Tobamovirus - Tobamovirus
| Tobamovirus | |
|---|---|
 | |
| Virus mozaiky tabáku (TMV) diagram a elektronový mikrofotografie virionů | |
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Riboviria |
| Království: | Orthornavirae |
| Kmen: | Kitrinoviricota |
| Třída: | Alsuviricetes |
| Objednat: | Martellivirales |
| Rodina: | Virgaviridae |
| Rod: | Tobamovirus |
| Zadejte druh | |
| Virus mozaiky tabáku | |
Tobamovirus je rod pozitivní viry RNA v rodině Virgaviridae.[2] Mnoho rostlin, včetně tabák, brambor, rajče, a squash, slouží jako přirození hostitelé. Mezi nemoci spojené s tímto rodem patří: nekrotické léze na listech.[2][3] Název Tobamovirus pochází z hostitele a příznaky prvního objeveného viru (Virus mozaiky tabáku).[4]
V tomto rodu existují čtyři neformální podskupiny: jedná se o tobamoviry, které infikují brassicas, tykvovité,zlovolný, a solanaceous rostliny. Hlavní rozdíly mezi těmito skupinami jsou genomové sekvence a příslušný rozsah hostitelských rostlin.[Citace je zapotřebí ] V současné době existuje v tomto rodu 37 druhů, včetně druhů druhů Virus mozaiky tabáku.[5]
Struktura
Tobamoviry jsou neobalené, mají geometrii spirálových tyčí a spirálovou symetrii. Průměr je kolem 18 nm, s délkou 300–310 nm. Genomy jsou lineární a nesegmentované, mají délku přibližně 6,3–6,5 kB.[2][3]
Genom
Genom RNA kóduje alespoň čtyři polypeptidy:[2] tohle jsou nestrukturální protein a čtecí produkt, který se účastní replikace viru (RNA-dependentní RNA polymeráza, RdRp); the pohybový protein (MP), který je nezbytný pro pohyb viru mezi buňkami a obalový protein (CP). Přečtená část RdRp může být vyjádřena jako samostatný protein v TMV.[6] Virus je schopen replikovat se bez pohybových nebo obalových proteinů, ale další dva jsou nezbytné. Nestrukturální protein má domény, které naznačují, že se podílí na uzavírání RNA, a produkt pro čtení má motiv pro RNA polymerázu. Pohybové proteiny se vytvářejí velmi brzy v infekčním cyklu a lokalizují se na plasmodesmata, jsou pravděpodobně zapojeni do specificity hostitele, protože se předpokládá, že interagují s některými faktory hostitelské buňky.[Citace je zapotřebí ]
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Replikace sleduje model replikace pozitivního řetězce RNA viru. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Překlad probíhá potlačením ukončení. Virus opouští hostitelskou buňku monopartitním ne-tubulárním řízeným virovým pohybem. Rostliny slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou mechanické.[2][3]
Cesty infekce
Infekce je od počátku lokalizována, ale pokud virus zůstane nezpochybněný, rozšíří se přes cévní systém do systémové infekce. Přesný mechanismus, který virus používá k pohybu v celé rostlině, není znám, ale jeho interakce pektin methylesteráza, mobilní enzym důležité pro buněčná stěna byl zapojen metabolismus a vývoj rostlin s pohybovým proteinem.[7]
Vývoj
Předpokládá se, že se tyto viry shodovaly se svými hostiteli od společného předka.[8] Existují nejméně 3 odlišné subtypy tobamovirů, které do určité míry sledují rozsahy svých hostitelů: to znamená, že existuje jeden infikující solanaceous druh; druhá infekce tykvovité a luštěniny a třetí infikuje křižníky.[9]
Klasifikace
Druh
- Virus mozaiky papriky (BPeMV)
- Brugmansia mírný skvrnitý virus
