Gyrovirus - Gyrovirus

Gyrovirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:incertae sedis
Království:incertae sedis
Kmen:incertae sedis
Třída:incertae sedis
Objednat:incertae sedis
Rodina:Anelloviridae
Rod:Gyrovirus
Zadejte druh
Virus kuřecí anémie

Gyrovirus je rod viry, v rodině Anelloviridae. Do roku 2011, virus kuřecí anémie byl jediný identifikovaný gyrovirus, ale od té doby byly gyroviry také identifikovány u lidí. Mezi nemoci spojené s tímto rodem patří: kuřecí infekční anémie, která je spojena s vyčerpáním kortikálních thymocytů a erytroblastoidních buněk.[1][2]

Taxonomie

Skupina: ssDNA

[2]

Struktura

Gyroviry mají průměrnou velikost 19 až 27 nanometrů. Jsou neobalené a mají ikosahedrální kapsidu se symetrií T = 1. Jedinečné kapsomery ve tvaru trumpety z jednoho proteinu Gyrovirus jsou uspořádány do 12 pentomerů, čímž se získá kapsida o velikosti 60 jednotek. Genom je kruhový, nesegmentovaný a 2290–2320 nukleotidy dlouho.[2][3][4]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
GyrovirusIcosahedralT = 1NeobalenéOběžníkMonopartitní

Genom

Zarovnání nukleotidových sekvencí genomu lidského gyroviru na základě segmentu 138 bp (nt 1328–1465) genu virového proteinu 1. Sekvence izolátu z Francie (FR823283) a 6 izolátů nalezených v tomto http://wwwnc.cdc.gov/eid/article/18/6/12-0179_article.htm studie. Pozice nukleotidů jsou podle izolátu FR823283 (1). Pomlčky označují identitu s prototypovou sekvencí izolátu FR823283 (1).

The Gyrovirus genom se skládá z negativního smyslu, jednořetězcové, kruhové, DNA. Genom je relativně malý s 2 300 nukleotidy. a obsahuje tři překrývající se otevřené čtecí rámce, které kódují pouze tři známé proteiny.[5]

Proteiny

The Gyrovirus genom kóduje jednu polysistronickou mRNA, která následně kóduje tři proteiny, VP1, VP2 a VP3. VP1 je 51kd kapsidový protein; kromě své strukturální funkce obsahuje také motivy pro replikaci kružnice v C-koncové oblasti. VP2 je 23kd nestrukturální protein s aktivitou fosfatázy. Viriony s mutacemi v SP2 jsou stále replikačně kompetentní; jejich cytopatické účinky však byly velmi oslabené.[6] VP3, také nazývaný apoptin, je 13kd protein, u kterého bylo prokázáno, že nezávisle indukuje apoptózu v kuřecích buňkách. Apoptin je také zkoumán pro svou schopnost indukovat apoptózu v lidských nádorových buňkách.[7][8]

Strategie replikace

Virová replikace je jaderná. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky.[1] Po vstupu do hostitelské buňky se virus převádí z jednořetězcové na dvouvláknovou, kruhovou DNA pomocí mechanismu hostitelských buněk. Kruhová dsDNA se poté použije jako templát pro transkripci a pro replikaci prostřednictvím mechanismu klouzavého kruhu podobného phiX174.[9] Metodou transkripce je transkripce templátovaná DNA s některými alternativními sestřihovými mechanismy. Virus opouští hostitelskou buňku jaderným výstupem a exportem jaderných pórů. Ptáci slouží jako přirozený hostitel. Způsoby přenosu jsou fekálně-orální, rodičovské, vaječné a dýchací.[1]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
GyrovirusPtactvoKuře: Thymocyty, erytrobalstoidní buňky; Vejce: embryonální tkáně a membrána skořápkyEndocytóza buněčných receptorůPučícíJádroJádroHorizontální: orálně-fekální; vertikální: pták na vejce

Virus kuřecí anémie

Virus kuřecí anémie (CAV) byl až do roku 2011 jediným členem rodu Gyrovirus identifikováno.[10] Způsobuje onemocnění po celém světě v oblastech, kde se produkují kuřata. CAV způsobuje těžkou anémii, krvácení a vyčerpání lymfatické tkáně ničením erytroblastoidních buněk kostní dřeně.[5] Toto onemocnění postihuje hlavně mladá kuřata nechráněná mateřskými protilátkami. Věková odolnost vůči chorobám začíná přibližně jeden týden, ale lze ji překonat koinfekcí s imunosupresivními chorobami, jako je virus bursální choroby, Marekova choroba a další.[11]

Byl popsán druhý virus v tomto rodu - avian gyrovirus 2.[12] Virový genom sdílí ~ 40% své sekvence s virem kuřecí anémie (CAV). Genom je dlouhý 2383 nukleotidů a má tři částečně překrývající se otevřené čtecí rámce kódující proteiny VP1, VP2 a VP3. Tyto proteiny sdílejí 38,8%, 40,3% a 32,2% identitu aminokyselin mezi svými homology v CAV.

