Desulfurococcaceae - Desulfurococcaceae

Desulfurococcaceae
Vědecká klasifikace
Doména:	Archaea
Království:	Crenarchaeota
Kmen:	Crenarchaeota
Třída:	Thermoprotei
Objednat:	Desulfurococcales
Rodina:	Desulfurococcaceae; Zillig & Stetter, 1983 vznikají. Burggraf a kol. 1997
Rody
	Aeropyrum Sako a kol. 1996; Desulfurococcus Zillig a Stetter 1983 vznikají. Perevalova a kol. 2005; Ignicoccus Huber a kol. 2000 ; Ignisphaera Niederberger et al. 2006; Staphylothermus Stetter a Fiala 1986; Stetteria Jochimsen a kol. 1998; Sulfophobococcus Hensel a kol. 1997; Thermodiscus Stetter 2003; Thermogladius ♠ Osburn & Amend 2011; Thermosphaera Huber a kol. 1998;

v taxonomie, Desulfurococcaceae plocha rodina diskových anaerobních mikroorganismů patřících do řádu Desulfurococcales, v doméně Archaea.^[1] Členové této rodiny se odlišují od druhé rodiny (Pyrodictiaceae ) v pořadí Desulfurococcales tím, že mají optimální růstovou teplotu pod 100 ° C, spíše než nad 100 ° C, a tím, že jsou rozmanitější.^[2] Bylo identifikováno několik rodů čeledi (viz taxobox).

Fylogeneze

Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)^[3] a Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI)^[4]a fylogeneze je založena na uvolňování LTP 16S rRNA 121 pomocí Projekt „All-Species Living Tree“.^[5] Podle studie provedené projektem „The All-Species Living Tree“ je Desulfurococcaceae a paraphyletic a polyfyletický clade s členskými rody rozloženými mezi tři subtypy po celé základně třídy Thermoprotei.

Ignisphaera aggregans Niederberger et al. 2006
Thermogladius shockii ♠ Osburn & Amend 2011
Desulfurococcaceae clade 1

Ignicoccus

I. hospitalis Paper et al. 2007

	I. islandicus Huber a kol. 2000 (typ sp.)

	I. pacificus Huber a Stetter 2000

Staphylothermus

	S. hellenicus Arab a kol. 2000

	S. marinus Stetter a Fiala 1986 (typ sp.)

Sulfophobococcus zilligii Hensel a kol. 1997

Thermosphaera aggregans Huber a kol. 1998

Desulfurococcus

?D. amylolyticus Bonch-Osmolovskaya et al. 2001

?D. mobilis ♦ Zillig a Stetter 1983

?D. saccharovorans ♠ Stetter 1986

D. sliznice Zillig a Stetter 1983 (typ sp.)

	D. fermentans Perevalova a kol. 2005

	D. kamchatkensis Kublanov a kol. 2009

Desulfurococcaceae clade 2

Stetteria hydrogenophila Jochimsen a kol. 1998

Thermodiscus maritimus Stetter 2003

Aeropyrum

	Aeropyrum camini Nakagawa a kol. 2004

	Aeropyrum pernix Sako a kol. 1996 (typ sp.)

Poznámky:
♦ Ztráta typu nebo není k dispozici
♠ Kmeny nalezené na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)

Reference

^ Viz NCBI webová stránka o Desulfurococcaceae. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.
^ Itoh, T .; K. Suzuki; P. C. Sanchez; T. Nakasel (2003). „Caldisphaera lagunensis gen. Nov., Sp. Nov., Nový termoacidofilní crenarchaeote izolovaný od horkého pramene na Mt Maquiling na Filipínách“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 53 (Pt 4): 1149–1154. doi:10.1099 / ijs.0.02580-0. PMID 12892143. Archivovány od originál dne 29. 9. 2007.
^ J.P.Euzéby. "Desulfurococcaceae". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN) [1]. Archivovány od originál dne 27.01.2013. Citováno 2013-08-07. Externí odkaz v | vydavatel = (Pomoc)
^ Sayers; et al. "Desulfurococcaceae". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie [2]. Citováno 2013-08-07. Externí odkaz v | vydavatel = (Pomoc)
^ Projekt All-Species Living Tree.„Vydání LTP založené na 16S rRNA 121 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA [3]. Archivovány od originál (PDF) dne 2015-09-23. Citováno 2015-08-07. Externí odkaz v | vydavatel = (Pomoc)

Další čtení

Vědecké časopisy

Burggraf S, Huber H, Stetter KO (1997). „Reklasifikace objednávek a rodin crenarchaelů podle 16S rRNA sekvenčních dat“. Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (3): 657–660. doi:10.1099/00207713-47-3-657. PMID 9226896.
Comolli, Luis R .; Banfield, Jill F. (25. července 2014). „Mezidruhová propojení v mikrobiálních komunitách odtoku kyselých dolů“. Hranice v mikrobiologii. 5: Článek 367. doi:10.3389 / fmicb.2014.00367. PMC 4110969. PMID 25120533. Citováno 13. listopadu 2014.^{[trvalý mrtvý odkaz ]}
Zillig W, Stetter KO, Prangishvilli D, Schafer W, Wunderl S, Janekovic D, Holz I, Palm P (1982). „Desulfurococcaceae, druhá rodina extrémně termofilních, anaerobních, sírou dýchajících Thermoproteales“. Zentralbl. Bakteriol. Parasitenkd. Infektionskr. Hyg. Abt. 1 Orig. C3: 304–317.

Vědecké knihy

Huber H, Stetter KO (2001). „Objednávka II. Desulfurococcales ord. Nov.“. V DR Boone, RW Castenholz (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria (2. vyd.). New York: Springer Verlag. str.169. ISBN 978-0-387-98771-2.

Vědecké databáze

externí odkazy

Tento Crenarchaeota související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Viz NCBI webová stránka o Desulfurococcaceae. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.

[2] Itoh, T .; K. Suzuki; P. C. Sanchez; T. Nakasel (2003). „Caldisphaera lagunensis gen. Nov., Sp. Nov., Nový termoacidofilní crenarchaeote izolovaný od horkého pramene na Mt Maquiling na Filipínách“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 53 (Pt 4): 1149–1154. doi:10.1099 / ijs.0.02580-0. PMID 12892143. Archivovány od originál dne 29. 9. 2007.

[3] J.P.Euzéby. "Desulfurococcaceae". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN) [1]. Archivovány od originál dne 27.01.2013. Citováno 2013-08-07. Externí odkaz v | vydavatel = (Pomoc)

[4] Sayers; et al. "Desulfurococcaceae". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie [2]. Citováno 2013-08-07. Externí odkaz v | vydavatel = (Pomoc)

[16S_rRNA-based_LTP_release_121_(full_tree)-5] Projekt All-Species Living Tree.„Vydání LTP založené na 16S rRNA 121 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA [3]. Archivovány od originál (PDF) dne 2015-09-23. Citováno 2015-08-07. Externí odkaz v | vydavatel = (Pomoc)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]