- Virus mírného kaktusu kaktusu (CMMoV)[10]
- Clitoria virus žluté skvrny
- Virus mozaiky skvrnitého ovoce
- Virus mozaiky zelené okurky (CGMMV)
- Virus okurky
- Virus mozaiky keře (FrMV)
- Hibiscus latentní virus Fort Pierce (HLFPV)
- Hibiscus latentní singapurský virus (HLSV)
- Virus mozaiky zelené skvrnitosti Kyuri
- Virus mozaiky maracuja (MarMV)
- Virus obuda pepře (ObPV)
- Virus Odontoglossum ringspot (ORSV)
- Opuntia chlorotic ringspot virus
- Virus papričky mírné skvrnitosti
- Virus mozaiky mučenky
- Pepřový mírný skvrnitý virus (PMMoV)
- Virus mozaiky Plumeria
- Virus spojený s nekrózou kaktusu (RCNaV)
- Virus mozaiky Rehmannia
- Virus mozaiky Ribgrass (HRV)
- Sammonsův virus Opuntia (SOV)
- Virus rozbité květiny Streptocarpus
- Virus mozaiky sunn-konopí (SHMV)
- Latentní virus tabáku
- Virus tabákové mírně zelené mozaiky
- Virus rajčatového hnědého ovoce (ToBRFV)
- Virus mozaiky rajčat (ToMV)
- Virus mozaiky tabáku (T2MV) - druh Druh
- Virus mozaiky rajče
- Virus mozaiky tropické sody a jablek
- Virus pro odstraňování žil z tuřínu (TVCV)
- Ullucus mírný skvrnitý virus
- Virus skvrnitosti wasabi (WMoV)
- Virus žluté ocasní skvrnitosti
- Virus mozaiky Youcai (YoMV) aka virus mozaiky řepky olejky (ORMV)
- Virus mozaiky ze zelené cukety[11]
Navrhovaní členové
Mezi navrhované, ale v současné době neuznané členy rodu patří:[11]
- Virus Chara corallina (CCV)
- Virus mozaiky Nicotiana velutina (NVMV)
Reference
- ^ „Virus Taxonomy: 2018b Release“. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Březen 2019. Citováno 18. března 2019.
- ^ A b C d E „Online zpráva ICTV Virgaviridae“.
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/Ratification_1975.pdf
- ^ ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
- ^ Creager AN, Scholthof KB, Citovsky V, Scholthof HB (březen 1999). „Virus tabákové mozaiky. Průkopnický výzkum po celé století“. Rostlinná buňka. 11 (3): 301–8. doi:10.1105 / tpc.11.3.301. PMC 1464663. PMID 10072391.
- ^ Chen MH, Citovsky V (srpen 2003). „Systémový pohyb tobamoviru vyžaduje pektinmethylesterázu hostitelských buněk“. The Plant Journal. 35 (3): 386–92. doi:10.1046 / j.1365-313X.2003.01818.x. PMID 12887589.
- ^ Stobbe AH, Melcher U, Palmer MW, Roossinck MJ, Shen G (únor 2012). „Společná divergence a změna hostitele ve vývoji tobamovirů“. The Journal of General Virology. 93 (Pt 2): 408–18. doi:10.1099 / vir.0.034280-0. PMID 22049092.
- ^ Lartey RT, Voss TC, Melcher U (prosinec 1996). „Vývoj tobamoviru: přesahy genů, rekombinace a taxonomické důsledky“ (PDF). Molekulární biologie a evoluce. 13 (10): 1327–38. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025579. PMID 8952077.
- ^ Min BE, Chung BN, Kim MJ, Ha JH, Lee BY, Ryu KH (leden 2006). „Virus kaktusové mírné skvrnitosti je nový tobamovirus infikující kaktusy“. Archivy virologie. 151 (1): 13–21. doi:10.1007 / s00705-005-0617-7. PMID 16132178. S2CID 40760030.
- ^ A b "Popisy rostlinných virů: skupina Tobamovirus". Asociace aplikovaných biologů (AAB).
Další čtení
- Hagiwara Y, Komoda K, Yamanaka T, Tamai A, Meshi T, Funada R, Tsuchiya T, Naito S, Ishikawa M (leden 2003). "Subcelulární lokalizace hostitelských a virových proteinů spojených s replikací tobamovirové RNA". Časopis EMBO. 22 (2): 344–53. doi:10.1093 / emboj / cdg033. PMC 140108. PMID 12514140.