Od lidí byly popsány dva druhy - lidský gyrovirus a lidský gyrovirus 3.[13][14][15] Lidský gyrovirus 1 se jeví jako stejný virus jako ptačí gyrovirus 2. Čtvrtý gyrovirus - gyrovirus 4 (GyV4) - byl izolován z lidské stolice a kuřecího masa.[16]

Literatura

  1. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  2. ^ A b C ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
  3. ^ Crowther, R. A .; et al. (2003). „Srovnání struktur tří cirkovirů: virus kuřecí anémie, prasečí cirkovirus typu 2 a virus choroby zobáku a peří“. Journal of Virology. 77 (24): 13036–13041. doi:10.1128 / jvi.77.24.13036-13041.2003.
  4. ^ Správa ICTVdB (2006). 00.016.0.02. Gyrovirus. In: ICTVdB — The Universal Virus Database, verze 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA.
  5. ^ A b Noteborn, M.H.M .; et al. „Charakterizace DNA viru klonované kuřecí anémie, která obsahuje všechny prvky pro cyklus infekční replikace“. Journal of Virology. 65 (6): 3131–3139.
  6. ^ Peters, Michelle A .; Crabb, Brendan S .; Tivendale, Kelly A .; Browning, Glenn F. (2007). „Útlum viru kuřecí anémie místně cílenou mutagenezí VP2“. Journal of General Virology. 88 (8): 2168–2175. doi:10.1099 / vir.0.82904-0.
  7. ^ Noteborn, M. H. M .; et al. "Jediný protein viru kuřecí anémie indukuje apoptózu". Journal of Virology. 68 (1): 346–351.
  8. ^ Heckl, Stefan; et al. (2008). "Hodnota 40-aminokyselinového C-terminálního fragmentu apoptinu pro rozlišení mezi lidskými nádorovými a nenádorovými buňkami". Apoptóza. 13 (4): 495–508. doi:10.1007 / s10495-007-0174-5.
  9. ^ Noteborn, Mathieu H. M .; Koch, Guus (1995). „Infekce virem kuřecí anémie: Molekulární podstata patogenity“. Ptačí patologie. 24 (1): 11–31. doi:10.1080/03079459508419046.
  10. ^ Phan, T. G .; Li, L .; O'Ryan, M. G .; Cortes, H .; Mamani, N .; Bonkoungou, I. J. O .; Wang, C .; Leutenegger, C. M .; Delwart, E. (14. března 2012). „Třetí druh gyroviru v lidských výkalech“. Journal of General Virology. 93 (Pt_6): 1356–1361. doi:10.1099 / vir.0.041731-0. PMC  3755516. PMID  22422066.
  11. ^ Veterinární příručka společnosti Merck (online) Zpřístupněno 20. 4. 2009 Infekce virem kuřecí anémie: Úvod http://www.merckvetmanual.com/mvm/index.jsp?cfile=htm/bc/200200.htm&word=chicken%2canemia%2cvirus
  12. ^ Rijsewijk, FA; Dos Santos, HF; Teixeira, TF; Cibulski, SP; Varela, AP; Dezen, D; Franco, AC; Roehe, PM (2011). „Objev genomu vzdáleného příbuzného viru kuřecí anémie odhaluje nového člena rodu Gyrovirus“. Arch Virol. 156: 1097–1100. doi:10.1007 / s00705-011-0971-6.
  13. ^ Sauvage, V; Cheval, J; Foulongne, V; Gouilh, MA; Pariente, K; Manuguerra, JC; Richardson, J; Dereure, O; Lecuit, M; Burguiere, A; Caro, V; Eloit, M (2011). „Identifikace prvního lidského gyroviru, viru souvisejícího s virem kuřecí anémie“. J Virol. 85 (15): 7948–7950. doi:10.1128 / jvi.00639-11.
  14. ^ Maggi, F; Macera, L; Focosi, D; Vatteroni, ML; Boggi, U; Antonelli, G; Eloit, M; Pistello, M (2012). „DNA lidského gyroviru v lidské krvi, Itálie“. Emerg Infect Dis. 18 (6): 956–9. doi:10.3201 / eid1806.120179.
  15. ^ Phan, TG; Li, L; O'Ryan, MG; Cortes, H; Mamani, N; Bonkoungou, IJ; Wang, C; Leutenegger, CM; Delwart, E (2012). "Třetí druh gyroviru v lidských výkalech". J Gen Virol. 93 (6): 1356–1361.
  16. ^ Chu, DK; Poon, LL; Chiu, SS; Chan, KH; Ng, EM; Bauer, I; Cheung, TK; Ng, IH; Guan, Y; Wang, D; Peiris, JS (2012). "Charakterizace nového gyroviru v lidské stolici a kuřecím masu". J Clin Virol. 55 (3): 209–213. doi:10.1016 / j.jcv.2012.07.001. PMC  3449218.

externí odkazy