replikace následuje po modelu vlásenky. Metodou transkripce je transkripce templátovaná DNA s některými alternativními sestřihovými mechanismy. Virus opouští hostitelskou buňku exportem jaderných pórů. Jako přirozeného hostitele slouží lidé, dobytek a psi. Způsoby přenosu jsou orální a dýchací.[4]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
BocaparvovirusLidé; krávy; psyŽádnýKlatrinem zprostředkovaná endocytózapředčasné uvolnění ze životaschopných buněk a buněčná lýzaJádroJádroAerosol

Klinický

Tyto viry obecně infikují gastrointestinální a dýchací cesty. Některé mohou procházet placentou a způsobit vrozenou infekci plodu.

Virus psí minuty, poprvé izolovaná v roce 1967 a spojená s onemocněním v roce 1970, způsobuje respirační onemocnění s dýchacími obtížemi a enteritidu se silným průjmem, spontánním potratem plodů a smrtí novorozených štěňat.

Lidské bocaviry byly poprvé izolovány v roce 2005 v roce 2006 Švédsko.[12] Mohou být schopni způsobit hepatitida v imunosuprimovaném hostiteli.[13]

Bocaparvoviry byly izolovány z lidských rakovin tlustého střeva a plic.[14] Klinický význam tohoto zjištění - pokud existuje - se teprve uvidí.

Výskyt bocaviru u pacientů s rakovinou je vyšší než u zdravých kontrol.[15]

Struktura

Stejně jako ostatní parvoviry mají i bocaparvoviry icosahedral a kulatá struktura s T = 1 symetrie. Kapsida není obalená a skládá se ze 60 kopií až šesti typů kapsidových proteinů (nazývaných VP1 až VP6), které sdílejí společnou C-koncovou oblast. Struktura viru podobné částice složené pouze z proteinu VP2 byla stanovena pomocí kryogenní elektronová mikroskopie a rekonstrukce obrazu.[16] Průměr je kolem 21-22 nm. Genomy jsou lineární o délce přibližně 5,5 kB[4]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
BocaparvovirusIcosahedralT = 1NeobalenéLineárníŽádný

Reference

  1. ^ Cotmore, SF; Agbandje-McKenna, M; Canuti, M; Chiorini, JA; Eis-Hubinger, A; Hughes, J; Mietzsch, M; Modha, S; Ogliastro, M; Pénzes, JJ; Pintel, DJ; Qiu, J; Soderlund-Venermo, M; Tattersall, P; Tijssen, P; a konsorcium zpráv ICTV (2019). „Profil taxonomie viru ICTV: Parvoviridae“. Journal of General Virology. 100 (3): 367–368. doi:10.1099 / jgv.0.001212. PMC  6537627. PMID  30672729.
  2. ^ „10. zpráva ICTV (2018)“.
  3. ^ „10. zpráva ICTV (2018)Bocaparvovirus".
  4. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 12. června 2015.
  5. ^ A b „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 5. května 2020.
  6. ^ Manteufel, Jill; Truyen, Uwe (2008). „Animal Bocaviruses: A Brief Review“. Intervirologie. 51 (5): 328–334. doi:10.1159/000173734. PMID  19023216.
  7. ^ Qu, Xiao-Wang; Liu, Wen-Pei; Qi, Zheng-Yu; Duan, Zhao-Jun; Zheng, Li-Shu; Kuang, Zi-Zhou; Zhang, Wan-Ju; Hou, Yun-De (2008). "Aktivita podobné oblasti lidského bocaviru VP1 podobné fosfolipáze A2". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 365 (1): 158–63. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.10.164. PMID  17981142.
  8. ^ Cotmore SF, McKenna MA, Chiorini JA, Gatherer D, Mukha DV, Pintel DJ, Qiu J, Venermo MS, Tattersall P, Tijssen P (19. července 2013). „Racionalizace a rozšíření taxonomie čeledi Parvoviridae“ (PDF). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. ICTV. Citováno 1. září 2020.
  9. ^ Ao, Yuanyun; Li, Xiaoyue; Li, Lili; Xie, Xiaolu; Jin, Dong; Yu, Jiemei; Lu, Shan; Duan, Zhaojun (2017). "Dva nové druhy bocaparvovirů identifikované u divokých himálajských svišťů". Science China Life Sciences. 60 (12): 1348–1356. doi:10.1007 / s11427-017-9231-4. PMC  7089499. PMID  29218438.
  10. ^ Dudleenamjil, E; Lin, C.-Y; Dredge, D; Murray, B.K; Robison, R. A; Johnson, F. B (2010). „Bovinní parvovirus používá k vstupu do buněk endocytózu zprostředkovanou klatrinem“. Journal of General Virology. 91 (12): 3032–3041. doi:10.1099 / vir.0.024133-0. PMID  20810750.
  11. ^ Sukhu, L; Fasina, O; Burger, L; Rai, A; Qiu, J; Pintel, D. J (2012). "Charakterizace nestrukturálních proteinů bocavirového minutového viru špičáků". Journal of Virology. 87 (2): 1098–1104. doi:10.1128 / JVI.02627-12. PMC  3554049. PMID  23135724.
  12. ^ Allander, T; Tammi, M. T; Eriksson, M; Bjerkner, A; Tiveljung-Lindell, A; Andersson, B (2005). „Klonování lidského parvoviru molekulárním screeningem vzorků dýchacích cest“. Sborník Národní akademie věd. 102 (36): 12891–6. Bibcode:2005PNAS..10212891A. doi:10.1073 / pnas.0504666102. PMC  1200281. PMID  16118271.
  13. ^ Kainulainen, L; Waris, M; Soderlund-Venermo, M; Allander, T; Hedman, K; Ruuskanen, O (2008). „Primární infekce hepatitidou a lidským bocavirem u dítěte s nedostatkem T-buněk“. Journal of Clinical Microbiology. 46 (12): 4104–4105. doi:10.1128 / JCM.01288-08. PMC  2593268. PMID  18842946.
  14. ^ Schildgen, Verena; Malecki, Monika; Tillmann, Ramona-Liza; Brockmann, Michael; Schildgen, Oliver (2013). „Lidský bocavirus je spojován s některými rakovinami plic a tlustého střeva a přetrvává v pevných nádorech“. PLOS ONE. 8 (6): e68020. Bibcode:2013PLoSO ... 868020S. doi:10.1371 / journal.pone.0068020. PMC  3694905. PMID  23826357.
  15. ^ Li, Yasha; Dong, Yanming; Jiang, JUN; Yang, Yongbo; Liu, Kaiyu; Li, YI (2012). „Vysoká prevalence lidské parvovirové infekce u pacientů se zhoubnými nádory“. Onkologické dopisy. 3 (3): 635–640. doi:10.3892 / ol.2012.548. PMC  3362544. PMID  22740966.
  16. ^ Gurda, B. L; Rodič, K. N; Bladek, H; Sinkovits, R. S; Dimattia, M. A; Rence, C; Castro, A; McKenna, R; Olson, N; Brown, K; Baker, T. S.; Agbandje-Mckenna, M (2010). „Struktura kapsidy lidského bocaviru: Pohledy do strukturního repertoáru Parvoviridae“. Journal of Virology. 84 (12): 5880–9. doi:10.1128 / JVI.02719-09. PMC  2876641. PMID  20375175.

externí odkazy