Motiv interagující s ubikvitinem - Ubiquitin-interacting motif - Wikipedia
| UIM | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktura řešení komplexu s5a uim-1 / ubikvitin | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | UIM | ||||||||
| Pfam | PF02809 | ||||||||
| InterPro | IPR003903 | ||||||||
| SCOP2 | 1p9d / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se Motiv interagující s ubikvitinem (UIM) neboLALAL-motiv', je sekvenční motiv asi 20 aminokyselina zbytky, který byl poprvé popsán v 26S proteazom podjednotka PSD4 / RPN-10, o které je známo, že rozeznává ubikvitin.[1][2] Kromě toho se UIM vyskytuje často v tandemových nebo tripletových polích bílkoviny buď zapojen do ubikvitinace a metabolismus ubikvitinu nebo je známo komunikovat s ubikvitin podobný modifikátory. Mezi UIM bílkoviny jsou dvě různé podskupiny rodiny deubikvitinačních enzymů UBP (ubikvitin karboxy-terminální hydroláza), jeden protein F-box, jedna rodina ubikvitin-ligáz obsahujících HECT (E3s) z rostlin a několik bílkoviny obsahující UBA a / nebo UBX související s ubikvitinem domén.[3] U většiny z těchto proteinů se UIM vyskytuje ve více kopiích a ve spojení s jinými domén jako UBA (INTERPRO ), UBX (INTERPRO ), ENTH doména, EH (INTERPRO ), VHS (INTERPRO ), SH3 doména, HECT, VWFA (INTERPRO ), EF-ruční vázání vápníku, WD-40, F-box (INTERPRO ), LIM, protein kináza, ankyrin, PX, fosfatidylinositol 3- a 4-kináza (INTERPRO ), Doména C2, OTU (INTERPRO ), Doména DnaJ (INTERPRO ), Prsteník (INTERPRO ) nebo FYVE-finger (INTERPRO ). UIM bylo prokázáno svázat ubikvitin a sloužit jako specifický cílový signál důležitý pro monoubikvitinaci. UIM tedy mohou mít v ubikvitinu několik funkcí metabolismus každý z nich může vyžadovat jiný počet UIM.[4][5][6]
Je nepravděpodobné, že by UIM tvořil nezávislý proteinová doména. Místo toho na základě rozteče konzervovaný zbytky, motiv pravděpodobně tvoří krátký alfa-šroubovice které lze vložit do různých záhyby bílkovin.[2] Některé proteiny, o nichž je známo, že obsahují UIM, jsou uvedeny níže:
- Eukaryotický PSD4 / RPN-10 / S5, multi-ubikvitin vazba podjednotka proteasomu 26S.
- Obratlovců Machado-Joseph choroba protein 1 (Ataxin-3), který působí jako protein vázající histon, který reguluje transkripce; defekty Ataxinu-3 způsobují neurodegenerativní poruchu Machado-Josephovy choroby (MJD).
- Obratlovci epsin a epsin2.
- Obratlovců hepatocytů růst faktorově regulované tyrosinkináza Podklad (HRS).
- Savčí receptor epidermálního růstového faktoru Podklad 15 (EPS15), který je zapojen do růst buněk nařízení.
- Savčí epidermální růstový faktor receptor Podklad EPS15R.
- Drosophila melanogaster (Fruit fly) tekuté fazety (lqf), epsin.
- Droždí VPS27 vakuolární třídící protein, který je vyžadován pro membrána provoz do vakuoly.
Reference
- ^ Young P, Deveraux Q, Beal RE, Pickart CM, Rechsteiner M (březen 1998). "Charakterizace dvou polyubikvitinových vazebných míst v 26S proteázové podjednotce 5a". J. Biol. Chem. 273 (10): 5461–7. doi:10.1074 / jbc.273.10.5461. PMID 9488668.
- ^ A b Hofmann K, Falquet L (červen 2001). "Motiv interagující s ubikvitinem konzervovaný v komponentách proteazomálních a lysozomálních proteinových degradačních systémů". Trends Biochem. Sci. 26 (6): 347–50. doi:10.1016 / s0968-0004 (01) 01835-7. PMID 11406394.
- ^ Buchberger A (květen 2002). "Od UBA k UBX: nová slova ve všudypřítomném slovníku". Trends Cell Biol. 12 (5): 216–21. doi:10.1016 / S0962-8924 (02) 02269-9. PMID 12062168.
- ^ Oldham CE, Mohney RP, Miller SL, Hanes RN, O'Bryan JP (červenec 2002). "Motivy interagující s ubikvitinem se zaměřují na endocytický adaptorový protein epsin pro ubikvitinaci". Curr. Biol. 12 (13): 1112–6. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00900-4. PMID 12121618.
- ^ Riezman H (březen 2002). "Buněčná biologie: spojení ubikvitinu". Příroda. 416 (6879): 381–3. doi:10.1038 / 416381a. PMID 11919614.
- ^ Reece DE, Barnett MJ, Connors JM, Fairey RN, Fay JW, Greer JP, Herzig GP, Herzig RH, Klingemann HG, LeMaistre CF (říjen 1991). „Intenzivní chemoterapie cyklofosfamidem, karmustinem a etoposidem následovaná autologní transplantací kostní dřeně pro relabující Hodgkinovu chorobu“. J. Clin. Oncol. 9 (10): 1871–9. PMID 1919637.