Acyl-CoA-vazebný protein - Acyl-CoA-binding protein
| ACBP | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Acyl-CoA vázající proteinový monomer, člověk | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | ACBP | ||||||||
| Pfam | PF00887 | ||||||||
| InterPro | IPR000582 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00686 | ||||||||
| SCOP2 | 1aca / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| OPM nadčeleď | 295 | ||||||||
| OPM protein | 2wh5 | ||||||||
| CDD | cd00435 | ||||||||
| Membranome | 497 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se Acyl-CoA-vazebný protein (ACBP) je malý (10 Kd) protein, který váže střední a dlouhý řetěz acyl-CoA estery s velmi vysokou afinitou a může fungovat jako intracelulární nosič acyl-CoA estery.[1] ACBP je také známý jako inhibitor vazby diazepamu (DBI) nebo endozepin (EP) kvůli své schopnosti vytlačit diazepam z benzodiazepin (BZD) rozpoznávací web umístěný na internetu GABA typ A receptor. Je proto možné, že tento protein funguje také jako a neuropeptid modulovat činnost GABA receptor.[2]
ACBP je vysoce konzervativní bílkovina asi 90 aminokyseliny který se nachází ve všech čtyřech eukaryotický království, Animalia, Plantae, Houby a Protista a v některých eubakteriálních druh.[3]
Ačkoli ACBP se vyskytuje jako zcela nezávislý protein, neporušený ACB domén byly identifikovány v řadě velkých multifunkčních zařízení bílkoviny v různých eukaryotický druh. Patří mezi ně velké spojené s membránou bílkoviny s N-koncovými doménami ACB, multifunkční enzymy s ACB i peroxisomálním enoyl-CoA Delta (3), Delta (2) -enoyl-CoA izomeráza domény a proteiny s doménou ACB i ankyrin se opakuje.[3]
ACB doména se skládá ze čtyř alfa-šroubovice uspořádané do tvaru mísy s vysoce exponovaným vazebným místem pro acyl-CoA. The ligand je vázán prostřednictvím specifických interakcí se zbytky na proteinu, zejména několika konzervovaný kladné poplatky komunikovat s fosfát Skupina na adenosin-3'-fosfátové části a acylový řetězec je vložen mezi hydrofobní povrchy CoA a proteinu.[4]
Mezi další proteiny obsahující ACB doménu patří:
- Podobně jako endozepin peptid (ELP) (gen DBIL5) z myš.[5] ELP je ACBP specifický pro varlata homolog které mohou být zapojeny do energie metabolismus zralého spermatu.
- MA-DBI, a transmembránový protein neznámé funkce, která byla nalezena v savci. MA-DBI obsahuje N-koncovou ACB doménu.
- DRS-1,[6] A člověk protein neznámé funkce, který obsahuje N-koncovou ACB doménu a C-koncovou enoyl-CoA izomerázovou / hydratázovou doménu.
Reference
- ^ Rose TM, Schultz ER, Todaro GJ (prosinec 1992). "Molekulární klonování genu pro kvasnicový homolog (ACB) inhibitoru vazby diazepamu / endozepinu / proteinu vázajícího acyl-CoA". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (23): 11287–91. doi:10.1073 / pnas.89.23.11287. PMC 50535. PMID 1454809.
- ^ Costa E, Guidotti A (1991). „Inhibitor vazby diazepamu (DBI): peptid s více biologickými účinky“. Life Sci. 49 (5): 325–44. doi:10.1016 / 0024-3205 (91) 90440-M. PMID 1649940.
- ^ A b Burton M, Rose TM, Faergeman NJ, Knudsen J (prosinec 2005). „Vývoj proteinu vázajícího acyl-CoA (ACBP)“. Biochem. J. 392 (Pt 2): 299–307. doi:10.1042 / BJ20050664. PMC 1316265. PMID 16018771.
- ^ van Aalten DM, Milne KG, Zou JY, Kleywegt GJ, Bergfors T, Ferguson MA, Knudsen J, Jones TA (květen 2001). „Rozdíly vazebných míst odhalené krystalovými strukturami Plasmodium falciparum a hovězím proteinem vázajícím acyl-CoA“. J. Mol. Biol. 309 (1): 181–92. doi:10.1006 / jmbi.2001.4749. PMID 11491287.
- ^ Pusch W, Balvers M, Hunt N, Ivell R (srpen 1996). „Nový endozepinům podobný peptid (ELP) je exprimován výlučně v zárodečných buňkách samce“. Mol. Buňka. Endokrinol. 122 (1): 69–80. doi:10.1016/0303-7207(96)03874-9. PMID 8898349. S2CID 36504570.
- ^ Suk K, Kim YH, Hwang DY, Ihm SH, Yoo HJ, Lee MS (květen 1999). "Molekulární klonování a exprese nové lidské cDNA související s inhibitorem vazby diazepamu". Biochim. Biophys. Acta. 1454 (1): 126–31. doi:10.1016 / s0925-4439 (99) 00033-2. PMID 10354522.