Betatorquevirus - Betatorquevirus - Wikipedia

Betatorquevirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:incertae sedis
Království:incertae sedis
Kmen:incertae sedis
Třída:incertae sedis
Objednat:incertae sedis
Rodina:Anelloviridae
Rod:Betatorquevirus
Zadejte druh
Točivý moment teno mini virus 1
Druh[1]

Betatorquevirus je rod z viry v rodině Anelloviridae, ve skupině II v Baltimore klasifikaci. Rod Betatorquevirus zahrnuje druh druhu Točivý moment teno mini virus 1 a další viry stejného jména, jejichž číslování je od 1 do 12. „Torque teno mini viry“ se tedy používá zaměnitelně s Betatorquevirus.

Počáteční objev

Objev TTMV, jako originál Virus točivého momentu Teno (TTV) izolovat, bylo náhodné. Poté, co byla TTV izolována v roce 1997 od japonského pacienta, byly vytvořeny primery pro podrobnější studium TTV. Primery specifické pro TTV použité v PCR vzorků lidské plazmy poskytly sekvence, které se částečně shodovaly se sekvencemi TTV, ale byly znatelně kratší.[2][3] Nakonec se ukázalo, že TTV má genom 3,6–3,9 kb, zatímco TTMV má genom 2,8–2,9 kb. Další virus podobný TT později izolovaný v roce 2007, Utahovací moment virus teno midi nebo TTMDV, má genom 3,2 kb.[3]

Genom a kapsida

TTMV sdílí podobné morfologické rysy s ostatními lidskými anelloviry. Kapsida má T = 1 ikosahedrickou symetrii.[2] Virion nemá lipidovou obálku a je tak „nahý“, což z něj činí extrémně jednoduchý virus. Odhaduje se, že virion má průměr o něco menší než 30 nm.[2][3]

Genom je kruhový a je vyroben z jednořetězcové DNA negativní polarity. Je dlouhý 2,86–2,91 kilobází.[2] Anelloviry jsou známé tím, že mají 3 nebo 4 překrývající se vnořené otevřené čtecí rámce; TTMV má 3 ORF, které se překrývají.[2][4] ORF-2 a ORF-3 se překrývají s ORF-1 na opačných koncích. Pro TTMV je ORF-1 asi 663 zbytků a ORF-2 je dlouhý asi 91 zbytků.[2] Hned za TATA boxem je vysoce konzervovaná 130-nt oblast.[3]

Fylogeneze a šíření

TTMV se velmi liší.[2][3] První fylogenetický strom vytvořený z genomových sekvencí TTMV odhalil velkou shluk kmenů; ORF-1 měl divergence přes 42% na úrovni nukleotidů a přes 67% na úrovni aminokyselin.[2]

TTMV je také velmi rozšířený, stejně jako jiné lidské anelloviry. Následný výzkum poté, co byl objeven, přinesl prevalenci TTMV DNA mezi dárci krve na 48% –72%.[3] Pravděpodobně může infikovat širokou škálu tkání, protože byl izolován z různých tělních tekutin a tkání, včetně slin, výkalů, plazmy / séra, PBMC, kostní dřeň, slezina, slinivka břišní, ledviny, nervová tkáň, lymfatické uzliny, sperma a výtěry z děložního hrdla.[2][3] Jeho přesný přenosový mechanismus není znám, ale předpokládá se, že je možný krví, sexuálními, fekálně-orálními a dýchacími cestami.[2]

Nedávné studie ukázaly, že lidé mohou mít několikanásobné infekce TT viry.[3][4]

Klinický

Ačkoli jsou TTV potenciálně spojeny s diety a o jejich patogenitě se diskutuje od jejich objevu, TTMV není v současné době známá jako explicitní příčina jakéhokoli onemocnění u člověka.[2] TTMV byl izolován z řady parapneumoik empyém.[5] Jeho klinický význam však zůstává nejasný.

Reference

  1. ^ „Virus Taxonomy: 2018b Release“ (html). Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Březen 2019. Citováno 28. února 2020.
  2. ^ A b C d E F G h i j k Spandole, Sonia; Cimponeriu, Dănuţ; Berca, Lavinia Mariana; Mihăescu, Grigore (duben 2015). „Lidské anelloviry: aktualizace molekulárních, epidemiologických a klinických aspektů“. Archivy virologie. 160 (4): 893–908. doi:10.1007 / s00705-015-2363-9. PMID  25680568.
  3. ^ A b C d E F G h Okamoto, H (2009). Historie objevů a patogenita TT virů. Aktuální témata v mikrobiologii a imunologii. 331. str. 1–20. doi:10.1007/978-3-540-70972-5_1. ISBN  978-3-540-70971-8. PMID  19230554.
  4. ^ A b Zhang, Yu (6. května 2016). „Nový druh momentového teno mini viru (TTMV) v gingivální tkáni pacientů s chronickou parodontitidou“. Vědecké zprávy. 6 (26739): 26739. Bibcode:2016NatSR ... 626739Z. doi:10.1038 / srep26739. PMC  4879676. PMID  27221159.
  5. ^ Galmès J, Li Y, Rajoharison A, Ren L, Dollet S, Richard N, Vernet G, Javouhey E, Wang J, Telles JN, Paranhos-Baccalà G (2012) Potenciální implikace nových točivých mini virů v parapneumonickém empyému u dětí . Eur Respir J

externí odkazy